Entry information : GmRboh16 (Glyma20g38000)
Entry ID 7187
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh16 (Glyma20g38000)
Name (synonym) GmRboh16 (Glyma20g38000)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh16
start..stop
S start..stop
GmRboh10 1513 0 1..748 79..825
MtRboh03 1428 0 1..748 131..885
GmRboh15 1419 0 1..748 120..871
GmRboh02 1415 0 1..748 135..885
Literature and cross-references GmRboh16 (Glyma20g38000)
DNA ref. GenBank:   ACUP01012262.1 (65478..71129)
EST ref. GenBank:   GR859240.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.18084
Protein sequence: GmRboh16 (Glyma20g38000)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   749
PWM (Da):   %s   85689.31 Transmb domain:   %s   o202-221i342-364o384-406i566-583o
PI (pH):   %s   9.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKAGTEGWS QVEKRFDELA IDAKLPKTRF SQCIGMTESK EFAGELFDAL ARRRGITSAS ITKDQLREFW EQITDQSFDS RLQTFFDMVD KDADGRINEE EVKEIITLSA SANKLSKLKD  RAEEYAALIM EELDPDNLGY IELYNLEMLL LQAPAQSTNI TTDSRILSQM LSQKLVPTKE YNPIKRGFRA LAYFVQDNWK RLWVIALWLS ICAGLFTWKF IQYKHRAVFH VMGYCVTVAK  GGAETTKFNM ALILLPVCRN TITWLRSRTK LGAIIPFDDN INFHKVVAFG IAIGVGLHAI SHLTCDFPRL LHATDVEYKP MKQFFGDERP NNYWWFVKGT EGWTGVVMVV LMAIAFILAQ  PWFRRNRLKL PKPLKKLTGF NAFWYSHHLF VIVYVLFIIH GYFLYLSKKW YKKTTWMYLA VPMILYGCER LLRAFRSGYK SVRILKVAVY PGNVLALHVS KPHGFKYSSG QYIYVNCSDV  SPFEWHPFSI TSAPGDDYLS VHIRTLGDWT SQLKGVFAKA CQPASDGQSG LLRADMLQGN NKPRMPRLLI DGPYGAPAQD YKNYEVILLV GLGIGATPLI SILKDVLNNI KQHKDVEEGA  VEKDNKRKPF ATKRAYFYWV TREEGSFEWF KGVMNEVEEN DKEGVIELHN YCTSVYEEGD ARSALITMLQ SLHHAKNGVD IVSGTRVKTH FARPNWRNVF KHAAIKHPDQ RVGVFYCGAH 
GLVGELKRLS LDFSRKTSTK FDFHKENF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 20, 11 introns + 1 intron in 5'UTR) and ESTs. Chromo position Gm20: 45727495..45734148.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCAAAG CAGGCACTGA AGGTTGGTCA CAGGTTGAGA AGCGCTTCGA TGAGTTGGCC ATTGATGCAA AGCTCCCCAA GACTCGCTTT AGTCAGTGCA TAGGTATATA TATAAAAAAA  CATTTTAATT TCAATACACT CTTATATATT ATCAATTTTT TTATCCACAA ATATTAATAT TAGTTATTAA TTTATTAATT TTTATTTAAA ACTCCATGTT CTCTCAACCC AACCTTGTAA  CTCTACCCAT GTTAAGAAAC TCTAACTATA AAAAACATTA TGGAAATTAT AAAAAAAATA TTTTTAATTG TTTGAGAATA TACTCTGAGT