Entry information : MpDiOx01 (Mapoly0089s0042)
Entry ID 7374
Creation 0000-00-00 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MpDiOx01 (Mapoly0089s0042)
Name (synonym) MpDiOx01 (Mapoly0089s0042)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Marchantiaceae Marchantia
Organism Marchantia polymorpha    [TaxId: 3197 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Thallus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MpDiOx01
start..stop
S start..stop
MpDiOx02 845 0 1..610 1..605
PpaDiOx01 698 0 2..609 7..635
PabDiOx01 670 0 7..610 16..638
HaDiOx01 655 0 1..609 3..631
Literature and cross-references MpDiOx01 (Mapoly0089s0042)
Literature Yamato,K.T., et al., Gene organization of the liverwort Y chromosome reveals distinct sex chromosome evolution in a haploid system. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104 (15), 6472-6477 (2007).
EST ref. GenBank:   BJ840715.1 [3' end]
Protein sequence: MpDiOx01 (Mapoly0089s0042)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   610
PWM (Da):   %s   68520.35  
PI (pH):   %s   7.55
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGLLSFAVSP ELRPAFDSMT FGYKLCLLYV NLSDRFLKWH KVPVVLGLIY LELRRTIHQK YNLIAVGPAD KDPGDEGSFI GRNIDQTPPV SESQLMEPHP AVVATKLLNR KNFVGTGTQF  NMIATSWINF MIHDWIDHQE DDSPSKIAEL VAPSSVAAQC PLKAFKFHPG HEEDIGSGKI GFRNTRSSWW DASMIYGTSA EVQQSLRTGK EGKLKISDDG SGLLQAGHND IPLTGDPRNP  WMGVAVLQSL FIAEHNLICD TIKAAHPTFD DETIYKHAKV TTQTVLAKIH TIDWTVQLLK MNTLLAGMRA NWYGLLGKWV KDNIGSTNIS LLSGIVGHSK TVDHGVPYSL TEEFTSVYRM  HPLLPEKIEI RDLRKAPKIK NEPVLIEEVP LGEMIGTAGI KKARGYGIKT LLMSMGNQPS GALTLFNYPT WMRDLEVTDA SGVRRTDHVD MAALEIYRDR SRRVYRYNEF RKRLFMPTIK  SWSDLTDDRE TIAILTDVYG NDVEKCDVLV GLLAEKKIKG YAISETAFYI FLLMATRRLE ATPLFTTNFN EATFTKEGLH WVNTTEGLKD VLLRHHPEVV KSWMPASSAF SIWSVPADSF 
