Entry information : SkoPxd01 (SkoPOX01)
Entry ID 7615
Creation 2010-09-22 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2010-09-22 (Marcel Zamocky)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2010-10-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SkoPxd01 (SkoPOX01)
Name (synonym) SkoPxd01 (SkoPOX01)
Class Peroxidasin    [Orthogroup: Pxd001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Hemichordata Enteropneusta Harrimaniidae Saccoglossus
Organism Saccoglossus kowalevskii    [TaxId: 10224 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SkoPxd01
start..stop
S start..stop
SkoPxd02 723 0 32..706 290..984
SpurPxd01 698 0 47..705 631..1312
LvaPxd 632 0 147..749 4..615
EcabPxd01 652 0 47..705 582..1264
Literature and cross-references SkoPxd01 (SkoPOX01)
Literature REFERENCE 1 Freeman,R.M. Jr., Wu,M., Cordonnier-Pratt,M.M., Pratt,L.H., Gruber,C.E., Smith,M., Lander,E.S., Stange-Thomann,N., Lowe,C.J., Gerhart,J. and Kirschner,M. (2008) cDNA sequences for transcription factors and signaling proteins of the hemichordate Saccoglossus kowalevskii: efficacy of the expressed sequence tag (EST) approach for evolutionary and developmental studies of a new organism.
Biol Bull 214: 284-302
REFERENCE 2 Freeman R.M.Jr., Wu M.M., Gerhart J.J. (unpublished since 2009)
Protein ref. UniProtKB:   D1LXG3
mRNA ref. GenBank:   GU076140
EST ref. GenBank:   FF500882   FF514530 [5' end]   FF639169 [3' end]
Protein sequence: SkoPxd01 (SkoPOX01)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   794 (772)
PWM (Da):   %s   88379.97 (85820.6)  
PI (pH):   %s   4.91 (4.87) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-794
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKHIAVVAIL LFMVWFPYDV VSQYGTNDDD EDNAIEESAV FELCFREAVN GVDRAIFETS NAIRNMHKPI TPAQLLKLFR YPTLRIIDAS RNKEVFEILL DILRSNNRGH KINPAFIETL  MVRLGCRPPS VSCNDMCFHS KFRTIDGTCN NFKYPSQGAA LTPFTRMRDS IYENGFTEPV GWNPGMLYNG FPKPLPRDVT NRLGRTYTIS HSLHLTDLVS LFGQFLDHDT DLTPQSPSSV  SFKDGQPCSA SCDNKPPCFP LLVPDDDPRI HGVNCTEFIR SSAVCGTGSV WLSREQTNAI TSYIDASQVY GSEQNKADNL RAFDGKGGMR VGHNETATGR PLLPFDPNSP MACLSDDNMN  DVPCFLAGDT RANELTGLTS MHTLFLREHN RISNILSQIN PHWDDEQLYQ EARKIVGATL QHITYDHYLP KIIGDVGMES MGVYNGYDPD TNAAIANVFA TAAFRFGHAT VKPFISRLDE  NFNETSEGHL PLHRAFFQPW RIVEEGGIDP VIRGFFATAA KDLNPGEIMT DELTEHLFEL SNSIALDLMS LNIQRGRDHA LPGYTVWRDM CGLVAADTFD KLKNEMSDDY VRHTLQDLYG  HPGNIDLFIG ALAEDPLEGS VVGPTFNCIL ARQFNKTRNG DRFWYENDGY FSENQVAEIK KTSLARIICD NTNIDVLQQD VFLMPSVSGG FVNCHSIEGF DLNAWTHQQD EDHTAPSIKC 
