Entry information : PhucoPxd01
Entry ID 7677
Creation 2010-11-02 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-02-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PhucoPxd01
Name PhucoPxd01
Class Peroxidasin    [Orthogroup: Pxd001]
Taxonomy Fungi/Metazoa; Metazoa; Bilateria; Ecdysozoa
Organism Pediculus humanus corporis (human body louse)    [TaxId: 121224 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PhucoPxd01
start..stop
S start..stop
TcasPxd01 1365 0 1..1179 216..1384
AgaPxd01 1355 0 1..1258 207..1496
AaePxd 1347 0 4..1263 203..1518
AaePxd 62 0.0000000007 275..379 189..297
CquPxd01 1343 0 1..1266 85..1339
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 514650..514698 49 N° 2 514439..514556 118 N° 3 514183..514352 170 N° 4 513941..514092 152
N° 5 513727..513847 121 N° 6 512076..512231 156 N° 7 511601..511999 399 N° 8 511214..511489 276
N° 9 510907..511140 234 N° 10 510432..510829 398 N° 11 510192..510369 178 N° 12 509980..510119 140
N° 13 509701..509920 220 N° 14 509283..509627 345 N° 15 509077..509194 118 N° 16 508760..508968 209
N° 17 508527..508672 146 N° 18 508203..508457 255 N° 19 508001..508117 117  
complement(join(508001..508117,508203..508457,508527..508672,508760..508968,5090 77..509194,509283..509627,509701..509920,509980..510119,510192..510369,510432..5 10829,510907..511140,511214..511489,511601..511999,512076..512231,513727..513847 ,513941..514092,514183..514352,514439..514556,514650..514698))


exon

Literature and cross-references PhucoPxd01
Literature Kirkness,E., Hannick,L., Hass,B., Bruggner,R., Lawson,D., Bidwell,S., Joardar,V., Caler,E., Walenz,B., Inman,J., Schobel,S., Galinsky,K., Amedeo,P. and Strausberg R. Annotation of Pediculus humanus corporis strain USDA. (Unpublished since 2008)
Protein ref. GenBank:   XP_002431634.1
DNA ref. GenBank:   DS235854.1 (514698..508001)
mRNA ref. GenBank:   XM_002431589.1
Protein sequence: PhucoPxd01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1266
PWM (Da):   %s   142301.68  
PI (pH):   %s   7.07
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MEGRELATMSEDDFHCRKPEIVEEPRDVEVSFGGSASFHCKVDGDPAPEVIWLRNSNEINANDGRHSILKDGTLMIESTLDEDLGTYECVAKSPLGQIKSKQVRMDKVRTTEGKPHFERTPLDWSANIGDTVQLVCSANGDPRPHISWYFGESHLSNSHKYIEDNGVLIIFNAQPQDAGIYRCTAANSLGVISSVSRLRVNVAPTFSTHPENLTLKSGEMAELVCAADGEPVPSISWYKGGRLLATGGRTYVLGQKLRIEHVKESDSGLYVCRADNRAGQAETTARILVKDYRERLPPKFIHTPYNLDVPAGSTIEIPCKADGEPAPVMVWRKDGNVISESKGHYRLSSHGSLYIHSVSFQDAGTYECSAVNDFGKVVANGVLKVKGKPQPASPGDKFVQKAFEEASRDIDHAVDNTLKTFVHRPRNGPPLSAGELMRLVRFPNAAARQVARAAEVYERTLYLIRKHVESGMKVKPEKDFSYKDILSPEKLTIIANLSGCMIHRPAINCSDMCFHNKYRTIDGTCNNMKHPMWGASLTGFDRILSPVYEDGFSMPVGWTKSIKYHGFSKPSARLISTRLIRTDEITPDDHVTHMLMQWGQFLDHDLDHAIPSVSSESWGGINCKKSCDYAAPCYPIEVPPNDPRVTNRRCIDVVRSSAICGSGQTSVLWADVQPREQINQLTAFIDASVYGFSTDVANILRNFTNDYGRLREGISYPNGKPLLPFAENHPNDCRRDPGESEIECFIAGDIRSNEQIGLLAMHTIWFREHNRIASELRHLNTHWDGDTIYYEARIVGAEMQHITYNHWLPLVLGEKGMEMLGKYKSYDPNISPGISNVFATAALRFGHSLINPVLERLNSSFQPIPEGHLLLQKAFFSPWRLVDEGGVDPLMRGLFTAPAKLKTPTQNLNSELTEHLFEFAHAVALDLAAINIQRGRDHALPEYNAFRKYCNLTVAETFDDLRGEISSQSVRNELEALYGHPGNIDVWVGGILEDQIDGAKVGPTFRCLLVEQFKRLRDGDRFWYENNGVFKPEQLTEIKQSSLARVLCDNGDDIRDVTRNVFVLPRKQGGYLPCAKIPQIDLRFWTECSDCQGPRIFDGISNSISRTRRSSSGSSMVKKRQTNSQMNQLNELNRFYNVQMDDEVNEDRIEGMETVLEEFQKTLKQIKRKMRKLSYQCQMNLNKKNSTQSHGSHHHNQCNDNGHKRINGEHWSKDACTQCVCQEKQITCTKILCPKMICSKPETKPDECCPVCPKDDNKNQ*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete from genomic (18 introns). No EST found. Strain="USDA". In GenBank annotated as "thyroid peroxidase precursor".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAGGAAGAGAATTGGCAACAATGTCAGAAGATGATTTTCACTGTCGTAAGTTTTTTAATTAATTAATTAATTAATTTCATTGGAAAATCGATTGCGTATTGATGGAATACCCCCGT
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GTAATATGGCTTCGAAATAG
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GTAAAAAAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAATTATTATTATTATTATTATTTGGGGTATTCGTTAATTTAAAATTTTA
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TTGGAGAATCTCATTTATCCAATTCGCACAAGTACAGA
GTTAGTAGTATAGCATCGAATCATTATTATTATTATTATTAAGTCGTGGCACCAGCCGAAAAAAAAAAAAATTAATTTCATC
AAATATTACAGATCGAAGATAATGGAGTTTTAATCATTTTCAACGCGCAACCTCAAGATGCTGGAATATATCGGTGCACGGCAGCAAATTCTTTAGGTGTTATTTCATCTGTGTCACGTC
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GTAAGTGTCATTAAAATAACATAAATAATAATAATAATAATAAAACGAACCATTAAAAAACGAGAAAAATTTTTTTCCTTTTTGCTCTCGTTAGCAAAGTCGCTATGA
CAATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGCTGACACAAGACATTCGAAGAAAAGGATATAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGATAGAAAGACATTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTT
TAATTAAAAATAATTAATTTTTTAAATTTTTTTGTAATGAAAAAAAGATTACAAAAAATTGAGTTAATTAAAAATTCAACACTTGATTCATTTTTTTTTTTTATCAGGGAAAACTCTTGA
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CAACTTTATTAAATGATTATTTAAAATATAAATTTTTTTTCCTTTTTATATGGCTGACAGAATCTCAAGCGGCGACATCTGACGGTAAAGTTTTTTATTAAATTTTTGTCGCACTTTTGT
AAAAAAAGCAGTAGTAGTAATAATAATAATAATAAATTTAATTATGTGCACACATTCATTTAGTAGCCTTTAGCCAGAAAAAAAAATGAAAAAAAAAAACATTTTATTAAATAAAATTAT
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GCGGTTTAAAAAAGAAAATAAAATAAAAACTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCGTCACCTTTTTCACAGTAATAATAAAAGAAAAAAAAAGGAAATTTATAAAGTAAACACTTTTCCC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTCTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTTTTTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTATATTTCATCCTCTTTG
TTGTTTTTCCCGGAAATTTTATTTTAATTGCGTTTTTTTTAAATATTGAAAAAATTGAATTTTTTTTTCTTTTCCAAAGCGTACGATTAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA
TATTAGCATGAAAATGGTGGGAGGGCTGGATAAGTGGATACATGTTTATGATAATTAAAGGGAGGGGGAGGGGGGGAGACTTTTCCGATCGTAAACGTGCGTGTCATATTTATAATAAAT
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AAAATTAGGGGGAGGGGAGTGAGAGGGAAAAAATACAAATAAAAAAAATAAATTAATAATTTTCCAGTGGCTCCGACATTTTCAACGCATCCGGAAAATTTGACGCTTAAATCTGGTGAA
ATGGCGGAATTAGTTTGTGCTGCTGATGGTGAACCCGTGCCATCGATATCTTGGTACAAAGGTGGAAGATTGTTGGCTACAGGAGGACGAACTTATGTTTTGG
GTAATTTTTTTTTGTCC
GCTTTATTTTATTTCGTTTGTTTTTAAATGTTTCATGGATTTTTTTATTTATTTTTCAGGTCAAAAATTAAGGATCGAACACGTTAAAGAATCCGATTCTGGACTTTATGTTTGCAGAGC
GGATAATCGTGCGGGTCAAGCAGAAACGACAGCAAGAATTTTAGTTAAAGATTATCGCGAACGGCTACCACCAAAATTTATTCACACCCCGTATAATTTAGACGTACCTGCAGGTTCGAC
TATTGAAATACCGTGTAAAGCCGATGGAGAACCTGCACCCGTTATGGTTTGGAGAAAAGATGGAAATGTCATATCGGAAAGCAAAGGTCATTATAGATTATCATCACACGGTAGTTTGTA
CATTCATAGTGTGTCTTTTCAAGATGCCGGAACGTACGAATGTTCTGCCGTTAATGATTTTGGAAAAGTTGTTGCCAATGGAGTGCTTAAAGTCAAAG
GTCAGCAAAGGATTTTCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAAACTGAAGCTCGAGACGTGACGAGAAAAAATTGTTTTTAATTTAAAAAAAAAAAAAACAGGAAAACCTCAACCGGCCAGTCCGGGAGATAA
ATTCGTTCAGAAAGCATTCGAAGAAGCTTCAAGAGATATCGATCATGCTGTTGACAACACTTTGAAAACATTCGTTCATCGTCCACGTAACGGTCCTCCTCTTTCAGCCGGCGAATTAAT
GAGATTGGTTAGATTTCCAAACGCTGCAGCACGACAGGTTGCCAGAGCAGCAGAAGTTTATGAGCGTACGCTTTATTTGATAAGAAAACATGTTGAATCTGGAATGAAAGTCAAACCTGA
AAAAG
GTACGTTATTTTAATTTCAAAAAAAAAAAAAAAACCGTTACGGAACCAGAGTTTAAAAATTATGTGATTAAAGATTTTAGCTATAAGGACATTCTATCACCGGAAAAATTGACAA
TAATAGCAAATCTTTCCGGATGCATGATTCATAGGCCTGCGATAAATTGTTCAGACATGTGCTTTCACAATAAGTACAGAACCATCGATGGTACTTGCAACAACATGAAACATCCGATGT
GGGGAGCATCACTTACAGGTTTCGATCGTATTCTTAGTCCTGTTTACGAAGATGGATTTTCCATGCCAGTCG
GTGAGTAGTAATCATTACAAATACCCCCCAAAAAAAAGGAAAAATTTC
AATGGTTAATTAAATTAATTACGTAACAGGTTGGACAAAATCAATAAAATATCACGGATTTTCAAAACCTAGCGCAAGGTTAATTTCAACACGTTTAATACGTACGGATGAAATAACTCC
AGACGATCACGTGACCCACATGCTCATGCAATGGGGACAGTTTTTAGATCACGATTTAGATCACGCGATACCCTCAGTTTCAAGCGAAAGTTGGGGAGGTATAAATTGTAAAAAATCGTG
CGATTATGCAGCACCCTGTTATCCTATCGAAGTACCACCGAACGATCCAAGGGTTACCAACAGAAGATGCATAGACGTTGTCCGATCGAGTGCGATTTGCGGTTCCGGTCAAACTTCCGT
ACTATGGGCCGACGTTCAACCCCGAGAACAAATCAATCAATTGACGGCGTTTATTGATGCTTCCCAG
GTACGTATATACGAGCACGAGTTCCAAAGTACGTAGGTACTAAGAAATGAAAT
TAATTTCAGGTTTATGGTTTTTCAACTGACGTCGCAAACATTTTAAGAAATTTCACAAACGATTATGGTCGTTTAAGAGAAGGTATTTCTTATCCGAACGGTAAACCGTTATTGCCATTT
GCCGAAAATCATCCCAACGATTGCAGACGTGATCCTGGAGAAAGCGAAATCGAATGTTTCATAGCAG
