Entry information : CatKat01
Entry ID 7265
Creation 2010-02-25 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2015-11-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-03 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: CatKat01
Name CatKat01
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Bacteria Bacteroidetes/Chlorobi Flavobacteria Flavobacteriaceae Croceibacter
Organism Croceibacter atlanticus    [TaxId: 313588 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CatKat01
start..stop
S start..stop
GfoKat01 1116 0 12..713 7..708
PEspKat01 894 0 8..712 23..738
PhepKat01 887 0 4..704 5..710
SpliKat01 882 0 1..704 1..711
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2488778..2490919 2142  
join(2488778..2490919)


exon

Literature and cross-references CatKat01
Literature Giovannoni S.J., Cho J.-C., Ferriera S., Johnson J., Kravitz S., Halpern A., Remington K., Beeson K., Tran B., Rogers Y.-H., Friedman R., Venter J.C. (DEC-2005) submitted to the EMBL/GenBank/DDBJ databases
Protein ref. UniProtKB:   A3UA09
DNA ref. GenBank:   CP002046.1 (2488778..2490919)
Protein sequence: CatKat01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   713
PWM (Da):   %s   80331.93  
PI (pH):   %s   5.73
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSDKENLQPD SNSKTDQLSS YTKDSEGKNL TTNQGLKVND TNNSLKAGER GSTLLEDFLL REKITSFDHE RIPERIVHAR GSAAHGHFEL YKSIEKYTKA GLFTDTSKKT PVFVRFSTVA  GSKGSPDLAR DVRGFAVKFY TEEGTWDLVG NNMPIFFIQD AMKFPDLIHS VKPEPNNEIP QAASAHDTFY DFVSHAPETL HNHIWAMSDR AIPRSYRMME GFGIHTFRFI NKEGKSHFVK  FHWKPVLGVH SVTWEEAVKI NGVDADFHRR DLWEAIEAGQ YPEWEFGIQV VPEEDEHKYD FDLLDPTKLI PEDMVPVEIV GKMTLNRNPS NFFAETEQVA FLPGHIIPGL DFTNDPLLQG  RLFSYRDTQL SRLGSPNFHQ IPINRPVTPA HNNQRDGHMQ TEIPKGQTAY FPNTLGGGCP HLAKMAEGGF TSYEERIDAK KVRTRSESFS DHFSQPALFY RSLEEWEKKH VANAYSFELG  KCNQKHIKER MLWLINQIDE DLANTVSENL GLSIPDDIEQ PINQSIGADA DVEKFQPSAK KVYLEKDKSL SQAHTKFDSI ATRQIAVLAA NGFSMDDFKT FTDALEDEGA VCKIIAPHGG 
TIKCDQDMDH EVDAAISTTE SVLFDAIFVP GGKDSVDKLL KTGKYSKFIS EAFKHCKAIA VCNEGEELLK NSYIKSYDDD KAVFVNGKPK NFIDAIAQHR NWDRMEAASD IPV 

Retrieve as FASTA  
Remarks strain="HTCC2559"
