Entry information : GmRboh03(Glyma.04G203200/ Glyma04g38040.1/GmRboh3)
Entry ID 7175
Creation 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-05-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh03(Glyma.04G203200/ Glyma04g38040.1/GmRboh3)
Name GmRboh03(Glyma.04G203200/ Glyma04g38040.1/GmRboh3)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh03
start..stop
S start..stop
GmRboh07 1768 0 1..928 1..941
PvRboh03 1666 0 1..928 1..930
PauRboh01 1664 0 1..928 1..922
CcajRboh05 1655 0 1..928 1..920
Literature and cross-references GmRboh03(Glyma.04G203200/ Glyma04g38040.1/GmRboh3)
DNA ref. GenBank:   ACUP01002697.1 (13641..7372)
EST ref. GenBank:   GR840497.1 [3' end]   BQ253515.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.19793
Protein sequence: GmRboh03(Glyma.04G203200/ Glyma04g38040.1/GmRboh3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   928
PWM (Da):   %s   104926.27 Transmb domain:   %s   o292-314i374-396o434-456i469-491o506-523i659-676o
PI (pH):   %s   8.38
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGTDVVVGGA SSDSHHHHRD SDIELIAERA PLPHSGPLNK RRSSKLNNTS SASTSATEEQ DEGDYVEVTM DIQGDSVALH SVKTVNNDQS EDEKLILLGK GMEKKRSFGA SVVRSASIRI  QQVSQELKRF ASLSKQTASS RLHYDRNKSA ASHALKGLKF ISKTDAGAGW VEVERQFDAL TASTNGYLHR SLFAKCIEMN KESEAFAGEL FDALSRRREI QGDSINKAQL KDFWDQISDQ  NFDSRLRTFF DMVDKDADGR ITEEEIKEII CLSATTNKLA NIQKQAEEYA ALIMEELDPE DTGFIMVNDL EMLLLHGPTH STRGDSKYLS QMLSLKLKPV DEDNPIRRWY TNTKYFLQDN  WQRTWVLLLW IGVMLGLFAY KFVQYRREDA YEVMGHCVCM AKGAAETLKL NMAIILLPVC RNTITWLRNK TKLGIMVPFD DNLNFHKCIA VAVTIGVGIH GIYHLACDFP RLLDASSEKY  KLMEPFFGDQ PSSYWFFVKS WEGVTGIIMV VLMAIAFTLA TPWFRRGRVK LPKPLNNLTG FNAFWYSHHL FVIVYALLIV HGIKLYLTKE WYKKTTWMYL AIPIIIYLSE RLTRALRSSI  KPVRILKVAV YPGNVLSLHM SKPQGFRYKS GQYMFLNCAA VSPFEWHPFS ITSAPGDDYL SVHIRTLGDW TRSLKVKFSE CCQPPDNGKS GLLRAEYLQG DRSPSTLPKV LIDGPYGAPA  QDYKQYEVVL LVGLGIGATP MISILKDIVN NMKAMEEEEE TNIEEGTNSG FGNKSPRGSS PHKKNSSSNF NTRRAYFYWV TREQGSFDWF KGVMNEVAEE DHKGVIELHN YCTSVYEEGD 
ARSALIAMLQ SLNHAKNGVD IVSGTRVKSH FAKPNWRAVY KRIAVSHPRA RVGVFYCGPP ALTKELGQLA SDFSHNTNTK YDFHKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 04, 11 introns) and 3 ESTs. Unigene mix ESTs from GmRboh07.
