Entry information : GmRboh03 (GmRboh3 / Glyma04g38040.1)
Entry ID 7175
Creation 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh03 (GmRboh3 / Glyma04g38040.1)
Name (synonym) GmRboh03 (GmRboh3 / Glyma04g38040.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh03
start..stop
S start..stop
GmRboh07 1684 0 1..859 79..941
MtRboh04 1522 0 1..859 73..923
MtRboh01 1367 0 1..859 52..898
NbRboh02 1358 0 1..859 76..939
Literature and cross-references GmRboh03 (GmRboh3 / Glyma04g38040.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01002697.1 (13641..7372)
EST ref. GenBank:   GR840497.1 [3' end]   BQ253515.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.19793
Protein sequence: GmRboh03 (GmRboh3 / Glyma04g38040.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   859
PWM (Da):   %s   97416.71 Transmb domain:   %s   o292-314i374-396o434-456i469-491o506-523i659-676o
PI (pH):   %s   8.91
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDIQGDSVAL HSVKTVNNDQ SEDEKLILLG KGMEKKRSFG ASVVRSASIR IQQVSQELKR FASLSKQTAS SRLHYDRNKS AASHALKGLK FISKTDAGAG WVEVERQFDA LTASTNGYLH  RSLFAKCIEM NKESEAFAGE LFDALSRRRE IQGDSINKAQ LKDFWDQISD QNFDSRLRTF FDMVDKDADG RITEEEIKEI ICLSATTNKL ANIQKQAEEY AALIMEELDP EDTGFIMVND  LEMLLLHGPT HSTRGDSKYL SQMLSLKLKP VDEDNPIRRW YTNTKYFLQD NWQRTWVLLL WIGVMLGLFA YKFVQYRRED AYEVMGHCVC MAKGAAETLK LNMAIILLPV CRNTITWLRN  KTKLGIMVPF DDNLNFHKCI AVAVTIGVGI HGIYHLACDF PRLLDASSEK YKLMEPFFGD QPSSYWFFVK SWEGVTGIIM VVLMAIAFTL ATPWFRRGRV KLPKPLNNLT GFNAFWYSHH  LFVIVYALLI VHGIKLYLTK EWYKKTTWMY LAIPIIIYLS ERLTRALRSS IKPVRILKVA VYPGNVLSLH MSKPQGFRYK SGQYMFLNCA AVSPFEWHPF SITSAPGDDY LSVHIRTLGD  WTRSLKVKFS ECCQPPDNGK SGLLRAEYLQ GDRSPSTLPK VLIDGPYGAP AQDYKQYEVV LLVGLGIGAT PMISILKDIV NNMKAMEEEE ETNIEEGTNS GFGNKSPRGS SPHKKNSSSN  FNTRRAYFYW VTREQGSFDW FKGVMNEVAE EDHKGVIELH NYCTSVYEEG DARSALIAML QSLNHAKNGV DIVSGTRVKS HFAKPNWRAV YKRIAVSHPR ARVGVFYCGP PALTKELGQL 
ASDFSHNTNT KYDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 04, 11 introns) and 3 ESTs. Unigene mix ESTs from GmRboh07. Position chromo Gm04:44456113..44463057
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACATCC AAGGTGACTC TGTGGCACTT CACAGTGTCA AAACTGTTAA CAACGATCAA AGCGAAGATG AGAAACTGAT TCTGCTTGGC AAAGGCATGG AGAAGAAAAG GTCCTTTGGT  GCCTCCGTTG TGAGAAGTGC TTCCATTCGT ATACAACAAG TGTCTCAGGA GCTGAAGCGT TTTGCTTCCT TGTCGAAGCA AACTGCATCT TCCAGATTGC ACTATGACAG GAACAAATCC  GCGGCTTCTC ATGCTCTCAA GGGACTCAAG TTTATCAGCA AGACTGATGC TGGTGCAGGG TGGGTTGAGG TTGAAAGGCA GTTTGATGCT CTCACTGCTT CCACTAATGG ATACCTGCAT  