Entry information : MEmaKat01
Entry ID 6276
Creation 2008-07-11 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2011-07-18 (Marcel Zamocky)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2011-08-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MEmaKat01
Name MEmaKat01
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Archaea Euryarchaeota Methanomicrobia Methanomicrobiaceae Methanoculleus
Organism Methanoculleus marisnigri    [TaxId: 2198 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MEmaKat01
start..stop
S start..stop
MmazKat01 1135 0 4..707 3..710
AmeKat01 990 0 4..707 9..713
DalKat01 981 0 7..707 12..711
BhaKat01_C-125 981 0 3..703 6..706
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1..2124 2124  
complement(join(1..2124))


exon

Literature and cross-references MEmaKat01
Literature Copeland A., Lucas S., Lapidus A., Barry K., Detter J.C., Glavina del Rio T., Dalin E., Tice H., Pitluck S., Saunders E., Brettin T., Bruce D., Han C., Tapia R., Gilna P., Schmutz J., Larimer F., Land M., Hauser L., Kyrpides N., Mikhailova N., Anderson I., Sieprawska-Lupa M., Whitman W., Woese C., Richardson P. Complete sequence of Methanoculleus marisnigri JR1. (unpublished since 2007)
Protein ref. UniProtKB:   A3CTV8
DNA ref. GenBank:   CP000562 (853504..855627)
Protein sequence: MEmaKat01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   707
PWM (Da):   %s   79972.05  
PI (pH):   %s   6.22
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDQKRKVDEK SKQEQLDEFR QDPEQEYLTT NQAVRVSHTD DSLKAGERGP TLLEDFHFRE KLTHFDHERI PERVVHARGS GAHGYFQVYE PMTEYTRAAF LQDPAKKTPV FVRFSTVVGF  RGSADTVRDV RGFATKFYTE EGNYDLVGNN MPVFFIVDAI KFPDLVHAIK PEQHHQMPQA SAAHDTFWDF VGNLPEITHM IMWVLSDRAL PRSYRMMEGF GVNTFRFINA EGKARFIKFH  WRPQLGVHSL VWDETQKIAG KDPDFNRRDL WEAIEMGDYP EFELGVQMIE EADEHNFEFD ILDATKLWPE EEVPIRWIGK MILNRNPDNF FAETEQVAFC PANVVPGIDF SNDPLLQGRL  FSYLDTQLIR LGGPNFQEIP INRTLAPAAN NQREGYNRMT IDKGVVSYFP NALGENKPRP ARVEEGGYAH YQEKIEGRKI RARSEKFNDH FSQAKLFWNS MSDAEKEHIV KAFHFELGKV  SDSGVRKRVV DLINNVDGDL AIRIAEGIGV PPPAEKGASS GTKKSPNLSQ EKTVMDTIKS RKVAILAMEG YDHDEVMQVK KALKDAGAHP QIVSQFRGMV KSADGKEMEV DKSYVTTTSV 