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAACAG ACGTGGTTGT CGGAGGAGCT TCTTCAGATT CACATCACCA CCACCGTGAC TCTGACATAG AACTCATTGC TGAAAGAGCA CCTTTACCTC ACAGTGGACC ACTGAACAAA  AGAAGAAGTT CCAAATTAAA CAACACTTCT TCTGCTTCCA CCTCCGCCAC AGAGGAACAA GATGAAGGAG ACTACGTTGA GGTCACTATG GACATCCAAG GTGACTCTGT GGCACTTCAC  AGTGTCAAAA CTGTTAACAA CGATCAAAGC GAAGATGAGA AACTGATTCT GCTTGGCAAA GGCATGGAGA AGAAAAGGTC CTTTGGTGCC TCCGTTGTGA GAAGTGCTTC CATTCGTATA  CAACAAGTGT CTCAGGAGCT GAAGCGTTTT GCTTCCTTGT CGAAGCAAAC TGCATCTTCC AGATTGCACT ATGACAGGAA CAAATCCGCG GCTTCTCATG CTCTCAAGGG ACTCAAGTTT  ATCAGCAAGA CTGATGCTGG TGCAGGGTGG GTTGAGGTTG AAAGGCAGTT TGATGCTCTC ACTGCTTCCA CTAATGGATA CCTGCATCGC TCTCTCTTTG CCAAGTGCAT AGGTATATTT  GAGTTGATCA CTGGTCGAGA AATTACTCCA TGGTCCGAGA CTGTCGTGGT CACGGATAAT CTCCATGTGA CACATAGCAT AACTGAGTTT TATTGATTCT TTCTCGTAAA TTGAGAAAAA  CTCAGTTACC TGTCACGTGA AGATTAGTCA TGATCATGGG CACTTGGTGG TTCTGGATCA TGTGATAATT TCTCGTGTTT TTTTTTCTTT ACTTAGCTTC AAATGTTTGT TGTTGGTGTA  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AATGCAGGGG TATTTTACTG TGGGCCACCA GCGCTAACCA AAGAGCTTGG TCAGTTAGCT TCGGATTTCT CTCACAACAC AAACACGAAA TATGATTTCC ACAAGGAAAA TTTCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAACAG ACGTGGTTGT CGGAGGAGCT TCTTCAGATT CACATCACCA CCACCGTGAC TCTGACATAG AACTCATTGC TGAAAGAGCA CCTTTACCTC ACAGTGGACC ACTGAACAAA  AGAAGAAGTT CCAAATTAAA CAACACTTCT TCTGCTTCCA CCTCCGCCAC AGAGGAACAA GATGAAGGAG ACTACGTTGA GGTCACTATG GACATCCAAG GTGACTCTGT GGCACTTCAC  AGTGTCAAAA CTGTTAACAA CGATCAAAGC GAAGATGAGA AACTGATTCT GCTTGGCAAA GGCATGGAGA AGAAAAGGTC CTTTGGTGCC TCCGTTGTGA GAAGTGCTTC CATTCGTATA  CAACAAGTGT CTCAGGAGCT GAAGCGTTTT GCTTCCTTGT CGAAGCAAAC TGCATCTTCC AGATTGCACT ATGACAGGAA CAAATCCGCG GCTTCTCATG CTCTCAAGGG ACTCAAGTTT  ATCAGCAAGA CTGATGCTGG TGCAGGGTGG GTTGAGGTTG AAAGGCAGTT TGATGCTCTC ACTGCTTCCA CTAATGGATA CCTGCATCGC TCTCTCTTTG CCAAGTGCAT AGAGATGAAC  AAGGAGTCAG AAGCCTTTGC AGGGGAGCTT TTTGATGCGC TTTCTAGGAG GAGGGAAATT CAGGGGGATT CCATTAACAA GGCCCAGCTG AAGGACTTCT GGGACCAGAT TTCTGACCAG  AATTTCGATT CTAGGCTCAG AACATTCTTT GACATGGTTG ATAAAGATGC GGATGGAAGA ATCACTGAGG AAGAAATTAA AGAGATTATC TGCCTTAGCG CCACTACCAA CAAACTTGCA  AACATACAGA AGCAGGCAGA