Entry information : ZmDiOx01 (GRMZM2G312997 [6a])
Entry ID 6328
Creation 2008-08-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-01-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-07-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ZmDiOx01 (GRMZM2G312997 [6a])
Name (synonym) ZmDiOx01 (GRMZM2G312997 [6a])
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmDiOx01
start..stop
S start..stop
HvDiOx 1182 0 1..619 1..617
OsiDiOx 1175 0 1..619 1..618
OsDiOx01 1167 0 1..619 1..618
CclDiOx02 874 0 10..617 16..623
Literature and cross-references ZmDiOx01 (GRMZM2G312997 [6a])
Literature Wilson,R.K., Rajasekar,S. and Marchetto,P. The sequence of Zea mays bac clone CH201-479P18
DNA ref. GenBank:   CZ271848 [5' end]   AC190953.3 (31183..36978)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Zm.141864 [5' end]   Zm.13494 [3' end]
Protein sequence: ZmDiOx01 (GRMZM2G312997 [6a])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   619
PWM (Da):   %s   70258.87  
PI (pH):   %s   7.94
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSGLFKPCV HPDFRVVFSK MSFGDKIGFL FVHAFDKRNL WHKMPVLIGL LYLNTRRTLL EKYNLLAVGS SHGALIDPKD QFMYRTGDGK YNDPDNAEAG SQYTFFGRNM KPVDQEYELM  SPDPFVVATK LLARREYKDT GKQFNILAAA WIQFMVHDWM DHMEDTKQIE ITAPNEVANK CPLKSFKFYA TKELPTNSDG TIKTGYYNVR TAWWDGSAIY GNNDKKAEKL RTYVDGKLVI  GDDGLLLHEE NGVALLGDVR NSWVGVSILQ ALFVKEHNAV CDAIKEEHPN LSDEELYRYA RLVTSAVIAK VHTIDWTVEL LKTKTMRAGM RANWYGLLGK KIKDTFGHIG GPALGGLVGL  KKPINHGVPY SLTEEFTSVY RMHSLLPSTL KLRDPTGQPD ANNSPPYLKD VDIGELVGLK GEGQLSKIGF EMEILSMGYQ ACGALELWNY PSFFRDLIPQ NLDGTNRSDR IDLAALEVYR  DRERSVPRYN EFRRRLFLIP IKCWEDLTSD KDAIEAIRAI YGDDVEKLDL LVGLMAEKKI KGFAISETAF NIFILMASRR LEADRFFTSN FNEKTYTKKG MQWVKTTEGL RDVINRHYPE 
ISAKWMKSSS AFSVWDADY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, 9 introns) and 3 ESTs. First exon is not predicted by Phytozome (undetermined sequence).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCAG GTCTCTTCAA GCCTTGTGTT CATCCGGACT TCCGTGTTGT TTTCTCTAAG ATGTCTTTCG GTGACAAGAT TGGCTTTCTA GTACGTTTTA ATTAAGAGTA ATTTATATAT  CAAGTATTTA TCTGATGTAC ATACTGCATA AAATAAACAT ACATATTCCT TGAGAATATC AGGTAGTGGT TATATATATA TATATAnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnTATT  TCGTTCATGC ATTTGACAAG AGAAACCTGT GGCACAAGAT GCCTGTTCTG ATCGGTTTAC TGTACCTGAA CACCCGTCGG ACCCTCCTCG AAAAATACAA CCTGCTAGCT GTTGGGAGTT  CTCATGGTGC TCTGATTGAC CCCAAGGATC AGTTCATGTA CCGCACCGGA GATGGCAAGT