Entry information : DsePxd01
Entry ID 7655
Creation 2010-10-25 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-02-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-02-18 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: DsePxd01
Name DsePxd01
Class Peroxidasin    [Orthogroup: Pxd001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Arthropoda Insecta Drosophilidae Drosophila
Organism Drosophila sechellia    [TaxId: 7238 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value DsePxd01
start..stop
S start..stop
DsiPxd01 1837 0 1..880 649..1528
DmPxd-A 1832 0 1..880 648..1527
DerPxd01 1793 0 1..880 647..1526
DyaPxd01 1784 0 1..880 649..1528
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2864..5506 2643  
complement(2864..5506)


exon

Literature and cross-references DsePxd01
Literature Drosophila 12 genomes consortium (2007) Evolution of genes and genomes on the Drosophila phylogeny. Nature 450:203-218.
Protein ref. UniProtKB:   B4INT5
DNA ref. GenBank:   CH676602.1 (2864..5506)
mRNA ref. GenBank:   XM_002045359.1
Protein sequence: DsePxd01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   880
PWM (Da):   %s   99208.09  
PI (pH):   %s   6.27
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MDLAPGDRYV RIAFAEAAKE IDLAINNTLD MLFSNRSDKA PPNYGELLRV FRFPTGEARQ LARAAEIYER TLVNIRKHVQ EGDNLTMKSE EYEFRDLLSR EHLHLVAELS GCMEHREMPN  CTDMCFHSRY RSIDGTCNNL QHPTWGASLT AFRRLAPPIY ENGFSMPVGW TKGMLYSGHA KPSARLVSTS LVATKEITPD ARITHMVMQW GQFLDHDLDH AIPSVSSESW DGIDCKKSCE  MAPPCYPIEV PPNDPRVRNR RCIDVVRSSA ICGSGMTSLF FDSVQHREQI NQLTSYIDAS QVYGYSTAFA QELRNLTSQD GLLRVGVHFP RQKDMLPFAA PQDGMDCRRN LDENTMSCFV  SGDIRVNEQV GLLAMHTIWM REHNRIASKL KQINSHWDGD TLYQEARKIV GAQMQHITFK QWLPLIIGES GIEMMGKYQG YNPQLNPSIA NEFATAALRF GHTIINPILH RLNETFQPIP  QGHLLLHKAF FAPWRLAYEG GVDPLMRGFL AVPAKLKTPD QNLNTELTEK LFLTAHAVAL DLAAINIQRG RDHGMPGYNV YRKLCNLTVA QDFEDLAGEI SSAEIRQKMK ELYGHPDNVD  VWLGGILEDQ VEGGKVGPLF QCLLVEQFRR LRDGDRLYYE NPGVFSPEQL TQIKQANFGR VLCDVGDNFD QVTENVFILA KHQGGYKKCE DIVGINLYLW QECGRCNSPP AIFDSYIPQT  YTKRSNRQKR DLGQENDEVA TDESYDSPLE SLYDVNEERV SGLEELIGSF QKDLKKLHKK LRKVEESCNS ADSEPVAQVV QLAAAPPQVV SKPKRSHCVD DKGTTRLNNE VWSPDVCTKC 
