Entry information : LePrx57 (Solyc02g085930.2.1[2.3])
Entry ID 655
Creation 2005-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx57 (Solyc02g085930.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx57 (Solyc02g085930.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx024]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Crown gall
Inducers Agrobacterium tumefaciens infection
Pathogen interaction
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx57
start..stop
S start..stop
RcPrx72 370 2e-128 41..348 27..349
PpePrx50 361 6e-125 41..348 11..342
MtPrx82 360 9e-124 41..352 60..388
VvPrx90 358 2e-123 41..352 48..374
Literature and cross-references LePrx57 (Solyc02g085930.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx57 (Solyc02g085930.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   353 (327)
PWM (Da):   %s   39018.37 (36248.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   5.65 (5.43) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-352
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MFSRNCVLLA VFSFLVICPV TTVAAQPEVD PGSASGFPFQ LRYNYYDEKC EDLEGIVWSK MKTIVKLQHN APAQLLRLMF HDCFIGGCDA SVLLADRNEN GTVEREAIPN RTLKGFNFID  TIKDEIEEEC PGVVSCSDIL VLATRDGIVL AGGPYYPVLT GRRDSKESFF DKAMAEIPRP NGNFSETLRL FSVRGFDERE TVALLGAHNI GRIGCQFIRP RLSNFTGTGL PDPTIPPYFL 
EELRRKCPDD NNTISNMLND EHTDTARGLS VSIATSLNNH YYKTLMRGRG LLFADQQLMA NEKTAAAATD YAIDDGNIFR TEFAHAMAKM SNFGVVTGSK GEVRHSCSHL NS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 2, 3 introns) and 1 singleton.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTTAGCA GGAACTGTGT TTTACTGGCG GTTTTCTCAT TCTTGGTTAT CTGCCCTGTG ACTACAGTGG CGGCGCAACC AGAGGTTGAT CCAGGAAGTG CCTCTGGATT CCCTTTTCAA  CTCAGATACA ATTATTATGA TGAGAAATGT GAGGATCTTG AGGGCATTGT GTGGTCAAAG ATGAAGACAA TTGTCAAGCT GCAACACAAT GCCCCAGCAC AACTATTACG CCTAATGTTC  CATGATTGTT TCATTGGGGT ACTCTCCATC CTTTGATGAT GCATTCATTT TAGTCTCTCT TTTTTTTCCT TTTGTTTCCC AATTTCTGGT TGTTCTTCAA TTTGTAAAAT TTCTCTTCTC  TTTTCATTTT GTTACATTTT ATGATTCTTG ATATGTGCAT CATGAGTTCT TTAATGAGGT TTCATTGGGG TACACTTCAT GCAACTGAAT GAATACTTTG TGTACACATT AGATCACAGA  GCCTTTAGGT TTTCTTTTTC TTCTCTTTTT GGGTGATTAG GATTAAGCAA GAACTTAGAG CTATGAAGGT TAAAGAAAAC GTCTAGGACG