ACAATGACCC CGATAATGCT GAGGCTGGTA GCCAATACAC ATTTTTTGGG AGAAACATGA  AGCCGGTTGA TCAAGAGTAT GAGGTACTTT TAATTTTCAT TCAAAATTCT AAGTTCTAAA AATACAAGTT AATAAATTAT CGTAATTTAA TTAAGCAATT ATTTCCCTTT GATTTTGGTA  ATTCTTGTTG TTGTGTGTGT GTAATATATA TAAATATATA TATATATATA TAAAAATATA AATATAATAT TTGCATGCTC TATATGTGCT CTTCTTATCT GCTGATTTCA ATTTGCATCC  CTATTATTTT GTTCAATATA AAATTAGATA CTACACATAT TGAATTTAGT TAATGAAAAA TAAACTTGAA ATTAAAGTGA AAGAAACCAA TTAAAGGAGT AAAGATCACC AAAAAAGTGT  GTGATTTTTA TTTTTTATAT AACATTTAGT TTGACACTTT GATTTCAAGA TTAATTAAAC TCTTTTGATG AAACTTTTTG TTTCGTAGTT CGTTCTCCAA TCTTCAGAAA TGTAAATGAA  TGAATTAACA TTGAAACAAA AAAAAAGATG CGAGTTTTGT CAATATATAA AAATAAGAGT TAATAATGTG TGTTTGTTCA TTTAAAAACA TGACCACTTC CTTTTTAATT AGATCGTACT  GTTAACAGAT GGAAAATTGA GGTATACTTT GAAATCATCA GATTATGCAT AAAATAATTA ACTGTTATTT ATCGATGTAG TTGATGAGCC CAGATCCATT TGTTGTGGCG ACAAAGCTGT  TAGCCAGGAG AGAATACAAG GACACAGGAA AACAGTTCAA TATACTAGCA GCTGCATGGA TACAGTTCAT GGTTCATGAC TGGATGGATC ATATGGAGGA TACCAAACAG GTGCATGCTT  GATTTAATTC CCTAATTTGA GAGCCATAAT TTTTTGAACT TAAAAATAGA TCTTCATCTT CCATTGAGAA TTTTAAATAT ACATTGCAGT TAAATGTAGC AAATTGGACA AGCGGGCCGG  GTTCGGGTTC AGGTTAGACA TGTTGGGTCA GTCTGACCTT CTAGAATATC ATGGGTCGAA TCGGATTGGG TTGCGGTGAT GGACGGGTCA GCTCAGACCA ATTTCTATAT CAACTTTTTT  GATCATAAGT TGATTTGAGT TGGATTGGGT CAGTTTTGGA TCAGGTCAGA TTAGGTCAAT TTAACTTTTT GGAAAATGTT AGGTCGGGTC GGATTTCGAG TCAAGTCGAG CAATTTTCTA  TCGGGCTCAT CCACATCTAA TAGTAGTTGA TATATAATTC GATTTCCTTG GTTTCTTCCA GATTGAAATC ACAGCTCCAA ACGAAGTGGC CAATAAGTGC CCACTCAAAT CATTCAAGTT  CTATGCCACA AAAGAACTGC CTACGAATTC TGATGGAACA ATAAAGACTG GTTACTACAA TGTCCGCACA GCTTGGTGGT GAGTAATGCT AAAATTTTCT CAAGTTAAGG TCATTGTCAT  AAATTTCTCT TAAGCGCAAA TAATGAATTA AAAAAAGATG ATTGATGAAT TTATATATAA ATCAATGCAC ATTTGCGCAT AAAATGTCAT AATTTTTTGC AATTTCTATG ATTATATATA  CTAAGGGACG GGAGTGCAAT ATATGGTAAT AATGATAAAA AGGCAGAAAA GCTCAGGACT TATGTTGATG GAAAACTAGT GATCGGAGAT GACGGTCTTC TTTTGCATGA GGAGAATGGT  GTGGCATTAT TGGGCGATGT CCGCAACAGT TGGGTTGGGG TTTCGATCTT ACAAGCTCTT TTTGTTAAGG AACACAATGC AGTGTGTGAT GCAATAAAGG TAAGAGAAGC ATCGCTATTA  TTATCTATTT ATTTAGTTTA TATGAAGAAT TTGATGTTCT TGATTTCTTT CCACCGTACC GATAAAGCTG TTTTTTATTA ATTACCAAGA CATTAATTTT TTATGCTAAA ATATGAAGAA  ACAATTACAA ATGTCCTTTT AATCTCAGGA AGAACATCCC AACCTATCAG ACGAAGAATT ATATCGATAT GCTAGATTGG TCACTTCTGC TGTCATTGCA AAGGTTCACA CTATTGATTG  GACTGTGGAG CTTCTCAAGA CTAAGACCAT GAGAGCTGGA ATGCGCGCAA ATTGGTGAGG ATATATTATC TCATTTTCTC