Entry information : GmRboh05 (GmRboh5 / Glyma05g33280.1)
Entry ID 7176
Creation 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh05 (GmRboh5 / Glyma05g33280.1)
Name (synonym) GmRboh05 (GmRboh5 / Glyma05g33280.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh05
start..stop
S start..stop
GmRboh08 1566 0 1..880 1..888
MtRboh01 1402 0 1..880 1..898
MtRboh04 1260 0 22..880 38..923
GmRboh07 1251 0 1..880 7..941
Literature and cross-references GmRboh05 (GmRboh5 / Glyma05g33280.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01003230.1
EST ref. GenBank:   EV266544.1 [3' end]   AW621060.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.2688
Protein sequence: GmRboh05 (GmRboh5 / Glyma05g33280.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   880
PWM (Da):   %s   99243.74 Transmb domain:   %s   o321-343i408-427o461-480i501-523o536-553i697-714o
PI (pH):   %s   8.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGTSADLHH HESDIELTDA ERTDTKLGAS DSKAGNDVGL DSGTKSQAEA EGQHYVEVTM DIHRDSVALH SVKTVAAGVD MSAANRMKQL KRLASFSKPA PKHFERTKSA VGHALTGLKF  ISKTDGGAGW GEVEKQFNKL TATTGGYLPR ALFAQCLGLN KESEAYAEKL FDTLARQRGI QGGSINKIQL KEFWDHISDQ SFDTRLKTFF DMVDKDADGR ITEEEIKEII CLSATANKLS  NIQKQAEEYA ALIMEELDPA DTGYIMIDNL ETLLLHEPEE TTRGESKYLS QMLSQKLKST FADSAIMRWC RDAKYFLLDN WQRSWVLALW IGVMLGLFAY KFVQYRRKAA YEVMGHCVCM  AKGAAETLKL NMALILLPVC RNTITWLRNK TKLGVVVPLD DNINFHKVIA VAIAVAVAVH SIYHLTCDFP RLLHASDEKY KLMQPFFGDR PSDYWYFVKS WEGVTGIIIV VLMAIAFTLA  NPRFRRGRAK LPKPFNKFTG FNAFWYSHHL FVIVYALLVV HGIKLYLTKE WYKKTTWMYL AIPITIYALE RLVRAFRSSI KSVTLYPGNV LSLKMSKPHG FSYKSGQYMF VNCAAVSPFE  WHPFSITSAP DDDYLSVHIK ILGDWTRSLK AKFTQKETHD PEDISHRLAA RIGVDHTWIA TKPFNYALID KKQGSFPKVL VDGPYGAPAQ DYREYEVVLL VGLGIGATPM ISILKDMVNN  FKAIDEEEGI GGAKSPTRLS DFKTSRAYFY WVTREQGSFD WFKGVMNEVA EEDRRKVIEL HSYCTSVYEE GDARSALIAM LQSLNHAKNG VDIVSGTRVM SHFAKPNWRS VYKRIALNHP 
DARVGVFYCG PSALTHELRQ LALDFSHNTS TKYDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 12 introns) and ESTs. Unigene contains ESTs from GmRboh05 and 08. Chromo position Gm05: 37994031..37999294.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA CTTCTGCAGA TCTTCACCAC CATGAATCAG ATATAGAACT CACTGATGCT GAAAGGACTG ACACGAAGTT AGGGGCTTCT GATTCAAAAG CTGGCAATGA TGTTGGACTT  GACAGTGGCA CCAAATCCCA GGCTGAAGCT GAAGGACAAC ACTACGTGGA GGTGACCATG GACATTCATC GTGACTCTGT GGCATTACAC AGTGTTAAAA CTGTTGCAGC CGGTGTTGAC  ATGGTGGAAG AAGAAGGTGA TAAATTGGGT TTGATGGGCA AGAGGCTTGA GAAGAAAACA ACCTTTGGTG CCTCTGTGGT TCAGAGTGCT GCCAATCGCA TGAAGCAGCT GAAGCGTTTG  GCATCATTTT CAAAACCAGC GCCCAAACAC TTTGAAAGGA CCAAGTCTGC AGTGGGTCAT GCTCTCACAG GGCTCAAGTT TATCAGCAAG ACCGATGGTG GCGCAGGATG GGGTGAGGTG  GAGAAGCAGT