Entry information : DalKat01
Entry ID 7257
Creation 2010-02-24 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2015-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-03 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: DalKat01
Name DalKat01
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Bacteria Firmicutes Clostridia Syntrophomonadaceae Dethiobacter
Organism Dethiobacter alkaliphilus    [TaxId: 427926 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value DalKat01
start..stop
S start..stop
AmeKat01 1170 0 1..711 1..713
BhaKat01_C-125 1115 0 4..702 2..702
MmazKat01 1009 0 12..711 6..710
MEmaKat01 981 0 12..711 7..707
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 20386..22521 2136  
complement(join(20386..22521))


exon

Literature and cross-references DalKat01
Literature Lucas S., Copeland A., Lapidus A., Glavina del Rio T., Dalin E., Tice H., Bruce D., Goodwin L., Pitluck S., Larimer F., Land M.L., Hauser L., Muyzer G. (2009) Sequencing of the draft genome and assembly of Dethiobacter alkaliphilus AHT 1.
Protein ref. GenBank:   EEG76297.1
DNA ref. GenBank:   ACJM01000020.1 (22521..20386)
Protein sequence: DalKat01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   711
PWM (Da):   %s   80019.66  
PI (pH):   %s   6.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNNEQNQSNT PLNEHSKNSQ LETFRVDHSN NNLTTNQAVQ VANTDDSLKA GTRGPTLMED FHFREKMMHF DHERIPERVV HARGSGAHGY FQAYEPMKEY TKAKFLQDPS VKTPVFVRFS  TVVGSRGSAD TVRDVRGFAT KFFTEDGNYD LVANNIPVFF IQDAMKFPDI VHSIKPEPDN EIPQASAAHD TFWDFVVNTP EITHMIMWLL SDRAIPRSYR MMQGFGVNTF RFVNEQGKAR  FVKFHWKPLL GVHSLVWDEA QKLAGKDPDY NRRDLWDAIE QGNYPEYELG VQLIEEEDEF SFDFDILDPT KIWPEEQVPV KPIGKMTLNK NPDNFFAETE QVAFHPGHVV SGIDFSNDPL  LQGRLFSYLD TQLIRLGGPN FHEIPINRPV APVHNNQRDG YHRMTIDQGK VSYSPNSLQN NAPQPDAQNG YIHYAEKVEG SKVRQRSASF MDHYRQATLF WNSMSPPEKQ HIIEAFHFEV  GKVKDKQIKQ RVVEMFNNVD SQLAHQIAMG VGANPPSKPG GTGVTAASPA VSQANTIKDA RTRKVAILLE NGFYYPEVTQ VMHALNGVGV MCDIVSKNLG MLTSFDGQQL EVNKNYVTTA 
SIMYDAVYVP GGRKSVDTLL THGDARHFVS EAFKHAKAIG ASNEGVDLLN ASEIQGVALA PPESQFETYN ELGVITIRNA GDMGYFGQEF IKAIAEHRHW GRLAQKDMVS A 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="AHT 1".