Entry information : CYspPxDo2
Entry ID 7246
Creation 2010-02-23 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2010-11-19 (Marcel Zamocky)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CYspPxDo2
Name CYspPxDo2
Class Short peroxidockerin     [Orthogroup: PxDo001]*
Taxonomy Bacteria Cyanobacteria Cyanothece
Organism Cyanothece sp    [TaxId: 43988 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CYspPxDo2
start..stop
S start..stop
CYspPxDo-rel 912 0 1..578 1..585
CwaPxDo01 791 0 1..578 1..584
LspPxDo01 580 0 27..548 144..660
NmoPxDo01 544 0 21..555 3..553
Literature and cross-references CYspPxDo2
Literature Stal L., Ferriera S., Johnson J., Kravitz S., Beeson K., Sutton G., Rogers Y.-H., Friedman R., Frazier M., Venter J.C.(unpublished since 2007).
Protein ref. GenBank:   EAZ93186.1   EAZ93187.1 UniProtKB:   A3IKJ8
DNA ref. GenBank:   AAXW01000003.1 (200231..201969)
Protein sequence: CYspPxDo2
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   578 (576)
PWM (Da):   %s   63020.62 (62919.5) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   4.28 (4.46) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-601
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNKKNTIILT GVTAISVGIL LPVEAAEFRS MDGTGNNVNN PTLGSVGSNL IRLSGVAYDD GFAIPRGKLN PGVLPSPRAI SNAISAQSFS IPNSSKVTDW VWQWGQFLDH DLDLSPIGSS  EPFNIAVPRG DPYFDPVKTG TEEIGLNRSE FNTDSFGVRQ QFNEITAYID ASNIYGSDNN RINVLRTNDG TGKLIADTAN NGKNCMLNTV GLANDTGGDP NTTNYFLSGD IRANEQIGLT  ATHSLFMREH NRIADDLKTR LDSGETALVN KFQEFGLSED DFIFESARKV VGAQMQIITY NEWLPVILGE NALEDYKGYD DQTDASIATE FSTAAFRFGH TMLSPNLLRV DNNGNIVDSL  SLRDSFFNPN EVLEGGIDTL LMGLASQQAQ KLDTFLVDDV RNFLFGPPGS GGFDLASLNL QRGRDHGIPD VNTVRLALGL IPYTTFLQLT GGDMDLANAF ASVYNNVDEV DLWIAGLAEK 
KVNGGLLGET FSYILIDQFT RSRDGDRFFY LNDLDHLNIL DPTLETVTLS SIIRRNSNIE NIQDNAFLAT SVPEPNTTVG ILMLMLLSLI GGRFRSNN 

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Remarks Two partial sequences from genomic. Strain="CCY0110"; N-terminal part is interrupted with 1 stop codon, immediately proceeding with C-terminal part (in different reading frame).
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTAAATA CAGTGGGTTT AGCTAATGAT ACGGGAGGTG ATCCCAATAC TACAAACTAT TTTCTATCAG GGGATATCCG TGCTAATGAA CAAATAGGAC TAACGGCTAC CCATTCTCTA  TTTATGCGAG AACATAATCG TATTGCTGAT GATCTTAAAA CCCGTCTGGA TAGTGGAGAA ACTGCTTTAG TTAATAAATT TCAGGAGTTC GGTCTGAGTG AAGATGACTT TATCTTTGAG  TCGGCTCGTA AAGTTGTAGG CGCACAGATG CAAATTATCA CCTATAATGA ATGGTTACCG GTTATCCTGG GGGAAAATGC CTTAGAGGAC TATAAAGGTT ACGATGATCA GACCGATGCA  AGCATTGCTA CAGAGTTCTC GACTGCTGCT TTTCGTTTTG GTCATACCAT GTTATCCCCT AATCTTCTGA GGGTTGATAA TAATGGCAAT ATTGTTGACT CTTTATCGTT GCGAGATAGT  TTCTTTAATC CTAATGAAGT GCTAGAAGGT GGTATTGATA