Entry information : OlaPxd01
Entry ID 7686
Creation 2010-11-04 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2010-11-11 (Marcel Zamocky)
Sequence status partial
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: OlaPxd01
Name OlaPxd01
Class Peroxidasin     [Orthogroup: Pxd001]*
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Actinopterygii Adrianichthyidae Oryzias
Organism Oryzias latipes (Japanese medaka)    [TaxId: 8090 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value OlaPxd01
start..stop
S start..stop
GacPxd01 2600 0 39..1472 5..1437
TrubPxd01 2561 0 34..1481 31..1476
DrPxd01 2473 0 13..1472 8..1466
TguPxd01 2313 0 67..1472 19..1426
Literature and cross-references OlaPxd01
Literature Kasahara,M., et al. (2007). The medaka draft genome and insights into vertebrate genome
evolution. Nature 447:714-719.
DNA ref. GenBank:   BAAE01247231.1 [Fragment]   BAAF04024967.1 [Fragment]
Protein sequence: OlaPxd01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1483 (1466)
PWM (Da):   %s   166377.25 (164519.4)  
PI (pH):   %s   7.2 (7.20) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-1483
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
LCVNVLNLCV CTHLVCMCTH PVCVFVSTHL VRVCTHPVCV FVSTHLVCTH LMCVFVSHLV LFCPHRDLRF NKIKDLQPAS FSRLKNLNTL LLNNNQIRRI SRGAFEDLEN LKYLYLYKNE  IQSIDRQAFK GLVSLEQLYL HFNNIESLEP ESFSHLPKLE RLFLHNNRIT QLVPGTFSHL SAMKRLRLDS NALNCNCEVL WLADLLKLYA ESGNAQAAAT CDHPSRLQGR SVATLTAEEL  NCELPRITSE PQDVDVTLGN TVYFTCRAEG NPKPQIIWLR NNNALNMRDD SRLNLLEDGT LMIQDTRETD QGVYQCMAKN VAGEVKTSQV TLRYFGAPTR PSFVIQPQNT EVLVGESVTL  ECSATGQPQP RVSWTKGDRT PLPNDPRITI TTSGGLYIQN VQQADGGQYT CFASNNVDTI HATAFIIVQA TPQFTVTPQD QTVLESHTVE FPCEASGYPP PVIAWTRGGS ALPLDRRHVV  LSSGMLRITR VAAHDEGQYE CQAVSPVGTV HASVQLRVEQ RVITPVFTNA PRDLTVESGQ DVQIPCRAQG QPPPVLTWIK DGVQVTESGK FHISPEGFLE VRDAGTADAG RYECTARNPI  GYQVAGMVLT VTVPAVSREG DTFVSTSIEQ AIRDVDSAIE STRRRLFDGQ PRTPGELLAL FRYPRDPYTV EQARAGEIFE QTLLLIQNHV NRGLMVDTNG TAFRYNDLVS PRFLDMIANL  SGCTAHRRIN NCSDICFHQK YRSHDGTCNN LQHPMWGASL TAFERLLKSV YDNGFNLPRG ATDRLQNGYR LPLPRLVSTT MIGTETITPD DRYTHMLMQW GQFLDHDLDS TVVALSQSRF  SDGQLCAQVC TNDPPCFPIQ FPPNDQRQLR TGARCMFFVR SSPVCGSGMT SLLMNSVYPR