NPIPTLIRFP * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Strain="E".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGCTCC TATCGTTTGC CGTCAGTCCG GAGCTGAGAC CAGCTTTCGA TAGCATGACA TTTGGATACA AACTCTGCTT GCTGGTATGT ACGGGCAGGG TTTTGTGGCA CTCTTATGAT  TTTTCATATT CTTCTACATT GAAAGAATTA ACGTTTGAGT TTTGGAATCC GGAACTCGTC AGCTTATCCA ATTTGGATGT GATAAGCTCC GTTGGGTGGG CAGCAACCTG AAGATAAGAT  ACCTTTAGAT ATGTCATTAT AGTAACATTC GGAGACTTCT TTGAGTCACT TGAATACACA TTGACCTTTG TTTGGAGAGT AGAACACTCC CGATCTAAAG CTTTATTGCA AGTTTAGTCT  GCGACATATG GAGTACATGG GTGTGTGTGT GTGTGTAGAT CAGATTGTTG ATGACATATT TGACTGTTGT GCAGTATGTC AATCTCAGCG ACAGGTTTCT CAAATGGCAC AAAGTACCGG  TGGTTTTGGG GCTCATTTAC CTCGAGCTGA GACGAACGAT TCATCAAAAG TACAATCTTA TTGCCGTCGG CCCAGCGGAC AAGGATCCTG GCGATGAAGG CTCATTCATC GGTCGAAACA  TCGACCAAAC TCCACCCGTA TCAGAAAGTC AAGTAAGATT GTCTTATATA GATGTATCAC CTGTTTAGTC TTATCGAAAT GATGCCAACT CGGAACTCAG CAGCTGTCCT CAAAAGTACA  CAAGAGTCGG ACTCAATTGC GATCTGGAAG ACGAATTGGA AAATTATCTG AAGAACTTAT TACTTTCTCA ATGTTAGCAC ACGATCTCTA GAACGTAAGT CTGAATGTGG TAAGAGATGT  GTTCACTTGT ATTTAACCAA CAATCAGCTC ACGATATGCG AAATGGCTTC CGATTGCCCA TCAGTCAGTA CGCCCCATTG TAGATTTCAA GACATAGAAG ACGGACAATC TACCTCGGAT  ATGCTGGCTG ATATAGACCC AGATGTTGAA AAGTAAAAGA TGTATGAAAG AAGCTGTTCA CTAGTTAATC TAACTGGATC GATGTATGTG CAGCTTATGG AACCACACCC AGCCGTGGTT  GCAACTAAGC TCCTCAACCG CAAGAATTTC GTTGGCACGG GAACTCAGTT CAACATGATA GCCACTTCGT GGATCAATTT CATGATTCAT GACTGGATCG ACCACCAGGA GGACGATTCA  CCGAGCAAGG TACAGTTCTC CCACAACCTC AGAGTGTTTC TCGGGCCAAT GGAAGTCCAA TAATGAGACG AAATTGCCCT TACATTCATT CGCGGCCAGA ACCTATCGAA GAGTTGACCG  CATCATAGTA TGGAGGAAAG ATCAACTGTT GCTAAATCAA GCGAGTACGC CATTTTCTCC ATCACATTGT CAACGTGACG TCACAGTAAC TTGGAACATT CCTGAAACTC ACGATAAACT  TGACGAGGTT ATGCATATCC GGCCGGATCA TAAAGATTTC ACCCCGTGAG CAAGAATGGT ATAGGCTGAC TAGAATGAAG GATACTTCAA AACGGACAGG AAATGTAGAT GGTGAACTTT  GGAATTATCA ACGCCATCTA TCTTCGATGA GGTTTTTGCC GGATTGTCAT ATCATAATGG TGAAGGTGCA AATGCAGATG CAATCTGATC AGATTGAGCT GGAAACTATC GTGCAATTAA  GGATGTCTCA CGAAGGATGA TGACCACCAT GAATCACCTC TCTGTATATA TACACATCTG CCACAGGCTG CCTGAACTCA GTCAATTATT GTGTCTCATT GCAGATTGCA GAATTGGTGG  CGCCAAGCTC TGTTGCCGCG CAGTGTCCAC TGAAGGCCTT CAAGTTTCAC CCAGGGCATG AGGAGGACAT TGGTTCCGGG AAAATTGGAT TCCGCAACAC ACGATCCTCT TGGTGGTACG  TATATCTAAG TCCCTTCAAT GTAACCATAG CAGAATCTCA TGCATGTCTT GACGATCACC TCCGCTTGAC AATATATAAA TATCTCCATG GTCTGGCATT