Entry information : SpolPrx01 (Spipo7G0013500[2.0] / SPPEROXDS)
Entry ID 74
Creation 2006-06-21 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-06-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SpolPrx01 (Spipo7G0013500[2.0] / SPPEROXDS)
Name (synonym) SpolPrx01 (Spipo7G0013500[2.0] / SPPEROXDS)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Araceae Spirodela
Organism Spirodela polyrhiza (great duckweed)    [TaxId: 29656 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Fronds
Inducer Abscissic acid treatment
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpolPrx01
start..stop
S start..stop
SpolPrx03 466 7e-167 14..329 15..330
RcPrx43 389 2e-136 7..329 7..330
OsPrx134 378 5e-132 6..329 11..335
PtPrx91 377 6e-132 14..329 18..327
Literature and cross-references SpolPrx01 (Spipo7G0013500[2.0] / SPPEROXDS)
Literature Chaloupkova,K. and Smart,C.C. The abscisic acid induction of a novel peroxidase is antagonized by cytokinin in Spirodela polyrrhiza L. Plant Physiol. 105 (2), 497-507 (1994)
Protein ref. UniProtKB:   Q43158
DNA ref. Phytozome 11:   pseudo7 (1033053..1042090)
mRNA ref. GenBank:   Z22920.1
Protein sequence: SpolPrx01 (Spipo7G0013500[2.0] / SPPEROXDS)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (306)
PWM (Da):   %s   35450.03 (33178.8)  
PI (pH):   %s   7.13 (7.13) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGRLSLFASL ALSLLLAVGS AEAQLRVGFY SKSCPHAESI ITEEIDRAIR VAPSIGGPLL RLFFHDCFVR GCDASLLLNA TSSSNPTEKD APPNQFLRGF ALIDRIKARL ERACPSTVSC  ADILALIARD VVHADQGPFW QVPTGRRDGF VSIASEATQL LPAFSANIST LKSQFNDVGL SAKDLVLLSG GHTIGNAHCF TFTTRLYNFS GRGDNSDTDP SLERNYLAKL RAKCAQDGSD 
ALKLVEMDPG SFTTFDNSYF KLVAKRRGLF QSDAALLDDA DTRSHVIHLA ESDNSVFFKE FAGAMVNMGN IAVLTGSQGE IRKNCARVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from cDNA
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGGGATTCTA TATACATATG CGTGTTTCTA GTGATTAGTG GGTATATTTT TAAATACTCT CCGGTTCTTG TGAGCTCAAT AGCATATACC ATGATTGATT CAACTATGGC ATTCGAGGAT  AATGTTCATG AAGTGACGCT AAAACTGATT CTATTCATCT TTGTGATATC CGCAGATTAT TATTGCATGA AAGGATTGCT AGTTACTGTG ATGCCTTAGA ACAGAAGAAA GAGAAGAAGA  AAAGTCCGAG GACAGAGAAG GGACCTTCCT ATCGCATGAT