AAGCGGAAAG GAGATTGACG TTTTATGCTG  AATTATCTAC TGTTTATTTA TGTGGTTTGG TCATCTAGAT GTCTACTGAC AATATTTTGT GGATTTTGTA TTACTTCATA TATTTCGCAT CGGTTCCTGA TGCACTTGCA TTTTTCTTTG  ACACACTTGT GGATGTTTTC TTCTTTATAA TTAGCAGTGT GATCTTGAAC ATCATGGATT TGTGATTCTT CATATGTTAT ATGCGTCTTT GCGCATTGTG TTCTTCGTCT GGTTCAGATG  GAGGTTTTAG CTGATCTAGT TTTGAGTTCG GGGACAGAGA TAAACACATG CATTGTTGTT CTCGCTAGTT TCACCAGAGC ATCACTTCTG TCTGTGCTTG TTGATTTCTG AAAACATTTC  TATGTACATT TACCTTATGC TGTAATGTTC ACTTCTAATT TTGGAAGCAA GTCTAATGTA GATGAGGTTC GCTTCCACAT GTTGTGCCAC TTCAATAATT GTCGATTGAT TTTCTGACTA  CCAAGAAAAC AACAAGTATC GATCTCTTTT GTGTCTTTCT TTCTGTTATT CTATGCAGTT AGTTCTTAGC CTTTTTTGGT TCTACTATCT CTAATGCATT TAACCCTGAT GAACACAAAA  TAGTTCCAAG TACTTCCAGC CTTCTGTCAC TATTATTTCT CTGTTCACAT TTCATGCATG TTGGATGTGA ATTCATTTTA TTTATTACTC TTATAGCATT GTAGATATTT CTTTAATAAG  CCTTTGATTT TTGGTATGTT GCATTGTGTG AACTTTCTGT AGCTTGTCAC TTGTCTTATT CTTTTTTGTG TCAATGGCCT TTAATGCTCC AAGTGGACCA GTTCCTATCA TCTCTCCCTA  CTTACGTCTT ACAGAAGTGT CAAGTGTGTT GTTAATGAAT TCAAAATATA GCTCTATGTT GATTTATCTG TGGTTTTGTC CATGCAGATG TGTATCAACT ATACTTTTTT GGATTTTGTA  TTTCTTCATA TTTGAAATTG GTTCCTGATG CACTTGCATT TCTTTGACGG ACTTGTGGAT TTTTTCTTTT AAAAATTAGC CGTGTGATCT TGAACATTAA GCACATGCGG TTCTTCATAT  GCTGTCATGT ATCATTGTGC CTTGTGTTCT TTGTTTGATT CAGATGGAGA TTTTAGCTGA TCCAGTTTTC TTGGCTTTGA GTTGGGGACA CAGATAAACA CATATATTGC AATTCTCGCT  TGTTTCACCA GAGCATCACT TATGTCTCTG CTTGTTGATT TTCTGTAAAT TTTTCGATGC ATATTTACCT GTAGTTATAT CCATCTGTGT ATGCATCCAC ACTCCTTTCC CGGATTTCCT  TTGATAACAG AAAGAGGGTG AATGTGATTA CTTGTGAAAA AGCAGAGGTG ATAAGGAAGT CAGAAATGAT ATTAGACATA GAATGGTTTT TCTTTTTTCG ATATGATAGA GTTTCCAGCC  TATGAATTAT CTATCCTATT GATTTTCAGG GTTGTGATGC ATCCGTTCTG CTAGCTGATA GAAATGAGAA TGGGACTGTT GAACGTGAGG CCATCCCAAA CAGGACGCTG AAAGGCTTCA  ACTTCATTGA CACGATAAAG GATGAAATTG AGGAGGAATG CCCTGGGGTT GTCTCTTGTT CTGATATCCT TGTCCTGGCA ACAAGAGATG GCATAGTTTT GGTATGAATT TGGCCATATC  CTTTGTTTCT TACTGTCCAA CATCTTAAGT TCATTTGCTG ATATCTTTGT TCTTGCTCTT AGTACTTTCT ATTTTACATG GTTCTGTCTC AGTGTTCCTT GTTCAAGAAG TAATTAAGAG  AGTAGAATCT GGCTAGCTAG TAAAATAGAC AACTCATACA CTAGCATGTG TACCATCTTT CTTAAAATAG TATAGTTCAA CAATCTTGTA GTGCATATTT ACATAACAGA ACATTTTGCA  CCTTTCAGTG GTATCATATG