Entry information : GmRboh08 (GmRboh8 / Glyma08g00880.1)
Entry ID 7181
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh08 (GmRboh8 / Glyma08g00880.1)
Name (synonym) GmRboh08 (GmRboh8 / Glyma08g00880.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh08
start..stop
S start..stop
GmRboh05 1567 0 1..888 1..880
MtRboh01 1509 0 1..888 1..898
MtRboh04 1352 0 30..888 53..923
GmRboh07 1348 0 1..888 7..941
Literature and cross-references GmRboh08 (GmRboh8 / Glyma08g00880.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01004536.1 (116789..121874)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.2688
Protein sequence: GmRboh08 (GmRboh8 / Glyma08g00880.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   888
PWM (Da):   %s   100406.12 Transmb domain:   %s   o343-365i430-449o483-502i523-545o558-575i710-727o
PI (pH):   %s   8.13
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGTCADLHH HESDIELTDA ERIGTDVGPD SGTKSQGEEA EGQHYVEVTM DIHRDSVALH SVKTVAADDV DMVEEEEEEG DKLGLMGKKR LEKKTSFGAS VVQSAANRMK QLKRLASFSK  PAPKHFERTK SAVGHALTGL KFISKTDGGA GWVEVEKRFH KLTATTDGYL PRALFAQCLG LNKESEAYAE KLFDTLARQR GIQGGSINKI QMKEFWDHIS DQSFDTRLKT FFDMVDKDAD  GRITEEEIKE IICLSATANK LSNIQKQAEE YAALIMEELD PDDTGYIMID NLETLLLHGP EETTRGESKY LSQMLSQKLK PTFADSAVMR WCRDAKYFLL DNWQRSWVLA LWIGVMFGLF  AYKFVQYRRK AAYEVMGHCV CMAKGAAETL KLNMALILLP VCRNTITWLR NKTKLGVVVP LDDNINFHKV IAVAIAVAVA VHSIYHLTCD FPRLLHASDE KYKLMQPFFG DRPSDYWYFV  KSWEGVTGII IVVLMAIAFT LANPRFRRGR AKLPKPFNKF TGFNAFWYSH HLFVIVYALL VVHGIKLYLT KEWYKKTTWM YLAIPITIYA LERLVRAFRS SIKSVKILKV TLYPGNVLSL  KMSKPQGFSY KSGQYMFVNC AAVSPFEWHP FSITSAPDDD YLSVHIKILG DWTRSLKAKF TQACQQPLNG QSGLLRAECL KGDNSPSSFP KVLVDGPYGA PAQDYREYEV VLLVGLGIGA  TPMISILKDM VNNFKANDEE EGGQERVSDF KTRRAYFYWV TREQGSFDWF KGVMNEVAEE DRRKVIELHS YCTSVYEEGD ARSALIAMLQ SLNHAKNGVD IVSGTRVMSH FAKPNWRSVY 
KRIALNHPDA RVGVFYCGPS ALTHELRQLA LDFSHNTSTK YDFHKENF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 8, 11 introns) and ESTs. Unigene contains ESTs from GmRboh05 and 08. Chromo position Gm08: 477493..483059.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA CTTGTGCAGA TCTTCACCAC CATGAATCAG ATATAGAACT CACTGATGCT GAAAGGATTG GCACTGATGT TGGACCTGAC AGTGGCACCA AATCCCAGGG TGAAGAAGCT  GAAGGACAAC ACTACGTTGA GGTGACCATG GACATTCATC GTGACTCTGT GGCCTTACAC AGTGTTAAAA CTGTTGCAGC TGATGATGTT GACATGGTGG AAGAAGAAGA AGAGGAAGGT  GATAAATTGG GTTTGATGGG AAAGAAGAGG CTTGAGAAAA AAACATCCTT TGGTGCCTCT GTGGTTCAGA GTGCTGCCAA TCGCATGAAG CAGCTGAAGC GTTTGGCATC ATTTTCAAAA  CCAGCGCCCA AACACTTTGA AAGGACAAAG TCTGCAGTGG GTCATGCTCT CACGGGGCTC AAGTTTATCA GCAAGACCGA TGGTGGCGCA GGATGGGTTG AGGTGGAGAA GCGCTTTCAC  AAGCTTACTG CTACCACTGA TGGCTATCTT CCTCGTGCTC TCTTTGCCCA ATGCTTAGGT ACCAAACCCC ACCCATCTTG CTTCAAATGA TTGATAGGAA TGTAAATATA AACTAGTTTC  TGAATTCTGA GTCTACATAT CACTGGATTT GATTTGATTG TAGGGTTGAA CAAAGAGTCT GAGGCTTATG CAGAGAAGCT TTTTGATACT CTTGCTAGGC AGAGAGGTAT TCAGGGGGGT  TCCATTAACA AGATCCAGAT GAAGGAATTC TGGGATCATA TTTCTGACCA GAGCTTTGAT ACTAGGCTCA