VYDAVYVPGG RHAETLKNQG FAIHFVNEAF KHCKPIGAMG EGIELLKASD IKGVTFVDAG TGGEAVSEMG VVTCGSQGDV NSFVEQFKTA IARHRHWDRE KKEQVPA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="ATCC35101/DSM 1498/JR1".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCAGGCCGGC ACCTGCTCCT TCTTCTCCCG GTCCCAGTGG CGGTGCCGGG CGATGGCCGT CTTGAACTGC TCGACAAACG AGTTCACGTC CCCCTGGCTC CCACAGGTGA CGACCCCCAT  CTCGGAGACG GCCTCTCCTC CGGTTCCTGC ATCGACGAAG GTCACACCCT TGATATCCGA TGCCTTCAGG AGTTCGATCC CTTCTCCCAT CGCTCCGATC GGTTTGCAGT GCTTGAAGGC  CTCGTTGACG AAGTGGATCG CGAAGCCCTG GTTCTTCAGG GTCTCCGCGT GCCTCCCGCC CGGGACATAC ACGGCGTCGT ACACGACGGA GGTGGTGGTG ACGTAACTCT TGTCCACCTC  CATCTCTTTA CCATCGGCAG ACTTGACCAT GCCGCGGAAC TGCGAGACGA TCTGCGGGTG AGCGCCCGCA TCCTTGAGCG CCTTCTTCAC CTGCATCACC TCGTCGTGGT CGTAGCCCTC  CATAGCGAGG ATCGCGACCT TCCGGCTCTT GATGGTGTCC ATGACGGTCT TCTCCTGGCT GAGGTTCGGG GACTTCTTCG TGCCGGAGGA TGCGCCCTTC TCCGCCGGGG GCGGCACCCC  GATCCCTTCC GCGATCCGTA TCGCGAGATC GCCGTCGACG TTGTTGATGA GGTCCACCAC CCTTTTGCGG ACCCCGGAGT CCGAGACCTT CCCGAGCTCG AAGTGGAAGG CCTTGACGAT  ATGCTCCTTC TCCGCGTCCG ACATGCTGTT CCAGAAGAGC TTCGCCTGGC TGAAGTGGTC GTTGAACTTC TCGCTCCGTG CACGGATCTT CCTCCCCTCG ATCTTCTCCT GGTAGTGGGC  GTAGCCGCCC TCCTCCACCC GGGCCGGCCG GGGTTTGTTC TCGCCGAGCG CATTCGGGAA GTAACTCACG ACACCCTTAT CGATCGTCAT CCGGTTGTAG CCCTCCCGCT GGTTGTTCGC  GGCGGGCGCG AGCGTCCGGT TGATCGGGAT CTCCTGGAAG TTCGGGCCGC CGAGGCGTAT CAGCTGGGTA TCCAGGTACG AGAAGAGCCG GCCCTGGAGG AGCGGGTCGT TCGAGAAGTC  GATCCCCGGC ACGACGTTCG CCGGGCAGAA AGCGACCTGC TCGGTCTCGG CGAAGAAGTT GTCCGGGTTC CGGTTCAGAA TCATCTTCCC GATCCACCGG ATCGGCACCT CCTCCTCGGG  CCAGAGTTTC GTCGCGTCCA GAATATCGAA CTCGAAGTTG TGCTCGTCCG CCTCCTCGAT CATCTGCACC CCGAGCTCGA ACTCCGGGTA GTCTCCCATC TCGATCGCCT CCCAGAGGTC  GCGGCGGTTG AAGTCCGGGT CTTTCCCGGC GATCTTCTGC GTCTCGTCCC AGACGAGCGA GTGAACCCCG AGCTGCGGTC GCCAGTGGAA CTTGATGAAC CGCGCCTTCC CCTCGGCGTT  GATGAACCGG AAGGTGTTGA CCCCGAACCC CTCCATCATC CGGTAACTCC TCGGGAGCGC ACGGTCAGAG AGAACCCACA TGATCATGTG CGTGATCTCG GGCAGGTTCC CGACAAAGTC  CCAGAAGGTG TCGTGGGCGG CGGAGGCCTG CGGCATCTGG TGATGCTGCT CCGGTTTGAT GGCGTGAACG AGGTCGGGGA ACTTGATGGC GTCCACGATG AAGAAGACCG GCATGTTGTT  GCCGACGAGG TCGTAATTCC CCTCCTCCGT GTAGAACTTC GTCGCAAATC CCCGGACATC CCTGACCGTA TCGGCAGACC CGCGGAACCC GACGACCGTC GAGAACCGGA CGAAGACCGG  CGTTTTCTTT GCAGGGTCCT GGAGGAACGC CGCCCTCGTA TACTCGGTCA TCGGTTCGTA GACCTGAAAG TAGCCGTGAG CGCCCGAACC CCTGGCGTGG ACGACCCGCT CGGGGATCCG  CTCGTGGTCG AAATGCGTCA GTTTCTCGCG GAAGTGGAAA TCCTCAAGGA GCGTCGGCCC CCGCTCCCCC GCTTTTAACG AGTCGTCGGT ATGGCTTACC CGGACCGCCT GGTTCGTCGT 