GTACAAATAAAAGAATTTTTCCCGAAGTGGATTTTTATCCAAATAATCTGATC
CCTTTGTTGCTCCTTCAAGGTGATATACGTTCGAACGAACAAATCGGACTTTTGGCAATGCATACCATTTGGTTTAGAGAACATAATCGTATAGCATCGGAACTACGTCATTTGAACACT
CATTGGGATGGAGATACCATTTATTACGAAGCGAGAAAG
GTATGAAAATTATAACAAAAGGCGATGAATTATTTTTTTTAAAATTTTAAAATGTTTAGATTGTAGGAGCCGAAATGCAAC
ACATAACTTACAATCATTGGTTACCCCTGGTTTTGGGAGAAAAAGGTATGGAAATGTTGGGTAAATATAAAAGTTACGATCCAAACATAAGTCCTGGAATATCAAACGTATTTGCAACTG
CTGCGTTAAGGTTCGGACATTCACTTATAAATCCAGTTTTGGAAAGGTTGAATAGTTCGTTTCAACCCATTCCAGAAG
GTACAACTCATAAACAACAACACAACACAACGTTTTAGAATT
GTTTTTTAAATTGTTTGTTTTGTTTTTCTAGGACATTTACTTCTCCAAAAGGCATTTTTTTCACCCTGGAGACTCGTCGACGAAGGCGGTGTGGATCCTTTGATGAGAGGACTTTTCACG
GCACCGGCAAAATTAAAAACTCCGACGCAAAATTTAAATTCAGAACTCACGGAACATTTATTTGAATTTGCACATGCCGTGGCATTAGATTTAGCAGCTATTAACATACAGAGAGGAAGA
GATCACGCATTGCCGGAATACAACGCATTTAGAAAATATTGTAATTTGACGGTCGCGGAAACTTTTGACGATTTGAGAGGGGAAATATCGAGTCAAAGCGTTAGAAACGAACTTGAAGCT
TTGTACGGTCATCCAG
GTACCAACAGAACAAAAAAAAAAAAAATTATTGTTTATTAAAATCTTCAAAATTTTTTTTTATTTAATTCAAATTTTTTTTTACAAAGGAAATATTGACGTTTG
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GTGAATAATTAAAATCAT
AATTTATTCTTTTTAAATGTAAAAATCTCATACGTCACACCCATCTTCTCGTCGCACCCTTTTGAAAAAAAAAAAAATGTTTTTTTTTAGATTTTGGTATGAAAACAATGGAGTTTTCAA
ACCTGAACAATTAACCGAAATAAAACAATCGAGTTTGGCACGAGTTCTTTGCGACAATGGAGACGACATTCGAGACGTTACACGAAACGTGTTTGTTTTACCGAGAAAACAGGGAGGATA
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GTACGTTTAAGAAAAGGGTAAAGTTTAAAAAAAAGGATTTAAATTTATTTATTTTAAAATATTTTTAA
GGTTCAAATGGATGACGAAGTTAACGAAGATAGAATCGAAGGTATGGAAACGGTTTTAGAAGAATTTCAAAAAACTCTTAAACAAATAAAAAGAAAAATGAGAAAATTATCTTATCAATG
TCAAATGAATTTAAATAAGAAAAATTCAACTCAGTCTCATGGATCCCATCATCACAATCAATGCAACGATAACGGTCATAAAAGAATTAACGGTGAACATTGGTCGAAAGATGCATGCAC
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GTTGGTACCCGTGACGGTTGCATCGATAAAACGATTAATCGATCGATAATCGAAATGAATATAATTTTTCTTATATTTTTTTCAGGAAAAACAAATAACTTGCA
CGAAAATTCTCTGCCCGAAAATGATTTGTTCGAAACCGGAAACGAAACCGGATGAATGTTGTCCAGTTTGTCCAAAGGATGATAATAAAAATCAGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAGGAAGAGAATTGGCAACAATGTCAGAAGATGATTTTCACTGTCGAAAACCGGAAATAGTTGAAGAACCGAGAGATGTTGAAGTTAGTTTTGGAGGTTCTGCATCGTTTCATTGC
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ACGCCTCTCGATTGGTCAGCAAACATTGGTGATACAGTGCAATTGGTTTGTTCGGCAAATGGAGATCCTCGACCTCACATTTCCTGGTATTTTGGAGAATCTCATTTATCCAATTCGCAC
AAGTACAGA
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CGAGTCAACG
TGGCTCCGACATTTTCAACGCATCCGGAAAATTTGACGCTTAAATCTGGTGAAATGGCGGAATTAGTTTGTGCTGCTGATGGTGAACCCGTGCCATCGATATCTTGGTAC
AAAGGTGGAAGATTGTTGGCTACAGGAGGACGAACTTATGTTTTGG
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TCTTTTCAAGATGCCGGAACGTACGAATGTTCTGCCGTTAATGATTTTGGAAAAGTTGTTGCCAATGGAGTGCTTAAAGTCAAAG
