Entry information : LePrx41 (Solyc04g081860.2.1[2.3])
Entry ID 639
Creation 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx41 (Solyc04g081860.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx41 (Solyc04g081860.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx016]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Germinating seeds
Radicles
Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx41
start..stop
S start..stop
LePrx98 501 0 1..313 1..317
MguPrx45 488 1e-175 3..314 9..320
SaPrx03 487 1e-175 6..314 7..319
HaPrx130 483 9e-174 5..314 14..323
Literature and cross-references LePrx41 (Solyc04g081860.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished
EST ref. GenBank:   AW219531.1 [5' end]   AW625257.1 [3' end]
Protein sequence: LePrx41 (Solyc04g081860.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   315 (295)
PWM (Da):   %s   34419.2 (32235.1)  
PI (pH):   %s   8.48 (8.56) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-314
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALQSVFVIT FVLFSCVNAL SSNYYDQTCP DAESTIRQVV KKAMSNDKTV PAALLRMHFH DCFVRGCDGS VLLNSTKNNQ AEKDGPPNIS LHSFYVIDVA KKQIENMCPG VVSCADILAL  AARDAVTLSG GPYWAVPKGR KDGRISIASE TRQLPGPNFN ISQLQQSFSQ RGLSLDDLVA LSGGHTLGFS HCSSFRNRIE NFDSKNDVDP SLDASFAANL KKICPVKNTT KNAGATMDTT 
TFLFDNAYYK LILQKKGLFS SDSTLLTNSR TKTLVLNFAN SQHEFFKAFA DSMIKMSSIS GSGQEIRHDC RFVN* 

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Remarks Complete sequence from genomic (chromo 4, 3 introns) and 1 EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTAC AAAGTGTTTT TGTAATTACT TTTGTGTTAT TTTCATGTGT AAATGCACTT AGCTCCAATT ACTATGATCA AACATGTCCA GATGCAGAAT CAACTATTAG ACAAGTTGTA  AAAAAAGCAA TGTCAAATGA TAAAACAGTT CCAGCTGCTC TTTTGAGGAT GCACTTTCAT GATTGTTTTG TCAGGGTACG TAAATTTAGT TTCTATTTCT ACATATAAAC ATAAATTTTA  AAATATTGTA ATTTATTAAT CGATATGTAG TTTAACCTAT GATAATATAT AATATTAGCT ATAATTTTAT TTGGTTATAA ATTACCGAGA TACTATATTA TGTCATCTAA TTAATCAGTA  GCTTTTAATT ATAGAGGAAA CAATGTGTTT AATTACTTAA AGGGCTAAAG AACTACCTTA GCCCATGAAT AAAACAAGTT AATATAATGT TAATTTATTT ACACGTAAAT CAATATATCA  AGATGAGCTT AAAATGAGCG ATATAATCAG GTTCATATGT GATCGATTAT ATATAATTGT ATAAATATCT TTTACCCTAT CAATCTTTTG AACGTGAAAC TTTCATGTTG TAATATTAGG  ACATAGTATA TGCTATATGG TTATTAATTA CTAACTAACT TATGGTATTT TTTTTCTCCT CAAATTTTTA TGAAGGGTTG TGATGGCTCT GTGCTGTTGA ATTCAACAAA AAACAACCAA  GCGGAGAAAG ATGGACCTCC AAATATTTCA TTACATTCTT TTTATGTTAT TGACGTTGCT AAGAAACAAA TTGAAAATAT GTGTCCTGGC GTTGTCTCTT GTGCTGATAT TTTAGCTCTT  GCAGCTAGAG ATGCTGTCAC TCTTGTGAGT TCTACTATAA CCTTTTAGAT TTTCGGCGTG TGAAATTTAC TAACTAGATT AATTTGAATT