Entry information : GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Entry ID 7189
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-05-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Name (synonym) GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh12
start..stop
S start..stop
GmRboh06 1855 0 1..941 1..941
MtRboh05 1744 0 1..941 1..944
GmRboh01 1655 0 1..941 1..927
CsRboh01 1653 0 1..941 1..946
Literature and cross-references GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
DNA ref. GenBank:   ACUP01004545.1 (2729..10919)
Protein sequence: GmRboh12 (Glyma08g02210.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   941
PWM (Da):   %s   106616.29 Transmb domain:   %s   o375-397i517-539o559-581i738-755o
PI (pH):   %s   9.77
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNGIPRHERR WASDSVPGKA TVSAGTSPGT ESNSAAEEFV EVTLDLQDDD TIVLRSVEPA SVISIDDSVA GSGNQTPASV SRSPTIRRSS SRGFRQFSQE LKAEAVAKAR QFSQELRRFS  WSHGHASRAL SSSSAPNGAG AGFETALAAR ALRKQRAQLD RTRSGAHKAL RGLKFISNRS NGVDAWNEVQ SNFDRLAKDG FLNRTDFAQC IGMKDSKEFA LELFDALSRK RRLRTDKISR  EELFEFWSQI TDQSFDSRLQ IFFDMVDKNE DGRITEEEVK EIILLSASAN RLSRLQEQAE EYAALIMEEL DPEGLGYIEL WQLETLLLQK DTYLNYSQAL SYTSQALSQN LQGLRKKSPI  RRMSRRLVYY LQENWRRLWV LTLWVSIMIG LFTWKFIQYK NKDAFQIMGY CLLTAKGAAE TLKFNMALIL LPVCRNTITW LRSTKLGYVV PFDDNINFHK TIAGAIVIGI ILHAGDHLAC  DFPRLVSTSE ERYEKYLKGV FGDHKPSYVD LVKGVEGVTG ILMVFLMIIA FTLATKWFRR NLIKLPKPFS RLTGFNAFWY SHHLFVIVYV LLIIHGIKLY LVHKWYHKTT WMYLAVPVLL  YASERILRLF RSGLYTVRLG KVAIYPGNVL TLQMSKPPQF RYKSGQYMFV QCPAVSPFEW HPFSITSAPG DDYLSVHIRQ LGDWTQELKR VFSEACEPPV SGKSGLLRAD ETTKKSLPKL  KIDGPYGAPA QDYKKYDVLL LVGLGIGATP FISILKDLLK NIIKMEEMAD SISDISRGSD LSVGSTTDSP SLNKNAPKRK KTLKTTNAYF YWVTREQGSF DWFKGVMNEV AELDQRGVIE 
MHNYLTSVYE EGDARSALIT MVQALNHAKN GVDIVSGTRV RTHFARPNWK KVFSKMCSKH CNGRIGVFYC GAPVLARELS KLCFEFNEKG PTKFEFHKEH F 

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequence from genomic (chromo 8, 13 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGGTA TTCCGAGACA CGAGCGCCGA TGGGCGTCCG ACAGCGTTCC GGGAAAAGCG ACCGTCAGCG CCGGAACTTC GCCGGGAACT GAGTCCAACT CCGCCGCGGA GGAGTTCGTG  GAGGTGACAC TCGATCTTCA AGACGATGAC ACCATCGTTC TCCGGAGCGT CGAGCCAGCC TCCGTCATTA GCATCGACGA CAGCGTCGCC GGCAGCGGAA ATCAAACTCC GGCGTCGGTT  TCGAGGTCTC CGACTATACG TCGGAGCTCG TCGAGAGGAT TCCGGCAGTT CTCGCAGGAG CTGAAAGCCG AGGCGGTTGC GAAGGCCAGG CAGTTCTCGC AGGAGCTGCG GCGCTTCTCG  TGGAGCCATG GCCATGCTTC GCGCGCGCTT TCGTCTTCCT CTGCTCCGAA CGGCGCCGGC GCCGGATTTG AAACGGCGTT GGCGGCTCGC GCTCTCAGGA AACAACGAGC TCAGCTTGAT  CGCACGCGCT CCGGTGCGCA CAAAGCGCTT CGCGGTCTGA AATTTATCAG CAACAGGTCC AATGGCGTTG ATGCGTGGAA CGAGGTGCAG AGCAACTTCG ATAGGCTTGC TAAGGACGGT  TTTCTCAATC GCACCGATTT CGCTCAATGC ATAGGTCCGT TTCTTTTTCA AATCTCGCAT TGTTCGTTTA AATCATTAGA TTCGTTATCC TATAGTGCTT TCTTTTCCCT CCCTGTTTCA  TTGCATTGAA TTTTCAATAA CTGTTTAGAT CTTTCATCTT TGTATATATA CTCTTTCTTC TTCTTGCTTC TGTTTTTTTT TTTTGTTAGC TTAAAGTGTG TTGCATCTGA ATTTTTATTT  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AAATGGTGTG TTTATTTTTT AATTTTTAAC AAGTACATTT AAACATGAAT TAGTTGATGA TGCTTGTTTG TTAGTTAGCT TAGTGTACAT TAATTTCCTA GCTTAGTCAG TGTTGGGCTA  GGGCCGCACT TATCTAATTA GTCAACAATG GACCAAATTG TGAATTGAAC AAGTCACCCG AAATTTCCTA GTGTAGTTCA GCCGTTTTCA AGGGTAAAAA GAAAAAGAAA GACAAATTAG  GCATATTATA ACTTATAAGT AAAAATTTGC TTGCTGAATT TAAAAAATTG ATTTGATATA CTTACAACAT CATTTCATTA ATTACGTAAA AAAATATTAT TAGTAATAGA CTAATAGGGT  GCACTCATTA ACATGCAATC TTATTTCTTC ATTCTTTTGC CGTGTCAACA AATTTAAATT CAGACCACTT TATCCCTAGC TAGGTACGTA ATATAATAAT TAAGCTGTTA TTTCTAATAA  CTCAGTTCAT GCAGTGCAGC GGCCGCGGTG CTGGTTAATA TAAATTATTA CAGTGACCTC ATTATTTCTT TGATCAATAA GACATTTTTT TCCAGAAGAT ATTAATTATA ATTTTGAGTA  GTAGTGGTTT TTGTCTTTGG GCATGTCTTC AGAGTGGATG GAGAGAGATA AAAAGTAAAA AAAAAATGTT GTGAAAATGT TTTTTTGTGG GAAGAGTATC ATTCTTGTTA TTTACCAAAA  AAAAAAGGAG TATTATTCTT GTTCATAGAG TAATTTCATT TTTTAATATT CCTTTCTCAG TTGTGAACTT AAAAACGTGT TTTGGGAGGT AAATTAAAAA AGGATCAATG ATATTAGCCT  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AACTAAATTT GAGTTCCACA AGGAGCATTT CTAA 

Retrieve as FASTA