Entry information : GmRboh06 (GmRboh4 / Glyma05g37330)
Entry ID 6445
Creation 2008-12-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2008-12-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh06 (GmRboh4 / Glyma05g37330)
Name (synonym) GmRboh06 (GmRboh4 / Glyma05g37330)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Seed pods
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh06
start..stop
S start..stop
GmRboh12 1855 0 1..941 1..941
MtRboh05 1735 0 1..941 1..944
GmRboh01 1654 0 1..941 1..927
CsRboh01 1647 0 1..941 1..946
Literature and cross-references GmRboh06 (GmRboh4 / Glyma05g37330)
Literature Umezawa,T., et al., Sequencing and Analysis of Approximately 40 000 Soybean cDNA Clones from a Full-Length-Enriched cDNA Library. DNA Res., doi:10.1093/dnares/dsn024 (2008) In press.
DNA ref. GenBank:   ACUP01003251.1 (14943..7325)
mRNA ref. GenBank:   AK245705
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.45253
Protein sequence: GmRboh06 (GmRboh4 / Glyma05g37330)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   941
PWM (Da):   %s   106447.35 Transmb domain:   %s   o375-397i511-533o560-582i738-755o
PI (pH):   %s   9.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNGIPRHERR WASDSVPGKA TVSAGTSPGT ESNSAAEEFV EVTLDLQDDD TIVLRSVEPA SVINIDDSVA GSGNQTPASV SRSPTIRRSS SRGFRQFSQE LKAEAVAKAR QFSQELRRFS  WSHGHASRAL SSSSAPNGAG AGFETALAAR ALRKQRAQLD RTRSGVHKAL RGLKFISNRS NGVDAWNEVQ SNFDKLATDG FLKRTDFAQC IGMKDSKEFA LELFDALSRK RRLRAEKISR  EELFEFWSQI TDQSFDSRLQ IFFDMVDKNE DGRITEVEVK EIIMLSASAN RLSRLKEQAE EYAALIMEEL DPEGLGYIEL WQLETLLLQK DTYLNYSQAL SYTSQALSQN LQGLRKKSPI  RRMSRRLVYY LQENWRRLWV LTLWVCIMIG LFTWKFIQYK RKDAFQIMGY CLLAAKGAAE TLKFNMALIL LPVCRNTITW LRSTKLGYSV PFDDNINFHK TIAGAIVIGI ILHAGDHLAC  DFPRLVSTSE ESYEKYLKGV FGDRKPSYVD LVKGVEGVTG VLMVVLMIIA FTLATKWFRR NLIKLPKPFS RLTGFNAFWY SHHLFVIVYV LLIIHGIKLY LVHKWYLKTT WMYVAVPVLL  YASERILRLF RSGLYTVRLG KVAIYPGNVL TLQMSKPPQF RYKSGQYMFV QCPAVSPFEW HPFSITSAPG DDYLSVHIRQ LGDWTQELKR VFSEACEPPV SGKSGLLRAD ETTKKSLPKL  KIDGPYGAPA QDYKKYDVLL LVGLGIGATP FISILKDLLI NIIKMEEMAD SISDISRGSD HSVGSTTDLP SISKIAPKRK KTLKTTNAYF YWVTREQGSF DWFKGVMNEV AELDQRGVIE 