CGCTCTCTCT TTGCCAAGTG CATAGGTATA TTTGAGTTGA TCACTGGTCG AGAAATTACT CCATGGTCCG AGACTGTCGT GGTCACGGAT AATCTCCATG TGACACATAG CATAACTGAG  TTTTATTGAT TCTTTCTCGT AAATTGAGAA AAACTCAGTT ACCTGTCACG TGAAGATTAG TCATGATCAT GGGCACTTGG TGGTTCTGGA TCATGTGATA ATTTCTCGTG TTTTTTTTTC  TTTACTTAGC TTCAAATGTT TGTTGTTGGT GTATGGAGTG GTTTTTTAGA TGCGTTTGGT TTTAATTGTA GAGATGAACA AGGAGTCAGA AGCCTTTGCA GGGGAGCTTT TTGATGCGCT  TTCTAGGAGG AGGGAAATTC AGGGGGATTC CATTAACAAG GCCCAGCTGA AGGACTTCTG GGACCAGATT TCTGACCAGA ATTTCGATTC TAGGCTCAGA ACATTCTTTG ACATGTAAGT  CTATGTTTGG TGTTTAGTTT CGTTCAAAAA GTAAAACGGA AAAGGCCTCG TTTGGTTTTC AGTAGGGTCT GATTGTAAAC TGAGTTTTGT TTTAATTTTC CCTCAAAACA CAGTTTGAAA  TAAGAGAAGA GAGAAGGTTG CTTTTGGGGT CTTAATTTGT AAAATGAAGT TCATTAAAAA AGTTTGCAAA CTATATTCCA AACATACACT AATTCTTTGA TCTTTGCTTT TTCTGGTTTA  TAAAGTTTAA GTGAAAAAAT ATGTGGCGAA TGTCCTGAAA TATGTTACCA AGCTTAATTT GTAATGCAGG GTTGATAAAG ATGCGGATGG AAGAATCACT GAGGAAGAAA TTAAAGAGGT  ATGGCATCAT AAATTCACCA CTAAGGAATT CTAATATTGT TACTTTTTAG TCTCATCAAC TCACAGAATT AGTAAAGTAG TTTTATGGGA AACTTTTTTT CTGGTTTGCA TTTTGTTCCC  ATTGGAATAG GATTTTCCTT GATTGTGTGA TCGATTCTGT TTTCAGATTA TCTGCCTTAG CGCCACTACC AACAAACTTG CAAACATACA GAAGCAGGCA GAGGAATATG CGGCTTTGAT  CATGGAAGAA CTAGACCCTG AAGACACAGG ATTTATCATG GTAATTAGTA ATTGGATAAG CCTATTATTT CATATTCATA AGATAGGCAT CAAAATGTTT TCACTATTAT AGATTCTCAT  CTTAGCCACA TTTCTTTGGC CATTTGGTGA TTATTAATGT GAAAACAGGT AAACGATCTA GAGATGCTCT TGTTACATGG ACCAACCCAT TCTACTAGAG GAGATAGCAA GTACCTGAGC  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TATAAATTCT TTAGGCTTAT TTTTTAATTT ATAATGTATT TTCAACAAAA TAAGCATACC CTTTATCATT ATATTTTTTC TTTTATTTTT CTAGTTAAAT AAAAATCAAT CATTTACACT  ATGTAAAACT TTATTTGTTG GGTTAGACTT AGAAACTCAT TCGCCAAAAC ATTGGGATTG GGCATCTAAA TTAAACAAAC TTGTTTTGTT GTCGTTATTT AGCTTGGTGT CAATAAATAA  TAATGTTTGC CGACATTCCC GATGCCACCT TCCCACGAGC TTAGATTTTT TATCGTCCTA GTGGCCAAAG CAAACGGTTG CTATTATTTC GATTTCGGAC TTAGAAAATT ACTATTATTA  TTAAAAAAAA ATAAAGGAGA TAAGGACGCT TGTTGAAAAT GCTTGTTTAT TGTTTGTAAG CGTGGTAGGT AATCAATCAG CCCAAGCAAT TTTATTCATT TTGAATTGAT TAAGTGTTAA  TTAAACACAT AACCCAAACG CTTTAAAATG TTCTGAATCA GACTTACAAA TTGTCATTTT CCCCTTATGC CATCGTGTGA AGTATATTCT TACAACTTCA ATTGTATAGT GACAGGCAAA  TGATACTTTA TTTTAGTATA TACAAGTTCT ATTGCTTAAT TAGTGGCAAA CAAGTAGTAA TTTTCAACCT TCATTATATT ATCATGTAGT ACTCTCCCTA AAGTTCTAAT TGACGGTCCG  TACGGAGCAC CAGCCCAAGA CTACAAGCAA TATGAGGTGG TTTTGCTAGT GGGGCTAGGA ATTGGAGCCA CCCCAATGAT TAGTATACTT AAGGACATAG TGAATAACAT GAAAGCCATG  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Retrieve as FASTA