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGCGATA AAGAAAATTT ACAGCCAGAT TCAAATAGTA AGACAGACCA ATTATCATCT TACACAAAAG ATTCTGAAGG AAAAAACTTA ACCACTAACC AAGGTTTAAA AGTTAACGAT  ACCAATAATT CTTTAAAAGC AGGAGAACGC GGTTCTACCC TTTTAGAGGA TTTTTTATTA CGTGAAAAAA TAACAAGTTT TGATCACGAA AGAATACCAG AGCGCATAGT ACACGCACGA  GGAAGTGCTG CACATGGTCA TTTTGAACTC TATAAAAGTA TTGAGAAATA TACCAAAGCA GGCCTTTTTA CAGATACCTC TAAAAAAACG CCTGTATTTG TAAGATTTTC AACAGTTGCA  GGTTCTAAGG GATCTCCAGA TTTGGCAAGA GACGTTCGTG GTTTTGCAGT AAAGTTTTAC ACAGAAGAAG GTACTTGGGA TTTGGTAGGT AATAACATGC CTATTTTCTT TATACAAGAT  GCTATGAAGT TTCCAGACTT AATACATTCT GTAAAGCCAG AACCAAATAA TGAAATTCCG CAGGCAGCTT CTGCACACGA TACGTTTTAT GATTTTGTGT CTCACGCGCC TGAAACTTTG  CATAACCATA TTTGGGCAAT GAGTGATAGA GCCATACCAA GAAGTTACCG AATGATGGAA GGTTTTGGTA TACATACATT CAGATTTATT AATAAAGAAG GGAAATCTCA CTTTGTAAAG  TTTCATTGGA AACCTGTACT AGGTGTACAT TCTGTAACTT GGGAAGAAGC AGTTAAAATT AATGGTGTAG ATGCCGATTT TCACCGTCGT GATCTTTGGG AAGCTATTGA AGCAGGACAA  TATCCAGAAT GGGAATTTGG TATACAAGTA GTTCCTGAGG AAGATGAACA TAAATATGAT TTTGACTTAT TAGATCCTAC CAAATTAATT CCAGAAGACA TGGTTCCTGT TGAGATTGTT  GGTAAGATGA CATTAAACAG AAACCCTAGT AATTTCTTTG CTGAGACAGA GCAAGTTGCA TTTTTACCTG GTCATATTAT TCCTGGTCTA GATTTCACGA ATGACCCATT ATTACAAGGT  CGTTTATTTT CTTACAGAGA CACACAGCTT TCAAGGTTAG GAAGTCCTAA CTTTCATCAA ATACCAATTA ACAGACCAGT AACGCCAGCA CACAACAACC AACGCGATGG CCATATGCAA  ACTGAAATTC CGAAAGGACA AACTGCATAT TTCCCTAATA CTTTAGGTGG TGGTTGTCCG CATTTAGCCA AAATGGCCGA AGGTGGTTTT ACGTCTTACG AAGAACGTAT TGATGCCAAG  AAAGTAAGAA CACGAAGTGA AAGCTTTAGT GACCATTTCT CACAACCAGC ATTATTTTAT AGAAGTTTGG AAGAATGGGA AAAGAAACAT GTAGCAAACG CCTACTCTTT TGAACTTGGT  AAGTGTAACC AAAAGCATAT TAAAGAACGT ATGCTATGGC TAATAAATCA AATAGATGAA GACCTTGCTA ATACTGTTTC AGAGAACTTA GGCTTATCTA TTCCAGATGA TATTGAACAG  CCAATAAATC AATCAATTGG TGCAGATGCA GATGTTGAGA AGTTTCAACC TTCAGCCAAA AAAGTGTATC TAGAAAAAGA CAAATCATTA AGTCAAGCTC ATACAAAGTT TGATAGTATA  GCAACGAGAC AAATTGCTGT ATTAGCTGCA AATGGCTTTT CTATGGATGA CTTTAAAACA TTTACAGATG CTTTAGAAGA TGAAGGTGCT GTTTGCAAAA TTATTGCTCC GCATGGTGGT  ACAATTAAAT GTGACCAAGA TATGGATCAC GAGGTTGATG CAGCAATATC GACAACCGAA AGCGTTCTTT TTGATGCTAT TTTTGTACCT GGCGGAAAAG ACTCTGTTGA TAAACTACTT  AAAACTGGTA AATATTCTAA GTTTATAAGT GAAGCTTTTA AACATTGTAA AGCTATTGCA GTTTGCAATG AAGGTGAAGA ATTACTTAAA AACAGTTATA TAAAATCTTA TGACGATGAT 