MHNYLTSVYE EGDARSALIT MVQALNHAKN GVDIVSGTRV RTHFARPNWK KVFSKMCSKH CNGRIGVFYC GAPVLAKELS KLCFEFNEKG PTKFEFHKEH F 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 13 introns), cDNA and 4 ESTs. Cultivar="Nourin No.2", "L82-2024". Position chromo Gm05 40929842..40938452.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGGTA TTCCGAGACA CGAGCGCCGA TGGGCGTCCG ACAGCGTTCC GGGAAAAGCG ACCGTCAGCG CCGGAACTTC GCCGGGAACT GAGTCCAACT CCGCCGCGGA GGAGTTTGTG  GAGGTGACTC TCGATCTTCA AGACGATGAC ACCATCGTTC TCCGGAGCGT CGAGCCAGCC TCCGTCATTA ACATCGACGA CAGCGTCGCA GGCAGCGGAA ACCAAACTCC GGCGTCGGTT  TCGAGGTCTC CGACGATCCG TCGGAGCTCG TCGAGAGGAT TCCGGCAGTT CTCGCAGGAG CTGAAAGCCG AGGCGGTTGC GAAGGCCAGG CAGTTCTCGC AGGAGCTGCG GCGGTTCTCT  TGGAGCCACG GCCACGCTTC GCGCGCGCTT TCGTCTTCCT CTGCTCCGAA CGGCGCCGGT GCCGGATTCG AAACGGCGTT GGCGGCTCGT GCTCTCAGGA AACAACGAGC TCAACTTGAT  CGCACACGCT CCGGCGCGCA CAAAGCGCTT CGCGGTCTAA AATTTATCAG CAACAGATCC AATGGCGTTG ATGCGTGGAA CGAGGTGCAG AGCAACTTCG ATAAGCTAGC TACGGACGGT  TTTCTCAAGC GCACCGATTT CGCTCAATGC ATCGGTACGT TTCTTTTTCA AATCTCGCGT TGTTCGTTTA AATCATTTGA TTCTTATCCT ATAGTGCTTG CTTTTCCCTC CCTGTTTCAT  TGCATTGAAT TTTCAATAAC TGTTTAGATG TTTCATCTTT GTATTTATAC TCTTTCTTCT GCTTGCTACT GTTTTTTTTT TTTTGTTAGC TTAAAGAGTG TTGTATTTGA ATTTTTATTT  ATTGTGAAGG TATGAAGGAT TCGAAGGAAT TCGCTCTTGA ACTGTTTGAT GCTCTGAGTC GTAAACGAAG GTTGAGAGCT GAGAAGATCA GCAGGGAAGA ACTGTTCGAA TTCTGGTCGC  AAATTACCGA TCAAAGTTTT GATTCGCGGC TCCAGATCTT CTTCGACATG TAATTATTCG GTCATTATTG TTGTTATCGG TGCTCAATTT AATTAGTGAT AAATAATTTT CCTCAGTTTA  CTTTTTGTTC TTTAATTAAG TCCGCAACAG CTAATGACAA ATTAAACACA GCATTGTTAA ATGTCACCGT ATATTTACTT TAGTATTTAA ATGTCCGTCA AAGCATTGAT GTTTTCTTTG  CTTGTAAGTT GTGATGCAAT TATTATCATT ACGTGCTTTT GTATTTTAAA ATAAATCATA ATCATCTTCA CAGGGTTGAC AAGAACGAAG ATGGGAGAAT CACTGAAGTA GAAGTGAAAG  AGGTATAGAA GACTTTAATT TTATATTCCA AAATCCAAAC CGAAACTATC TCTCTTATGT TTGTATGCAC AACTGAATTT AAATTTTAAT ACTCATTTTT TAATTATTGT GTTATTCTTT  TTCATATTAT GGACGTAATA CGTTGCTTAC ATGGTGTCCA CTTGAGGTTT AATAAATCAA CATTAGGCTG GATTGGTTGA GCTTAATTTA ATGCCTACTA AATTAACTGC TTCCAATATT  CAACGTTCCC ACGTATAACG TTTCCCATTT TCTAGAACGT AATATTAATT AGTTGGTGTA TATTCAAGAG TTAGTGAACT ATGTCTTACT TTTTCGGCTT TTGTCATACA TATAGCGCTT  TCATTTTTCT GATTTTACCA AATTCTTGGA ATGTATAATG