ATATTTGTTG AAAGAAAACA ATTAACGCTG GTATTACTTT  TCCAAGTGGA AATTTTATTT ACATCTGCAA ATTCAAATAA ATTAATTAGT GAGATTGTGT ACAAATTTAC CTCATATTCT AATTCTTTTG TGAAGGTATG GTTTATTGGG TAAGAAAATA  AAAGATACAT TTGGTCACAT AGGAGGACCG GCATTAGGTG GGCTTGTGGG ATTGAAGAAG CCGATCAACC ATGGCGTACC TTATTCTTTG ACTGAAGAGT TTACTAGTGT TTACAGAATG  CACTCCCTAT TACCAAGCAC TCTTAAGCTC AGGGATCCGA CCGGCCAACC CGATGCAAAT AATTCCCCAC CGTACTTGAA AGAGTGAGTA GACAATTTAT ATATGTTTGA CATCCATTCC  TCTCATTTTT ATGTAGAATT AAATCACACA GAAAAGAGTG ATACAGATTA TAAAGAATTG AACAAAAAAA AGTTAAGACA TTATTCTATT AGATCTCGAC TTTTACATAA TGCATTACTC  AACCAGACTT TAGACACTGA ACTTGACACA ACAAACAGCT ACATTATTAT GTTTTTTAGC TTCTTAACTA TAGAATAAAA ATATAGCTAG AATGTATAAG TTTTCTGCTC GATTAGCACA  TTTTTAGTAT AACTAACATA AACACTGACT CAAATTCTTT CTTGTGTCGA AACATAGCGT CGATATTGGA GAGTTGGTTG GTCTCAAGGG GGAAGGACAA CTATCGAAAA TAGGCTTTGA  AATGGAAATA TTATCAATGG GATATCAAGC TTGTGGTGCA CTTGAACTAT GGAACTACCC AAGTTTCTTC AGGGACCTCA TACCACAAAA TTTGGATGGT ACCAATCGAT CTGACAGGAT  CGACCTTGCT GCCCTAGAAG GTATGAAATT TGGACCCAAT TTGTACCATA TCAGTAGAGG ATCATGATTT TGCACCATGT CAAATTGTTA CAAGGGTCCA CCAAGAATAC TCCAATGCAT  GAAAATATTT AAAATAACTC ATATATAGTG GCAACAAATT AAGCACTAGA ACAAATATGG TAACCTTAAA CTACTATGTT GAAATTTATC ACGACATACT TTTCAATTTT CAAGAATTCC  CAAACTATTA TTCTGTACTA ACTAGATTGA AAATACAAGG TTCCCTTACC AAGACATATA TCATGTTTGT ATCCTGTAAC CTTGGCACCA TCCTCTAATT AAGCAATCAC AACTACCATT  TATTTTAAAA ACAAGGACAT TGCTGCATAC TAGTATAAAT AACAATGTTA AGCAAAAATT GTACTCTTTA AGTTAAATAT AATAAAGATG ATTACTGTTT CTAATGCCTT TGATAATGAT  TACACTAAGG CCCTGTTTGG GAACAAAGTT TTTGAAAACC ACAGTTTTTG AAATACTATA CTATACTTTA GTTATGACAA TACCGTAGTT TATAATACCG CAGTTTTGAA AACTGAGGTC  CAGAGCTAAG TTTAGAATGC CTTAAAACAA CTATAGTATT TGCAATACTT CAGTTTTGAA AACAGAGATT TTACCCAGCT TGCCAAACAC CATTATGTAT ATAATACTGC AGTATTTGAG  AATACTGCAG TATTCTTTCA AAACTGCAGA AAAACTTTGT TCCCAAACAC CCCCTAAGAT TGATGTCATT TTATTTTCCT CCAAATTAAA GTATACAGAG ATAGGGAGAG AAGTGTACCG  AGGTACAATG AGTTCAGGAG AAGACTATTT CTGATTCCAA TAAAATGCTG GGAGGATCTG ACAAGTGACA AGGACGCAAT TGAAGCCATA AGAGCAATAT ATGGAGACGA TGTAGAGAAA  TTGGATCTTC TTGTTGGTCT TATGGCAGAG AAAAAAATCA AGGGGTTTGC CATAAGCGAA ACAGCATTCA ACATTTTCAT TTTAATGGCA TCGAGGTGAG ATTTAGTTTT AACTGATATT  TAGTGCTAGA CAAAGTACCA AATTTGATTT AAGCCCTCGC TAAATGTATT AGGCCACAAC TGAGAATGTG GCCCTAAGCT AATTTTGACT GATTCAAAAT TTACCCAAGC CAATTTTCAA  AAAGGCAAGA AAGCATAAGG TTGTGACCAT TTTGGGTACT TTAAGATATG AATATTAATT TATTAGTAGA TCCAGAATGT TACCAGCAAA AAGAAGTCAA ATGTGGAAGT ACTAGTTTGA  GATGATAACC ACTAAGTTAA GATATGAATA TTAATTTAAC ATCTCTATAA ACAGGAGACT GGAAGCAGAT CGATTTTTTA CAAGCAATTT CAATGAGAAA ACATACACAA AGAAGGGGAT 