AAACATTCTT TGACATGTAA TTCATTGTTT TGGTTAATTT GGATTCTCTG  TAAGTATATA TCACCCTTGA GATGACTTAT ATTAATTTGG ATTTGGAATG CAGGGTTGAT AAAGATGCAG ATGGCAGAAT CACCGAGGAA GAAATTAAAG AGGTACAGTA CAAAATAATT  AATTCACCAC TAACTGTTCA GACTTTTACT TTCCAAGTTT GTTCAACATA CAAAAGTTGT TTTATCAGCA AATTCTGCTA GTCTGAATCT GATTATGATT TTCCTTGATC ACATGTGATC  AATTCTGGAC TCAGATTATC TGCCTTAGCG CCACTGCCAA CAAACTGTCA AACATCCAGA AGCAAGCAGA GGAATATGCG GCTTTGATTA TGGAAGAATT GGACCCTGAT GACACAGGAT  ACATCATGGT ATATGAATAG CCTATCCTGC AATTTCCAAA TTGGAAATTC ACTTTTAAAG AATTATCCAC TTACCCTAAT TTCTTTAACT CTTTGGCCAT ATTTTATTTG GAAAAAAACA  GATAGACAAC CTGGAGACGC TCTTGTTGCA TGGACCAGAG GAAACTACAA GAGGAGAAAG TAAGTACCTG AGCCAAATGC TAAGTCAAAA ACTTAAGCCT ACATTTGCGG ACAGTGCAGT  TATGAGGTGG TGTAGAGATG CCAAGTACTT CTTGCTGGAC AACTGGCAAA GATCTTGGGT ACTTGCACTT TGGATTGGTG TGATGTTTGG CCTATTTGCC TATAAATTTG TGCAATATAG  GAGAAAAGCT GCCTATGAGG TGATGGGCCA TTGTGTATGC ATGGCAAAAG GTGCAGCCGA GACACTTAAA TTGAACATGG CTCTTATCTT GTTACCTGTT TGCCGCAACA CCATCACCTG  GCTCAGGAAT AAGACCAAGC TAGGTGTTGT AGTTCCTTTG GATGACAACA TCAACTTCCA CAAGGTAACT TTTACTTCTG ATTGCTCCTT CAAGAGTGAC AAGAAAAGGA AACATATCTA  TTTCAATTCA AATGTTTGTT GGGTTATATA GCAGCTTTCG CAAGTCAAAA AGGCTTGCAA ATTTATAGTT GTAAAAATGG GAGTATTTTT GCAGGTAATA GCTGTGGCAA TAGCAGTTGC  TGTTGCTGTA CATTCCATCT ATCATCTTAC TTGTGATTTT CCTCGCCTTC TTCATGCAAG CGATGAAAAG TACAAGCTCA TGCAACCTTT TTTCGGAGAC AGACCATCAG ATTATTGGTA  TTTTGTCAAA TCATGGGAAG GAGTAACAGG GATTATAATA GTTGTGCTAA TGGCAATAGC CTTTACGCTG GCTAATCCTA GGTTCAGGAG AGGCCGGGCC AAACTACCCA AACCTTTCAA  CAAATTCACG GGTTTCAATG CCTTTTGGTA TTCCCATCAC CTCTTCGTCA TTGTCTATGC CCTGTTGGTT GTACATGGAA TCAAACTTTA CTTGACTAAG GAATGGTACA AGAAAACGGT  TAGCACCTTC AGTTGACCCT TATATTTATG TAGTTGTTTT GGATTGAAAG ATAATCGATT AACATGCACT TGATATTATG TGATTGATAG ACCTGGATGT ATCTGGCTAT TCCCATCACC  ATTTATGCAT TGGAAAGACT GGTTAGAGCA TTCAGATCGA GCATTAAGTC CGTCAAAATA TTGAAGGTAA GTATCAAATA AATAAAATTC AATTATTTAC TATATGAAGA AACACATTGC  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CATAAGGTAT TGAAAAATAC GTAACCCCAA TAAAACAGAA AGAAACACAT GACATGACAT GACCCAGAAG AAGGCCAGAA GATATATTTC AAAGGCAGCG AAGATAGACT TGCATAGCAA  CAAAGCCTTT TTAATCAAGC ATTGATTGAC AAAAAAGCAC GGATTCTTTA TTTATGATCT CATGTGTGTG TGTGTGTGTA TGCAGTTCCT TTCCTAAGGT TCTGGTGGAT GGTCCGTATG  GGGCGCCAGC ACAAGACTAC AGGGAGTATG AGGTGGTGTT GCTGGTGGGG CTTGGAATTG GGGCTACACC AATGATAAGT ATACTAAAGG ACATGGTGAA TAATTTTAAG GCGAATGATG  AGGAGGAGGG AGGGCAAGAG AGGGTGAGTG ACTTCAAGAC AAGGAGGGCA TACTTCTACT GGGTGACTAG AGAGCAGGGT TCATTTGACT GGTTCAAAGG GGTAATGAAC GAAGTGGCAG  AAGAGGACCG AAGGAAAGTG ATTGAACTCC ACAGCTACTG CACCAGCGTC TACGAAGAGG GTGATGCTCG CTCTGCTCTT ATTGCTATGT TGCAGTCCCT AAACCATGCA AAGAATGGAG  TGGACATTGT CTCTGGGACA CGAGTCATGT CTCACTTTGC AAAACCCAAT TGGCGCAGTG TCTACAAGCG CATTGCGCTT AATCATCCAG ATGCCCGAGT TGGTCAGTTC CCACCCCTTC  TACTCACGTT GCGTCTGCTT TTTGCTTTTT TCCAAATTCA TTAAATTGCA ATGCAGGGGT ATTTTACTGT GGGCCATCAG CCCTCACCCA TGAGCTTCGT CAGCTAGCAT TGGATTTCTC 
TCACAACACA TCCACCAAGT ACGACTTCCA TAAAGAAAAT TTCTGA 

Retrieve as FASTA