Entry information : LePrx61 (Solyc06g082420.2.1[2.3])
Entry ID 659
Creation 2005-06-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx61 (Solyc06g082420.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx61 (Solyc06g082420.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Crown gall
Inducers Agrobacterium tumefaciens infection
Pathogen interaction
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx61
start..stop
S start..stop
StPrx25 613 0 1..312 1..314
CclPrx113 471 2e-169 8..312 12..318
PtPrx40 470 2e-168 1..312 45..360
RcPrx52 468 4e-168 1..312 6..317
Literature and cross-references LePrx61 (Solyc06g082420.2.1[2.3])
Literature van der Hoeven,R. et al., unpublished
Protein sequence: LePrx61 (Solyc06g082420.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   313 (292)
PWM (Da):   %s   33514.56 (31210.5)  
PI (pH):   %s   6.35 (6.35) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-312
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFNLSMFII MFSLIGICSA DLSSDYYEKS CPKAMYTIKN AVANAVTNER RMGASLLRLH FHDCFGCDAS VLLDDTTDFT GEKSAKPNSN SIRGFDVIDK IKSQIEKLCP GIVSCADIIA  VAARDSVVLL GGPSWTVELG RRDSTTASLD TANSDIPSPS LDLNDLITNF ANKGFTAKEM VALSGGHTIG KAQCTTFRAR VYNETNIDSS LATSLKSNCP STGGDDTLSS LDATTPVLFD 
NHFYKNLVNN KGILHSDQQL YSGGSTDSQV KSYSTNPIAF DADFAKAMVK LGNLSPLTGT NGQIRTNCRK IN* 

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Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, 3 introns). No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTA ACTTGTCTAT GTTTATAATT ATGTTTTCAT TAATTGGAAT TTGTTCAGCC GATTTATCTT CGGACTACTA TGAAAAATCA TGTCCAAAAG CTATGTATAC AATTAAAAAC  GCTGTGGCGA ATGCTGTTAC GAACGAGCGA CGCATGGGGG CCTCGTTGCT TCGTCTTCAT TTCCATGATT GCTTCGTTAA TGCACGTTCA CTTCTTAACA CTTTTATTTT TGTGTCTCAC  GCAACTGACA TAAATTGCGT TAACTCCTTA ATCTTAACAT TTATTTTTGT ATCTCACACA ACTGACGTTT ACAGTGACAC GTCATGTTTT TATTTTTAGA TTCTTTCCAA GATAAAAGAG  CGACAACATA TTAAGTTGTG GACTAATAAT GTTAAAAAAT TTCGTTTATT TATTTATTTT GAAATATTTA TATTTTTTTT TGACAGGGAT GTGATGCATC TGTATTATTG GATGATACGA  CTGATTTTAC TGGAGAGAAA TCAGCAAAAC CAAATTCAAA TTCAATAAGA GGTTTTGATG TGATTGACAA AATCAAATCT CAAATAGAAA AATTATGTCC TGGAATTGTT TCTTGTGCTG  ATATTATAGC TGTTGCTGCA CGAGATTCTG TTGTGCTCGT AAGTATTTTA ACTAGAACTC GTTTAGTTGT CTTATTTTAA GTGTTTTAAG TCAAAACAAT TTCAGCCAAT CCAAATAGAC  TCCCTATCCA TCAACAAATT TTAAAAAATA GCCATTTCCT AAACCCAAAA TATTCAATTT AAGTAATAAG CTCGAACTTA TAAAAGTAAA ATTTAATCAT AGTATTATGG ACGAATATCC  AAAAATGTTA TGAAATTTCA CTCTTCATTA AGTTTGAAAT TCACGATATT ATCATACATT