Entry information : GmRboh04(GmRboh6 / Glyma.05G021100 / Glyma05g00420.1)
Entry ID 7177
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh04(GmRboh6 / Glyma.05G021100 / Glyma05g00420.1)
Name GmRboh04(GmRboh6 / Glyma.05G021100 / Glyma05g00420.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh04
start..stop
S start..stop
GmRboh13 1568 0 1..820 1..821
PvRboh07 1482 0 1..820 1..823
PauRboh09 1481 0 1..820 1..814
CcajRboh01 1476 0 1..820 1..818
Literature and cross-references GmRboh04(GmRboh6 / Glyma.05G021100 / Glyma05g00420.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01002754.1 (20073..25784)
Protein sequence: GmRboh04(GmRboh6 / Glyma.05G021100 / Glyma05g00420.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   820
PWM (Da):   %s   93069.9 Transmb domain:   %s   o290-309i374-393o424-446i471-493o503-520i648-665o
PI (pH):   %s   9.77
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDGLVKSQAP HERSLIALFK SSPSSSSFSS SSWTSEVVLQ IQTESKVRRE CGPNDVADLR SEQTLSHITE NEEIQGVGFI NGIVGRIGME WKDLEKRFDQ VARTESGAEP AVTWSEFGFC  IGMQSSPEFA NELLRALRRG KGWKSNITKT DLYHLWFRMK DNSFNSRMRI FFDMCNRNKD GRVTETDIKQ TILLTASTNK LSVTHDEAED YASLIMESLD KKNKGYIEIS QMGSLFKATT  SLSNSKAHFP MKKVPAAGSS TQNVQNTSGD FCEEREEPMS RTEVLFRTYW RRAWIVLVWL LACLGLFVWK FVQYRHRSGF EVMGYCLSTA KGAAETLKLN MALVLLPVCR NTITWLRKHR  PINSVIPFND NINFHKLIAG GIVVGVILHG GTHLACDFPR ISESDKSIFR QTIASGFGYH RPTYAQILAT TEVASGIGMV VLMGIAFALA TKWPRRRSPV LPVSLRRVTG YNTFWYSHHL  FVLVYALLII HSMFLFLTDK LMEKTTWMYI AFPVLLYAGE RIFRAIRSGS YEVDILKASL YPGKVLYLKM QKPEGFKFHS GMYIFIQCPQ ISPFEWHPFS LTSGPQEDYL SVHIRTLGDW  SYQIYDLFQE AVLSRSQGCP KLYIDGPYGS AAQDHVKYDI LVLIGLGIGA TPFISILKDV VKGVQTTQND HSGLRQCSLT KGPLKAYLYW VTREPNSFDW FRDVMKEISI STKKQSVVEM 
HNFLTSVHPE GDIRSALLSV IQALHLAKNG TDIVSRTPIH THFARPNWFN IFSRLARKHG GAKIGVFYCG PSKLARELKK LCTKFSTKTT TRFVFHKENY * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 14 introns). Position chromo Gm05:197274..202985.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGGTC TTGTAAAGTC CCAAGCTCCT CATGAACGTT CCCTCATTGC TCTCTTCAAA TCATCTCCTT CTTCTTCCTC CTTCTCTTCT TCTTCTTGGA CCTCTGAAGT AGTCCTTCAG  ATTCAGACAG AGTCCAAGGT TCGGCGCGAA TGTGGGCCTA ACGATGTAGC AGACTTGAGA TCGGAACAAA CACTTTCTCA CATAACAGAA AATGAAGAAA TTCAAGGCGT GGGGTTCATC  AATGGCATTG TTGGCCGCAT CGGAATGGAG TGGAAGGATT TGGAGAAACG GTTCGACCAA GTGGCACGAA CCGAAAGTGG CGCCGAACCG GCTGTGACAT GGTCCGAATT TGGCTTCTGC  ATTGGTGAGA ATAGCAAATT AAAGTCAACA GTACATTATC ACTTTGTTTC ACGACCACAA ATACAATAAT TCACAATGCA TTAATGCATG ATGCTCATTG AGACTTTGAG AAGTCCTTTT  CGGTGTCTCT TGTGTTTATC ATCTGGCACC GATCAATTAA CACGAGAATA ATAGCAAGCA GAGCAGTTAG CCACCTTAGC CATGTTCTTC GGATACGCTA TAGTTCCGTA ATATAAGACA  ACTTGTTTCA CTTTTTAATT ATTCTTCTTC CTACTTTTAT TTAGTTCAAT GATCAATGTT CAACACTTTA TTTCTCCTTT TTAATTAATT CTCCATTAGT TTAATATCCT TTTTAATAAT  ATCAAAAAAC CAAATGCGTT ATCTACACCT ACCTGTTCTT AGTTTATTCT GATCTTATTA TGCCAATTAT TGTTTTAGTT TTTCACTTTC AATTATGTCC TATTTTATAG GGATGCAGTC  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TTGAAGAAGT TGTGCACCAA ATTTTCCACC AAAACCACAA CTAGATTTGT TTTCCACAAG GAAAATTACT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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Retrieve as FASTA  
cDNA
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TTTAAAAGGG TATCCGTACA ACATTTCAAT GAACTGTGGA TTTTGA 

Retrieve as FASTA