TTAACAACCC AGTTTTGAAA ATATGGGAAT ATTCATAAAC TGTTCGTATA ATGGGACCAT GTAGCTTTTC GAACCAAATT GGCTTTTTTG TCATGCTGAT  TTCCTATTCT TTAATATTCC TCCTTCGCTC TCACATGCTG ATTTTCCTAG ATTTTTTAGG CTGGTGGACC ATATTATCCT GTGCTTACAG GCAGAAGGGA CAGTAAGGAG TCATTCTTTG  ATAAGGCGAT GGCTGAAATT CCACGACCAA ATGGGAATTT CAGTGAAACT CTTAGGCTAT TTTCGGTCAG AGGATTTGAT GAGAGGGAAA CAGTGGCCCT CCTTGGTAAC CTTTCTAATC  CCACAACTTT AATCTTCAGT GCACCTTTTC TGGATTATAC ATATTCTGAA ATTCTATCAT TTTTTGTTGT TTTATCATTT GAAGGAGCAC ATAATATTGG GAGGATTGGC TGTCAATTTA  TTCGGCCCAG GCTCAGTAAT TTCACGGGGA CAGGTTTACC TGATCCAACA ATTCCTCCCT ACTTTCTTGA AGAGTTGAGG CGGAAGTGTC CAGACGACAA CAACACCATC AGCAATATGT  TGAATGATGA ACATACAGAT ACAGCTAGGG GTCTGAGTGT ATCAATTGCG ACTTCATTAA ATAATCACTA CTACAAGACT TTGATGAGAG GAAGAGGGCT GTTGTTTGCT GATCAACAGT  TGATGGCTAA TGAGAAGACT GCTGCAGCAG CGACAGATTA CGCTATTGAT GATGGGAATA TATTTAGAAC AGAGTTTGCT CATGCCATGG CTAAAATGTC CAATTTTGGT GTTGTTACTG 
GATCGAAAGG AGAAGTTCGG CACAGTTGCT CCCATCTAAA TTCATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTTAGCA GGAACTGTGT TTTACTGGCG GTTTTCTCAT TCTTGGTTAT CTGCCCTGTG ACTACAGTGG CGGCGCAACC AGAGGTTGAT CCAGGAAGTG CCTCTGGATT CCCTTTTCAA  CTCAGATACA ATTATTATGA TGAGAAATGT GAGGATCTTG AGGGCATTGT GTGGTCAAAG ATGAAGACAA TTGTCAAGCT GCAACACAAT GCCCCAGCAC AACTATTACG CCTAATGTTC  CATGATTGTT TCATTGGGGG TTGTGATGCA TCCGTTCTGC TAGCTGATAG AAATGAGAAT GGGACTGTTG AACGTGAGGC CATCCCAAAC AGGACGCTGA AAGGCTTCAA CTTCATTGAC  ACGATAAAGG ATGAAATTGA GGAGGAATGC CCTGGGGTTG TCTCTTGTTC TGATATCCTT GTCCTGGCAA CAAGAGATGG CATAGTTTTG GCTGGTGGAC CATATTATCC TGTGCTTACA  GGCAGAAGGG ACAGTAAGGA GTCATTCTTT GATAAGGCGA TGGCTGAAAT TCCACGACCA AATGGGAATT TCAGTGAAAC TCTTAGGCTA TTTTCGGTCA GAGGATTTGA TGAGAGGGAA  ACAGTGGCCC TCCTTGGAGC ACATAATATT GGGAGGATTG GCTGTCAATT TATTCGGCCC AGGCTCAGTA ATTTCACGGG GACAGGTTTA CCTGATCCAA CAATTCCTCC CTACTTTCTT  GAAGAGTTGA GGCGGAAGTG TCCAGACGAC AACAACACCA TCAGCAATAT GTTGAATGAT GAACATACAG ATACAGCTAG GGGTCTGAGT GTATCAATTG CGACTTCATT AAATAATCAC  TACTACAAGA CTTTGATGAG AGGAAGAGGG CTGTTGTTTG CTGATCAACA GTTGATGGCT AATGAGAAGA CTGCTGCAGC AGCGACAGAT TACGCTATTG ATGATGGGAA TATATTTAGA 
ACAGAGTTTG CTCATGCCAT GGCTAAAATG TCCAATTTTG GTGTTGTTAC TGGATCGAAA GGAGAAGTTC GGCACAGTTG CTCCCATCTA AATTCATGA 

Retrieve as FASTA