TTAACAAGCT TACTGCTACC ACTGGTGGCT ATCTTCCTCG TGCTCTCTTT GCCCAATGCT TAGGTACCTA AACCCCCATC TTGCTTCAGA TGATAGGAAT GTAAATATAT  AGTTTCTGAA TTCTGAGTAT ATCATATAAT TGGATTTGAT TGTAGGGTTG AACAAGGAGT CTGAGGCTTA TGCAGAGAAG CTTTTTGATA CTCTTGCTAG GCAGAGAGGT ATTCAGGGGG  GTTCCATTAA CAAGATCCAG TTGAAGGAGT TCTGGGATCA TATTTCTGAC CAGAGCTTTG ATACTAGGCT CAAAACATTC TTTGACATGT AATTTAATGT TTTGGTTAAT ATAAACATGA  ACGCAATTGT TTGGGTTCTC TCTGTAAGTA TATATCACCC TTGACCTGAT CAATATTAAT TTGGATTTGT AATGCAGGGT TGATAAAGAT GCCGATGGCA GAATTACCGA GGAAGAAATT  AAAGAGGTAC AGCTCAAATC ATTAATTCAC CACTAACTGT ACAGACTTCA CTTTCCAAGT TTGTTCAACA TACAAAAGTT GTTTTATTAG CAAATTCTTC TAGTCTGAAT CCGATTAAGA  TTTTCCTTGA TCACATGTGA TCAATTCTGG TCTCAGATTA TCTGCCTTAG CGCCACTGCC AACAAACTGT CAAACATCCA GAAACAAGCA GAGGAATATG CGGCTTTGAT CATGGAAGAA  TTGGACCCTG CTGACACAGG ATACATCATG GTAAATGAAT AGCCTATCCT GCAATTTCCA GATTGGAAAA GCCCCATTAA CTTTTATAGA ATTCTCCACC TAGCCTAATT CCTTTAGCTG  TTTGGCCATA TTTTATTTGG AAAAACAGAT AGACAACCTG GAGACGCTCT TGTTGCATGA ACCAGAGGAA ACCACAAGAG GAGAAAGTAA ATACCTGAGC CAAATGCTAA GTCAAAAACT  TAAGTCTACA TTTGCCGACA GTGCAATTAT GAGGTGGTGT AGAGATGCCA AGTACTTCTT GCTGGACAAT TGGCAAAGAT CTTGGGTACT TGCACTTTGG ATTGGTGTGA TGTTAGGTCT  TTTTGCCTAT AAATTTGTGC AATATAGGAG AAAAGCAGCC TATGAGGTGA TGGGCCATTG TGTATGCATG GCAAAAGGTG CAGCCGAGAC ACTTAAATTG AACATGGCTC TTATCTTGTT  ACCTGTTTGC CGCAACACCA TCACCTGGCT GAGGAATAAG ACCAAGTTAG GTGTTGTAGT TCCTTTGGAT GACAACATCA ACTTCCACAA GGTAATTTTT ACTTCTGATT GCTCCTTCAA  GAGTGACAAA AAAAGGAAAC ATATCTACTT CAATTCATAT GTTTGTTGGG TTATATAGCA GCTTTCACAA GTCAACAAGG CATGCAAATT TATAGTTGTA CAAATGGGAG TATTTTTTGC  AGGTGATAGC TGTGGCAATA GCAGTTGCTG TTGCTGTACA TTCCATCTAT CATCTTACTT GTGATTTTCC TCGCCTTCTT CATGCAAGTG ATGAAAAGTA CAAGCTGATG CAACCTTTTT  TCGGAGACAG ACCATCAGAT TATTGGTATT TTGTCAAATC ATGGGAAGGA GTAACAGGGA TCATAATAGT TGTGCTAATG GCAATAGCCT TTACGCTGGC TAATCCTAGG TTCAGGAGAG  GCCGGGCCAA ACTACCCAAA CCTTTCAACA AATTCACAGG TTTCAATGCC TTTTGGTATT CGCATCACCT CTTCGTCATT GTCTATGCCC TGTTGGTTGT ACATGGAATC AAACTTTACT  TAACTAAGGA ATGGTACAAG AAAACGGTTA GCACCTTCAG TTGAACCTTA TATTTATGTA GTTGTTTTGG ATTGAAAAAT AATCGATTAA AATGCACTTG ACATTATGTG ATTGATAGAC  CTGGATGTAT CTGGCTATTC CCATCACCAT TTATGCATTG GAAAGACTGG TTAGAGCATT CAGATCGAGC ATTAAGTCCG TCAGAATATG AAGGTAAGTA TCAAATAATT AAAATTCAAT  TATTTTCTAT ATGAAGAAAC ACATTACTCC ATCAAAATTA CTTTTGGCCA AGATTAAAAA GTATGCGTAT CGCCAACTTT GAAGGTGACT CTTTATCCTG GAAACGTGTT ATCACTTAAA  ATGTCAAAGC CGCATGGGTT TAGCTACAAA AGTGGACAAT ACATGTTTGT GAACTGTGCT GCTGTGTCTC CATTTGAATG GTATGCATTT GAAGAAACAT ATTCTAAATG AAATGTTTGC  ATGTAAATAC CTTCATAACA CCCTGAGGTG CTTTGTTTAC GCATTCATAG GCATCCATTT TCCATAACTT CCGCCCCTGA TGATGATTAC CTTAGCGTTC ACATAAAAAT ACTTGGTGAT  TGGACTCGAA