EQINQITSYI DASNVYGSSR HESEEIRDLA SQRGLLRQGI IQRTGKPLLP FSPGPPTECM  RDENESPIPC FLAGDHRANE QLALTAMHTV WFREHNRIAT ELLRLNPHWD GDTIYHEARK IVGAQMQHIT YSHWLPKILG EVGMKMLGPY KSYDPNVNAG IFNAFATAAF RFGHTLINPI  LYRLNEHFQP IPQGHISLHK AFFSPFRIVN EGGIDPLLRG LFGVPGKMRV STQLLNTELT ERLFSMAHAV ALDLAAMNVQ RGRDHGIPPY NDYRTFCNLS SAQTFDDLKN EIKNPIIREK  LQRLYGTPQN IDLFPALMAE DIIPGSRLGP TLMCLLTTQF KLVRNGDRFW YENPGVFTPS QLTQLKQASL ARVLCDNGDN ITRVQSDVFM VAELPHGFGS CDDIPHIDLR MWQDCCEDCR  TKGQFNALSY HFRGRRSAEH SYREESPAHR IQEKRLVEEA GKSLQNVSVT SIKTTEPSVG DFQDFVTDMQ KTISSLRKQI KRLESRLSRT DCTDRDGRER KDGERWKDDS CSTCQCRDAQ 
VTCFVESCPP VACRKPIKAK GACCPVCPQE ATPDEAKAKV QLQ 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial from genomic (chromosome unknown). No EST. Strain="HNI".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGCTGAGGTT CCCTTTGACC AGGATGGATC ATTGAGTCCA TCAGAGGAAC AGATCATGGA TGTTCTGGAG ATCCATGCAG GGAAGCAGAT GGAGGAACAC TGATGATTGT GAAAGGACGC  TGAGATTGGA GAAGATAGAG AGGAAGACCA AAGAGGTTGA TGGAGGAAGG AGGTTGGCGT GAGCGAGAAG AGGGTAGAGG AGAGGGCTAC AGAGAGGCGG ATAACTCGCT GCAGCGACCT  CCAAAGGGCG GAGTCAAACA TGTTGCTAAT GAAGATGATT TGACTTTTAT GGGGTCAGAA CTGGTTTTGA AGAACATCGT AAAATCCAAC ATGGTGAAAG TTCCTCACCT TCACAGCAGT  CCTGCCACAT GCGCAGGTCA ATGTGAGGGA TGTCGTCACA GCTGCCAAAT CCATGAGGCA GTTCAGCCAC CATAAACACA TCTGATTGGA CGCGAGTGAT GTTGTCTCCA TTGTCGCACA  GAACCCGAGC CAGAGAGGCC TGCTTTAGCT GGGTCAGCTG GGATGGAGTA AACACACCTG GGTTTTCGTA CCAAAACCTG TCCAAAGCCA AAGCAGACGA GACGACACGC TCACTTCTTT  TTAGAGACAG ATTTTCCGTA CATTGGATTT ATTTTGTGGG TGTGGCTTCA GCATACCGGT CACCGTTCCG GACGAGCTTG AATTGTGTTG TGAGCAAACA CATCAGGGTG GGACCCAACC  TGCTACCAGG AATGAGGTCT TCTGCCATCA GGGCTGGGAA CAGGTCGATG TTTTGTGGGG TGCCATAAAG CCTGCCATGA AGACGGTGAC TCGTTCAATA AAACTCTGCG CATTAGGGTT  TCTTTTTATT ATTTCATTAG TGATTTCAAA AACAGAGAAA CTCACCTCTG AAGCTTTTCT CTGATAATGG GATTCTTGAT CTCGTTCTTC AAATCATCAA ACGTCTGGGC GGAGCTTAGG  TTACAGAACG TCCTGTAGTC GTTGTACGGA GGAATGCCAT GATCCCGCCC TCGCTGAACA TTCATGGCAG CCAGGTCCAG GGCCACAGCG TGGGCCATTG AAAACAGCCG TTCTGTCAGC  TCTGTGTTCA GAAGCTGAGT GGAAACCCGC ATTTTGCCGG GAACCCCAAA GAGGCCACGC AGAAGAGGGT CGATGCCTCC CTCGTTTACA ATACGGAAGG GGGAGAAAAA GGCCTTGTGC  AGAGAAATGT GCCCCTGTGG GATTGGTTGG