GAAAACCTCAACCGGCCAGTCCGGGAGATAAATTC
GTTCAGAAAGCATTCGAAGAAGCTTCAAGAGATATCGATCATGCTGTTGACAACACTTTGAAAACATTCGTTCATCGTCCACGTAACGGTCCTCCTCTTTCAGCCGGCGAATTAATGAGA
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G
ATTTTAGCTATAAGGACATTCTATCACCGGAAAAATTGACAATAATAGCAAATCTTTCCGGATGCATGATTCATAGGCCTGCGATAAATTGTTCAGACATGTGCTTTCACAATAAGTAC
AGAACCATCGATGGTACTTGCAACAACATGAAACATCCGATGTGGGGAGCATCACTTACAGGTTTCGATCGTATTCTTAGTCCTGTTTACGAAGATGGATTTTCCATGCCAGTCG
GTTGG
ACAAAATCAATAAAATATCACGGATTTTCAAAACCTAGCGCAAGGTTAATTTCAACACGTTTAATACGTACGGATGAAATAACTCCAGACGATCACGTGACCCACATGCTCATGCAATGG
GGACAGTTTTTAGATCACGATTTAGATCACGCGATACCCTCAGTTTCAAGCGAAAGTTGGGGAGGTATAAATTGTAAAAAATCGTGCGATTATGCAGCACCCTGTTATCCTATCGAAGTA
CCACCGAACGATCCAAGGGTTACCAACAGAAGATGCATAGACGTTGTCCGATCGAGTGCGATTTGCGGTTCCGGTCAAACTTCCGTACTATGGGCCGACGTTCAACCCCGAGAACAAATC
AATCAATTGACGGCGTTTATTGATGCTTCCCAG
GTTTATGGTTTTTCAACTGACGTCGCAAACATTTTAAGAAATTTCACAAACGATTATGGTCGTTTAAGAGAAGGTATTTCTTATCCG
AACGGTAAACCGTTATTGCCATTTGCCGAAAATCATCCCAACGATTGCAGACGTGATCCTGGAGAAAGCGAAATCGAATGTTTCATAGCAG
GTGATATACGTTCGAACGAACAAATCGGA
CTTTTGGCAATGCATACCATTTGGTTTAGAGAACATAATCGTATAGCATCGGAACTACGTCATTTGAACACTCATTGGGATGGAGATACCATTTATTACGAAGCGAGAAAG
ATTGTAGGA
GCCGAAATGCAACACATAACTTACAATCATTGGTTACCCCTGGTTTTGGGAGAAAAAGGTATGGAAATGTTGGGTAAATATAAAAGTTACGATCCAAACATAAGTCCTGGAATATCAAAC
GTATTTGCAACTGCTGCGTTAAGGTTCGGACATTCACTTATAAATCCAGTTTTGGAAAGGTTGAATAGTTCGTTTCAACCCATTCCAGAAG
GACATTTACTTCTCCAAAAGGCATTTTTT
TCACCCTGGAGACTCGTCGACGAAGGCGGTGTGGATCCTTTGATGAGAGGACTTTTCACGGCACCGGCAAAATTAAAAACTCCGACGCAAAATTTAAATTCAGAACTCACGGAACATTTA
TTTGAATTTGCACATGCCGTGGCATTAGATTTAGCAGCTATTAACATACAGAGAGGAAGAGATCACGCATTGCCGGAATACAACGCATTTAGAAAATATTGTAATTTGACGGTCGCGGAA
ACTTTTGACGATTTGAGAGGGGAAATATCGAGTCAAAGCGTTAGAAACGAACTTGAAGCTTTGTACGGTCATCCAG
GAAATATTGACGTTTGGGTCGGTGGAATATTAGAAGATCAAATT
GATGGTGCTAAAGTAGGACCAACGTTTAGATGTTTGTTAGTCGAACAATTTAAAAGATTAAGAGATGGCGACAG
ATTTTGGTATGAAAACAATGGAGTTTTCAAACCTGAACAATTAACC
GAAATAAAACAATCGAGTTTGGCACGAGTTCTTTGCGACAATGGAGACGACATTCGAGACGTTACACGAAACGTGTTTGTTTTACCGAGAAAACAGGGAGGATACCTGCCGTGTGCAAAA
ATACCACAAATCGATTTAAGATTTTGGACGGAATGTTCTCACG
ATTGTCAAGGTCCGAGAATCTTCGATGGTATATCAAATTCAATATCGAGAACGAGAAGATCTTCTTCAGGTTCGTCG
ATGGTAAAAAAACGTCAAACAAATTCACAAATGAATCAATTAAACGAATTAAATCGATTTTACAATGAG
GTTCAAATGGATGACGAAGTTAACGAAGATAGAATCGAAGGTATGGAAACG
GTTTTAGAAGAATTTCAAAAAACTCTTAAACAAATAAAAAGAAAAATGAGAAAATTATCTTATCAATGTCAAATGAATTTAAATAAGAAAAATTCAACTCAGTCTCATGGATCCCATCAT
CACAATCAATGCAACGATAACGGTCATAAAAGAATTAACGGTGAACATTGGTCGAAAGATGCATGCACTCAATGCGTTTGTCAG
GAAAAACAAATAACTTGCACGAAAATTCTCTGCCCG
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Retrieve as FASTA