TGAACCCTTC CTTTGCTCCC TTCCTCTCTC CTCTTCGGAT GCGAAGCTCG CACACGCCTT AAGTGTGACG TGGCTTATCC  AGACTGTCTC CATGAAATCA GCGTCCTTCC TTGCCACGTA CGTTCGTGGA AGGAAGCGAC GCAAGGGTCC AAGCCAAGCC TTGACTGGAT CATAGGCTTA TCCAGGCACG TGCTACGCCA  GCCATGCGTA TCCAATGGTG CTAGAAAACT TCTTCTTTCT CACGCCTCAC CGTAGGCAGG ATATTTCTAT AGAATCGACG ATTCGACCCG GCGCCTCTTG GGCGGTAGCT AGCCGCCAGA  AAACGACATG TAGCCGCCGC CGGGGACCGG ACACGTTGAG GTCGGTAGCC GGAAGGCAGA GCAGTCTCCG TCACCTCCGG ACATCTCTCT TACGTAAGCT GCTTCTCCAT CTTCGCCGAA  GGGTTCTGAC GCGTGGTGGA TCAGTTGAGG AGCAACATAC TGGATGCGAT AACAGCGCTT CAAACGTACG CACACCGTCC TCTCCCACCC AGACCACAAT CCCGCCCAGC CAATGACGTC  CATGAAGGAT CTGGTGCAAT AGGACCCATT TTTTTAAAAA AACTGGGAAT GTGTAGCTGA GGAGGACTCG TTCCACGAGC AAGTTGATGG CCATTAACCC AGTCGGGCCC GGGCTTTGCA  CGGGTCTGAT GAGAAGTCTG CTTTCAAGGC TCTTCATGAT ACAAGACTGA CCGAAACCCA GGTCCTAAAA GGTTTCCTTA GCAAAATTCT AATGTAGAAC ACAAAGCAAT AACGTCCAAT  GTGGATAATG ATATTTTGCG AATGGCAATT ATTTCCTCAA ATTAGGGTGA ATTGCAACGA TAATTAAATC AAGATGCTGC ATACATCGCA CTAAGGGCAG ACAGATTTTG GCTTTAGTTA  TTTCTCTGTC GTCTTGTGAT ACACTCGTCT ATCTGAAGAT AGTAAAATTG TAAGAAACCT ATTAGGAATC CACATCCGGC GATGACTCTA ATAACGAATA CCTTCAAACT CATCGTTGTC  TCTAAAGCAT GCCTCAAAAG TTGGATACGG AAAAATTGAT AACACTTAGG GAATCAAGAT GTTCCTGTGA CGTCACAATG GTTAGTTATG TTTAGGTGTC GCATCTTCAA AATTCGTAAA  TAGTGACAGT TTGAAAGCCC ATTTGAAAAC AGCTTATAAT TGTCATCAAC ATCGATGAGA CAAAATTCAA GATTAAATAT TGAAATAAAA TGGGTCAATG TCAACTTCTT AAGGAAACTT  GAGACGTAAG TCTTCACAAA AGTTCTATTC TTGGACTGAG GATTCATCCT CGATGGCTAA TGTTATAAAG TTATGTATGT GTGTTATCAG CCTCTGACCA TCACATATTT AGCTTTCGAA  TGATTCTTAA TCACGAGATT CTGAGTTGAA TGAATTCCAC CTTCTCTTTT TTAAGATTAG CACCATACGT TTCGAGTCGC CACGAATGTC TTTTACCTAC TTATGCTTTC TTTCTGAGGC  TATATTATGA TTAGATGGTC CCCACCCTAG CTGATCTTCT TTAATATTAG ATTTTGGGTT AAATAACGAC CTTCTTAATT ATTGACCTCT CATGGCAGAG TTTGACTTGG GACTTGATTC  GGGAGGTGGA TAGATTCCTA GTTTTGTGCA TGTGGCGCCA AACGAGCCAT TATAGCAAAT GCGTTGAAAA GTCTGAGCCC ATGGTGAGCT GACGGCCCTG TCGTTGTCGT GTCTGCTCGG  CTGCTCAATC AACCTTGTTT CCTGCTCACG TTGAAGACCC CATCCAACAC GACTCCTCGG GCAATGGGTG ACAGCTAATC GTTTCCTCAT GAACCCGCCG ATGAAAAAAG AGAAGCCCCA  ATAATGATGG CTTGTTGCTT TCATATTTTT TCCCGCGGAT TTGGAGTATT TGATTTTTTT TAAAAAATGT GGCGTATATT