Entry information : LePrx40 (Solyc01g015080.2.1[2.3])
Entry ID 638
Creation 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx40 (Solyc01g015080.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx40 (Solyc01g015080.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx40
start..stop
S start..stop
StPrx73 628 0 1..330 1..330
NtPrx30-1A 562 0 1..330 1..329
LePrx59 535 0 3..330 4..330
GrPrx41 478 1e-171 1..330 2..331
Literature and cross-references LePrx40 (Solyc01g015080.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
Cluster/Prediction ref. UniGene:   les.23836
Protein sequence: LePrx40 (Solyc01g015080.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331
PWM (Da):   %s   35815.89 Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   6.35
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRKPCNFTLY YPLFVTFMIM FVVVNSQLTT DFYAKTCPNV LKVVRKEVQN AIKNEMRMAA SLLRLHFHDC FVNGCDGSLL LDGNSTTSEK FAAGNINSAR GFEVIDNIKK AVEDACSGVV  SCADILAIAA RDAVLLSGGP TWKVRLGRRD GLVGNISGAN SGLPAPFHSR DTIISMFQDV GLNVTDVVSL SGAHTIGLAK CATFDNRLTN FNGSGEPDTT LDTALVTELQ NLCPSTSDGN 
NTAPLDRNST DLFDNHYFKN LINQRGLLES DQILFSSNDA IATTKTLVEI YSNSSSVFFS DFVNSMIKMG NISPLTGSNG EIRKNCRVIN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 1, 3 introns) and 15 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGAGGAAGCC ATGCAACTTT ACTTTGTATT ATCCTCTTTT TGTGACTTTC ATGATTATGT TTGTAGTCGT AAATTCACAA TTAACAACTG ATTTTTATGC AAAAACATGT CCAAATGTTC  TCAAAGTTGT TCGTAAAGAA GTTCAAAATG CTATCAAGAA TGAAATGAGA ATGGCGGCTT CATTGCTTCG TCTTCATTTT CATGATTGCT TTGTTAATGT GAGTTCTTAA GGTTCTCTTT  TATGAGCTTT ATATATGTTT TACTAAAGTA AATTAGTCTA GAGTAGCGAT AATCATTTTT TACGTGGAAA GGGATTTACT CCCTTAGTCT CATATGAAAC AAGCTTGATT TGACATAATG  TTTAGGAGAA AAAAAGAAGG ATTTTTAAAG TTTATGGTTT AAAATAAATT TAGATATTCG TGTGGCTATA AGTCATTTCA TTAATCTTAG ATATTTGTGA CCTGCACACT TCATACTCCA  TCCTTCCAAC AAAGAATAAC ATAGTTCGAT TGACACGAAG TTTAAGAAAA TAAAGTTATA GTTATGTCAA ATATATCAAA ATATTCTTTA ATCATGTAGC TTTAAAGATG ACACATAAAA  AGTTGAAATT AAAATGATGT CAAGAAGAAA AGAAGTCATT CTTTTTTTTA AAAAAAAACT ATAAGCAAAA GTAAATCATT CATTCTTTTT AAATAAAAAA TATATAATTT TCTATATATA  CCGTATAATT TTATGATAAT GGATTTTCTT CTGACCATCC TTCTAAATAT TAACTATATC TACTTGTAGG GTTGTGATGG ATCATTGTTA TTGGATGGCA ATAGCACCAC AAGTGAAAAG  TTTGCAGCAG GGAACATAAA TTCTGCTAGA GGTTTTGAAG TGATAGACAA TATTAAGAAA GCTGTTGAAG ATGCATGCAG TGGAGTTGTT TCTTGTGCTG ATATACTTGC TATTGCGGCT  AGAGACGCTG TCTTATTAGT ATGCTCCCTT TTATTTATTC ATTTCGTTCC AATTTCTATG CCTTAATTAC TTTCTTTTTT ATACAAATAT ATATTTATTT TCAATTTTTC ACTTGATATA  TTTAATATCA GATATTTTGA TACTTTCTAA