NCFHGQVNCL RERCGEVSCP PGVDPLTPPE ACCPHCPMIK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromosome unknown, no intron). no EST.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATTTGG CTCCAGGCGA TCGGTATGTG CGCATCGCGT TTGCCGAGGC AGCCAAGGAG ATTGACCTGG CCATCAACAA CACCCTGGAC ATGCTCTTCT CCAACCGATC CGACAAGGCG  CCGCCCAACT ATGGCGAACT ACTGCGGGTC TTCCGCTTTC CCACTGGCGA AGCTAGGCAG TTGGCCCGTG CAGCCGAGAT CTACGAGAGG ACACTGGTCA ATATCCGGAA GCACGTACAG  GAGGGCGACA ACCTGACCAT GAAGAGCGAG GAGTACGAGT TCCGGGATCT GCTGTCGCGA GAGCACTTGC ATCTGGTGGC GGAGCTATCG GGCTGCATGG AGCACCGTGA GATGCCCAAC  TGCACGGACA TGTGCTTTCA CTCGAGGTAC AGAAGTATCG ATGGCACGTG CAACAACCTG CAGCATCCCA CCTGGGGAGC TTCGCTCACC GCCTTCCGGA GATTGGCGCC ACCGATTTAC  GAGAACGGAT TCAGCATGCC CGTGGGCTGG ACCAAGGGCA TGTTGTACTC GGGTCATGCC AAGCCCAGTG CAAGATTGGT ATCCACCTCC CTAGTGGCCA CCAAGGAGAT CACACCGGAT  GCCAGGATAA CGCACATGGT GATGCAGTGG GGTCAGTTCC TGGACCATGA TCTGGATCAT GCCATTCCTT CGGTGAGTTC GGAGAGCTGG GATGGCATCG ATTGCAAAAA GAGCTGCGAG  ATGGCTCCAC CGTGCTATCC CATTGAAGTG CCTCCGAATG ATCCTCGTGT CCGCAACCGC CGATGCATCG ATGTGGTGCG ATCCAGCGCC ATTTGTGGAT CGGGCATGAC CTCCCTCTTC  TTCGACAGCG TGCAGCATCG CGAGCAGATC AACCAACTGA CCTCCTACAT AGATGCATCG CAGGTGTATG GCTACAGTAC TGCATTCGCC CAGGAGCTGC GCAATCTGAC ATCCCAGGAT  GGATTACTCC GAGTGGGTGT CCACTTCCCG CGGCAGAAGG ACATGCTGCC CTTTGCTGCT CCCCAGGATG GGATGGATTG CCGCAGGAAT CTCGACGAGA ACACCATGAG CTGCTTTGTT  TCGGGCGACA TCCGTGTGAA CGAGCAGGTC GGTCTTCTGG CCATGCACAC CATTTGGATG AGGGAGCACA ACAGGATAGC CAGCAAACTG AAGCAGATCA ATTCCCATTG GGATGGGGAC  ACCTTGTACC AGGAGGCTCG CAAGATAGTG GGTGCCCAGA TGCAGCACAT CACCTTCAAG CAGTGGCTGC CACTGATTAT TGGCGAAAGT GGCATAGAGA TGATGGGCAA GTACCAGGGC  TACAATCCCC AACTGAACCC CAGCATAGCC AACGAGTTTG CCACGGCTGC CCTGCGATTT GGACACACCA TCATAAACCC CATTCTCCAC CGCTTGAACG AGACCTTCCA GCCGATACCC  CAGGGACATC TGCTGCTCCA CAAGGCCTTC TTTGCTCCCT GGCGTCTGGC TTACGAGGGT GGAGTGGATC CCCTTATGAG AGGCTTCCTG GCCGTGCCCG CCAAGCTGAA GACCCCCGAT  CAGAACCTCA ACACTGAGCT CACAGAGAAA CTGTTCCTGA CAGCCCATGC