Entry information : LpPrx05
Entry ID 657
Creation 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2005-09-15 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-05-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LpPrx05
Name LpPrx05
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx064]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon pennellii    [TaxId: 28526 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Pollens
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LpPrx05
start..stop
S start..stop
LePrx96 919 0 1..487 1..487
NtPrx24-1A 465 2e-162 181..487 123..429
NtPrx24-1A 54 0.00000004 1..44 1..45
NtPrx24-1B 463 1e-161 191..487 137..433
NtPrx24-1B 52 0.0000002 1..44 1..45
LePrx55 451 1e-156 180..487 127..434
Literature and cross-references LpPrx05
Literature van der Hoeven,R. et al., unpublished
Protein ref. GenPept:   XP_015075221.1
Cluster/Prediction ref. Genebank:   107019161
Protein sequence: LpPrx05
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   487
PWM (Da):   %s   52357.3  
PI (pH):   %s   4.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGKARIFAG LFLICIVLPS LASAFVDHLP EVGQVNDNND VPIHVSTVAH FSENQVKEAL IRRAKAVQDL WANFGNDDKN DVAKEDAAPV TPTPVDSTPT TTPVDPTPTP VDPTPNPGPV  NPVPADPTPN PVPANNVPAG YPGATQGPPV AMGYGGAPIT QNPSDQQTVP EQAGAAQNHP TPEEIKEQRK HAGLQVGFYD NTCPNAEKII KDGMNRAFGN DSSMAAPIGR LLFHDCFVNG  CDASILLDKT PSGARVEKLA PTNGATIRGF ELIDEIKAEL EAECPGIVSC SDLLVYLSRD AFVVSGVPHY DVPGGRRDGM ESLEANVIGN LPLPDNTVDK MIDLFKKKGL TEEDLVVLIG  AHSIGVAHCF SFRYRVDDPV KATMVDPRLA GVVKFACTTP MSTLAFDTTT QYKMDSIYYK QLSGKRALLE SDALLNEDPR TKDFIQKFGD DENGWFIKFG KAMNKLTSIQ VLTGDQGQIR 
KQCRFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic DNA and 2 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACATGA TTAATGCTAT TAGAAAGATG GCAGGGAAGG CGAGGATTTT CGCTGGTCTT TTTCTTATTT GCATTGTCCT CCCTTCGCTG GCCTCAGCGT TTGTAGATCA TCTACCTGAA  GTTGGCCAAG TAAACGATAA CAATGATGTA CCGATCCATG TTAGTACTGT TGCTCACTTC AGCGAAAATC AAGTTAAGGA GGCATTGATA AGAAGGGCAA AGGCAGTGCA AGATCTGTGG  GCAAATTTTG GTAATGATGA TAAGAATGAT GTAGCTAAAG AAGATGCTGC ACCTGTAACT CCAACGCCTG TTGATTCAAC ACCTACAACT ACACCTGTTG ATCCAACTCC AACGCCTGTT  GATCCAACAC CTAATCCTGG GCCTGTTAAC CCTGTTCCAG CTGATCCAAC ACCTAATCCT GTGCCTGCTA ACAATGTACC TGCAGGATAT CCAGGAGCAA CTCAAGGGCC GCCTGTGGCG  ATGGGATATG GGGGTGCACC TATAACACAA AATCCATCAG ACCAACAAAC TGTGCCTGAA CAGGCAGGTG CTGCTCAGAA CCATCCAACA CCGGAAGAAA TTAAAGAGCA GCGCAAACAT  GCTGGATTAC AAGTGGGATT TTACGATAAC ACTTGCCCGA ATGCTGAGAA GATCATTAAG GATGGAATGA ACAGAGCTTT TGGGAATGAT TCCAGCATGG CTGCTCCAAT TGGGCGTCTT  CTGTTCCATG ATTGCTTTGT CAATGTAAGT TTTCAGTGTG CAGATTCTAC