CTCTATTAAT GGGTTTAGCG TCTCAACAAG CTCAAAAATT GGATACCTTT TTAGTTGATG ATGTGCGTAA CTTCTTATTT  GGACCTCCTG GAAGCGGAGG ATTTGATCTC GCTTCTTTAA ATTTACAACG AGGCCGAGAT CATGGCATTC CTGATGTCAA TACAGTTCGT TTAGCCTTGG GATTAATCCC TTATACGACC  TTTTTACAAC TGACTGGAGG CGATATGGAT TTAGCCAATG CCTTTGCTAG TGTTTATAAT AATGTTGATG AGGTGGATTT GTGGATTGCT GGTTTAGCAG AAAAAAAGGT GAATGGGGGT  TTATTAGGAG AAACCTTTAG TTATATTTTG ATCGACCAAT TTACTCGCAG TCGGGATGGC GATCGCTTTT TCTATCTTAA CGACCTCGAT CATCTCAATA TCTTAGATCC GACCCTCGAA  ACCGTCACTC TCTCTAGTAT TATTCGTCGC AATAGTAACA TCGAAAATAT TCAAGATAAT GCGTTTTTGG CGACTTCAGT TCCCGAACCC AATACTACAG TAGGAATATT GATGTTGATG 
TTGTTAAGTT TAATCGGAGG TCGTTTTCGT TCTAACAACT AA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATAAAA AAAATACTAT TATTTTAACA GGTGTGACTG CTATTAGTGT GGGAATCTTA TTACCTGTAG AAGCTGCTGA ATTTCGCAGT ATGGATGGCA CTGGTAATAA TGTTAATAAT  CCTACCTTGG GGTCAGTGGG TAGTAATTTA ATTCGTCTTT CTGGGGTTGC CTATGATGAT GGTTTTGCTA TCCCCAGAGG TAAATTGAAT CCCGGTGTTT TACCAAGTCC TCGCGCCATT  AGCAACGCTA TTTCTGCTCA ATCTTTTTCT ATTCCTAACT CATCAAAAGT AACAGATTGG GTGTGGCAAT GGGGCCAATT TCTTGACCAT GATCTCGATT TAAGTCCTAT TGGTAGTAGT  GAACCCTTTA ATATAGCTGT CCCCAGAGGA GATCCCTATT TTGATCCTGT TAAGACTGGA ACTGAAGAAA TTGGCTTAAA TCGCTCAGAA TTTAATACCG ATAGTTTCGG TGTGCGTCAA  CAATTCAACG AGATTACTGC TTATATTGAT GCTTCTAATA TTTATGGTTC AGATAATAAT CGCATTAATG TTCTACGGAC GAATGATGGC ACCGGAAAAC TAATTGCTGA TACAGCAAAC  AATGGGAAAA ATTGTTGATG TTAAATACAG TGGGTTTAGC TAATGATACG GGAGGTGATC CCAATACTAC AAACTATTTT CTATCAGGGG ATATCCGTGC TAATGAACAA ATAGGACTAA  CGGCTACCCA TTCTCTATTT ATGCGAGAAC ATAATCGTAT TGCTGATGAT CTTAAAACCC GTCTGGATAG TGGAGAAACT GCTTTAGTTA ATAAATTTCA GGAGTTCGGT CTGAGTGAAG  ATGACTTTAT CTTTGAGTCG GCTCGTAAAG TTGTAGGCGC ACAGATGCAA ATTATCACCT ATAATGAATG GTTACCGGTT ATCCTGGGGG AAAATGCCTT AGAGGACTAT AAAGGTTACG  ATGATCAGAC CGATGCAAGC ATTGCTACAG AGTTCTCGAC TGCTGCTTTT CGTTTTGGTC ATACCATGTT ATCCCCTAAT CTTCTGAGGG TTGATAATAA TGGCAATATT GTTGACTCTT  TATCGTTGCG AGATAGTTTC TTTAATCCTA ATGAAGTGCT AGAAGGTGGT ATTGATACTC TATTAATGGG TTTAGCGTCT CAACAAGCTC AAAAATTGGA TACCTTTTTA GTTGATGATG  TGCGTAACTT CTTATTTGGA CCTCCTGGAA GCGGAGGATT TGATCTCGCT TCTTTAAATT TACAACGAGG CCGAGATCAT GGCATTCCTG ATGTCAATAC AGTTCGTTTA GCCTTGGGAT  TAATCCCTTA TACGACCTTT TTACAACTGA CTGGAGGCGA TATGGATTTA GCCAATGCCT TTGCTAGTGT TTATAATAAT GTTGATGAGG TGGATTTGTG GATTGCTGGT TTAGCAGAAA  AAAAGGTGAA TGGGGGTTTA TTAGGAGAAA CCTTTAGTTA TATTTTGATC GACCAATTTA CTCGCAGTCG GGATGGCGAT CGCTTTTTCT ATCTTAACGA CCTCGATCAT CTCAATATCT  TAGATCCGAC CCTCGAAACC GTCACTCTCT CTAGTATTAT TCGTCGCAAT AGTAACATCG AAAATATTCA AGATAATGCG TTTTTGGCGA CTTCAGTTCC CGAACCCAAT ACTACAGTAG 
GAATATTGAT GTTGATGTTG TTAAGTTTAA TCGGAGGTCG TTTTCGTTCT AACAACTAA 

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