AAGACGTTTT CAGTGGAGTT GGTGGGGGTG TAGTCGTCAT TTTAAGCCAA AGTTTTTCTT TTGTTCCTAA TATAGTTGTT  TTCTTACACG TAATGTTTAG TCAAAATTAA AAAGTTTTTA CATTAAATTT GTTATTAGCC AATTCATGTT TCATTTATTG ATTACAGATC ATCATGTTAA GCGCTTCTGC AAATAGGTTG  TCCAGATTGA AGGAACAGGC CGAAGAATAT GCAGCTCTAA TCATGGAAGA GTTGGACCCC GAAGGACTTG GCTACATCGA GGTTGGAAAT CTTTTTATAT TTCATTATAG ATTCTGAATT  TATCAACACA TGCATACATA TAGTCAAAAT AATGTGCTCA TATTATTATT TTTTCATTAA AAAAAACATA CAAATGATTA ATGAGTTGCG TGGTGAAAGG GTGCATCGCT CCGGTTAAGT  ACATAAGAAA AATAATGGTA TGCAATGCTC TTACAATATT ATTAGGACTT GGTTTGTGGT TGACTTGAAA TATAAAATAA TTTTTCTTTT CCTTGAAATA TGAGGTTTTC TTGGCACATT  AAGGGAACAA TTGTTCTCGT AATTCCAAAT ATAAAAGAAT TTATGTGTTG TTTTTATTTT TTTATAAATC TTTATAAATA TAAAATATAG AAATAATATG ATAATTTTTT GTATTTATCG  GTATAAGAAG AAAATCAAAT CTCTAATTCA ACAACACTTA ATTTTTACAG CAAAATTATT TAACAAATAC TGAAGAGTAT CTTTAAAAAA TATTAAATAA AAATCATTTT TAAGTTAATA  ATTAATTAAA TACAATGTTT TTTTTTAATT TTTAACAAAT ACTTTTAAAC ATTAATTAGT TGACGATGCT TGTTTGTTTA GTTAGGTTTG TGTACATTAA TTTAGTCAGT GTTGAACTAG  GGTCGCACTT ATCTTCACTA GATGGGCCAA TTTGTGAATT GAGCAACCAT CCAGCATTTC CTAGTGTAGT TCAGCGTGAA GAAGGGTAAA AAGAAAAAGA AAGACAAATT AGGCATATTA  AAACTTATAA GTAAAAACTT GCTGAATTTA AAAAATGATT TGATATATAC TAACAACATC ATTACATTAA ACAGGTAAAA AGAATATATT ATTAGTAATA GACTGATAGG GTGCACTACA  TCAACATGCA ATCTTATTTC TTCATTCTTT TGCCGTGTCA ACAAATTTAA CAGTATTACA AATTTTTCCT CTAAAAAGAA AATTTTTAAC AGTAAAATCA ATTAGAGGCT CAGACCACTT  TGTCCCTAGG TACGTAATAT AATAATTAAG CTGTTATTTC TAATAACTCA GTTCATGCAG TGCAGCAGTG CTGGTTAATA CAAATAATTA TAGTGACCTC ATTATTTCTT TGACCAATAA  GACATTTTTT CCCCAGAAGA TATTCATTAT AATTTTGAGT AGCACTGGTT TTTTGTCTTT GGGAATGTCT TCAGAGGTAC AAGTTAATGT GGAAAAATCC AAAGAGCTAA AGATGGAATT  TTAGTTATTG CATGCTGATC CTGGCTAGAG TATTCTTCAC GTATTTCCAC TTAAATATCT ATCTCATAAT AATTTTTATA ACAAAGGCAA AGATTAGGAA CAGAAGAGAT ACAAATGTAA  AATGAAATAA GTGATATAAT GGAGAGAGAT AAAAAGTAAA AAAAATGTTG TGAAAATGTT TTTTGTGGGA AGAGTATTAT TCTTGTTATT TACAAAAAAA AAAGAGTATT ATTTTTGTTC  ATAGAGTAAT TTCATTTTTC AATATTCCTT TCTCAGTTGT GAACTTAGAA ACGTGTTTTG GGAGGTAAAT AAAAAAAGGA TCAATGATAT TAGCCTTTTG CTAATTTATA TCGTGGGCGA  AAGAGCGGAG AGGGAAGAGG GGTTATCTCG ATGACCAACA GCATTATTGA CACTGTGAAT TCATATTCCT GTTGATGAGT GTTTTTTCTG