Entry information : LePrx25 (Solyc06g050440.2.1[2.3])
Entry ID 623
Creation 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx25 (Solyc06g050440.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx25 (Solyc06g050440.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Crown gall
Flower buds
Flowers
Inducers Agrobacterium tumefaciens infection
Pathogen interaction
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx25
start..stop
S start..stop
StPrx16 635 0 1..319 1..319
NtPrx78-1A 609 0 1..319 1..319
NtPrx11-1A 571 0 1..319 1..321
StPrx47 553 0 17..319 20..322
Literature and cross-references LePrx25 (Solyc06g050440.2.1[2.3])
Literature Alcala,J. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx25 (Solyc06g050440.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   320 (297)
PWM (Da):   %s   34544.45 (32158.2) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   9.7 (9.70) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-319
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MACFKSAIVL FFLVTLVGSS SAQLTTGFYS KSCPKLYQTV KSVVNSAIQK ETRMGASLLR LFFHDCFVNG CDGSLFLDDT STFTGEKRAQ PNFNSARGFE VIDNIKSAVE KVCLGVVSCA  DILAVTARDS VVILGGPNWD VKLGRRDART ASQGAANNSI PTPTSNLNRL ISSFTAVGLS TKDMVALSGA HTIGQARCTS FRGRIYNETK NMDASLARTR QNNCPRASGS GDNNLAPLDL 
QTPTRFDNHY FINLVNKKGL LHSDQQLFNG GSVDSIVKSY SNNPSSFISD FVTAMIKMGD IRPLTGSNGE IRKNCRRIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, 3 introns) and 4 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTGTT TTAAGAGTGC CATAGTTTTG TTTTTCCTAG TGACTTTAGT GGGAAGTTCC TCAGCTCAAC TCACCACTGG ATTTTACTCA AAATCATGTC CTAAGCTCTA TCAAACTGTG  AAATCTGTGG TGAACTCTGC TATTCAGAAG GAAACCCGAA TGGGTGCTTC CCTCCTTCGC CTATTCTTCC ACGATTGCTT CGTTAATGTA ATCTAATCTA TCTTCTTCAT TTTCACTCCT  TTTTGTTTTT GTTAATATTG TTGTTTTAGA ACACAGTATT TTATTATATA CGGAAAAAAA AGCTTAATAT ACTCATCAAT TTTATGACTT AAAGTTGATA TATCCCTCGG GGAAAACGAC  ATTTTTAGTC CTTGTGTTAA GACTATATTC TTATTTTAGT CCTCATGTTA TTTTACTCAG CACTATTAAC CTTCAATTAT ATCAAGTAAG TGATTTTAAT CCTTCAACTT ACAGATTCAT  AAAAAATTAA CAGAGAGTTC ACTGTTAAAA GGGATAGTTT GAGTATTTCC TTTTTAATTC TATCTCTCTT TGAAGAACAA GCTAAGTTTT CCCTGCCTCT ATCTAGAAGA ACAAACCAAT  CGATTTGAGC TATAATGCCA ACAAAACCAA CTTTATAAGC ATTAACCCTC CCTCTCACGC CCACGAACGA TATTGATCTT TGAAAAAAAA ATTCATTTTC TGAAGCAGTA ACATTAAAAT  ACCCAAATTA CCCCTTTTAG CAGTGCTATA AATGAAGGTT AATAGTGCTA AATTAAATAA CACAAGAACT AAAACAAGAA ATTAGCCTTA ACACAGGGAC TAAAAATATC GTTTCCCAAT  