GCCTAGTGAC CGGAAAGGTT  GTGGGAGGCA ATTCAATGTT CGCTACCGAG CTTCGAAGTT TCAAGACAGC GTCGGATCTT ATATCGAATA TTCAAGCCCT GCGATTCAAT ACGTTGCTGT TCGTTCCATT TCAGACAACC  TTCGCTCTGA ATTTGGTTGA GGTTGACCGC TCTGGTCTGG TGGTTCGTTG GCAGGGATGC GAGTATGATC TATGGAACCA GTGCCGAGGT CCAGCAGTCC CTGAGGACTG GCAAGGAAGG  AAAATTGAAA ATTTCAGACG ATGGATCGGG ACTTCTCCAG GCTGGGCACA ACGACATCCC CCTCACCGGA GATCCTCGCA ACCCATGGAT GGGGGTCGCA GTTCTGCAGT CCTTGTTCAT  TGCCGAGCAC AACCTTATCT GTGATACGAT CAAGGTTTAT AATCAGTCGC ACCCTTTCTC CTTATGTCGA GAATCAGTCG GACCTCTCTT GTATGTGGAT TTTTCATTGG ATTGACCGGA  TGCTGAATTC GAATTCCTGC GCATTAGATC TCGTGCTTTC AGGACCTTCT TCTTGAGATC TTGAGCCAGC ATATATGATT CAACACAATT TGTTCTGTCA TTCACTACCG ATGGGACCGA  TAAAATATAC TTCAGCCAGT GAGTTGATTC TTGAGTAGTA CTGTCGGACT TTCCTCGATA CGATGTAGGC AGTATTAGAC GCGGCACATT AGAAAGGTTG GCTTCCGAGT GAGTTCCTGC  TTTGAGCTCT AGGGTCTTTT TGCTTGAGGT CTTTGAGGCT GGTTTGGGTT ATCCAGATCT TTTATAGCTC TAACGATTCT GGTGTATTTA AGCAACTTTC TGGTGTAACT CGATTCTGTG  GACCATGCAC CGTGCAGGCA GCTCATCCCA CTTTCGACGA CGAGACGATC TACAAGCACG CCAAGGTTAC GACTCAGACT GTCCTTGCTA AAATCCACAC CATCGACTGG ACCGTTCAGC  TCCTGAAGAT GAACACTCTG CTTGCTGGCA TGCGAGCGAA CTGGTACGGA CTCCGGAAAT TTAAATGATT GATGGCATAG ATTGATCACC TTCCCTGAGC TCCACGTAAA GCGAAGTGCG  TAGCTATCGA GATCCCCGCC TAGACTATTG CTAAATCATC GCATTATTTC ACACAGATTT GTATAATTCA ATTCCAATTT GTCCTAAAAT CGCAATCGGC TGCTCAAGAA TTTAGATCGT  CCATTTCGAT GCCCTGGAAA CTCGGTGAAA ACGCTGACGT TTGCTTTGTT TTTTTATCTT GCGTCAGGTA CGGGCTGCTA GGAAAGTGGG TCAAGGACAA CATCGGAAGC ACAAACATCA  GTCTTCTTAG TGGGATCGTT GGGCACTCGA AGACAGTGGA CCATGGCGTG CCTTATTCTT TGACGGAGGA GTTCACTTCA GTCTACAGGA TGCACCCTCT TCTGCCCGAG AAAATCGAGA  TCAGGGATCT CCGAAAAGCG CCGAAAATTA AAAATGAACC CGTGCTGATT GAAGAGTACG AATCTCTAAC CATCTCCAAA TCGCCGAAGC CAGATTTTGG TCATTTTCTT AGCACTAGTG  CAGTTCAGAT CTGCAGGTCA TTGTCTTGAT CTTAATGCGC TGTCGACTCT TGCGTGCAGA GTCCCACTCG GAGAAATGAT CGGTACGGCG GGGATCAAGA AGGCCAGAGG ATATGGAATC  AAGACCCTGC TGATGTCTAT GGGCAACCAG CCGTCTGGAG CTCTGACTCT ATTCAACTAT CCCACATGGA TGAGGGACCT CGAAGTGACA GATGCAAGTG GAGTCCGTCG CACTGATCAT  GTAGACATGG CAGCTCTGGA AAGTAAGTGA CAAACGCTTT TCATGCTGCG