TCACATTAAT TGGATAATAT TTTATTTTAA ATTTTTAAAA  AATTGTTGAT GCCATTCAAG CATCTAAGTT TAGACATTAT TAAGAATGGC GTCATTCGTG CTTAACATGT TTTAGCTAAC TTTGGACTAT CCTCCAATGT TTCTTCCCAT GAAACACGAT  TTCTAAATGG CTATTTGTGT TGAGAGTAAG CGTCCCCTAC AGAACCTTTA TGTGACTTGC TACTTTGTTA CCATGTAAGT ATTGCTGTTT AGCTCAAAAT CAGTTTAATG AGCCCCCAGC  ATTCTCATGG CGATGAGTTT TACCCTCATG GAAGTCCTCC AGGCACTCTG ATGTATTTTG CATTGATATG GTTGGGAGGC CAGTCATGGA AAGAGATAGG CATGGAGCGG TTTAACGGAT  TACACTAAAT AATGATGATC CGAGAGAAGA CCCCGCCTGG TTTGGTCAAC TGGTCGCATT GATGGAGACA GAAAACTAGG GGAGAATTTT CACTGCCCAA TAGAATCTGG TCTATGCGTC  GCATTGAAGG AGACTAAAAA AACTAGCAAA ACATTCACCA CCCATTAGAC TTTCTCGATC ACCGGATGGA GACAGCTTCG TCACAAGCCC CGCGCTATCG CTGGAGAGAT TTCAGCCACC  AACAGTCAGC ACAAAATGGG CAGACTACGA GCCTTACTTC CTCATTCTTC TTCACAGCTT CGCTACAAAT AACCTGGATA AAGAAACCCG GGTAAGCTAA GCTCGCCCCG GTTCCTATCT  GGGGTTGGGC GTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CGATAATTGA TGCATGACAA TCTGGCTCGA ACTTCTAGAG CTGGTTGGAA CATCGTAGGG TTCAGTCTGG AGCCCACCTT TCAGGCTTTC  TTCATGTCTC AGGTGGTCGA TTGTCGAAAG CCTGTACTTA TCTTTTCCCA TCAATGGACA GCTCGTATCT CTCTACTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTAAC GGGTGTATGT GGACAATCAG  GTCAAGTTCC ACCCGGGTGT CTAGTAAAAT ACACACACAC TCCAGATCTA CTAATCACAT AGCTTGAGTT ATCACCCTCC AGTGGTTTAT GAGTCCAACA ATGAAACGCC GACATTTATT  GCCTTCAGAA ATATTTCTTC AGGACGAATG AGGAGAAATA TCATACCATC AAGAACATTA AATCTAACAT TGATCCCACC AGATAGGAGC TCTTCTCCGA CAGATAGTTC ACATCAGCAA  TTATTTAATC CATCTATCGT AATCATGAAG GATTATTTGG TAAGATTCGG TACAGAGAAC ACCCTAAACT TACCGTGCGT TACATCTCAC CCTTTCAACG CAGAATATCG CTAGAAATTT  CAAGCTCGCA AATGCTCTGT ACTTTACTCA GTATACCCTA AGTGGGAGTA ATTTCAAGAA GCTCGTGCCT GCCCAACGCC TACATCGAGG AAAATATTAT AGAAAGCCCA CACCCACCTA  CTCCTCTCTC TCTCTCTCTC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnGAGAGAGA  GAGAGAGGGA GAGGGAGAGA AACAGGGGGC TCTAACGTGG GTCGGGCTCA TCTGTTCTTG CAGGGATGCG ACGCCTCGCT TCTACTCAAC GCCACCAGCT CGAGTAACCC GACGGAAAAG  GACGCCCCGC CGAACCAGTT CCTTAGGGGC TTCGCTCTCA TCGACAGGAT CAAGGCGAGG CTGGAGAGGG CCTGCCCCTC CACCGTCTCG TGCGCCGATA TCCTCGCTCT CGTTGCCAGG  GACGTCGTAC ATGCGGTAGA AACTTCAGCC TCCTTCCTCT CTTCTCTGAA CGCCAGTTTC CTGTTCGGTT CCTCCAAACT TTAACCATTC CCCTTGGCTC