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACAACG AGCAAAACCA GTCCAACACC CCTCTCAATG AACACAGCAA AAACTCGCAA TTGGAAACTT TCCGTGTGGA TCACAGCAAT AACAACCTAA CTACAAATCA GGCGGTTCAG  GTTGCCAACA CCGACGATTC TCTTAAAGCA GGTACCCGGG GTCCTACTTT AATGGAGGAC TTTCATTTCC GCGAAAAAAT GATGCACTTT GACCACGAAC GGATCCCGGA ACGTGTGGTG  CATGCCCGTG GTTCCGGCGC TCATGGCTAT TTTCAGGCCT ATGAACCCAT GAAAGAATAC ACCAAAGCAA AGTTTTTACA GGACCCGTCG GTTAAAACAC CTGTTTTTGT CCGCTTCTCC  ACCGTGGTAG GCTCTCGCGG CTCAGCGGAT ACGGTCCGCG ACGTGCGGGG TTTTGCTACC AAGTTCTTCA CAGAAGACGG CAATTATGAC CTGGTAGCCA ATAACATTCC GGTCTTCTTT  ATTCAGGATG CCATGAAATT CCCGGACATT GTGCACTCCA TTAAACCGGA ACCGGATAAT GAAATTCCAC AGGCATCCGC AGCCCATGAT ACATTTTGGG ACTTTGTTGT CAATACTCCG  GAAATCACTC ATATGATAAT GTGGCTGCTC TCTGACAGGG CCATTCCCCG CAGTTACCGG ATGATGCAGG GTTTTGGCGT AAATACATTC CGCTTTGTCA ATGAGCAGGG CAAAGCACGG  TTTGTTAAAT TTCACTGGAA GCCCCTCCTG GGTGTTCACT CCCTGGTCTG GGACGAAGCA CAAAAATTAG CAGGAAAAGA CCCGGACTAC AACCGTCGGG ATCTCTGGGA CGCCATTGAG  CAGGGCAATT ACCCGGAGTA TGAACTGGGA GTACAGCTTA TTGAAGAAGA GGATGAGTTC AGTTTTGATT TTGATATCCT GGATCCCACC AAAATCTGGC CGGAAGAACA GGTTCCCGTT  AAACCCATTG GCAAAATGAC CCTCAACAAA AACCCGGATA ACTTCTTTGC AGAAACGGAA CAGGTAGCAT TTCATCCCGG ACATGTGGTG TCGGGAATTG ATTTCTCCAA TGATCCATTG  CTGCAGGGTC GACTCTTCTC CTATCTGGAC ACCCAGCTAA TCCGCTTAGG AGGACCAAAC TTCCATGAAA TTCCCATTAA CCGCCCTGTG GCGCCGGTCC ATAACAATCA GCGCGACGGC  TATCACCGCA TGACCATCGA TCAAGGCAAA GTAAGCTATT CTCCCAACTC ACTACAAAAC AATGCACCAC AGCCCGATGC CCAAAACGGG TATATCCACT ATGCGGAAAA GGTGGAGGGC  AGTAAAGTGC GCCAACGCAG TGCCAGCTTC ATGGACCACT ACCGGCAGGC CACCCTGTTC TGGAACAGTA TGTCACCTCC GGAAAAGCAG CATATCATCG AAGCATTTCA TTTTGAGGTG  GGCAAAGTAA AGGACAAACA GATTAAGCAG CGGGTAGTAG AGATGTTTAA CAACGTGGAC AGTCAGCTGG CACATCAAAT CGCCATGGGA GTGGGGGCAA ACCCACCGTC CAAACCCGGA  GGAACAGGGG TTACCGCCGC TTCCCCCGCT GTAAGCCAGG CTAATACCAT AAAGGATGCT CGCACCCGCA AAGTGGCAAT ACTTTTGGAA AACGGCTTCT ATTATCCGGA AGTCACCCAA  GTAATGCATG CCTTAAACGG AGTCGGCGTG ATGTGCGACA TTGTCAGCAA AAATCTGGGC ATGCTCACCA GCTTTGACGG ACAACAGCTG GAGGTCAATA AAAATTATGT CACAACGGCG  TCCATAATGT ACGATGCTGT TTATGTCCCC GGTGGCCGCA AGAGCGTAGA TACCCTGCTG ACTCATGGAG ATGCGCGCCA TTTTGTCAGC GAAGCCTTTA AACACGCCAA AGCCATCGGT  GCCAGTAATG AAGGGGTAGA CTTATTGAAT GCCTCAGAAA TCCAGGGAGT TGCCTTGGCA CCTCCTGAAA GCCAATTTGA AACGTACAAT GAACTGGGTG TAATTACTAT CCGCAATGCT 