PSDIVINAHA PTATVYWPRL IVRDNSKENI GVTCSRANGS DFPEGVTIVT CTCTDSSGNC ATCSFSVVVQ CNQP 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from mRNA and 9 ESTs.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACACA TTGCCGTGGT CGCCATCTTG CTGTTTATGG TATGGTTTCC ATATGATGTT GTTTCACAGT ATGGAACCAA TGATGACGAC GAAGACAATG CGATCGAAGA AAGTGCCGTA  TTTGAGTTGT GCTTCAGAGA AGCAGTTAAT GGCGTCGACA GGGCCATCTT TGAAACCAGT AACGCTATCC GCAACATGCA CAAGCCCATA ACTCCTGCAC AATTACTAAA ACTGTTCCGC  TATCCAACAC TGAGAATTAT TGATGCTTCA AGGAACAAAG AGGTTTTTGA GATTTTGCTT GATATTTTAA GATCAAACAA CAGAGGACAC AAAATTAACC CAGCATTCAT CGAAACATTA  ATGGTAAGGT TGGGATGCAG ACCGCCCTCT GTATCCTGCA ATGACATGTG CTTTCATTCT AAGTTCCGGA CTATAGATGG TACATGCAAT AATTTCAAAT ACCCGTCCCA AGGAGCAGCA  TTGACACCAT TTACTCGTAT GAGAGATTCG ATTTATGAAA ATGGTTTCAC TGAACCAGTT GGTTGGAATC CTGGTATGTT ATACAATGGT TTCCCTAAAC CATTGCCTCG GGACGTGACT  AATCGACTGG GACGCACTTA CACAATCTCC CATAGCCTTC ACTTAACCGA TTTGGTCAGT TTGTTTGGAC AGTTTCTAGA CCACGACACG GATTTGACAC CTCAGAGTCC TAGTTCAGTT  TCTTTTAAAG ACGGTCAACC CTGCAGTGCA TCGTGCGATA ACAAGCCTCC CTGTTTCCCT CTTCTCGTCC CTGATGACGA TCCACGCATC CATGGCGTAA ACTGTACCGA GTTTATACGA  TCCAGTGCAG TGTGTGGGAC AGGTAGTGTA TGGCTTTCAC GAGAACAGAC AAACGCAATC ACATCCTATA TTGATGCATC ACAAGTTTAT GGAAGCGAAC AGAACAAGGC TGACAATTTG  AGAGCTTTTG ATGGTAAAGG GGGCATGAGA GTTGGACATA ATGAGACAGC AACTGGACGA CCACTGCTGC CTTTTGACCC TAATTCTCCA ATGGCATGTC TGAGTGACGA TAACATGAAT  GATGTACCAT GCTTTCTCGC AGGTGATACT CGGGCCAATG AACTGACTGG TCTCACTTCT ATGCACACCC TCTTTCTGCG TGAACACAAT CGCATCAGTA ATATCTTATC ACAGATCAAT  CCACACTGGG ACGATGAACA ACTATATCAG GAAGCACGTA AAATCGTGGG TGCTACATTA CAGCATATTA CATATGATCA CTATCTACCT AAGATTATCG GTGACGTTGG TATGGAATCC  ATGGGTGTGT ACAACGGCTA TGACCCAGAC ACTAATGCCG CTATAGCTAA TGTATTTGCC ACGGCCGCGT TTAGATTTGG CCATGCAACA GTGAAACCAT TTATCTCAAG ACTTGACGAG  AATTTTAACG AAACTTCAGA AGGTCATCTA CCACTACACC GTGCATTCTT CCAACCTTGG AGAATTGTTG AAGAAGGTGG TATAGACCCA GTTATTAGAG GATTCTTTGC TACAGCTGCC  AAGGATCTCA ATCCGGGTGA AATAATGACA GACGAGCTGA CTGAACATCT