CGCCATTGCA GGACCAGGGC  CCATTCTGGC AAGTCCCCAC GGGGCGCAGG GACGGGTTCG TCTCCATCGC CAGTGAGGCC ACGCAACTGT TACCCGCCTT CTCTGCCAAC ATCTCCACCT TGAAAAGTCA GTTCAACGAC  GTCGGTCTCA GCGCCAAGGA CCTCGTCCTC CTCTCAGGTA TTGAACCATT CTTCTCCTTT CACTGTCAAT CAATATCCAG CTCCACGCTT CCTTCCACAA TTCACGGACT CATTCCGCAG  GCGGTCACAC AATCGGAAAC GCCCACTGCT TCACCTTCAC CACCCGCCTG TACAACTTCT CGGGGAGAGG TGATAACTCC GACACCGACC CATCGCTGGA GAGGAATTAC CTGGCCAAGC  TGAGGGCCAA GTGCGCGCAA GATGGCAGCG ACGCCCTCAA GCTGGTGGAA ATGGACCCGG GGAGCTTCAC CACCTTCGAC AACAGCTACT TCAAGCTGGT GGCCAAGCGC AGGGGGCTCT  TCCAGTCCGA CGCCGCTCTG CTCGACGACG CCGACACGAG GTCCCACGTC ATCCACCTCG CCGAGTCCGA CAACTCGGTG TTCTTCAAGG AGTTCGCCGG GGCCATGGTG AACATGGGCA 
ACATCGCCGT CCTCACCGGA AGCCAGGGGG AGATCAGGAA GAATTGCGCC CGCGTCAACT AG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAGCT GACGGCCCTG TCGTTGTCGT GTCTGCTCGG CTGCTCAATC AACCTTGTTT CCTGCTCACG TTGAAGACCC CATCCAACAC GACTCCTCGG GCAATGGGTG ACAGCTAATC  GTTTCCTCAT GAACCCGCCG ATGAAAAAAG AGAAGCCCCA ATAATGATGG CTTGTTGCTT TCATATTTTT TCCCGCGGAT TTGGAGTATT TGATTTTTTT TAAAAAATGT GGCGTATATT  TCACATTAAT TGGATAATAT TTTATTTTAA ATTTTTAAAA AATTGTTGAT GCCATTCAAG CATCTAAGTT TAGACATTAT TAAGAATGGC GTCATTCGTG CTTAACATGT TTTAGCTAAC  TTTGGACTAT CCTCCAATGT TTCTTCCCAT GAAACACGAT TTCTAAATGG CTATTTGTGT TGAGAGTAAG CGTCCCCTAC AGAACCTTTA TGTGACTTGC TACTTTGTTA CCATGTAAGT  ATTGCTGTTT AGCTCAAAAT CAGTTTAATG AGCCCCCAGC ATTCTCATGG CGATGAGTTT TACCCTCATG GAAGTCCTCC AGGCACTCTG ATGTATTTTG CATTGATATG GTTGGGAGGC  CAGTCATGGA AAGAGATAGG CATGGAGCGG TTTAACGGAT TACACTAAAT AATGATGATC CGAGAGAAGA CCCCGCCTGG TTTGGTCAAC TGGTCGCATT GATGGAGACA GAAAACTAGG  GGAGAATTTT CACTGCCCAA TAGAATCTGG TCTATGCGTC GCATTGAAGG AGACTAAAAA AACTAGCAAA ACATTCACCA CCCATTAGAC TTTCTCGATC ACCGGATGGA GACAGCTTCG  TCACAAGCCC CGCGCTATCG CTGGAGAGAT TTCAGCCACC AACAGTCAGC ACAAAATGGG CAGACTACGA GCCTTACTTC CTCATTCTTC TTCACAGCTT CGCTACAAAT AACCTGGATA  AAGAAACCCG GGTAAGCTAA GCTCGCCCCG GTTCCTATCT GGGGTTGGGC GTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CGATAATTGA TGCATGACAA TCTGGCTCGA ACTTCTAGAG CTGGTTGGAA  CATCGTAGGG TTCAGTCTGG AGCCCACCTT TCAGGCTTTC TTCATGTCTC AGGTGGTCGA TTGTCGAAAG CCTGTACTTA TCTTTTCCCA TCAATGGACA GCTCGTATCT CTCTACTCTC  