GGGGATATGG GTTATTTCGG CCAGGAATTT ATTAAGGCCA TAGCGGAGCA CCGCCACTGG GGCCGTCTGG CACAAAAAGA TATGGTTTCA GCCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACAACG AGCAAAACCA GTCCAACACC CCTCTCAATG AACACAGCAA AAACTCGCAA TTGGAAACTT TCCGTGTGGA TCACAGCAAT AACAACCTAA CTACAAATCA GGCGGTTCAG  GTTGCCAACA CCGACGATTC TCTTAAAGCA GGTACCCGGG GTCCTACTTT AATGGAGGAC TTTCATTTCC GCGAAAAAAT GATGCACTTT GACCACGAAC GGATCCCGGA ACGTGTGGTG  CATGCCCGTG GTTCCGGCGC TCATGGCTAT TTTCAGGCCT ATGAACCCAT GAAAGAATAC ACCAAAGCAA AGTTTTTACA GGACCCGTCG GTTAAAACAC CTGTTTTTGT CCGCTTCTCC  ACCGTGGTAG GCTCTCGCGG CTCAGCGGAT ACGGTCCGCG ACGTGCGGGG TTTTGCTACC AAGTTCTTCA CAGAAGACGG CAATTATGAC CTGGTAGCCA ATAACATTCC GGTCTTCTTT  ATTCAGGATG CCATGAAATT CCCGGACATT GTGCACTCCA TTAAACCGGA ACCGGATAAT GAAATTCCAC AGGCATCCGC AGCCCATGAT ACATTTTGGG ACTTTGTTGT CAATACTCCG  GAAATCACTC ATATGATAAT GTGGCTGCTC TCTGACAGGG CCATTCCCCG CAGTTACCGG ATGATGCAGG GTTTTGGCGT AAATACATTC CGCTTTGTCA ATGAGCAGGG CAAAGCACGG  TTTGTTAAAT TTCACTGGAA GCCCCTCCTG GGTGTTCACT CCCTGGTCTG GGACGAAGCA CAAAAATTAG CAGGAAAAGA CCCGGACTAC AACCGTCGGG ATCTCTGGGA CGCCATTGAG  CAGGGCAATT ACCCGGAGTA TGAACTGGGA GTACAGCTTA TTGAAGAAGA GGATGAGTTC AGTTTTGATT TTGATATCCT GGATCCCACC AAAATCTGGC CGGAAGAACA GGTTCCCGTT  AAACCCATTG GCAAAATGAC CCTCAACAAA AACCCGGATA ACTTCTTTGC AGAAACGGAA CAGGTAGCAT TTCATCCCGG ACATGTGGTG TCGGGAATTG ATTTCTCCAA TGATCCATTG  CTGCAGGGTC GACTCTTCTC CTATCTGGAC ACCCAGCTAA TCCGCTTAGG AGGACCAAAC TTCCATGAAA TTCCCATTAA CCGCCCTGTG GCGCCGGTCC ATAACAATCA GCGCGACGGC  TATCACCGCA TGACCATCGA TCAAGGCAAA GTAAGCTATT CTCCCAACTC ACTACAAAAC AATGCACCAC AGCCCGATGC CCAAAACGGG TATATCCACT ATGCGGAAAA GGTGGAGGGC  AGTAAAGTGC GCCAACGCAG TGCCAGCTTC ATGGACCACT ACCGGCAGGC CACCCTGTTC TGGAACAGTA TGTCACCTCC GGAAAAGCAG CATATCATCG AAGCATTTCA TTTTGAGGTG  GGCAAAGTAA AGGACAAACA GATTAAGCAG CGGGTAGTAG AGATGTTTAA CAACGTGGAC AGTCAGCTGG CACATCAAAT CGCCATGGGA GTGGGGGCAA ACCCACCGTC CAAACCCGGA  GGAACAGGGG TTACCGCCGC TTCCCCCGCT GTAAGCCAGG CTAATACCAT AAAGGATGCT CGCACCCGCA AAGTGGCAAT ACTTTTGGAA AACGGCTTCT ATTATCCGGA AGTCACCCAA  GTAATGCATG CCTTAAACGG AGTCGGCGTG ATGTGCGACA TTGTCAGCAA AAATCTGGGC ATGCTCACCA GCTTTGACGG ACAACAGCTG GAGGTCAATA AAAATTATGT CACAACGGCG  TCCATAATGT ACGATGCTGT TTATGTCCCC GGTGGCCGCA AGAGCGTAGA TACCCTGCTG ACTCATGGAG ATGCGCGCCA TTTTGTCAGC GAAGCCTTTA AACACGCCAA AGCCATCGGT  GCCAGTAATG AAGGGGTAGA CTTATTGAAT GCCTCAGAAA TCCAGGGAGT TGCCTTGGCA CCTCCTGAAA GCCAATTTGA AACGTACAAT GAACTGGGTG TAATTACTAT CCGCAATGCT 
GGGGATATGG GTTATTTCGG CCAGGAATTT ATTAAGGCCA TAGCGGAGCA CCGCCACTGG GGCCGTCTGG CACAAAAAGA TATGGTTTCA GCCTAA 

Retrieve as FASTA