TTCTTAATAC GCTCTGGATC GTGTGAGAGA ATAGTTTCTT CCATATCAGA CTGAAGGATG GAGGATTTCA  AGACTGTCCT CTGTCATTGT TGCATTCATT TCGAGAGAAT TCGGAGGTGC AAAGATTCCG GCATACGGAA TGCTATACAT CTAGTTTGCA ATGGCAATTG AGTTCCTGGA AATAAGATGT  TCCGATGCTT CAGCTTTGAT GATCCGGGCT TTGACTCCAT GGTTCCTGGA CCTAACACAT CTAAATCTTC TCTATTTTGG CAGTCTACAG AGATCGTTCA CGCAGAGTTT ATCGTTACAA  CGAATTCCGC AAGAGACTGT TCATGCCCAC GATCAAGAGT TGGAGCGACC TGACCGACGA CCGTGAAACC ATCGCAATCC TCACTGACGT TTACGGAAAC GATGTGGAGA AGTGTGACGT  TCTCGTCGGA CTGCTAGCAG AAAAGAAGAT CAAAGGATAC GCGATTAGCG AGACGGCTTT CTACATTTTC CTCCTGATGG CAACAAGGTA CGTTTGACTT CCATGTACAA ACCTGCAAGA  CGCTCACGAG CATTTCAAAT TTGAATTCAC AATCAGGATC AGCCCATTGA TGCACGCCCA GTATCAGTGT AAGTACAACA GCCAAATCAA TGCAGCTCAT CGCGTTTGCA TCTGAAGCTA  ACAGCATTTT CTTCCATGTT CGTTGAGGTG AAGGGAAAAA CTTTGGATAG ATTGTCAGGT AATAGCTCTC GGAAGTTTTA TATTCAGAAT AGGAAATTCT CAACAGCTCT CAACCGGCGG  CTCCTTGTAG CTCAATTGGT GTTGGTTCAT ATATTTGCAT TATTTTGCAA CCTACTGATG TCGAACAATG CGATTGCAGG AGGCTGGAGG CTACTCCCCT CTTCACCACC AACTTCAACG  AGGCAACATT CACAAAAGAG GGACTGCACT GGGTCAATAC AACCGAGGGT CTCAAGGATG TACTTCTTCG CCATCACCCT GAAGTTGTAA AATCCTGGAT GCCAGCAAGC TCGGCCTTCA 
GCATTTGGAG CGTTCCTGCC GATAGTTTCA ACCCCATCCC AACTCTAATT CGCTTTCCCT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGCTCC TATCGTTTGC CGTCAGTCCG GAGCTGAGAC CAGCTTTCGA TAGCATGACA TTTGGATACA AACTCTGCTT GCTGTATGTC AATCTCAGCG ACAGGTTTCT CAAATGGCAC  AAAGTACCGG TGGTTTTGGG GCTCATTTAC CTCGAGCTGA GACGAACGAT TCATCAAAAG TACAATCTTA TTGCCGTCGG CCCAGCGGAC AAGGATCCTG GCGATGAAGG CTCATTCATC  GGTCGAAACA TCGACCAAAC TCCACCCGTA TCAGAAAGTC AACTTATGGA ACCACACCCA GCCGTGGTTG CAACTAAGCT CCTCAACCGC AAGAATTTCG TTGGCACGGG AACTCAGTTC  AACATGATAG CCACTTCGTG GATCAATTTC ATGATTCATG ACTGGATCGA CCACCAGGAG GACGATTCAC CGAGCAAGAT TGCAGAATTG GTGGCGCCAA GCTCTGTTGC CGCGCAGTGT  CCACTGAAGG CCTTCAAGTT TCACCCAGGG CATGAGGAGG ACATTGGTTC CGGGAAAATT GGATTCCGCA ACACACGATC CTCTTGGTGG GATGCGAGTA TGATCTATGG AACCAGTGCC  GAGGTCCAGC AGTCCCTGAG GACTGGCAAG GAAGGAAAAT TGAAAATTTC AGACGATGGA TCGGGACTTC TCCAGGCTGG GCACAACGAC ATCCCCCTCA CCGGAGATCC TCGCAACCCA  TGGATGGGGG TCGCAGTTCT