AGGTACACGT TTCATCATGC TTCAGTTGCC  AAGTGCCCTT TCTGCTTCTT CGCCAGTTAG GCGTACACCT TATTGAACAC GTATATATGC ACGCGTGATG CATTCTGTTG CTCTTGTAAT GCTCATAATA ATATATATAG TAGACATGCT  GAAATATCTT TTGCATGATT CAACATCTGA TATATAGTTT TGCGGCATTT TGGATGGCCA TTATGTCATC GCAGCTATGG CAATTGGAGA CGCTTCTTTT ACAAAAGGAC ACGTACCTCA  ACTACAGCCA AGCTCTAAGC TACACAAGCC AAGCTTTGAG CCAGAACCTA CAGGGGCTGA GGAAAAAAAG TCCTATACGT AGAATGAGCC GCAGATTGGT GTACTATTTG CAAGAGAATT  GGAGGAGACT TTGGGTTTTG ACACTGTGGG TTTGCATAAT GATTGGGCTG TTCACGTGGA AGTTTATTCA GTACAAGCGG AAAGATGCAT TTCAGATCAT GGGTTACTGT CTTCTCGCGG  CTAAAGGTGC GGCTGAGACT CTAAAGTTCA ACATGGCACT TATACTCCTG CCCGTGTGCA GAAACACCAT AACTTGGCTC AGGTCGACCA AGCTGGGCTA TTCTGTACCT TTTGATGACA  ACATCAACTT TCATAAGGTA CGCACTAAGG CCACCAGGGA ACTTTTTAAG CATTGACTAT TTATTTACAG AATAGCGAGC GCCACCAGTA ACTGTATTTC GAATTCATTT TTTGGTCCTC  AACATCGTGA TATCATATTT GTTCTTTTTT TCCTGTTTGT AAATTTAAAA CGTGTAATGC TCGGTGGTAA AATTAATGTT TTTCATTACT ATTTTCTAAC TATCATAAAA CATGGAGCCC  ACACATAAAT AAAATACTTA AGTTACACCA AAGAGTTATT CTTTATTATC ATCCTTCATT TTACTTATTG CTTCTTACAG ACAATTGCTG GGGCCATCGT TATTGGTATT ATACTTCATG  CCGGGGATCA CCTTGCTTGT GATTTTCCAA GACTTGTAAG TACGTCTGAA GAAAGTTATG AAAAGTATTT GAAAGGCGTA TTTGGTGATC GTAAACCCAG TTATGTAGAC CTAGTTAAAG  GCGTCGAGGG TGTGACTGGA GTTTTGATGG TGGTTCTTAT GATAATAGCA TTTACACTTG CTACCAAATG GTTCCGGAGA AATCTCATTA AGCTGCCTAA ACCATTTAGT AGGCTCACTG  GCTTCAATGC CTTCTGGTAT TCACACCATT TGTTTGTCAT TGTCTATGTC CTCCTAATCA TCCACGGAAT AAAGCTTTAC CTCGTGCATA AATGGTACCT CAAAACGGTA TATAATTTTT  AGTATCATAT TTCAATTATT TAGGATATCT ATCAATGCTT TGTTTACCGG TGATGATTAG TTACTTACGC GTGCATTGGT TTCCGTTTTC AGACATGGAT GTATGTTGCG GTTCCAGTTT  TACTTTATGC GTCAGAGAGA ATACTCAGAT TATTTCGTTC TGGTTTGTAT ACAGTCCGTC TTGGAAAGGT GAGCAGATTA AGTGAACCGA TCAGAGTTAG GCTCCAAATT AGTTTTCAAC  TTAAAAAATA TCCTTGTATT ACTTGTCTTG ACTACTCTTA AGTAAAATAG GCCTGGGCTA ATTGTGAGCA TTCAGATCCA GACATAAGAA TCATAAAAAG TAAACTAAAA ACTGCGAGGA  CTGTTTCAAA AACCTCAAAA GCGACACTTG ATTCAATCAC TTCTTATGAA TTGTAGTCAT TTAATTTGAA CAGTATGTTA ACATCTTTTT TTAAATATGG AATATATTTA GGTTGCCATA  TATCCTGGAA ATGTTCTCAC ATTGCAAATG TCGAAGCCTC CTCAATTTCG CTACAAGAGT GGACAATACA TGTTTGTGCA GTGTCCTGCC GTTTCTCCGT TCGAGTGGTA AGTTGCATTT  TAATTTTTAA CATAAATATG