CCCTCATTAT AAAAGTTACG TAGTAGAAAA GTTTATCTAT CAAAAACAAG ATGAGTGTTA TATTGTGCAC TTTGCATAAT TCCAAAATCG TTGGTATTTT ATGTTGCCAA GTGTCTTGGG  ACGACTGATA ATGATATTTT TTTTTGTGAG ACAGTTCGAC AACTTTGTTG GTGAGTTCGT TTACTAGGCA TTCAAAGGTT TCCCTGCCCT TTATATATAT ATAATTAATT TTTTGACTTT  TGACAGGGAT GCGATGGATC ATTGTTCCTG GACGATACAT CAACCTTCAC AGGAGAAAAG AGGGCACAAC CCAATTTCAA TTCCGCCAGA GGATTTGAAG TTATTGACAA CATCAAATCT  GCTGTTGAAA AAGTTTGTCT TGGTGTGGTC TCTTGTGCTG ATATTTTAGC TGTTACCGCT CGAGACTCTG TTGTAATTGT AAGTTGTTCA TCGACATATT TATTTATGCA TTTAATATGA  AATATAAACA AAAATTTATT GGATGTTATA TTATATAGCT TGGAGGACCT AATTGGGATG TAAAACTGGG AAGAAGAGAT GCGAGGACAG CAAGCCAAGG TGCTGCAAAT AACAGCATTC  CTACCCCAAC TTCTAACCTT AACCGTCTCA TCTCTAGCTT CACTGCTGTT GGCCTTTCTA CAAAGGATAT GGTTGCTTTA TCTGGTTTGT TTCAATCCTA CTCCTACTCT TTCTTTTCTA  ATTTAATTTG ACTGGACACG AAATTAACAT TTTGTAATGT AGGAGCTCAT ACTATTGGAC AAGCAAGGTG CACAAGTTTC AGGGGACGCA TATACAACGA GACCAAAAAC ATGGACGCAT  CACTAGCGAG AACCAGGCAA AATAATTGCC CCAGAGCCTC AGGATCAGGG GATAACAATT TGGCACCTCT TGATTTACAG ACCCCTACGC GCTTCGACAA TCACTACTTC ATAAACCTTG  TTAACAAAAA GGGACTGCTC CATTCTGATC AGCAGCTTTT CAATGGAGGA TCCGTTGATT CAATTGTGAA ATCATACAGT AACAATCCCA GCAGTTTCAT CTCTGATTTT GTGACTGCCA 
TGATTAAGAT GGGTGATATC CGTCCCCTCA CTGGTTCTAA TGGAGAGATC AGGAAGAACT GCAGGAGAAT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTGTT TTAAGAGTGC CATAGTTTTG TTTTTCCTAG TGACTTTAGT GGGAAGTTCC TCAGCTCAAC TCACCACTGG ATTTTACTCA AAATCATGTC CTAAGCTCTA TCAAACTGTG  AAATCTGTGG TGAACTCTGC TATTCAGAAG GAAACCCGAA TGGGTGCTTC CCTCCTTCGC CTATTCTTCC ACGATTGCTT CGTTAATGGA TGCGATGGAT CATTGTTCCT GGACGATACA  TCAACCTTCA CAGGAGAAAA GAGGGCACAA CCCAATTTCA ATTCCGCCAG AGGATTTGAA GTTATTGACA ACATCAAATC TGCTGTTGAA AAAGTTTGTC TTGGTGTGGT CTCTTGTGCT  GATATTTTAG CTGTTACCGC TCGAGACTCT GTTGTAATTC TTGGAGGACC TAATTGGGAT GTAAAACTGG GAAGAAGAGA TGCGAGGACA GCAAGCCAAG GTGCTGCAAA TAACAGCATT  CCTACCCCAA CTTCTAACCT TAACCGTCTC ATCTCTAGCT TCACTGCTGT TGGCCTTTCT ACAAAGGATA TGGTTGCTTT ATCTGGAGCT CATACTATTG GACAAGCAAG GTGCACAAGT  TTCAGGGGAC GCATATACAA CGAGACCAAA AACATGGACG CATCACTAGC GAGAACCAGG CAAAATAATT GCCCCAGAGC CTCAGGATCA GGGGATAACA ATTTGGCACC TCTTGATTTA  CAGACCCCTA CGCGCTTCGA CAATCACTAC TTCATAAACC TTGTTAACAA AAAGGGACTG CTCCATTCTG ATCAGCAGCT TTTCAATGGA GGATCCGTTG ATTCAATTGT GAAATCATAC  AGTAACAATC CCAGCAGTTT CATCTCTGAT TTTGTGACTG CCATGATTAA GATGGGTGAT ATCCGTCCCC TCACTGGTTC TAATGGAGAG ATCAGGAAGA ACTGCAGGAG AATCAACTAA 

Retrieve as FASTA