TCTCTCTCTC TCTCTCTAAC GGGTGTATGT GGACAATCAG GTCAAGTTCC ACCCGGGTGT CTAGTAAAAT ACACACACAC TCCAGATCTA CTAATCACAT AGCTTGAGTT ATCACCCTCC  AGTGGTTTAT GAGTCCAACA ATGAAACGCC GACATTTATT GCCTTCAGAA ATATTTCTTC AGGACGAATG AGGAGAAATA TCATACCATC AAGAACATTA AATCTAACAT TGATCCCACC  AGATAGGAGC TCTTCTCCGA CAGATAGTTC ACATCAGCAA TTATTTAATC CATCTATCGT AATCATGAAG GATTATTTGG TAAGATTCGG TACAGAGAAC ACCCTAAACT TACCGTGCGT  TACATCTCAC CCTTTCAACG CAGAATATCG CTAGAAATTT CAAGCTCGCA AATGCTCTGT ACTTTACTCA GTATACCCTA AGTGGGAGTA ATTTCAAGAA GCTCGTGCCT GCCCAACGCC  TACATCGAGG AAAATATTAT AGAAAGCCCA CACCCACCTA CTCCTCTCTC TCTCTCTCTC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnGAGAGAGA GAGAGAGGGA GAGGGAGAGA AACAGGGGGC TCTAACGTGG GTCGGGCTCA TCTGTTCTTG CAGGGATGCG ACGCCTCGCT  TCTACTCAAC GCCACCAGCT CGAGTAACCC GACGGAAAAG GACGCCCCGC CGAACCAGTT CCTTAGGGGC TTCGCTCTCA TCGACAGGAT CAAGGCGAGG CTGGAGAGGG CCTGCCCCTC  CACCGTCTCG TGCGCCGATA TCCTCGCTCT CGTTGCCAGG GACGTCGTAC ATGCGGTAGA AACTTCAGCC TCCTTCCTCT CTTCTCTGAA CGCCAGTTTC CTGTTCGGTT CCTCCAAACT  TTAACCATTC CCCTTGGCTC CGCCATTGCA GGACCAGGGC CCATTCTGGC AAGTCCCCAC GGGGCGCAGG GACGGGTTCG TCTCCATCGC CAGTGAGGCC ACGCAACTGT TACCCGCCTT  CTCTGCCAAC ATCTCCACCT TGAAAAGTCA GTTCAACGAC GTCGGTCTCA GCGCCAAGGA CCTCGTCCTC CTCTCAGGTA TTGAACCATT CTTCTCCTTT CACTGTCAAT CAATATCCAG  CTCCACGCTT CCTTCCACAA TTCACGGACT CATTCCGCAG GCGGTCACAC AATCGGAAAC GCCCACTGCT TCACCTTCAC CACCCGCCTG TACAACTTCT CGGGGAGAGG TGATAACTCC  GACACCGACC CATCGCTGGA GAGGAATTAC CTGGCCAAGC TGAGGGCCAA GTGCGCGCAA GATGGCAGCG ACGCCCTCAA GCTGGTGGAA ATGGACCCGG GGAGCTTCAC CACCTTCGAC  AACAGCTACT TCAAGCTGGT GGCCAAGCGC AGGGGGCTCT TCCAGTCCGA CGCCGCTCTG CTCGACGACG CCGACACGAG GTCCCACGTC ATCCACCTCG CCGAGTCCGA CAACTCGGTG 
TTCTTCAAGG AGTTCGCCGG GGCCATGGTG AACATGGGCA ACATCGCCGT CCTCACCGGA AGCCAGGGGG AGATCAGGAA GAATTGCGCC CGCGTCAACT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTCGCC TCTCCCTCTT CGCGTCTCTC GCTCTCTCTC TTCTCCTAGC AGTGGGATCA GCAGAAGCCC AGCTCCGAGT TGGCTTCTAC TCCAAGTCAT GCCCTCATGC TGAGTCCATC  ATCACCGAGG AGATCGACAG AGCCATCAGG GTAGCCCCCT CCATTGGAGG CCCCCTCCTC AGGCTCTTCT TCCACGACTG CTTCGTCAGA GGATGCGACG CCTCGCTTCT ACTCAACGCC  ACCAGCTCGA GTAACCCGAC GGAAAAGGAC GCCCCGCCGA ACCAGTTCCT TAGGGGCTTC