GCAGTCCTTG TTCATTGCCG AGCACAACCT TATCTGTGAT ACGATCAAGG CAGCTCATCC CACTTTCGAC GACGAGACGA TCTACAAGCA CGCCAAGGTT  ACGACTCAGA CTGTCCTTGC TAAAATCCAC ACCATCGACT GGACCGTTCA GCTCCTGAAG ATGAACACTC TGCTTGCTGG CATGCGAGCG AACTGGTACG GGCTGCTAGG AAAGTGGGTC  AAGGACAACA TCGGAAGCAC AAACATCAGT CTTCTTAGTG GGATCGTTGG GCACTCGAAG ACAGTGGACC ATGGCGTGCC TTATTCTTTG ACGGAGGAGT TCACTTCAGT CTACAGGATG  CACCCTCTTC TGCCCGAGAA AATCGAGATC AGGGATCTCC GAAAAGCGCC GAAAATTAAA AATGAACCCG TGCTGATTGA AGAAGTCCCA CTCGGAGAAA TGATCGGTAC GGCGGGGATC  AAGAAGGCCA GAGGATATGG AATCAAGACC CTGCTGATGT CTATGGGCAA CCAGCCGTCT GGAGCTCTGA CTCTATTCAA CTATCCCACA TGGATGAGGG ACCTCGAAGT GACAGATGCA  AGTGGAGTCC GTCGCACTGA TCATGTAGAC ATGGCAGCTC TGGAAATCTA CAGAGATCGT TCACGCAGAG TTTATCGTTA CAACGAATTC CGCAAGAGAC TGTTCATGCC CACGATCAAG  AGTTGGAGCG ACCTGACCGA CGACCGTGAA ACCATCGCAA TCCTCACTGA CGTTTACGGA AACGATGTGG AGAAGTGTGA CGTTCTCGTC GGACTGCTAG CAGAAAAGAA GATCAAAGGA  TACGCGATTA GCGAGACGGC TTTCTACATT TTCCTCCTGA TGGCAACAAG GAGGCTGGAG GCTACTCCCC TCTTCACCAC CAACTTCAAC GAGGCAACAT TCACAAAAGA GGGACTGCAC  TGGGTCAATA CAACCGAGGG TCTCAAGGAT GTACTTCTTC GCCATCACCC TGAAGTTGTA AAATCCTGGA TGCCAGCAAG CTCGGCCTTC AGCATTTGGA GCGTTCCTGC CGATAGTTTC 
AACCCCATCC CAACTCTAAT TCGCTTTCCC TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGGTCCGGG AAGACTCCAA GAGAGAGTCT CGTCGGACCT CCAGAGGAAG GACTTTTTCC TTATGCGCTG GAGGAGCAAG GAGCAGAAGG TCGACTTGAG CCGGGTGAGA ACTGTCAGGG  ACTCATGGAC CCGTGGACTT CGACTACTCG TGGACTTCGA CATTAGTCTT CTCTTGTTGG GACCGAGCTG CAGATTTGCC TTTGATGAAT CTGGCGGGAG CAGCAGTACA TTAACCTAAG  ACCCGTGTTG AGGGAACGAC TTGACAGATT TTCCTGCACG ACAAGAGTTG GAGCCCGCTT ATATTGCGAG ACGGTGTTTT CCGAATCGGG CATATTTCCT CGGGAGGTGT AGACTTTCAC  GGTCGACGGG TTTTTTTTAA ATCATTTTGG GTTCGAAGTG TTCGAATATA GTGACAACCG TAGGACCCTG CAGAAGAGGA AAACATGGGG CTCCTATCGT TTGCCGTCAG TCCGGAGCTG  AGACCAGCTT TCGATAGCAT GACATTTGGA TACAAACTCT GCTTGCTGTA TGTCAATCTC AGCGACAGGT TTCTCAAATG GCACAAAGTA CCGGTGGTTT TGGGGCTCAT TTACCTCGAG  CTGAGACGAA CGATTCATCA AAAGTACAAT CTTATTGCCG TCGGCCCAGC GGACAAGGAT CCTGGCGATG AAGGCTCATT CATCGGTCGA AACATCGACC AAACTCCACC CGTATCAGAA  AGTCAACTTA