GTCCTTTACA AAATAAGAAA GTCTTGTTTG ATTTTTTTTA AAAAATTTTA TGCCAAAGTT TAAGTCGAAG TCTAAATAAT AAAATTATTG  TGTTTTTATT TATATATAGA GTGGAGGACC AACATGGAAA GTGAGATTGG GAAGAAGGGA TGGATTAGTT GGTAATATAT CAGGAGCAAA TAGTGGACTT CCAGCTCCTT TTCACTCTCG  AGATACTATC ATTTCCATGT TCCAAGATGT TGGACTCAAT GTTACTGATG TTGTCAGCTT ATCAGGTAAT TAATATACTT TTCAAATTTA TTAAACTTAC ACAAATATCA CTAGTTTAGA  AGTTACTTAG ATATACTTTA ATTTTTAATG TTATACTCTC TTCGTTTAAA AAAATATCTT TATTTCCTTT AGTTTGTTTA AAAAGAATGA CTCTTTTTTT TTACTATACT TTAATATCAA  CTTTTCACGT GGCATGTTTA AGATCACAAG ATTAAAGGGT ATTTTGATAT ATTTGACATA ACTTTAATTT GGAACCACAA TATTAAAGTC TTCTTTTTTT TCTTAAATTT CGTTCCAAGT  TAAACCAGGT CATCTTTTTT TAAACGAAGG GAGTAAATTT TATCAGGTTT TAATGCAATA TTTAGATATG TTTAGATACA TGTATATCAA CATACATAAA TCACAATTAA ATGTAATAAT  ATGTTCTAGA TATATTGTAT CCAGTTGGAT TTGTATGTAT CTGAAAAACA TAAAAAAAAT TTGCTCTATT GCCATTAAAT ATCTCTTTTG TTGCAGTATA CTGACTGATC TTATGAATTT  ATAGGTGCTC ATACAATTGG TCTAGCAAAA TGTGCAACCT TTGACAACAG ACTAACAAAC TTCAATGGAT CAGGTGAACC AGATACAACA CTAGACACAG CCCTAGTGAC TGAACTCCAA  AACTTATGCC CTTCCACAAG TGATGGAAAC AACACAGCCC CACTTGACAG GAATTCAACT GACTTATTTG ACAATCACTA CTTCAAAAAC TTGATCAATC AAAGAGGACT TCTTGAATCT  GACCAAATAT TGTTTTCTAG TAATGATGCT ATAGCGACAA CTAAAACATT GGTTGAAATT TATAGTAATA GTTCAAGTGT ATTTTTTAGT GACTTTGTTA ATTCTATGAT TAAGATGGGA 
AATATTAGCC CTCTTACTGG ATCTAATGGG GAGATTAGAA AGAATTGTAG GGTAATTAAT TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAGC CATGCAACTT TACTTTGTAT TATCCTCTTT TTGTGACTTT CATGATTATG TTTGTAGTCG TAAATTCACA ATTAACAACT GATTTTTATG CAAAAACATG TCCAAATGTT  CTCAAAGTTG TTCGTAAAGA AGTTCAAAAT GCTATCAAGA ATGAAATGAG AATGGCGGCT TCATTGCTTC GTCTTCATTT TCATGATTGC TTTGTTAATG GTTGTGATGG ATCATTGTTA  TTGGATGGCA ATAGCACCAC AAGTGAAAAG TTTGCAGCAG GGAACATAAA TTCTGCTAGA GGTTTTGAAG TGATAGACAA TATTAAGAAA GCTGTTGAAG ATGCATGCAG TGGAGTTGTT  TCTTGTGCTG ATATACTTGC TATTGCGGCT AGAGACGCTG TCTTATTAAG TGGAGGACCA ACATGGAAAG TGAGATTGGG AAGAAGGGAT GGATTAGTTG GTAATATATC AGGAGCAAAT  AGTGGACTTC CAGCTCCTTT TCACTCTCGA GATACTATCA TTTCCATGTT CCAAGATGTT GGACTCAATG TTACTGATGT TGTCAGCTTA TCAGGTGCTC ATACAATTGG TCTAGCAAAA  TGTGCAACCT TTGACAACAG ACTAACAAAC TTCAATGGAT CAGGTGAACC AGATACAACA CTAGACACAG CCCTAGTGAC TGAACTCCAA AACTTATGCC CTTCCACAAG TGATGGAAAC  AACACAGCCC CACTTGACAG GAATTCAACT GACTTATTTG ACAATCACTA CTTCAAAAAC TTGATCAATC AAAGAGGACT TCTTGAATCT GACCAAATAT TGTTTTCTAG TAATGATGCT  ATAGCGACAA CTAAAACATT GGTTGAAATT TATAGTAATA GTTCAAGTGT ATTTTTTAGT GACTTTGTTA ATTCTATGAT TAAGATGGGA AATATTAGCC CTCTTACTGG ATCTAATGGG 
GAGATTAGAA AGAATTGTAG GGTAATTAAT TAG 

Retrieve as FASTA