CTTTGAATTA TCCAACTCTA TAGCATTGGA CTTGATGTCT TTAAATATTC AACGAGGTCG TGACCATGCC  TTGCCAGGTT ACACTGTTTG GCGTGATATG TGCGGGCTTG TTGCAGCTGA TACATTTGAC AAGCTGAAGA ATGAAATGTC AGATGATTAC GTCCGTCACA CGCTGCAAGA TCTCTACGGC  CACCCCGGGA ACATCGATCT ATTTATTGGT GCATTGGCAG AAGATCCCCT GGAAGGCAGT GTGGTGGGAC CAACTTTCAA CTGTATACTG GCGAGACAAT TTAATAAAAC AAGAAATGGA  GACAGATTTT GGTATGAGAA TGATGGATAC TTTTCAGAAA ATCAAGTAGC AGAGATAAAG AAGACCTCAC TTGCTCGTAT CATATGTGAC AATACAAACA TAGACGTGCT TCAACAAGAT  GTGTTCTTGA TGCCTAGTGT TAGTGGTGGA TTTGTTAACT GTCATTCTAT TGAGGGGTTC GATTTAAATG CATGGACTCA TCAACAAGAC GAAGATCACA CAGCGCCTTC TATAAAGTGC  CCGAGTGACA TCGTCATTAA CGCGCATGCT CCAACAGCTA CAGTGTATTG GCCAAGACTA ATAGTCCGAG ATAATTCCAA GGAAAATATT GGTGTTACAT GCTCGCGTGC CAACGGCTCA 
GATTTTCCGG AGGGGGTAAC AATCGTGACA TGCACATGCA CCGATTCTTC TGGCAACTGT GCAACCTGCA GCTTCTCTGT GGTAGTGCAA TGTAATCAGC CGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACACA TTGCCGTGGT CGCCATCTTG CTGTTTATGG TATGGTTTCC ATATGATGTT GTTTCACAGT ATGGAACCAA TGATGACGAC GAAGACAATG CGATCGAAGA AAGTGCCGTA  TTTGAGTTGT GCTTCAGAGA AGCAGTTAAT GGCGTCGACA GGGCCATCTT TGAAACCAGT AACGCTATCC GCAACATGCA CAAGCCCATA ACTCCTGCAC AATTACTAAA ACTGTTCCGC  TATCCAACAC TGAGAATTAT TGATGCTTCA AGGAACAAAG AGGTTTTTGA GATTTTGCTT GATATTTTAA GATCAAACAA CAGAGGACAC AAAATTAACC CAGCATTCAT CGAAACATTA  ATGGTAAGGT TGGGATGCAG ACCGCCCTCT GTATCCTGCA ATGACATGTG CTTTCATTCT AAGTTCCGGA CTATAGATGG TACATGCAAT AATTTCAAAT ACCCGTCCCA AGGAGCAGCA  TTGACACCAT TTACTCGTAT GAGAGATTCG ATTTATGAAA ATGGTTTCAC TGAACCAGTT GGTTGGAATC CTGGTATGTT ATACAATGGT TTCCCTAAAC CATTGCCTCG GGACGTGACT  AATCGACTGG GACGCACTTA CACAATCTCC CATAGCCTTC ACTTAACCGA TTTGGTCAGT TTGTTTGGAC AGTTTCTAGA CCACGACACG GATTTGACAC CTCAGAGTCC TAGTTCAGTT  TCTTTTAAAG ACGGTCAACC CTGCAGTGCA TCGTGCGATA ACAAGCCTCC CTGTTTCCCT CTTCTCGTCC CTGATGACGA TCCACGCATC CATGGCGTAA ACTGTACCGA GTTTATACGA  TCCAGTGCAG TGTGTGGGAC AGGTAGTGTA TGGCTTTCAC GAGAACAGAC AAACGCAATC ACATCCTATA TTGATGCATC ACAAGTTTAT GGAAGCGAAC AGAACAAGGC TGACAATTTG  AGAGCTTTTG ATGGTAAAGG GGGCATGAGA GTTGGACATA ATGAGACAGC AACTGGACGA CCACTGCTGC CTTTTGACCC TAATTCTCCA ATGGCATGTC TGAGTGACGA TAACATGAAT  GATGTACCAT GCTTTCTCGC AGGTGATACT CGGGCCAATG AACTGACTGG TCTCACTTCT ATGCACACCC TCTTTCTGCG TGAACACAAT CGCATCAGTA ATATCTTATC ACAGATCAAT  CCACACTGGG ACGATGAACA