GCAATGGGTC AAAACAACTG AAGGCCTACG GGATGTGATC AACCGGCACT ACCCTGAAAT CAGTGCCAAG TGGATGAAGT CCTCTAGTGC TTTCTCTGTG TGGGATGCAG ACTACTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCAG GTCTCTTCAA GCCTTGTGTT CATCCGGACT TCCGTGTTGT TTTCTCTAAG ATGTCTTTCG GTGACAAGAT TGGCTTTCTA TTCGTTCATG CATTTGACAA GAGAAACCTG  TGGCACAAGA TGCCTGTTCT GATCGGTTTA CTGTACCTGA ACACCCGTCG GACCCTCCTC GAAAAATACA ACCTGCTAGC TGTTGGGAGT TCTCATGGTG CTCTGATTGA CCCCAAGGAT  CAGTTCATGT ACCGCACCGG AGATGGCAAG TACAATGACC CCGATAATGC TGAGGCTGGT AGCCAATACA CATTTTTTGG GAGAAACATG AAGCCGGTTG ATCAAGAGTA TGAGTTGATG  AGCCCAGATC CATTTGTTGT GGCGACAAAG CTGTTAGCCA GGAGAGAATA CAAGGACACA GGAAAACAGT TCAATATACT AGCAGCTGCA TGGATACAGT TCATGGTTCA TGACTGGATG  GATCATATGG AGGATACCAA ACAGATTGAA ATCACAGCTC CAAACGAAGT GGCCAATAAG TGCCCACTCA AATCATTCAA GTTCTATGCC ACAAAAGAAC TGCCTACGAA TTCTGATGGA  ACAATAAAGA CTGGTTACTA CAATGTCCGC ACAGCTTGGT GGGACGGGAG TGCAATATAT GGTAATAATG ATAAAAAGGC AGAAAAGCTC AGGACTTATG TTGATGGAAA ACTAGTGATC  GGAGATGACG GTCTTCTTTT GCATGAGGAG AATGGTGTGG CATTATTGGG CGATGTCCGC AACAGTTGGG TTGGGGTTTC GATCTTACAA GCTCTTTTTG TTAAGGAACA CAATGCAGTG  TGTGATGCAA TAAAGGAAGA ACATCCCAAC CTATCAGACG AAGAATTATA TCGATATGCT AGATTGGTCA CTTCTGCTGT CATTGCAAAG GTTCACACTA TTGATTGGAC TGTGGAGCTT  CTCAAGACTA AGACCATGAG AGCTGGAATG CGCGCAAATT GGTATGGTTT ATTGGGTAAG AAAATAAAAG ATACATTTGG TCACATAGGA GGACCGGCAT TAGGTGGGCT TGTGGGATTG  AAGAAGCCGA TCAACCATGG CGTACCTTAT TCTTTGACTG AAGAGTTTAC TAGTGTTTAC AGAATGCACT CCCTATTACC AAGCACTCTT AAGCTCAGGG ATCCGACCGG CCAACCCGAT  GCAAATAATT CCCCACCGTA CTTGAAAGAC GTCGATATTG GAGAGTTGGT TGGTCTCAAG GGGGAAGGAC AACTATCGAA AATAGGCTTT GAAATGGAAA TATTATCAAT GGGATATCAA  GCTTGTGGTG CACTTGAACT ATGGAACTAC CCAAGTTTCT TCAGGGACCT CATACCACAA AATTTGGATG GTACCAATCG ATCTGACAGG ATCGACCTTG CTGCCCTAGA AGTATACAGA  GATAGGGAGA GAAGTGTACC GAGGTACAAT GAGTTCAGGA GAAGACTATT TCTGATTCCA ATAAAATGCT GGGAGGATCT GACAAGTGAC AAGGACGCAA TTGAAGCCAT AAGAGCAATA  TATGGAGACG ATGTAGAGAA ATTGGATCTT CTTGTTGGTC TTATGGCAGA GAAAAAAATC AAGGGGTTTG CCATAAGCGA AACAGCATTC AACATTTTCA TTTTAATGGC ATCGAGGAGA  CTGGAAGCAG ATCGATTTTT TACAAGCAAT TTCAATGAGA AAACATACAC AAAGAAGGGG ATGCAATGGG TCAAAACAAC TGAAGGCCTA CGGGATGTGA TCAACCGGCA CTACCCTGAA 
ATCAGTGCCA AGTGGATGAA GTCCTCTAGT GCTTTCTCTG TGTGGGATGC AGACTACTAG 

Retrieve as FASTA