GTCTGAAAGC CAAATTCACA CAGGTGAATT CCACCCCTCC CCTTGAATGT GGGTTTCTCG TAATTTCCCA ATCCATATTG CTTTGGTTTC TTTCAGGCGT GCCAGCAACC  CCTCAATGGA CAGAGTGGAC TCCTAAGAGC TGAATGCTTG AAAGGAGATA ACAGCCCAAG GTAAGTCCTA TTTTGTTTTC AGTTACTTTC TTTAAATAGG GAAATTTACT AAGTATATGA  TGGATAGCCA AGGCAAAAAC TATAGTTTGG CACTTCACCA TGATGGGGAT AACATTAAAT ATATAAAAGT TTGTATCAAT TCCATCAGTT ACTAATTCAC CAAAAAAAAA TCATCAATTA  CTCTAATCAA ATCTAATATA GATACAATTA ACTGAATGTT TATATATTTT AATTTGTTAA AAATAATTAT CAATTTAATA ATGCGCTGTA ATAAAAGTTT CAGAACACCT TGAATTTAAT  ATTTATTAAT TTAATTAATT ATCATATTAA CTCTTTTTAC TATGTAGTTT ATGCTTTAAT TTATTTATTC TGAAAACCCA CGAAAGTTCC ATATTTGTAA AATTTGCTAG TAAACTTGGA  GTTTAAATCA CACCAGAACC ACTTATAATT AAGGTTAGGA TGCTACTCTG TTAAAAACAC GTGTAGAAAT TAATGACACT TTGTATACTG AAAAACCCTT CACCAAATTT TGACCTTTTT  TTTATATAGG GAAAATTAGC GATCCAATAA TTGATGACTG CTGGATAACA CATAACAAGT TGGTGGTAGC ACATAGCGCG TTCGTTTGAA ATTAATTAAC AAAACTTTGG CATCATGCTC  ACATGCTTAG TATTTTGGAA AATGTTATGT GAACATTAAA ATGAGATAAT AAAAAGCTGT CAATCTTGAG TTTGAGATAT ATTTTTAAAA TGTGTACATG CAAAAAATAC AAAATGAAAA  AATATAGAAA ATTATATATA ATATCAAGTA CTACTATGTT AGTTTTTTGA TGTTCAAATA AGAATAAGAA TATGTGGACA TTCATATATT ACACATACTT ATTAGACACT TTTAATTTCT  ATTCGGCTCT TCTTGTTGTA TCATATTATT ATCTACTACA AGTGTGTGTG TATGATTTAT ATTTTATAAT CAAATTCTAT TGTCACGCGG GGGAAAAGGT GGGGTTGTTA TCTGGACTCA  AAAAAATATT AGGGTGATAA GGACGCCTAT TGAAAATTTC TGCATGCAAG TTTAAGTTGT CAGTTCAAGC ATTTAATTAG TCGAGTTCAT AAGATATTGA AAAATAAGTA ACCCTGTAAC  CCCAATAAAA TAGAAAGAAA CACATGACCC AGAAGATATA TCGCACAGGC TGGCAGCGAG GATTGGAGTC GATCACACTT GGATAGCAAC AAAGCCTTTT AATTATGCGT TGATTGACAA  AAAGCAGGGG TTCTTTATTT ATGATCATGT GTTATATATA TGTGCAGTTC CTTTCCAAAG GTTCTGGTGG ATGGTCCATA TGGGGCGCCA GCGCAAGACT ACAGGGAGTA TGAGGTGGTG  TTGCTAGTGG GGCTTGGAAT TGGGGCTACC CCAATGATAA GTATACTAAA GGACATGGTG AACAATTTTA AGGCCATTGA TGAGGAGGAG GGAATAGGTG GTGCTAAATC ACCAACGAGG  TTGAGTGACT TCAAGACAAG TAGGGCATAC TTCTATTGGG TGACTAGAGA GCAGGGTTCA TTTGACTGGT TCAAAGGGGT CATGAACGAA GTGGCCGAAG AGGACCGAAG GAAAGTGATT  GAACTCCACA GCTACTGCAC CAGCGTCTAC GAAGAGGGTG ATGCTCGCTC TGCTCTTATT GCTATGTTGC AGTCCCTAAA CCATGCAAAG AATGGAGTGG ACATTGTCTC TGGCACACGC  GTCATGTCTC ACTTTGCCAA ACCCAATTGG CGCAGTGTCT ACAAGCGCAT TGCGCTTAAT CATCCAGATG CCCGAGTTGG TGAGTTCCCA CCCCCACTCC ACTCCTTCAA CTCATCACGT  TGCGTTTGTT AATTTCTATC ATTCAGCCAC TTCAATAATT ACGGATCCAT TATAGAATAT GCTTCTTTCT TTTTTTTTTT CAAAAGACGC ATGCTTGTGG TTGTCACTAG GCTGATTGCA  TTTCGATCAA CATCAATCAT TTATGATTTT TGACATGTTT CATCGAATTC AAGACTTATC ATTAAATTAC AATTTAGATA GATTTAGACA GCATGCTTTA TTTATGTAAT GCAGGGGTAT 
TTTACTGTGG GCCATCAGCC CTCACCCATG AGCTTCGTCA GCTAGCATTG GATTTCTCTC ACAACACATC CACCAAGTAC GACTTCCATA AAGAAAATTT CTGA 

Retrieve as FASTA