CAGGTACTCC TGCTCCGGGT CCTGGCGGAA TTCGTCGAGC TGCTCCTGCT TGCTCTTCTC ATCTACCTTT CTCTTCTGAT CCAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TCAGGCCGGC ACCTGCTCCT TCTTCTCCCG GTCCCAGTGG CGGTGCCGGG CGATGGCCGT CTTGAACTGC TCGACAAACG AGTTCACGTC CCCCTGGCTC CCACAGGTGA CGACCCCCAT  CTCGGAGACG GCCTCTCCTC CGGTTCCTGC ATCGACGAAG GTCACACCCT TGATATCCGA TGCCTTCAGG AGTTCGATCC CTTCTCCCAT CGCTCCGATC GGTTTGCAGT GCTTGAAGGC  CTCGTTGACG AAGTGGATCG CGAAGCCCTG GTTCTTCAGG GTCTCCGCGT GCCTCCCGCC CGGGACATAC ACGGCGTCGT ACACGACGGA GGTGGTGGTG ACGTAACTCT TGTCCACCTC  CATCTCTTTA CCATCGGCAG ACTTGACCAT GCCGCGGAAC TGCGAGACGA TCTGCGGGTG AGCGCCCGCA TCCTTGAGCG CCTTCTTCAC CTGCATCACC TCGTCGTGGT CGTAGCCCTC  CATAGCGAGG ATCGCGACCT TCCGGCTCTT GATGGTGTCC ATGACGGTCT TCTCCTGGCT GAGGTTCGGG GACTTCTTCG TGCCGGAGGA TGCGCCCTTC TCCGCCGGGG GCGGCACCCC  GATCCCTTCC GCGATCCGTA TCGCGAGATC GCCGTCGACG TTGTTGATGA GGTCCACCAC CCTTTTGCGG ACCCCGGAGT CCGAGACCTT CCCGAGCTCG AAGTGGAAGG CCTTGACGAT  ATGCTCCTTC TCCGCGTCCG ACATGCTGTT CCAGAAGAGC TTCGCCTGGC TGAAGTGGTC GTTGAACTTC TCGCTCCGTG CACGGATCTT CCTCCCCTCG ATCTTCTCCT GGTAGTGGGC  GTAGCCGCCC TCCTCCACCC GGGCCGGCCG GGGTTTGTTC TCGCCGAGCG CATTCGGGAA GTAACTCACG ACACCCTTAT CGATCGTCAT CCGGTTGTAG CCCTCCCGCT GGTTGTTCGC  GGCGGGCGCG AGCGTCCGGT TGATCGGGAT CTCCTGGAAG TTCGGGCCGC CGAGGCGTAT CAGCTGGGTA TCCAGGTACG AGAAGAGCCG GCCCTGGAGG AGCGGGTCGT TCGAGAAGTC  GATCCCCGGC ACGACGTTCG CCGGGCAGAA AGCGACCTGC TCGGTCTCGG CGAAGAAGTT GTCCGGGTTC CGGTTCAGAA TCATCTTCCC GATCCACCGG ATCGGCACCT CCTCCTCGGG  CCAGAGTTTC GTCGCGTCCA GAATATCGAA CTCGAAGTTG TGCTCGTCCG CCTCCTCGAT CATCTGCACC CCGAGCTCGA ACTCCGGGTA GTCTCCCATC TCGATCGCCT CCCAGAGGTC  GCGGCGGTTG AAGTCCGGGT CTTTCCCGGC GATCTTCTGC GTCTCGTCCC AGACGAGCGA GTGAACCCCG AGCTGCGGTC GCCAGTGGAA CTTGATGAAC CGCGCCTTCC CCTCGGCGTT  GATGAACCGG AAGGTGTTGA CCCCGAACCC CTCCATCATC CGGTAACTCC TCGGGAGCGC ACGGTCAGAG AGAACCCACA TGATCATGTG CGTGATCTCG GGCAGGTTCC CGACAAAGTC  CCAGAAGGTG TCGTGGGCGG CGGAGGCCTG CGGCATCTGG TGATGCTGCT CCGGTTTGAT GGCGTGAACG AGGTCGGGGA ACTTGATGGC GTCCACGATG AAGAAGACCG GCATGTTGTT  GCCGACGAGG TCGTAATTCC CCTCCTCCGT GTAGAACTTC GTCGCAAATC CCCGGACATC CCTGACCGTA TCGGCAGACC CGCGGAACCC GACGACCGTC GAGAACCGGA CGAAGACCGG  CGTTTTCTTT GCAGGGTCCT GGAGGAACGC CGCCCTCGTA TACTCGGTCA TCGGTTCGTA GACCTGAAAG TAGCCGTGAG CGCCCGAACC CCTGGCGTGG ACGACCCGCT CGGGGATCCG  CTCGTGGTCG AAATGCGTCA GTTTCTCGCG GAAGTGGAAA TCCTCAAGGA GCGTCGGCCC CCGCTCCCCC GCTTTTAACG AGTCGTCGGT ATGGCTTACC CGGACCGCCT GGTTCGTCGT 
CAGGTACTCC TGCTCCGGGT CCTGGCGGAA TTCGTCGAGC TGCTCCTGCT TGCTCTTCTC ATCTACCTTT CTCTTCTGAT CCAT 

Retrieve as FASTA