TGCATCATAG AAAATTATAT TTAGAACAAA  ATGAAGAAGA ATACGATGCT AAAATAATAC AACGTAACTA TTAGGGTTTT TTTGATAGTG TGCATGATAA TACCATCAAA TACGATGTTT TAATAATGTT GAAATTAGTT GTGTTTGATA  TTATCTTTTG TCGATTGTTT GATTAGTTGT ATTAATTGAT AGGGAGTTTA GAATAGAAAT AGTAACTCCA CCCACCATCG TATTATTAAT ATCATGATTT ACTATATTAA AAATAGTACT  AAATATAGTG TATAACTAAT ATATCTATAT CTAAGTTGAA AACACTGTCA AACAAGAGCT AATACATTAT TGTTTAATTT CTCTAACACC TTCTATCAAA AGAGAACTTA CTTTAAACAT  ATGTAGACAG TGCACAAATG CATTTTCTAT AATCATGGTA TTTTAGTCGG TTAGTTTTTG TGCACACCTC GACTAGTCAG GGGTATATGT TACCTCCCAC TGATATACGT AGTTTGTAAC  ATTACTTATC AAGGCTCGAA CAGATAAAAA AATATCATCT AATATTCTTA CCTTTGCTGG AATTTAAACT TGAATTTCGA TAATTCTCAA CCCATTTCAT TATTATAAAT AAATTTTATG  TTATTTTCTA GAGGTTATAT ATGAAAGACT AATGTTGAAA TTATTTTTTT TCAGTCTGGA GGGCCTTATT GGGCCGTACC AAAAGGTAGA AAAGATGGAA GAATTTCTAT AGCCAGTGAA  ACAAGACAAT TACCTGGCCC AAATTTTAAC ATCTCTCAAT TGCAACAAAG CTTCTCCCAA AGAGGCCTTT CTTTAGATGA TTTGGTTGCA CTTTCAGGTA TAATTTACGA ATTAATTTCA  CGTATAATTA CTGAACTTAT AATAAAATTA TCAAATTACT TTTTTCTAAC TTTTTTTTTT TTTTAATATT CAGGAGGACA CACTCTTGGA TTTTCTCATT GTTCATCATT CCGAAACAGA  ATAGAAAACT TCGATAGCAA AAACGACGTC GATCCATCAC TAGACGCATC GTTTGCAGCT AATTTAAAGA AAATATGCCC TGTTAAAAAC ACAACAAAAA ATGCAGGGGC TACTATGGAT  ACTACGACAT TTTTATTCGA TAACGCGTAT TATAAATTAA TATTGCAAAA GAAAGGTCTT TTTTCTTCTG ATTCAACTTT ACTCACAAAT TCAAGAACCA AAACACTTGT TTTAAATTTT 
GCCAATTCCC AACACGAGTT CTTTAAAGCT TTTGCTGATT CAATGATTAA GATGAGCAGT ATCAGCGGTT CTGGTCAAGA AATAAGGCAT GATTGTAGAT TTGTTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTAC AAAGTGTTTT TGTAATTACT TTTGTGTTAT TTTCATGTGT AAATGCACTT AGCTCCAATT ACTATGATCA AACATGTCCA GATGCAGAAT CAACTATTAG ACAAGTTGTA  AAAAAAGCAA TGTCAAATGA TAAAACAGTT CCAGCTGCTC TTTTGAGGAT GCACTTTCAT GATTGTTTTG TCAGGGGTTG TGATGGCTCT GTGCTGTTGA ATTCAACAAA AAACAACCAA  GCGGAGAAAG ATGGACCTCC AAATATTTCA TTACATTCTT TTTATGTTAT TGACGTTGCT AAGAAACAAA TTGAAAATAT GTGTCCTGGC GTTGTCTCTT GTGCTGATAT TTTAGCTCTT  GCAGCTAGAG ATGCTGTCAC TCTTTCTGGA GGGCCTTATT GGGCCGTACC AAAAGGTAGA AAAGATGGAA GAATTTCTAT AGCCAGTGAA ACAAGACAAT TACCTGGCCC AAATTTTAAC  ATCTCTCAAT TGCAACAAAG CTTCTCCCAA AGAGGCCTTT CTTTAGATGA TTTGGTTGCA CTTTCAGGAG GACACACTCT TGGATTTTCT CATTGTTCAT CATTCCGAAA CAGAATAGAA  AACTTCGATA GCAAAAACGA CGTCGATCCA TCACTAGACG CATCGTTTGC AGCTAATTTA AAGAAAATAT GCCCTGTTAA AAACACAACA AAAAATGCAG GGGCTACTAT GGATACTACG  ACATTTTTAT TCGATAACGC GTATTATAAA TTAATATTGC AAAAGAAAGG TCTTTTTTCT TCTGATTCAA CTTTACTCAC AAATTCAAGA ACCAAAACAC TTGTTTTAAA TTTTGCCAAT 
TCCCAACACG AGTTCTTTAA AGCTTTTGCT GATTCAATGA TTAAGATGAG CAGTATCAGC GGTTCTGGTC AAGAAATAAG GCATGATTGT AGATTTGTTA ATTGA 

Retrieve as FASTA