TTGCATGTTG CGGTGTTACA ATATACATTT TGCTTGATTC ACTGTTTGGA AGTTTTTAGT ATGGATTTAA TTGAAAGAAA TATGGAAAAA CGATATGAAA  TTAGGAAAAA TTAACCACCC TCCGCATTTT TTAGTATCCA TAAAACAAAG ATCGAAAGTT TAGTACCCCT CATGCTCAGG CATATTGAAC AAGAAAAGAA GGGGAAAGTG AAGTGTTATC  GCATCTTATG AACAATTAGG AGTCTCGATT TTGTTTCAGA GTGAAACTTG TGTCATCTTT GCTCAATTAG TATCGGTATC TGACAGTAAC ATGGGCCATT ATATACGTAA CAGGCATCCG  TTCTCTATTA CCTCAGCCCC TGGCGATGAC TACCTGAGTG TTCACATTCG GCAACTGGGT GATTGGACAC AGGAACTTAA AAGAGTGTTC TCTGAGGCCT GTGAGCCTCC TGTGTCAGGG  AAGAGTGGGC TTCTCAGGGC TGATGAAACC ACTAAGAAAA GGTACATCTT GCGCTTGCCA TATCTTTTTA GCCTTCTAAT TTTGGTCCTT GGAGAGTAGG GAAGAATAGT TTATACTGAA  TTCCCCGCTT ACTTATTGTT AACCAATGAT AACAGTTTGC CGAAGTTAAA GATAGATGGA CCTTACGGTG CGCCAGCACA AGATTATAAA AAATATGATG TTTTGTTACT TGTCGGTCTC  GGGATAGGAG CAACACCTTT CATCAGCATT CTAAAAGATC TTCTCATCAA CATCATCAAA ATGGAGGAAA TGGCGGTGAG TTCCTGCGCA GCGTAGTATT AATTAATGAA CACGCATATA  ACAAAGTCAT ATTCATGTTA ATATGCTATA TATAGCTTAA TTATGATGTT GAATTGCTGA TCATTATTTG AACATCTGTA TGTATGTAAA TTCAGTGCGA CAAAATATAT TAATCAGGGT  TACTTCTATT CAGGATTCAA TCTCTGATAT AAGTAGAGGT TCAGACCATA GTGTTGGGAG TACTACTGAT TTACCATCAA TTAGTAAAAT TGCGCCAAAA CGGAAGAAAA CACTGAAGAC  TACCAACGCT TATTTCTACT GGGTTACAAG AGAGCAAGGC TCTTTTGATT GGTTCAAAGG AGTCATGAAT GAAGTGGCAG AGCTTGATCA AAGGGTAATT ATTTATTGCA GAAGATTTGT  TTATCTTATT GATTCTTCCT CCTGAAGGAT ATTTAGTATT CCTTTTCCCT GCTGCAAGAT GAATAAGAAT TATTTGCAAT GGCTAATGTT GAACATCAAA TTATGGACTT CAGGGTGTCA  TTGAGATGCA CAACTACTTG ACTAGCGTAT ACGAAGAAGG GGATGCCAGA TCCGCTCTCA TCACCATGGT GCAAGCACTC AACCATGCCA AAAATGGAGT TGACATTGTT TCTGGCACTA  GAGTAAGCAT TCATGTTTTG TTATTTTTAT GTATCATACA CTATGGTTTG CACCATTTTA ATGCCTAAGT CGGGAGTGAG AAAATTTAAA ACCTCGCTTG CTTCTTTGAA TTTCTACTAC  CAGGTGCGAA CTCATTTTGC TAGGCCTAAC TGGAAGAAGG TTTTCTCTAA AATGTGCTCC AAGCACTGTA ATGGACGAAT AGGTCAGTTG ATCTCCATCA AGCATATTGT GGTAGTCATT  AGAAATTTTT TGCTTTTTTA TAATGTCATT ATTTGAACAT CTCAGGTAAA TCTTTGACAC TGTATGCAAT TTTATTTCTC TCTCACTTTT TTTATATTCT TTTATAATGC GTATCTCAAA  AATATTCTTT CATTCTTATT TTCTTTGTTT CCCTTTTACT GACATTATGG TTATCATGGG TCGGCTCAGG GGTATTTTAT TGTGGTGCAC CAGTTTTGGC CAAAGAACTT AGCAAGCTCT 
GCTTCGAGTT CAATGAAAAG GGTCCAACAA AATTTGAGTT CCACAAGGAG CATTTCTAA 

Retrieve as FASTA