Entry information : LePrx58 (Solyc08g013930.2.1[2.3] / SlSBM_L12983_01[kazuza])
Entry ID 656
Creation 2005-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-07-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Qiang Li
Last annotation changes 2015-12-11 (Qiang Li)
Peroxidase information: LePrx58 (Solyc08g013930.2.1[2.3] / SlSBM_L12983_01[kazuza])
Name (synonym) LePrx58 (Solyc08g013930.2.1[2.3] / SlSBM_L12983_01[kazuza])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx030]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx58
start..stop
S start..stop
StPrx300 677 0 1..345 1..345
MguPrx89 431 2e-152 3..338 2..338
MguPrx300 431 2e-152 3..338 2..338
CroPrx20 423 2e-149 1..345 3..347
Literature and cross-references LePrx58 (Solyc08g013930.2.1[2.3] / SlSBM_L12983_01[kazuza])
Literature van der Hoeven,R.S. et al., unpublished.
Protein sequence: LePrx58 (Solyc08g013930.2.1[2.3] / SlSBM_L12983_01[kazuza])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (315)
PWM (Da):   %s   38856.74 (35534.0) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.35 (8.35) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-345
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKYSGILLL LLPILMSFVA VSLNSGYANA AVFLPPEDKP LVRHYYKKLN TCANVEPFVQ HQVKLYWDKD KTITAKLLKL LYADCMVNGC DASVLLTGPN TERNSSKNAR LDGYLLIDKI  KKVLEIRCPR TVSCADILNL AVRDAVHYAG APSYPVFLGR RDGVESKAEW IDYPSPSMSW EEGLAYFESK NLDVQDFVTL LGAHTMGQAH CSSFYDRLYD FQGTGKPDPS MKRSVLVKLR 
DQCPKNSKND SPVYFNEEYG SNYTFTNKLY TKVLAHESLL RVDQQLSYGS DTGELVDEYA KSLELFRRGF ALSISRMGGL KVLTGKNGEI RQDCKFTNKN NPNIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 8, 3 introns) and singleton. Containing motif 'YSDC' or 'YADC'.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGAGAAATA CTCGGGAATT CTTCTTCTTC TTCTTCCGAT ACTGATGAGT TTTGTTGCAG TGAGCTTGAA TTCAGGTTAT GCAAATGCCG CGGTGTTTTT GCCACCGGAG GATAAACCAT  TGGTGAGACA TTACTATAAG AAGCTAAATA CATGTGCCAA TGTGGAACCA TTTGTTCAAC ATCAAGTGAA GCTCTATTGG GACAAGGATA AGACTATTAC TGCTAAACTC CTCAAGTTAC  TCTATGCTGA TTGCATGGTT AATGTATGTC TCTTTGTCTC TCTTTTATTT CATGCACAAT TTTTGATATA GATAATCTAT CCTAATATAA ATAGCAGTGA GTGTTTCCTT AGCTTGAATT  TGTTATCATA GATCACACAA AGATAATTTT ATTATTGCTG CAAGACATAC GTAGCTTGAA TTTGTTACCC ATAGATCACA CAAAGATAAT TTTATTATTG CTGCAAGACA TACGTAGCTT  GAATTTGTTA CCCATAGATC ACACAAAGAT AATTTTATTA TTGCTGCAAG ACATACTTAC TCCCCTCCAT TTACTCCCTC TGTCCCAATT TATATGTCAC CTTTTATGTT TTGAGAGTCG  AATAGTTCAA GTTTGACTGG AAATTTGTGC ATGAAATTTT TATTTTTTCT GAAATGAAAT TTATATATTT GTAAACTGCG TAAAAAGTAA TATGAGTCAC AATAATTGAT AATTCAAAAT  ATTTAAAAAA TCTATAAAAA ATTTGCGATA AAAAATAGAC TTGTTTGACT CTTGAAATCT GAAAGGTGAC ATATAAAATA GGACGACGAT AATATCTCAT TGCTATTTTA GCTTCAATAT  ACCGAAGTAT AATGATAAGT CTAAGATTTT TAGAATATGA CTCAAACCTA GTCCACCATT TATCCATCAA TTTATGAGTA GCATGGATGG