Entry information : GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Entry ID 7178
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Name GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh13
start..stop
S start..stop
GmRboh04 1570 0 1..821 1..820
PauRboh09 1492 0 1..821 1..814
PvRboh07 1476 0 1..821 1..823
CcajRboh01 1475 0 1..821 1..818
Literature and cross-references GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
DNA ref. GenBank:   ACUP01009771.1 (330375..324186)
EST ref. GenBank:   CO985132.1 [5' end]   BM523487.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.6385
Protein sequence: GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   821
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PI (pH):   %s   9.97
Sequence
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Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 17, 14 introns) and 9 ESTs (BE555472.1, BQ081563.1). Chromo position Gm17:6368476..6374763.
DNA
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ATGGATGGAC TTGTAAAGTC TCAAGTTCCT CATGAACGTT CCCTCCTTGC TCTCTTCAAA TCATCACCCT CTTCATCATC GTTATCTTCC TCATTCTCTT CTTCTTGGAC CTCTGAAGTA  GTCCTTCAGA CAAGGTCCAA GATTCGGCGT GAAGGTGAGC CTAACAATGT AGCAGACTTG AGATCGGAAC AAACACGTTC TCACATAATA GAAAATGAAG CAATTCAAGG TGTGGGATTC  ATCAATGGCA TTGATGGTCA CAGTGGAATG GAGTGGAAGG ATTTGGAGAA ACGGTTCGAC CAGGTGGCAC GAACCGGAAG TGGAGCCGAA CCGGTTGTGA CATGGTCCGA ATTTGGCTTC  TGCATTGGTG AGAATAGCAA ATTAAAGTCA ACAGTTCATG TAATAACATT AATTATAACT TTGTTTCACG ACCACAAATA CAATAATTCA CACAATGCAT GATGCTCATT TGAGACTTTG  ATAAGTCCTT TTCGGTGTCT CTAGTGTTTA TCATCTGGCA TTGGTCAATT AACACGAGAA TAATAGAAAG CAGAGCAGTT AGCCACCTTA GCCATGTTCT TCGGATACGC TATAGTGCCG  TAATATAAGA CAACCAGTTT AATTTTTATT TTTTTTTATT CTTCTTCCTA CTTTAATTTA GTTCAATGAT CAATGTTCAA CACTTTATTT CTCCTTTTAT AATTCTCCAT TAGTTTAATA  TCCTTTTAAT AATATAAAAA AAAACAAATG CGTTATCTAC ACCTACCTGT AACCTGTTCT TAATTTATTC TGATCTTATT ATTATGCCAA TTATTGTTTT AGTTTTTCAC TTTCAATTAT  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Retrieve as FASTA  
CDS
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Retrieve as FASTA  
cDNA
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GAACAAATCT TGTACAATTT AACGGGTATC CGTATAACAA CATGTCAATA AACTGTGGAT TTTGAATCTA CA 

Retrieve as FASTA