TCAGAAATCA TGACATTTAT GTTATCAATT TGTCCCTTGT TATTAAAGTT CAAAATCAAG  ATATTGTTGT GACTTGTGGT ATTTCTACAT CAAAGTGGCT ATATCTTACA CAAATTTCCA AAACACTGGC TATCTTTCAA AAATCAGTTC TATTAATGGC TATTTCATAC AACTTTTACA  ATTTCAAGTT CCATAATAAT TTGGGCCATA ATTATGATTA TAACTCCATT AAATTTGTTG GACTCAGTTA GGTGGGCCTT CATGGACAGT GGAATTAGGA AGAAGAGATT CAACAACAGC  AAGTTTGGAT ACAGCAAATA GTGATATACC TTCCCCTTCA TTGGATCTTA ATGACCTTAT TACTAATTTT GCCAATAAAG GCTTCACTGC TAAAGAAATG GTTGCTCTTT CAGGTAACAA  ACTTTTTCTT ATTAAGATGA TTTTATGTAA AATTAAATTA AATTTATAAC GATAACATAT CCAGCTTAAT CCCACAAAGT AAGGTCTGGA GAGGATAAAA TATATACGTA TACATTATCC  CTATCTTAGA GATGGTAGTA GCATTTTCTA AATTGAAAAT AATAGTTCGA AATAAGTACT TAGGCCCGAA TAACCATATA TATATACATA CACACAAATA ACATGACGTA GAAAACCACT  TAATTCATGT TGCTATCTAT GTGTACGACA ATGATCATAT ATACAATGTC AGTGTATATA ATTCAAATTT GTTTGACTCC AATTATTTTG CAAAGTATTT AACTAAGTTT ATATTGTCGG  TTTATAGAAG TTAAAACCAA AAAAAAAAAC TAAGTTTAGT TTACTAATTG ATATGTATAT TTTCATGTAT ATAGGTGGTC ATACAATAGG CAAAGCACAA TGTACAACAT TCCGAGCACG  TGTATACAAC GAAACAAACA TCGATTCATC TTTAGCTACA TCGTTGAAAT CCAACTGTCC TAGTACTGGT GGAGATGATA CCCTTTCATC ACTTGATGCA ACGACCCCTG TATTATTCGA  TAATCATTTC TACAAAAACT TGGTTAACAA TAAAGGAATA CTTCATTCTG ATCAACAATT ATATAGTGGC GGTTCTACAG ACTCTCAAGT GAAAAGTTAT AGTACTAATC CTATAGCGTT 
CGATGCGGAT TTTGCAAAAG CTATGGTTAA ATTGGGGAAT TTAAGCCCAC TTACTGGAAC TAATGGCCAG ATTCGTACTA ATTGCAGGAA AATCAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATTTA ACTTGTCTAT GTTTATAATT ATGTTTTCAT TAATTGGAAT TTGTTCAGCC GATTTATCTT CGGACTACTA TGAAAAATCA TGTCCAAAAG CTATGTATAC AATTAAAAAC  GCTGTGGCGA ATGCTGTTAC GAACGAGCGA CGCATGGGGG CCTCGTTGCT TCGTCTTCAT TTCCATGATT GCTTCGGATG TGATGCATCT GTATTATTGG ATGATACGAC TGATTTTACT  GGAGAGAAAT CAGCAAAACC AAATTCAAAT TCAATAAGAG GTTTTGATGT GATTGACAAA ATCAAATCTC AAATAGAAAA ATTATGTCCT GGAATTGTTT CTTGTGCTGA TATTATAGCT  GTTGCTGCAC GAGATTCTGT TGTGCTCTTA GGTGGGCCTT CATGGACAGT GGAATTAGGA AGAAGAGATT CAACAACAGC AAGTTTGGAT ACAGCAAATA GTGATATACC TTCCCCTTCA  TTGGATCTTA ATGACCTTAT TACTAATTTT GCCAATAAAG GCTTCACTGC TAAAGAAATG GTTGCTCTTT CAGGTGGTCA TACAATAGGC AAAGCACAAT GTACAACATT CCGAGCACGT  GTATACAACG AAACAAACAT CGATTCATCT TTAGCTACAT CGTTGAAATC CAACTGTCCT AGTACTGGTG GAGATGATAC CCTTTCATCA CTTGATGCAA CGACCCCTGT ATTATTCGAT  AATCATTTCT ACAAAAACTT GGTTAACAAT AAAGGAATAC TTCATTCTGA TCAACAATTA TATAGTGGCG GTTCTACAGA CTCTCAAGTG AAAAGTTATA GTACTAATCC TATAGCGTTC 
GATGCGGATT TTGCAAAAGC TATGGTTAAA TTGGGGAATT TAAGCCCACT TACTGGAACT AATGGCCAGA TTCGTACTAA TTGCAGGAAA ATCAATTAA 

Retrieve as FASTA