AAAGCTGTTT TTGTAAATGG AAAACCTAAA AACTTTATTG ATGCTATTGC CCAACATAGA AATTGGGACC GTATGGAAGC AGCATCAGAT ATTCCAGTAT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGCGATA AAGAAAATTT ACAGCCAGAT TCAAATAGTA AGACAGACCA ATTATCATCT TACACAAAAG ATTCTGAAGG AAAAAACTTA ACCACTAACC AAGGTTTAAA AGTTAACGAT  ACCAATAATT CTTTAAAAGC AGGAGAACGC GGTTCTACCC TTTTAGAGGA TTTTTTATTA CGTGAAAAAA TAACAAGTTT TGATCACGAA AGAATACCAG AGCGCATAGT ACACGCACGA  GGAAGTGCTG CACATGGTCA TTTTGAACTC TATAAAAGTA TTGAGAAATA TACCAAAGCA GGCCTTTTTA CAGATACCTC TAAAAAAACG CCTGTATTTG TAAGATTTTC AACAGTTGCA  GGTTCTAAGG GATCTCCAGA TTTGGCAAGA GACGTTCGTG GTTTTGCAGT AAAGTTTTAC ACAGAAGAAG GTACTTGGGA TTTGGTAGGT AATAACATGC CTATTTTCTT TATACAAGAT  GCTATGAAGT TTCCAGACTT AATACATTCT GTAAAGCCAG AACCAAATAA TGAAATTCCG CAGGCAGCTT CTGCACACGA TACGTTTTAT GATTTTGTGT CTCACGCGCC TGAAACTTTG  CATAACCATA TTTGGGCAAT GAGTGATAGA GCCATACCAA GAAGTTACCG AATGATGGAA GGTTTTGGTA TACATACATT CAGATTTATT AATAAAGAAG GGAAATCTCA CTTTGTAAAG  TTTCATTGGA AACCTGTACT AGGTGTACAT TCTGTAACTT GGGAAGAAGC AGTTAAAATT AATGGTGTAG ATGCCGATTT TCACCGTCGT GATCTTTGGG AAGCTATTGA AGCAGGACAA  TATCCAGAAT GGGAATTTGG TATACAAGTA GTTCCTGAGG AAGATGAACA TAAATATGAT TTTGACTTAT TAGATCCTAC CAAATTAATT CCAGAAGACA TGGTTCCTGT TGAGATTGTT  GGTAAGATGA CATTAAACAG AAACCCTAGT AATTTCTTTG CTGAGACAGA GCAAGTTGCA TTTTTACCTG GTCATATTAT TCCTGGTCTA GATTTCACGA ATGACCCATT ATTACAAGGT  CGTTTATTTT CTTACAGAGA CACACAGCTT TCAAGGTTAG GAAGTCCTAA CTTTCATCAA ATACCAATTA ACAGACCAGT AACGCCAGCA CACAACAACC AACGCGATGG CCATATGCAA  ACTGAAATTC CGAAAGGACA AACTGCATAT TTCCCTAATA CTTTAGGTGG TGGTTGTCCG CATTTAGCCA AAATGGCCGA AGGTGGTTTT ACGTCTTACG AAGAACGTAT TGATGCCAAG  AAAGTAAGAA CACGAAGTGA AAGCTTTAGT GACCATTTCT CACAACCAGC ATTATTTTAT AGAAGTTTGG AAGAATGGGA AAAGAAACAT GTAGCAAACG CCTACTCTTT TGAACTTGGT  AAGTGTAACC AAAAGCATAT TAAAGAACGT ATGCTATGGC TAATAAATCA AATAGATGAA GACCTTGCTA ATACTGTTTC AGAGAACTTA GGCTTATCTA TTCCAGATGA TATTGAACAG  CCAATAAATC AATCAATTGG TGCAGATGCA GATGTTGAGA AGTTTCAACC TTCAGCCAAA AAAGTGTATC TAGAAAAAGA CAAATCATTA AGTCAAGCTC ATACAAAGTT TGATAGTATA  GCAACGAGAC AAATTGCTGT ATTAGCTGCA AATGGCTTTT CTATGGATGA CTTTAAAACA TTTACAGATG CTTTAGAAGA TGAAGGTGCT GTTTGCAAAA TTATTGCTCC GCATGGTGGT  ACAATTAAAT GTGACCAAGA TATGGATCAC GAGGTTGATG CAGCAATATC GACAACCGAA AGCGTTCTTT TTGATGCTAT TTTTGTACCT GGCGGAAAAG ACTCTGTTGA TAAACTACTT  AAAACTGGTA AATATTCTAA GTTTATAAGT GAAGCTTTTA AACATTGTAA AGCTATTGCA GTTTGCAATG AAGGTGAAGA ATTACTTAAA AACAGTTATA TAAAATCTTA TGACGATGAT 
AAAGCTGTTT TTGTAAATGG AAAACCTAAA AACTTTATTG ATGCTATTGC CCAACATAGA AATTGGGACC GTATGGAAGC AGCATCAGAT ATTCCAGTAT AA 

Retrieve as FASTA