ACTATATCAG GAAGCACGTA AAATCGTGGG TGCTACATTA CAGCATATTA CATATGATCA CTATCTACCT AAGATTATCG GTGACGTTGG TATGGAATCC  ATGGGTGTGT ACAACGGCTA TGACCCAGAC ACTAATGCCG CTATAGCTAA TGTATTTGCC ACGGCCGCGT TTAGATTTGG CCATGCAACA GTGAAACCAT TTATCTCAAG ACTTGACGAG  AATTTTAACG AAACTTCAGA AGGTCATCTA CCACTACACC GTGCATTCTT CCAACCTTGG AGAATTGTTG AAGAAGGTGG TATAGACCCA GTTATTAGAG GATTCTTTGC TACAGCTGCC  AAGGATCTCA ATCCGGGTGA AATAATGACA GACGAGCTGA CTGAACATCT CTTTGAATTA TCCAACTCTA TAGCATTGGA CTTGATGTCT TTAAATATTC AACGAGGTCG TGACCATGCC  TTGCCAGGTT ACACTGTTTG GCGTGATATG TGCGGGCTTG TTGCAGCTGA TACATTTGAC AAGCTGAAGA ATGAAATGTC AGATGATTAC GTCCGTCACA CGCTGCAAGA TCTCTACGGC  CACCCCGGGA ACATCGATCT ATTTATTGGT GCATTGGCAG AAGATCCCCT GGAAGGCAGT GTGGTGGGAC CAACTTTCAA CTGTATACTG GCGAGACAAT TTAATAAAAC AAGAAATGGA  GACAGATTTT GGTATGAGAA TGATGGATAC TTTTCAGAAA ATCAAGTAGC AGAGATAAAG AAGACCTCAC TTGCTCGTAT CATATGTGAC AATACAAACA TAGACGTGCT TCAACAAGAT  GTGTTCTTGA TGCCTAGTGT TAGTGGTGGA TTTGTTAACT GTCATTCTAT TGAGGGGTTC GATTTAAATG CATGGACTCA TCAACAAGAC GAAGATCACA CAGCGCCTTC TATAAAGTGC  CCGAGTGACA TCGTCATTAA CGCGCATGCT CCAACAGCTA CAGTGTATTG GCCAAGACTA ATAGTCCGAG ATAATTCCAA GGAAAATATT GGTGTTACAT GCTCGCGTGC CAACGGCTCA  GATTTTCCGG AGGGGGTAAC AATCGTGACA TGCACATGCA CCGATTCTTC TGGCAACTGT GCAACCTGCA GCTTCTCTGT GGTAGTGCAA TGTAATCAGC CGTGACGTCA CACAGTTGCA  TTTCAACACG TGGTATCAAG CTACAACCAC ACATCGTGTA CCTTCCAAAT CACCAGATTA ATATGTGCCA TCACGTGACT GTCAATGCTT TACCTACAGC TTGAGGTTGC GTCACTTTAA  AAAAATAAAT CTTTTCTCTT TTTATGCGAC TGTCAACAGT GACTCGTTTT TTTAAATTTC CAGCGTTTTC AAGATGCTTT TTAAGTTGTT TTTAACGAAA TGATGATATC GCAATATATT  TTTAACGAAT ACAATAATTT TTATACTAAT GCGTATTTTC CCATAATTCA CGACGTCAAA ATACAAATTA AACGATATGC ATTATTGGAA CCAATAAGGC AAAAACTAAT CTCCAGTCAT  TCTTCTCTTA AGGCAACGTG AGATTTTTCA AGAACATTAA ATGTACAAGA AACAATTGGT CTTAAACTCA AACGGCGGCT GTGATCTCGT TTACAGCGAG AGAGCCACGA GACTTATTCC  CCCGCTAACT TCCGTCATTG GTCCACGTTC TCATTACCTA TACAGCGATG GTATTTGGAA CAGTAGGCGC GATGACGAGA AAAATACAAC ACGTGACTCG CTCCCAACGA GATCTCGACG  ATTTTGTCAA TGGTTTTTAA ATATTTGAAT GATTTTTTAA ATAAGTTAAA GTATAATAAA TAATACCAAC ATGTAATCCT ATACATAGGT AATTTTTAAA TAGTTTTGTA CGTTTATGTT 
TTATACTTCA ATCTCGTGAT TTATTTTAAA TCGGAAATAA ACGTTGTCTA TTTTGTTAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA 

Retrieve as FASTA