AATGTACACC TCTGAAAATA GGTTTTGCTA TGCTTTCTTA ACAATGACAA CCAAAAGAAA CCCTTAAAAG  TTTCATGAAA ATTCATTTAT CTAATGTACA GGGATGTGAT GCGTCTATAC TCTTAGACAA GACACCAAGT GGTGCAAGGG TAGAAAAACT TGCCCCCACC AATGGTGCAA CAATTAGGGG  ATTTGAACTC ATTGACGAGA TCAAGGCTGA GCTTGAGGCA GAATGCCCTG GCATAGTCTC ATGCTCTGAT CTTTTGGTAT ACTTGTCAAG GGATGCCTTT GTTGTATCAG GTGTCCCTCA  CTACGACGTG CCTGGTGGAC GTCGTGATGG AATGGAATCC CTTGAAGCAA ATGTTATTGG AAACCTCCCG CTTCCTGATA ATACAGTGGA CAAGATGATT GACCTGTTCA AAAAGAAAGG  CCTGACTGAA GAGGATTTGG TTGTCCTAAT TGGTGCCCAC TCCATTGGAG TAGCCCACTG TTTCAGCTTC CGTTACAGAG TGGATGATCC AGTGAAGGCT ACTATGGTAG ATCCAAGACT  CGCGGGAGTT GTGAAATTCG CATGTACCAC CCCAATGAGT ACTCTGGCTT TTGATACCAC CACACAGTAC AAGATGGACT CCATTTATTA CAAACAGCTG TCGGGGAAGA GAGCATTGCT  TGAATCTGAT GCACTTCTGA ATGAAGATCC CAGAACAAAG GACTTTATCC AGAAGTTTGG TGACGATGAA AACGGATGGT TCATTAAGTT TGGTAAGGCC ATGAACAAGT TGACTTCAAT 
ACAAGTGCTC ACGGGAGACC AGGGGCAGAT CAGGAAACAA TGCCGGTTTG TCAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGGGA AGGCGAGGAT TTTCGCTGGT CTTTTTCTTA TTTGCATTGT CCTCCCTTCG CTGGCCTCAG CGTTTGTAGA TCATCTACCT GAAGTTGGCC AAGTAAACGA TAACAATGAT  GTACCGATCC ATGTTAGTAC TGTTGCTCAC TTCAGCGAAA ATCAAGTTAA GGAGGCATTG ATAAGAAGGG CAAAGGCAGT GCAAGATCTG TGGGCAAATT TTGGTAATGA TGATAAGAAT  GATGTAGCTA AAGAAGATGC TGCACCTGTA ACTCCAACGC CTGTTGATTC AACACCTACA ACTACACCTG TTGATCCAAC TCCAACGCCT GTTGATCCAA CACCTAATCC TGGGCCTGTT  AACCCTGTTC CAGCTGATCC AACACCTAAT CCTGTGCCTG CTAACAATGT ACCTGCAGGA TATCCAGGAG CAACTCAAGG GCCGCCTGTG GCGATGGGAT ATGGGGGTGC ACCTATAACA  CAAAATCCAT CAGACCAACA AACTGTGCCT GAACAGGCAG GTGCTGCTCA GAACCATCCA ACACCGGAAG AAATTAAAGA GCAGCGCAAA CATGCTGGAT TACAAGTGGG ATTTTACGAT  AACACTTGCC CGAATGCTGA GAAGATCATT AAGGATGGAA TGAACAGAGC TTTTGGGAAT GATTCCAGCA TGGCTGCTCC AATTGGGCGT CTTCTGTTCC ATGATTGCTT TGTCAATGGA  TGTGATGCGT CTATACTCTT AGACAAGACA CCAAGTGGTG CAAGGGTAGA AAAACTTGCC CCCACCAATG GTGCAACAAT TAGGGGATTT GAACTCATTG ACGAGATCAA GGCTGAGCTT  GAGGCAGAAT GCCCTGGCAT AGTCTCATGC TCTGATCTTT TGGTATACTT GTCAAGGGAT GCCTTTGTTG TATCAGGTGT CCCTCACTAC GACGTGCCTG GTGGACGTCG TGATGGAATG  GAATCCCTTG AAGCAAATGT TATTGGAAAC CTCCCGCTTC CTGATAATAC AGTGGACAAG ATGATTGACC TGTTCAAAAA GAAAGGCCTG ACTGAAGAGG ATTTGGTTGT CCTAATTGGT  GCCCACTCCA TTGGAGTAGC CCACTGTTTC AGCTTCCGTT ACAGAGTGGA TGATCCAGTG AAGGCTACTA TGGTAGATCC AAGACTCGCG GGAGTTGTGA AATTCGCATG TACCACCCCA  ATGAGTACTC TGGCTTTTGA TACCACCACA CAGTACAAGA TGGACTCCAT TTATTACAAA CAGCTGTCGG GGAAGAGAGC ATTGCTTGAA TCTGATGCAC TTCTGAATGA AGATCCCAGA  ACAAAGGACT TTATCCAGAA GTTTGGTGAC GATGAAAACG GATGGTTCAT TAAGTTTGGT AAGGCCATGA ACAAGTTGAC TTCAATACAA GTGCTCACGG GAGACCAGGG GCAGATCAGG 
AAACAATGCC GGTTTGTCAA CTGA 

Retrieve as FASTA