GAACAATTAA TATAAACCAA TATTAGAAAA  TATATAGATA CATAAAATAT CTAATTTTAC GAAAAGATCA CAGATTAACG TGTCTCATTT TTAACCTATA CTTATTCCAC CCCTCTCTAT AATTATAGTT AGGGTCTTAT GATTGCCAGT  TAAGGGAGTC GTTCATATAT TAAAACTAGC CCAACTTATA ATATCAAGTT AGATACCTTT TTAGCTACTT TGCATAAAAT TTACCACACC AAAAAAAATG AATAATGTTT TTAATTTCTC  AAAATAACGT TACGTGTACG ATTATTTAGA CATAAACAAG GAGAATAGTG CAAAAGTGAA CCTATATATA CGAGTTGAAT AATGTCTAGT ATATATTGAT AATTCTAGTG TTAAGACTAA  TAAAAAACTC ACAAAATATC TATAAAATGT ATGTACATAG TGTATATTTT ATATGCACAT ATTATATACA ACATACACAT AACACTGACA TTGTATAGTA TATTACTCAT ATATATTTCG  ATCATATTGT TATAAGTTAA ACCATATTCA TATAATATTT CTATGGAGGC CTTAGGAAGG AATCTTGGGT AGCTTCGTAA ATTGAGACAT AGCTTTAACC ATAAGCAACT AAGTTTTAAT  TAATACACAC TAAAATAGAG GACATATTAG ACAATGATCT AGAGATCTAA GCCTATAAAA AATGGTGTGT CTCCTCTTTA AAGAAAAAAA AAATATGTAA ATACAATACT ACGAGCTTGT  TTGGATCGGT ATTTGACTAT ATTTTTACTT ATAAGTCAGA AGTCATACGT TAAAACTTTT AATTTATAAT TTTTAGCTTG TATTTATCGT TTTAGCTTAA TATAAAGTGC TTAATACTTC  AAAAGTCTTT TAAAAGTTAC TTAATTTAAA AGTATTTAAA ATAAGTCAAT TTAAACAGGG CTTGTTATGC ACAAGCTTTG AAAAGATAAT TCCAAGAAAT AAGTTCCATA GTAATGAATA  TTTTTAAAAA TTAGGTTTCT TCGAGTTTTG AGGTTACGTT GGATCTAAAC TACATCAAAT TTTTGTGGTG TCCATGAATA CAAGTAATTA TAGTAATCCT TTTTATTTTA ATTAATGTGA  AGAAGTTCAA AGTACGATAG TTAAAATATT TAGAATATAA TATATGAAAA TTACATTGAA AAGTATTCTC TCTAGTTTAT ATTAATTATA TAATTAAATT CGAATTGGAG GTATGACACA  CCTTTTAAGA AAAATATATA AGAATATAAA TCAAATAAAT TACTATTTTT ATTATTGTTT TTTTAATTAT TATTCTCCTA AAAGATGTAA AGTAATTAAG AACTTTATTA TAAAAAAAGA  AATGATATGA AAAAAAAATC TCAATAATTC TTGTCAACTT GCAAAATTAC TTATTTTGAA CAAAAAAGTT CTCAATAATT CACTTAATGT GGAATTGTGG ATTGGAGGAA GTACTACAAA  CATAACTAAT AATTCATAAT ATTTTCAATT TTTTTTTGAT AAAATTATAA TTATAAAACA ATATTATTTT GATTCCCAAA ACAATAACAC CTCATCTTAA AAATGGAACG GAGGGAATGT  ATCTCTATTC ACCCTTAGAA AAGTATCATG GGCAGTGTCT TAAAGAAAAA TAGCTTTAAT TAAGCAACTA ATTAATTAAA AATAAGGAAA TATTAGACAA TAATCTAGAT CTAAGCCTCA  AAATTTGGCT TGTGATCTCT CTTCAAGAAA TCAAATTATG TATAATATAA AGGGTGTGTT TGTTGGCAAG GAAAATATTT TTCAATTCTT CATATTTAAT TGGTCGAATA TATTTTCTAG  ATTAACGAGT TCTTTATAAA TAAAAAAATA TTCTTTTATC AGAATAGAAA AAATAAATTA TATAAGCGAC ATTACGAGTT TATTATCTTC CCCTCACACA CCAAATACCC TTACCTCCTT  CCATTTGACC ATCTCAATCC TTGCCATAGT GAAATGTTAT TATAAGATAT GATTGTTATA AAGAAGCTTG ACTATAATTG AAAGTAACTT AAGAAAATGA CGTAATTAAC TACAATAGGT  CTTAAATTCA TTATATTGTC ACTAAATATG AGTTAATTAT ATATATATTC TAAATCCTCA TATAGAGTAT ACAATGACAA TGAGCATCTG AGGTATCAAC TCAATCAGTA ACTTATTAAT  TTGTGATATT TATTCCTTTA CTATTGTTGT CCAGGGTTGT GATGCATCGG TCCTGCTAAC GGGTCCAAAC ACAGAGAGAA ATTCATCGAA AAACGCAAGG CTGGATGGAT ACCTGTTGAT  CGATAAAATA AAAAAAGTGC TTGAAATTCG ATGTCCTAGA ACCGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCAATCTT GCTGTTAGGG ATGCCGTCCA TTATGTAACT AATATATTTC TCTATTGCGC  TTTATTTATT TAATTTATCG CGATATATAT