ATATACTAAA CTCGTAGTTT TTTATTTTGC  ATCAAGAAAC TTTTCTTAGA TAGAGCTAAT TTTGGTGGAA ATTAATGATG ATGACAATTA GGGATGACCG AGTCGAAGGA GTTTGCCGGA GAGTTATTCG ATGCATTGGC TCGTCGTCGG  GGGATAACAT CAGCTTCCAT AACGAAGGAT CAGCTGCGTG AATTTTGGGA GCAAATTACA GATCAGAGCT TTGACTCGAG GCTTCAGACC TTTTTTGACA TGTAAGACTT CATTGATCAG  CATCTTTTAT TTATTTAGTT AATTGCAATT TCATTTTCAT CAGGAAGCTC ATTTTATAAA TATATCTGAC AAATAATACA ACACAGCTCA TTGTTTTGTA TTTAAAAATT ACTTAATCAG  GATATGCATG CCAGAACAGA TTATATCATT TGTCTAATTT AATTAGGCAG CATATGAAAG AGACGGGTTG TTTTGTTGGC TTCAACATGT AGATATAGAA ATATTTTTAT GTTGGACTAA  TGTCTATTTA TATTGTCTAA GTAGGGTGCT CAGTTTTCAA ATGATGATAG AAAATCGTTA CGGACTGTGT GGAGTTCGTT TGTAAATTTT TCTATAAAAG ACTTCGAAAC CGCGTTTCGA  GGAATCTGCA TGTGAAATCA TTTGTCGTAT ATATAATACT GTTTATTAAT TATTTGATTA AAAAGTATCA GGGTTTGACA AGAAAGTCTT ATGATGAGTA TAGTGAATAG CGATACAAGA  ATGCTGATCC CATGCAACTG TTTTGCATTT AATTAAACTA TAAATAAAAA GTTATTTTGT ATTTGCTTAT AATTGTTTTC TTTAATCTTC CTTAGAAAAT TAAAAGCATG CATATTATTT  GAAGTGACGT CAATACTTTT TTTTTTCAAT TGGATGAATA TATAGTTCAT ACAATTTTTC TATATATATC ATTAGCGCCA TGAAACTTTT TTTTTGTTCG AATTATTTTA CTCACTATAT  ATTCAACTTT CCCATGAACA AAGTAGGAGT AAAATAGCGA CACATGAACG AATAAAAATA AAAACAGTAA TGTATTAACT GATCGATGGT TAGGTTGGTT GACTAAAGAA AAATATAAAT  GGTAGCAGCA GCTATATATT TGAGGAGTTA CGTATGCATT TGTCAGTCAC AATAAAATAA CATTTTAAAG AAAAATATAA GAAATATCGC ATCTTAATTG ATTAGGTATA CATGCACTTT  TGGTTACTTA TAAATCTAAC TCATGTCAGG GTGGACAAAG ATGCTGATGG ACGAATTAAT GAAGAAGAAG TAAAAGAGGT AAGAGTTTAT CATCAAATTA AAAATTTACG TTTATTATTA  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AGTTGACGAG ATTATGGTTT TACTCTTAAA AATAATCTTC TTATCATCAA TTTTTTGAGA CTTCAAGAAT CTTGTTTTAT AGGAATAGTT AATCAACACT AACTAATAAT ATGATCAAAC  TAATAGTAAT TACTTAATAT TCATAGAATA ACCCCACGTG ACTTAAAAGC CTCATATTTT GAGTTAGTAA ATATATATCA TGAACTTAGT TTTGTACTTT TATTTAATTT TTTTGACTGG  ATATAGTTTT GATAAGTTAG TAGTTACGTC CCTACGTACC TAAACTAAAA TATTTAGTTC TTACTAAAAA CTTGTGGCAA CTACTTAAGT TTATGTCCTT TTAATTAAGC TCAATTATTA  TGAAAAATGT TCCCTAAAGT AAATGTATGG TCTCATGCAG TTATACAACT TGGAAATGCT TCTTCTGCAA GCCCCAGCAC AATCAACCAA CATAACCACC GATAGCAGGA TACTGAGCCA  AATGCTGAGC CAGAAACTAG TCCCTACAAA GGAGTACAAC CCCATCAAAC GGGGCTTTCG GGCACTAGCA TACTTCGTGC AGGACAATTG GAAACGCCTA TGGGTCATAG CCCTGTGGCT  