TGGAACCACA CCCAGCCGTG GTTGCAACTA AGCTCCTCAA CCGCAAGAAT TTCGTTGGCA CGGGAACTCA GTTCAACATG ATAGCCACTT CGTGGATCAA TTTCATGATT  CATGACTGGA TCGACCACCA GGAGGACGAT TCACCGAGCA AGATTGCAGA ATTGGTGGCG CCAAGCTCTG TTGCCGCGCA GTGTCCACTG AAGGCCTTCA AGTTTCACCC AGGGCATGAG  GAGGACATTG GTTCCGGGAA AATTGGATTC CGCAACACAC GATCCTCTTG GTGGGATGCG AGTATGATCT ATGGAACCAG TGCCGAGGTC CAGCAGTCCC TGAGGACTGG CAAGGAAGGA  AAATTGAAAA TTTCAGACGA TGGATCGGGA CTTCTCCAGG CTGGGCACAA CGACATCCCC CTCACCGGAG ATCCTCGCAA CCCATGGATG GGGGTCGCAG TTCTGCAGTC CTTGTTCATT  GCCGAGCACA ACCTTATCTG TGATACGATC AAGGCAGCTC ATCCCACTTT CGACGACGAG ACGATCTACA AGCACGCCAA GGTTACGACT CAGACTGTCC TTGCTAAAAT CCACACCATC  GACTGGACCG TTCAGCTCCT GAAGATGAAC ACTCTGCTTG CTGGCATGCG AGCGAACTGG TACGGGCTGC TAGGAAAGTG GGTCAAGGAC AACATCGGAA GCACAAACAT CAGTCTTCTT  AGTGGGATCG TTGGGCACTC GAAGACAGTG GACCATGGCG TGCCTTATTC TTTGACGGAG GAGTTCACTT CAGTCTACAG GATGCACCCT CTTCTGCCCG AGAAAATCGA GATCAGGGAT  CTCCGAAAAG CGCCGAAAAT TAAAAATGAA CCCGTGCTGA TTGAAGAAGT CCCACTCGGA GAAATGATCG GTACGGCGGG GATCAAGAAG GCCAGAGGAT ATGGAATCAA GACCCTGCTG  ATGTCTATGG GCAACCAGCC GTCTGGAGCT CTGACTCTAT TCAACTATCC CACATGGATG AGGGACCTCG AAGTGACAGA TGCAAGTGGA GTCCGTCGCA CTGATCATGT AGACATGGCA  GCTCTGGAAA TCTACAGAGA TCGTTCACGC AGAGTTTATC GTTACAACGA ATTCCGCAAG AGACTGTTCA TGCCCACGAT CAAGAGTTGG AGCGACCTGA CCGACGACCG TGAAACCATC  GCAATCCTCA CTGACGTTTA CGGAAACGAT GTGGAGAAGT GTGACGTTCT CGTCGGACTG CTAGCAGAAA AGAAGATCAA AGGATACGCG ATTAGCGAGA CGGCTTTCTA CATTTTCCTC  CTGATGGCAA CAAGGAGGCT GGAGGCTACT CCCCTCTTCA CCACCAACTT CAACGAGGCA ACATTCACAA AAGAGGGACT GCACTGGGTC AATACAACCG AGGGTCTCAA GGATGTACTT  CTTCGCCATC ACCCTGAAGT TGTAAAATCC TGGATGCCAG CAAGCTCGGC CTTCAGCATT TGGAGCGTTC CTGCCGATAG TTTCAACCCC ATCCCAACTC TAATTCGCTT TCCCTAGGCA  GTCATCGAAT TCGGCGATTC CTCCTGTAGA TACGTGTACT TACTAGCTCC TTGACGTGTT ATCTTCCATA TCTCAGAGAT CCAAAGTCTG GCCAAAATTC CCATCACTCG ACTGGGCAAA  GCTTTTGTAG TTGTAGGTTA CATTTGTAAA CGCGTTGTTG GTAAGAAAAT AGTTCAGTTG TAGTTATCAG CAAATACTGT TCAAAGCAGT AACAATACGG TTTCCCCATC GAGCAGTCGC 
CAGCACGTGA CTTGTTCATT CCTGTGACAC ATATTTTGAG TATAATCAAT AAAAATCACC TTCTG 

Retrieve as FASTA