Entry information : GmRboh17 (Glyma11g02310.1)
Entry ID 7179
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-05-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-05-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh17 (Glyma11g02310.1)
Name (synonym) GmRboh17 (Glyma11g02310.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh17
start..stop
S start..stop
GmRboh01 1885 0 1..927 1..927
GmRboh12 1633 0 1..927 1..941
GmRboh06 1627 0 1..927 1..941
MtRboh05 1609 0 1..927 1..944
Literature and cross-references GmRboh17 (Glyma11g02310.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01006267.1 (131436..121780)
EST ref. GenBank:   BU579343.1 [5' end]   BW679457.1 [5' end]   GR843332.1 [Fragment]
Protein sequence: GmRboh17 (Glyma11g02310.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   927
PWM (Da):   %s   105794.44 Transmb domain:   %s   o362-384i504-526o546-568i725-742o
PI (pH):   %s   9.41
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNGAPKHERR WASDTVPEMA FVSAGTSPGT EYNSVTDEYV EVTLDVQDDH TIVLRGVEPV TVVNVDDGVA TSGNETPASS AWSPSIRRSS PNRWRQFSQE LKAEAVAKAR QFSQELKAEL  RWFSWSQGGS EAALVARDLR KQRAQLERNR SDTKKALRGL KFISSKSNGV DAWNEVQSNF YSLAKDGYLY RTDFAQCIGM KDSKEFALEL FDALSRRRRL KFEKISRDEL NEFWSQITDQ  SFDSRLQIFF DMVDKNEDGR IIEEEVKEII MLSASANKLS RLKEQAEEYA ALIMEELDPE RLGYIELWQL ETLLLQKDTY LNYSQALSYT SQALSQNLQG LRARSPIRRM SRRMLYYLQE  NWRRLWVLAL WISAMIGLFT WKFIEYKRKN AYHIMGNCLL AAKGAAETLK FNMALILLPV CRNTITWLRS TKLAYVAPFD DNINFHKTIA AAVMIGVILH AGNHLACDFP RLVSSSEKDY  KTYLDGVFGD HRPSYGDLVK GVEGVTGILM VILMAIAFTL ATKWFRRNLI KLPKPFNRLT GFNAFWYSHH LFVIVYVLLI IHGVSLYLER RWHRQTTWMY LAVPILLYAG ERTLRFFRSG  FYTVRLIKVA IYPGNVLTLQ ISKPSQFRYK SGQYMFVQCP AVSPFEWHPF SITSAPDDDY LSVHIRQLGD WTQELKRVFS AACEPPVAGK SGLLRADETT KKCLPKLRID GPYGAPAQDY  RNYDVLLLVG LGIGATPFIS ILKDLLNNII KMEELADSVS DSSRGSDLST GSADSISSNK ISPKRKKTLK TTNAYFYWVT REQGSFDWFK GVMNEVAELD QRGVIEMHNY LTSVYEEGDA 
RSALITMVQA LNHAKNGVDI VSGTRVRTHF ARPNWKKVFS RICSKHCNGR IGVFYCGAPV LAKELSKLCF EFNEKGQTKF EFHKEHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 11, 13) and 6 ESTs. Chromo position Gm11: 1447465..1457799
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAACGGTG CTCCCAAGCA CGAACGCCGC TGGGCGTCCG ACACCGTGCC GGAGATGGCA TTCGTCAGCG CCGGGACTTC GCCGGGAACT GAGTACAACT CCGTCACCGA CGAGTACGTT  GAGGTCACTC TCGATGTTCA AGACGATCAC ACCATCGTTC TCCGCGGCGT TGAGCCGGTG ACTGTCGTTA ACGTCGACGA CGGCGTCGCC ACAAGCGGAA ACGAAACTCC GGCGTCCTCT  GCGTGGTCGC CGTCCATCAG GAGGAGCTCT CCCAACCGGT GGCGGCAGTT CTCGCAGGAG CTGAAGGCCG AGGCGGTTGC GAAGGCGAGG CAGTTCTCGC AGGAGCTCAA GGCGGAGCTG  CGGTGGTTCT CGTGGAGCCA AGGCGGATCT GAAGCGGCGT TGGTAGCTCG AGATCTCAGG AAGCAGCGCG CTCAGCTTGA ACGCAACCGT TCGGATACGA AGAAAGCGCT CCGTGGACTG  AAATTTATTA GCAGTAAATC CAATGGCGTT GACGCCTGGA ACGAAGTGCA AAGCAATTTC TATAGTCTAG CCAAGGACGG TTATCTGTAT CGCACTGATT TTGCGCAATG CATAGGTACG  ATTCCTTTTC AAATATCAGT TCACATTCGT GCGTTTTGCA TGTGCATTTA ATCGGTTTGA TTTGTCGTCG TCATTTTTAC TCCTTGTTTG AAGAGTTTTG TATGTTTTAT TTTTATTTTT  TTTAAGGGAT GAAGGACTCT AAGGAGTTCG CTCTGGAACT ATTCGACGCG CTGAGTCGTA GACGGAGACT GAAGTTTGAA AAGATCAGCA GAGACGAGCT TAACGAATTC TGGTCGCAAA  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TTCGAGTTCA ACGAAAAAGG TCAAACAAAA TTTGAGTTCC ACAAGGAGCA TTTCTAA 

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