TGTAGCATTG GATCTGGCTG CCATCAACAT CCAGAGGGGC AGGGATCACG GAATGCCCGG CTATAATGTC  TACAGGAAGC TATGCAATCT CACGGTGGCC CAGGACTTTG AGGATCTGGC CGGCGAGATC AGTAGTGCCG AGATACGCCA GAAGATGAAG GAACTCTATG GACATCCGGA TAACGTGGAT  GTTTGGTTGG GTGGCATCCT AGAGGATCAG GTGGAGGGTG GCAAGGTGGG TCCTCTCTTC CAGTGCTTGC TGGTTGAACA GTTCCGTAGA CTTCGTGATG GCGATCGCTT GTACTACGAG  AACCCCGGTG TCTTCTCACC CGAGCAACTG ACCCAAATCA AGCAGGCTAA CTTTGGTCGA GTGCTCTGCG ATGTGGGTGA CAACTTCGAC CAGGTCACCG AGAACGTGTT CATTTTGGCC  AAGCACCAGG GTGGCTACAA GAAGTGCGAG GATATAGTGG GCATTAATCT GTATCTGTGG CAGGAGTGCG GCAGGTGCAA CAGTCCACCC GCCATCTTTG ATTCGTACAT ACCGCAAACC  TACACCAAGC GGAGCAACAG GCAGAAGCGA GATCTCGGTC AGGAAAACGA TGAGGTGGCC ACTGACGAGA GCTATGACAG TCCGCTGGAA TCCCTCTACG ATGTGAACGA AGAAAGGGTC  AGTGGTCTGG AGGAACTGAT TGGCAGCTTC CAGAAGGATC TAAAAAAGCT GCACAAGAAG CTGCGCAAGG TGGAGGAATC CTGCAACTCC GCCGACTCCG AGCCGGTGGC TCAGGTGGTG  CAGTTGGCGG CGGCACCGCC CCAGGTGGTT TCCAAGCCCA AGCGGAGCCA CTGCGTCGAC GACAAGGGCA CCACCCGGCT GAACAACGAG GTTTGGTCTC CGGACGTCTG CACCAAGTGC  AACTGCTTCC ACGGCCAGGT CAACTGCCTG AGGGAGCGGT GCGGCGAGGT CAGCTGTCCG CCGGGCGTGG ATCCACTGAC GCCTCCGGAG GCCTGCTGCC CACACTGCCC GATGATCAAG 
TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGATTTGG CTCCAGGCGA TCGGTATGTG CGCATCGCGT TTGCCGAGGC AGCCAAGGAG ATTGACCTGG CCATCAACAA CACCCTGGAC ATGCTCTTCT CCAACCGATC CGACAAGGCG  CCGCCCAACT ATGGCGAACT ACTGCGGGTC TTCCGCTTTC CCACTGGCGA AGCTAGGCAG TTGGCCCGTG CAGCCGAGAT CTACGAGAGG ACACTGGTCA ATATCCGGAA GCACGTACAG  GAGGGCGACA ACCTGACCAT GAAGAGCGAG GAGTACGAGT TCCGGGATCT GCTGTCGCGA GAGCACTTGC ATCTGGTGGC GGAGCTATCG GGCTGCATGG AGCACCGTGA GATGCCCAAC  TGCACGGACA TGTGCTTTCA CTCGAGGTAC AGAAGTATCG ATGGCACGTG CAACAACCTG CAGCATCCCA CCTGGGGAGC TTCGCTCACC GCCTTCCGGA GATTGGCGCC ACCGATTTAC  GAGAACGGAT TCAGCATGCC CGTGGGCTGG ACCAAGGGCA TGTTGTACTC GGGTCATGCC AAGCCCAGTG CAAGATTGGT ATCCACCTCC CTAGTGGCCA CCAAGGAGAT CACACCGGAT  GCCAGGATAA CGCACATGGT GATGCAGTGG GGTCAGTTCC TGGACCATGA TCTGGATCAT GCCATTCCTT CGGTGAGTTC GGAGAGCTGG GATGGCATCG ATTGCAAAAA GAGCTGCGAG  ATGGCTCCAC CGTGCTATCC CATTGAAGTG CCTCCGAATG ATCCTCGTGT CCGCAACCGC CGATGCATCG