GGAATATGCG GCTTTGATCA TGGAAGAACT AGACCCTGAA GACACAGGAT TTATCATGGT AAACGATCTA GAGATGCTCT TGTTACATGG ACCAACCCAT  TCTACTAGAG GAGATAGCAA GTACCTGAGC CAAATGCTAA GCTTAAAGCT TAAGCCTGTA GATGAAGACA ATCCTATTAG GAGGTGGTAC ACAAACACCA AGTACTTCCT GCAGGACAAT  TGGCAAAGAA CTTGGGTATT GCTGCTGTGG ATTGGCGTCA TGTTAGGTCT ATTTGCCTAC AAATTTGTGC AGTATAGGAG AGAAGATGCA TATGAGGTGA TGGGCCATTG TGTATGCATG  GCCAAAGGTG CAGCTGAGAC ACTTAAATTG AACATGGCTA TTATCTTGCT ACCAGTTTGC AGAAACACCA TCACTTGGCT AAGGAACAAG ACCAAGCTTG GCATTATGGT TCCTTTTGAT  GACAACCTCA ACTTCCACAA GTGCATAGCT GTGGCAGTAA CAATCGGAGT TGGTATACAT GGCATCTACC ATCTTGCTTG TGACTTTCCT CGCCTTCTTG ATGCAAGTAG CGAAAAGTAC  AAGCTCATGG AACCTTTTTT CGGAGATCAA CCATCAAGTT ATTGGTTTTT TGTCAAATCA TGGGAAGGAG TAACAGGGAT TATCATGGTT GTGCTAATGG CAATAGCCTT CACTTTAGCC  ACCCCTTGGT TCAGGAGAGG CAGGGTCAAG CTACCCAAAC CCCTCAACAA TCTCACCGGC TTCAACGCCT TCTGGTACTC ACATCATCTC TTTGTCATTG TCTATGCACT GCTCATTGTG  CATGGAATCA AACTTTACTT GACCAAGGAA TGGTACAAGA AAACGACCTG GATGTATTTG GCTATTCCCA TTATCATTTA CTTATCAGAA AGATTGACTA GAGCACTCAG ATCAAGCATC  AAGCCTGTGA GAATATTAAA GGTGGCTGTT TATCCTGGAA ATGTGTTGTC TCTTCATATG TCAAAGCCCC AGGGATTTAG ATACAAGAGT GGACAATACA TGTTTCTCAA TTGTGCTGCT  GTGTCTCCAT TTGAATGGCA TCCATTTTCT ATAACCTCCG CCCCTGGTGA TGATTACCTT AGCGTTCATA TCAGAACACT TGGTGATTGG ACCCGGAGTC TCAAAGTCAA GTTCTCAGAG  TGTTGCCAGC CACCGGACAA CGGCAAGAGT GGACTTCTAA GAGCTGAATA CTTGCAAGGA GATAGAAGTC CGAGTACTCT CCCTAAAGTT CTAATTGACG GTCCGTACGG AGCACCAGCC  CAAGACTACA AGCAATATGA GGTGGTTTTG CTAGTGGGGC TAGGAATTGG AGCCACCCCA ATGATTAGTA TACTTAAGGA CATAGTGAAT AACATGAAAG CCATGGAAGA GGAAGAGGAG  ACCAACATAG AGGAAGGAAC AAATAGTGGG TTTGGTAATA AATCACCAAG AGGGTCGTCC CCACACAAGA AAAATAGCTC GAGCAACTTC AACACTAGGA GGGCCTACTT CTATTGGGTG  ACAAGGGAGC AAGGGTCCTT TGATTGGTTC AAAGGGGTGA TGAATGAGGT GGCTGAAGAG GATCATAAGG GGGTGATTGA GCTCCACAAC TATTGCACTA GTGTCTATGA AGAGGGTGAT  GCTCGCTCAG CTCTTATTGC TATGTTGCAA TCTCTAAACC ATGCCAAGAA TGGCGTGGAC ATTGTCTCTG GCACGCGTGT AAAGTCCCAC TTTGCTAAAC CTAATTGGCG CGCTGTCTAC  AAGCGCATTG CGGTTAGTCA TCCACGAGCT CGTGTTGGGG TATTTTACTG TGGGCCACCA GCGCTAACCA AAGAGCTTGG TCAGTTAGCT TCGGATTTCT CTCACAACAC AAACACGAAA 
TATGATTTCC ACAAGGAAAA TTTCTAA 

Retrieve as FASTA