Entry information : GrPrx01 (Gorai.008G090200)
Entry ID 6414
Creation 2008-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-02-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GrPrx01 (Gorai.008G090200)
Name (synonym) GrPrx01 (Gorai.008G090200)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Whole seedlings
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx01
start..stop
S start..stop
GhPrx01 669 0 1..329 1..329
TcPrx17 533 0 14..325 13..323
GrPrx17 525 0 1..325 1..323
ThasPrx65 524 0 7..327 6..326
Literature and cross-references GrPrx01 (Gorai.008G090200)
Literature Udall,J.A., et al., A global assembly of cotton ESTs. Genome Res. 16 (3), 441-450 (2006).
DNA ref. Phytozome 12:   Chr08 (21319210..21320365)
EST ref. GenBank:   CO107914 [5' end]   CO088454 [3' end]
Protein sequence: GrPrx01 (Gorai.008G090200)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (310)
PWM (Da):   %s   36430.23 (34122.0)  
PI (pH):   %s   4.72 (4.65) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYRFPWVLLL VAAVNMAVAA EPLRPGFYSE TCPPAEFIVR DVMKKAMIRE PRSLASVMRL QFHDCFVNGC DGSLLLDDTA DMVGEKQALS NINSLRSFEV VDEIKEALED ACPSTVSCAD  ILVLAARDAV ALSGGPDWEV RLGRTDSLTA SQQDSDNIMP SPRADATSLI NLFAQFNLSV KDLVALSGSH SIGKARCFSI MFRLYNQSGS GKPDPAIEPE FREKLNQLCP LGVDENVTGP 
LDATPRVFDN QFFKDLVGGR GFLNSDQTLF TSRRTRPYVR VFSKDQDEFF KAFVEGMLKM GELQVEQPGE IRTNCRVVNG RPVDVLMSY* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 3 ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTTTTCTTA AATATTCATT ATTATTTTAA TGACATTTAT TTTTCGTATT TTTATATAAT CTTTAAATAA ATTTTTATAT AAAATGTTTT CTCTCACCCA AACTATGCAT ATAGATAATG  TCCTTGGTTG AGTTAATGTC GCAAGTCAAC TTAACAACAA CTCAAGATTG ATGACAACTG TGTGATAAAC AATGATGATG CGTATAATAT TCTTAATTTG AAATATTTAC GTATTTAAAT  TTTGTTTTAC TCGTAATTTA ATCTATTTTA TTTATTTTAA TATAATACAT ATTTAATGTG TTATTATTAA TTAGTTTTAA ATTATTTGTT TCATTATTTA TTATGCATTA TTTTTAAACA  CACCATTACA TATATATTGG TGAAAAGGAA AGATGAATTA CATCAAATGC ATAAAAGTAC CACTGACTTT ATCTTTTTGT AAAAATTCTA AGATTTCCTT AGGTTTCTCA TCAAAGACAT  GTAAGGTCGA TTTCCAATTC AAGCTATGTT TAGCAAGTCG ATCTGCCACC AAGTTCTTCT TTCTCGGTAT GTGATTAATC TTCCACTACC CTTCAGACCT CATGATACGT TGAGTCATTC  TAAGCACAAT AATTCCTAAA TCCTCCAATC TCAAATTGGT CAAGGCTTGG ACTACTTCAA AGTTATTAGT CTGGATTATG GCCCTTCTAT ATCATTTATT AAGTAAAATA AGGATCCCAT  CTAGAATACA CCGTTATATT TTAAATACAT TATTTATACA TATATACGCG TTTGATAGAA TTTCTAATAT ATAAAGAAAA GTCCCCTTTT GTTAAATTAT TGATGGGAAT AAATAAATTT  TTAACAATTT AAAATTAGTT ATCCATTATG GGTAAAAATA ATATATAATA TGTAAAAAAA ATAAAGTAAA TATTGTGGCC ATTCAAAAAA AAAAAAAGCT GCTAGGGGAA TATTTTTAGA  TTCTCCAAAA AATTATTATA TAAATCCTTA TAGCCGCTAT TAGAATAGTT GCTATCGAAT ATTTTAGATT TTCTAAAAGA ATATATTCAT ATATGGTAAT TATTTTAAAA AAAATTCCTT  AATATACTAA TTATATAACC ATAGTATGAC ATCGAAGTAT ATTATATCGA TTCTAATTCA ATTAAAAAGT TATTAGAAAC TTCTATTTAA ACAAAATAGT AGAGATATTA TTTGAAGTGA  ATTTTATTTT TCATGTAAAA TTTTTAAAAA AAAATATCTA TATATTATTG AATTTGAATT CAAAATATTA AAATTTTTAA TATCTTAATT TTATCAAAAT TATATTTCAT TGTTATATCA  ATTTTTTTAT AAAATTGTCA TAACCTATAT ATATTTATTT TGCTTACATA TTTACTTTAA CCCTTCATAT TAGCTCAATT TAGAACAAGG ACATTATGTT ATAGTTTTTT TTTTCTCATA  AAAATAAGGT