TAACTAATTT CGGGAAAAAA AATGTAAAAC AGGCAGGTGC ACCATCTTAT CCAGTGTTCT TGGGAAGAAG GGATGGAGTA GAATCAAAAG  CTGAATGGAT TGATTATCCT TCACCTTCAA TGTCTTGGGA GGAAGGACTT GCTTACTTTG AATCCAAAAA TCTTGATGTA CAAGACTTTG TCACACTTTT AGGTACATAA ATATGACTTA  TATTATAATT TTCTTTTATT TTAACATTCA ACTAATAGTT GTTTTCTTAA TAGCAAAAAT GCACAAGTAG CTCCAACTCT ATGCCCGAAA TTTTAGAGAC ACATTTATAC TATATTAAGG  TCCTATTATC TTTCTGAACT TATTTTATAA ATAATGTTCT ACTCCTTTTC GATCTACGTG GTACTAGCTT GAAAAAAAAG TCAACACACA CTGAGCCGAA AAGATAGTGT CACGTAGGCC  GAAAAGGGGC AAAAAATTAT TTATAAATTA AGTTCAGGAA GGTAATAGGA CATTAGTATA GTATAAATGT GTCTTTGAGA TGTGAGACAT ATATATGTTT GAGGGGTACT TAATTCCATG  TTTCACTAAC ATTGGGCTTC CATATATTAT CCATGCTCTT AATTCCACGT TTAACTAATG TTGGGCTTCC ATATATTGTC CACGCTCTAG TTGACAGGTC TAGACGTACG AGGGTGTGTT  GAGCCTCCTA CTCAGGGATG GAGCACTTGG TCTCTTCATA TGTCTTAGAC AATCGTCACT TCTTGAACTA GCTTTTGGGG TCAAGTCAGA CCCAAGATCC ACTTTTATAT AGTTGTTGTT  GTCGTTCCCT CAACGTCCTT TTCCATGTCC TTTAACCATT TTGTTCCTCA CTAACTCTAC CCAGGCAACT AGATTTATAC TGGATATGTT GTTATTGTTC TAAACGCGGG CCGTTTGGTT  CCTATTTCAG GGGCACATAC AATGGGACAA GCACATTGCA GCTCCTTCTA TGACCGCCTT TACGATTTCC AAGGTACAGG AAAACCAGAC CCCAGCATGA AGAGATCTGT GTTAGTAAAG  CTAAGGGATC AATGCCCTAA AAACAGCAAA AATGATTCAC CTGTTTATTT CAATGAAGAA TATGGTTCTA ACTATACATT CACTAACAAA TTATACACTA AGGTTCTTGC TCATGAATCA  CTTCTTAGAG TTGATCAACA ATTATCTTAT GGAAGCGATA CAGGTGAACT AGTCGATGAA TACGCAAAGA GTTTAGAGCT ATTTCGAAGG GGATTTGCAT TATCGATTAG TAGAATGGGA 
GGTCTTAAAG TGTTGACAGG TAAAAATGGC GAAATTCGCC AAGATTGCAA GTTTACAAAT AAGAACAATC CTAACATCAA TTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAAT ACTCGGGAAT TCTTCTTCTT CTTCTTCCGA TACTGATGAG TTTTGTTGCA GTGAGCTTGA ATTCAGGTTA TGCAAATGCC GCGGTGTTTT TGCCACCGGA GGATAAACCA  TTGGTGAGAC ATTACTATAA GAAGCTAAAT ACATGTGCCA ATGTGGAACC ATTTGTTCAA CATCAAGTGA AGCTCTATTG GGACAAGGAT AAGACTATTA CTGCTAAACT CCTCAAGTTA  CTCTATGCTG ATTGCATGGT TAATGGTTGT GATGCATCGG TCCTGCTAAC GGGTCCAAAC ACAGAGAGAA ATTCATCGAA AAACGCAAGG CTGGATGGAT ACCTGTTGAT CGATAAAATA  AAAAAAGTGC TTGAAATTCG ATGTCCTAGA ACCGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCAATCTT GCTGTTAGGG ATGCCGTCCA TTATGCAGGT GCACCATCTT ATCCAGTGTT CTTGGGAAGA  AGGGATGGAG TAGAATCAAA AGCTGAATGG ATTGATTATC CTTCACCTTC AATGTCTTGG GAGGAAGGAC TTGCTTACTT TGAATCCAAA AATCTTGATG TACAAGACTT TGTCACACTT  TTAGGGGCAC ATACAATGGG ACAAGCACAT TGCAGCTCCT TCTATGACCG CCTTTACGAT TTCCAAGGTA CAGGAAAACC AGACCCCAGC ATGAAGAGAT CTGTGTTAGT AAAGCTAAGG  GATCAATGCC CTAAAAACAG CAAAAATGAT TCACCTGTTT ATTTCAATGA AGAATATGGT TCTAACTATA CATTCACTAA CAAATTATAC ACTAAGGTTC TTGCTCATGA ATCACTTCTT  AGAGTTGATC AACAATTATC TTATGGAAGC GATACAGGTG AACTAGTCGA TGAATACGCA AAGAGTTTAG AGCTATTTCG AAGGGGATTT GCATTATCGA TTAGTAGAAT GGGAGGTCTT 
AAAGTGTTGA CAGGTAAAAA TGGCGAAATT CGCCAAGATT GCAAGTTTAC AAATAAGAAC AATCCTAACA TCAATTAG 

Retrieve as FASTA