TTCCATTTGC GCTGGTCTTT TCACTTGGAA GTTCATCCAA TACAAGCACC GTGCAGTGTT CCATGTCATG GGCTACTGTG TCACAGTGGC CAAGGGTGGC GCTGAAACAA CCAAGTTCAA  CATGGCCTTG ATCTTGTTGC CTGTTTGTAG GAACACCATC ACTTGGCTCA GGAGCAGGAC CAAACTAGGA GCAATCATTC CCTTTGATGA CAACATCAAC TTTCACAAGG TATAATTAGA  CCCCCAATTA ATACATAAAC AAAGTGAGAC TTCTGCTAAC ACACTTTTCA CTTTTGTTTA AAATTTATTA AAAATTATAA AATCATGAGC CAAATTCACC AAATATTCAT ACTCGCAAAA  TTACATGATT TTCAATAAAT CTTTAACTTT AGTATAAAAA AAAAGTGTGT TAGAGTTTGG TACTAGCTAG CATTTCTCAA ACAAACTATA CTATTACATT ACTTTTTGAT TAAATTGAAC  TACTATCACT AACTTGAACA TTTTTATAGG TGGTGGCCTT TGGCATTGCA ATTGGGGTTG GATTGCATGC GATTTCACAT CTGACGTGTG ACTTCCCTAG ATTGTTACAT GCCACAGACG  TAGAATACAA ACCCATGAAA CAATTTTTTG GGGATGAGAG GCCCAACAAT TATTGGTGGT TTGTGAAAGG GACTGAGGGA TGGACCGGGG TGGTGATGGT GGTGCTTATG GCTATAGCCT  TCATTTTGGC TCAACCATGG TTCCGAAGGA ACAGGCTAAA ACTCCCCAAA CCCCTTAAGA AGCTCACTGG TTTCAATGCC TTTTGGTACT CCCACCACCT TTTTGTCATC GTCTACGTGC  TTTTCATCAT TCACGGATAC TTCCTATACC TCAGCAAGAA ATGGTACAAG AAAACGGTAC GTGCATGGTC TCACTCAAAC ATAGCATGCA CCTTTATTCT CTGTTCCTTT TTCTTGCAAA  AAAAAAAAAA AAACTTGTTT ATTGATGAAT TTCTTTGGTT ACACACCAGA CGTGGATGTA TCTCGCCGTT CCCATGATAC TATACGGATG CGAAAGGCTA CTTCGTGCTT TTAGGTCTGG  CTACAAATCT GTGAGGATTC TCAAGGTACA TACATTTTAA ACAACTTCAC TCCTCTGTTT TAACATCAAT TGTGGTGTCA GTGTCACTAA ATGAAATTTT AACCATAAAT GTTTCAGGTT  GCTGTGTACC CAGGAAATGT GCTAGCATTG CATGTGTCTA AACCACATGG ATTTAAGTAC TCTAGTGGCC AGTATATATA CGTTAACTGT TCAGATGTAT CCCCATTTGA ATGGTATGCA  CCTAACTTAA GTTCATTCTT TTTTCTTATA TAACTGTTAA TACGAGGACG GTGATCGTGA ACAATGTTAA TTTAATTTTG TGGTATTGGT CTGTATCTGC AGGCATCCCT TTTCTATTAC  ATCAGCTCCA GGAGATGACT ACTTAAGTGT TCACATTCGA ACTTTGGGTG ACTGGACATC ACAGTTAAAG GGTGTTTTCG CCAAGGTGAA TTTTGCACCA CATAACACTC TGTAGTCTGT  TCATCTTATA TGGAGAATTA AAATTGTTGT TGTTCATGAA ATAAATTCTT ATTAATTACT ATATCAATAT TCATGCAGGC ATGTCAACCA GCAAGTGACG GTCAAAGTGG TCTTCTACGA  GCTGATATGC TACAAGGCAA CAACAAACCA AGGCATGTAA TTTAAATTGT ATGATCAAAA AGAGAAATGT GAAACTAAAA TTGACAAAAA ACCAATTTCT AATTCTTGTG AAATTAAAAT  AAATTGCAGG ATGCCCAGGC TACTAATCGA TGGACCTTAT GGAGCTCCAG CACAAGACTA CAAAAATTAT GAAGTAATCC TTCTGGTGGG GCTAGGAATT GGTGCCACCC CTTTGATTAG  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GAAAATTTTT AG 

Retrieve as FASTA