ATGTGGTGCG ATCCAGCGCC ATTTGTGGAT CGGGCATGAC CTCCCTCTTC  TTCGACAGCG TGCAGCATCG CGAGCAGATC AACCAACTGA CCTCCTACAT AGATGCATCG CAGGTGTATG GCTACAGTAC TGCATTCGCC CAGGAGCTGC GCAATCTGAC ATCCCAGGAT  GGATTACTCC GAGTGGGTGT CCACTTCCCG CGGCAGAAGG ACATGCTGCC CTTTGCTGCT CCCCAGGATG GGATGGATTG CCGCAGGAAT CTCGACGAGA ACACCATGAG CTGCTTTGTT  TCGGGCGACA TCCGTGTGAA CGAGCAGGTC GGTCTTCTGG CCATGCACAC CATTTGGATG AGGGAGCACA ACAGGATAGC CAGCAAACTG AAGCAGATCA ATTCCCATTG GGATGGGGAC  ACCTTGTACC AGGAGGCTCG CAAGATAGTG GGTGCCCAGA TGCAGCACAT CACCTTCAAG CAGTGGCTGC CACTGATTAT TGGCGAAAGT GGCATAGAGA TGATGGGCAA GTACCAGGGC  TACAATCCCC AACTGAACCC CAGCATAGCC AACGAGTTTG CCACGGCTGC CCTGCGATTT GGACACACCA TCATAAACCC CATTCTCCAC CGCTTGAACG AGACCTTCCA GCCGATACCC  CAGGGACATC TGCTGCTCCA CAAGGCCTTC TTTGCTCCCT GGCGTCTGGC TTACGAGGGT GGAGTGGATC CCCTTATGAG AGGCTTCCTG GCCGTGCCCG CCAAGCTGAA GACCCCCGAT  CAGAACCTCA ACACTGAGCT CACAGAGAAA CTGTTCCTGA CAGCCCATGC TGTAGCATTG GATCTGGCTG CCATCAACAT CCAGAGGGGC AGGGATCACG GAATGCCCGG CTATAATGTC  TACAGGAAGC TATGCAATCT CACGGTGGCC CAGGACTTTG AGGATCTGGC CGGCGAGATC AGTAGTGCCG AGATACGCCA GAAGATGAAG GAACTCTATG GACATCCGGA TAACGTGGAT  GTTTGGTTGG GTGGCATCCT AGAGGATCAG GTGGAGGGTG GCAAGGTGGG TCCTCTCTTC CAGTGCTTGC TGGTTGAACA GTTCCGTAGA CTTCGTGATG GCGATCGCTT GTACTACGAG  AACCCCGGTG TCTTCTCACC CGAGCAACTG ACCCAAATCA AGCAGGCTAA CTTTGGTCGA GTGCTCTGCG ATGTGGGTGA CAACTTCGAC CAGGTCACCG AGAACGTGTT CATTTTGGCC  AAGCACCAGG GTGGCTACAA GAAGTGCGAG GATATAGTGG GCATTAATCT GTATCTGTGG CAGGAGTGCG GCAGGTGCAA CAGTCCACCC GCCATCTTTG ATTCGTACAT ACCGCAAACC  TACACCAAGC GGAGCAACAG GCAGAAGCGA GATCTCGGTC AGGAAAACGA TGAGGTGGCC ACTGACGAGA GCTATGACAG TCCGCTGGAA TCCCTCTACG ATGTGAACGA AGAAAGGGTC  AGTGGTCTGG AGGAACTGAT TGGCAGCTTC CAGAAGGATC TAAAAAAGCT GCACAAGAAG CTGCGCAAGG TGGAGGAATC CTGCAACTCC GCCGACTCCG AGCCGGTGGC TCAGGTGGTG  CAGTTGGCGG CGGCACCGCC CCAGGTGGTT TCCAAGCCCA AGCGGAGCCA CTGCGTCGAC GACAAGGGCA CCACCCGGCT GAACAACGAG GTTTGGTCTC CGGACGTCTG CACCAAGTGC  AACTGCTTCC ACGGCCAGGT CAACTGCCTG AGGGAGCGGT GCGGCGAGGT CAGCTGTCCG CCGGGCGTGG ATCCACTGAC GCCTCCGGAG GCCTGCTGCC CACACTGCCC GATGATCAAG 
TGA 

Retrieve as FASTA