ATTTGATATA TAACTTGTGC AGCTTTTACA TTTCACAATA ATAATTAAAA GTGTAATTTT TCTGTCTACT GGTAGAGGAG TAGAAAAAGC TCCATAAGTA TGTCTAGATT  GATGTCATTT TATCATCTTG GAATTTTTTT ACTCCACTAA CCTAGGATAA TTATTCTAAT TAAAAATGCA ACCAAAGTTT ATAATTTGAT ACATAAAACT TTGATTGTGA TTCAAATAGA  TATGTAAAAC TTTTTTAATT TTATTTAATT ATACATATTT TAAAATATAA ATTTATCAAA AATATTTTTA TATTAAATAA ATATAATCAT TGCATATATA AAGTAAAATT AAATCAAAAT  TTATTTATAA AATTACAAAA TTAATATATA ATTTTGAGAT TTATACTTAT ATATTTATAT TTTCCTACCC CTGTTAAGAA TTCATCTAAA AAAGTTCAAA AGTTAAGACC CAGATGACCA 
TTCAAGAAAA AAAAGCCTGA ATTGGTGTAT TTCAAATCCC CCCCGCCCCC CAATCCACCA TTGTTGTGTT CCCCCAAACG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCGGT TTCCTTGGGT GTTGCTTCTG GTAGCAGCAG TGAACATGGC CGTTGCTGCA GAGCCTCTCC GGCCAGGGTT TTACTCTGAA ACATGTCCGC CGGCAGAATT CATCGTCAGA  GATGTGATGA AGAAAGCAAT GATTAGGGAA CCAAGAAGCC TTGCTTCTGT TATGCGCCTT CAATTCCATG ATTGCTTTGT TAATGTATTA TACAAGTCTG TTCAATTCCA TGATTACTTC  GTTCATGAGT TTTTGCTTAA GCCTGCTTTT GTTTTGATTC AGGGCTGTGA TGGTTCGTTA CTCTTAGATG ATACAGCAGA CATGGTTGGG GAAAAGCAAG CTCTTTCAAA TATAAATTCG  CTACGATCTT TTGAAGTTGT GGATGAAATC AAGGAAGCCT TGGAAGATGC TTGCCCGTCA ACTGTTTCTT GTGCAGATAT CTTAGTCTTA GCCGCCAGAG ATGCTGTTGC TCTGGTACTA  ATAAGAAATA ACCCTTTCTT TATTTCTTCG TCACTTTTTT GATAGAATTT AAGTTCAGCT TTTTTGGTTT GTAATTTATC AGAGTGGAGG ACCCGATTGG GAAGTGAGAT TGGGAAGAAC  AGATAGCTTA ACAGCCAGTC AACAAGACTC CGACAATATA ATGCCAAGCC CAAGAGCGGA TGCAACTTCT TTGATCAATC TTTTCGCCCA ATTCAATCTA TCAGTGAAGG ACCTTGTAGC  CCTTTCTGGG TCACACTCCA TAGGCAAAGC TAGGTGTTTC TCCATCATGT TCAGGCTCTA CAACCAATCT GGGTCCGGCA AACCTGACCC TGCCATCGAA CCAGAGTTCA GAGAAAAGCT  AAACCAGCTT TGCCCACTTG GTGTAGATGA AAACGTGACG GGACCCCTGG ATGCAACCCC TAGAGTGTTT GATAACCAGT TCTTCAAAGA CTTGGTGGGT GGAAGAGGGT TTCTGAATTC  GGATCAAACC CTTTTCACGT CTCGTCGGAC TAGGCCATAT GTAAGGGTTT TTAGCAAAGA CCAAGATGAA TTTTTTAAGG CATTTGTAGA GGGGATGTTG AAGATGGGGG AGTTGCAGGT 
TGAGCAGCCT GGTGAGATAC GAACCAATTG CAGGGTGGTC AATGGTAGAC CTGTGGATGT ATTAATGTCA TATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATCGGT TTCCTTGGGT GTTGCTTCTG GTAGCAGCAG TGAACATGGC CGTTGCTGCA GAGCCTCTCC GGCCAGGGTT TTACTCTGAA ACATGTCCGC CGGCAGAATT CATCGTCAGA  GATGTGATGA AGAAAGCAAT GATTAGGGAA CCAAGAAGCC TTGCTTCTGT TATGCGCCTT CAATTCCATG ATTGCTTTGT TAATGGCTGT GATGGTTCGT TACTCTTAGA TGATACAGCA  GACATGGTTG GGGAAAAGCA AGCTCTTTCA AATATAAATT CGCTACGATC TTTTGAAGTT GTGGATGAAA TCAAGGAAGC CTTGGAAGAT GCTTGCCCGT CAACTGTTTC TTGTGCAGAT  ATCTTAGTCT TAGCCGCCAG AGATGCTGTT GCTCTGAGTG GAGGACCCGA TTGGGAAGTG AGATTGGGAA GAACAGATAG CTTAACAGCC AGTCAACAAG ACTCCGACAA TATAATGCCA  AGCCCAAGAG CGGATGCAAC TTCTTTGATC AATCTTTTCG CCCAATTCAA TCTATCAGTG AAGGACCTTG TAGCCCTTTC TGGGTCACAC TCCATAGGCA AAGCTAGGTG TTTCTCCATC  ATGTTCAGGC TCTACAACCA ATCTGGGTCC GGCAAACCTG ACCCTGCCAT CGAACCAGAG TTCAGAGAAA AGCTAAACCA GCTTTGCCCA CTTGGTGTAG ATGAAAACGT GACGGGACCC  CTGGATGCAA CCCCTAGAGT GTTTGATAAC CAGTTCTTCA AAGACTTGGT GGGTGGAAGA GGGTTTCTGA ATTCGGATCA AACCCTTTTC ACGTCTCGTC GGACTAGGCC ATATGTAAGG  GTTTTTAGCA AAGACCAAGA TGAATTTTTT AAGGCATTTG TAGAGGGGAT GTTGAAGATG GGGGAGTTGC AGGTTGAGCA GCCTGGTGAG ATACGAACCA ATTGCAGGGT GGTCAATGGT 
AGACCTGTGG ATGTATTAAT GTCATATTGA 

Retrieve as FASTA