GCTCTCATCG ACAGGATCAA GGCGAGGCTG GAGAGGGCCT GCCCCTCCAC CGTCTCGTGC  GCCGATATCC TCGCTCTCAT TGCCAGGGAC GTCGTACATG CGGACCAGGG CCCATTCTGG CAAGTCCCCA CGGGGCGCAG GGACGGGTTC GTCTCCATCG CCAGTGAGGC CACGCAACTG  TTACCCGCCT TCTCTGCCAA CATCTCCACC TTGAAAAGTC AGTTCAACGA CGTCGGTCTC AGCGCCAAGG ACCTCGTCCT CCTCTCAGGC GGTCACACAA TCGGAAACGC CCACTGCTTC  ACCTTCACCA CCCGCCTGTA CAACTTCTCG GGGAGAGGTG ATAACTCCGA CACCGACCCA TCGCTGGAGA GGAATTACCT GGCCAAGCTG AGGGCCAAGT GCGCGCAAGA TGGCAGCGAC  GCCCTCAAGC TGGTGGAAAT GGACCCGGGG AGCTTCACCA CCTTCGACAA CAGCTACTTC AAGCTGGTGG CCAAGCGCAG GGGGCTCTTC CAGTCCGACG CCGCTCTGCT CGACGACGCC  GACACGAGGT CCCACGTCAT CCACCTCGCC GAGTCCGACA ACTCGGTGTT CTTCAAGGAG TTCGCCGGGG CCATGGTGAA CATGGGCAAC ATCGCCGTCC TCACCGGAAG CCAGGGGGAG 
ATCAGGAAGA ATTGCGCCCG CGTCAACTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGAGACGGTC TCCATGGGTC GCCTCTCCCT CTTCGCGTCT CTCGCTCTCT CTCTTCTCCT AGCAGTGGGA TCAGCAGAAG CCCAGCTCCG AGTTGGCTTC TACTCCAAGT CATGCCCTCA  TGCTGAGTCC ATCATCACCG AGGAGATCGA CAGAGCCATC AGGGTAGCCC CCTCCATTGG AGGCCCCCTC CTCAGGCTCT TCTTCCACGA CTGCTTCGTC AGAGGATGCG ACGCCTCGCT  TCTACTCAAC GCCACCAGCT CGAGTAACCC GACGGAAAAG GACGCCCCGC CGAACCAGTT CCTTAGGGGC TTCGCTCTCA TCGACAGGAT CAAGGCGAGG CTGGAGAGGG CCTGCCCCTC  CACCGTCTCG TGCGCCGATA TCCTCGCTCT CATTGCCAGG GACGTCGTAC ATGCGGACCA GGGCCCATTC TGGCAAGTCC CCACGGGGCG CAGGGACGGG TTCGTCTCCA TCGCCAGTGA  GGCCACGCAA CTGTTACCCG CCTTCTCTGC CAACATCTCC ACCTTGAAAA GTCAGTTCAA CGACGTCGGT CTCAGCGCCA AGGACCTCGT CCTCCTCTCA GGCGGTCACA CAATCGGAAA  CGCCCACTGC TTCACCTTCA CCACCCGCCT GTACAACTTC TCGGGGAGAG GTGATAACTC CGACACCGAC CCATCGCTGG AGAGGAATTA CCTGGCCAAG CTGAGGGCCA AGTGCGCGCA  AGATGGCAGC GACGCCCTCA AGCTGGTGGA AATGGACCCG GGGAGCTTCA CCACCTTCGA CAACAGCTAC TTCAAGCTGG TGGCCAAGCG CAGGGGGCTC TTCCAGTCCG ACGCCGCTCT  GCTCGACGAC GCCGACACGA GGTCCCACGT CATCCACCTC GCCGAGTCCG ACAACTCGGT GTTCTTCAAG GAGTTCGCCG GGGCCATGGT GAACATGGGC AACATCGCCG TCCTCACCGG  AAGCCAGGGG GAGATCAGGA AGAATTGCGC CCGCGTCAAC TAGAGCGAGC GAGAGAGAGG TCTGATCGTC CTCTTTGCGG GTTGCAGAGA GAGGGCCAGA CTTGTTCTGC GGATTGAGGG  TTTTCAAAAC TCAATGAGAA TAATCCCCGA GGATAACCGG GTTGCAGACG CGACCTCTGC GGGTGGCTGC TTGCTTCCTT TCTTTCTCTC TCTAAGAATA GCAATGGTTT GTTACCGAGT 
CGC 

Retrieve as FASTA