AAGTGCTCAT TTAAGCGGTA GAGAATGGGG TTGATGAGGG TGTGTCCAAA GCGGAAAGCA GCCGTAGCAA ACGCATTGAA AATGCCAGCA  TTAACATTGG GGTCATAACT CTTGTATGGT CCCAACATCT TCATACCGAC CTCACCCAGA ATCTAGGAGA AAAGACACGT TTCAATAAAC ACACCAACAC CAGTGAAAAG TGGGACCCGG  ACCGCAGAGA CGTTACCTTT GGCAGCCAGT GGCTGTAGGT GATGTGCTGC ATTTGGGCTC CCACTATCTT CCTGGCCTCG TAATATATTG TGTCTCCATC CCAATGAGGA TTTAACCTCA  GCAGCTCGGT GGCTATGCGG TTGTGTTCTC TGAACCACAC CGTGTGCATG GCAGTCAAAG CTAGTTGCTC ATTGGCTCGA TGGTCGCCTG CCAGAAAACA TGGGATGGGA CTTTCATTTT  CATCCCTCAT GCACTCAGTT GGGGGACCTG GGGAAAATGG TAAAAGGGGT TTCCCTGTTC GCTGAATGAT GCCTTGACGG AGCAGTCCCC TTTGGCTAGC CAAGTCACGG ATTTCCTCGG  ACTCGTGCCG TGAGCTACCA TAGACGTTTG AGGCATCGAT ATAAGACGTG ATTTGGTTTA TTTGCTCTCT TGGATAAACA CTGTTCATTA GAAGAGAAGT CATGCCGCTG CCACACACTG  GACTGGATCG CACAAAGAAC ATGCAGCGGG CACCAGTTCG CAGCTGGCGC TGGTCATTGG GCGGAAACTG GATTGGAAAG CATGGGGGGT CGTTCGTGCA GACCTGAGCA CAGAGCTGGC  CGTCCGAAAA ACGGGACTGA CTCAGGGCCA CCACTGTTGA GTCCAAGTCA TGGTCCAGGA ACTGACCCCA CTGCATCAGC ATGTGAGTGT AGCGGTCATC AGGAGTTATG GTCTCCGTTC  CAATCATTGT AGTCGACACC AGCCTTGGCA AAGGCAACCG GTAGCCATTC TGCAGCCGGT CGGTGGCGCC TCTCGGCAGG TTAAACCCGT TATCATAGAC AGATTTTAGG AGGCGCTCAA  ACGCAGTGAG AGAAGCTCCC CACATGGGGT GCTGAAGGTT GTTGCAGGTG CCGTCGTGGC TGCGGTACTT CTGGTGGAAG CAAATGTCCG AGCAGTTGTT TATGCGGCGA TGCGCTGTGC  ATCCAGACAA GTTGGCGATC ATGTCCAGAA AGCGGGGCGA CACCAGGTCA TTGTAGCGAA ATGCTGTGGA GAAAAAGGAG AGTTCAGTGT CTTTATAATG TGAATCAAAT GAAACCTTGG  TTATATGTTT AAAATAAAAC GACTAAAAAC TGGTAGATAA TTAGATATCA CCTAACATTT GGAGGAATGA CTGTCCATGT CAGTAAAAAA TATTTGTTTA TGTCTCAGTA TTCTTGAGAA  TAAAACAGAA TAGAATAAAA CCTTTACTGA TCCCACAACT CTATTAAAAA CAGCTGATAG ATTAAGGTTT ATTGATCCCT TCATGGTGTA TGTCGGTGCT TCGCATTGTA CCATTCAATC  CAGGACTTCC CTTGATTTAA CGCCACCTTG AGGAATAAAT ATTGAAGAAT ATTTTTTAAA TAGGCCTATG CCAATTGGAA ATAAGGTCAG GCACCAAAGG GTTAGTGTTG TGACGAATAT  GTGAAGGTGA AAAGTGGTGC ATTAATGTCC TTCAGAGAAA AAAACTAAAC ATCCATTTCA TATTTGAGGA GTGCAAGAAT TATTAGGAAA CATATTTTAA ATTGTTTTAT ATAGCTACTA  AATGCTAAAT AATGTTTACT GCTTCTGGCT AAAAGAGTGG AAAAGCATCT TTCAGGACTC ACAACAGACA CAGCGGATCT CATTTAGGCA TGTCAATGCA TTTCTCTGTG TCCCAGGTGG  ATCCCAGGTG GATGTGAATA GAGAAGAAGA TCCAGGGAGC TTGAAATCTA CTCTGGAGTG AATAAATGTC AGCTACAGCA AGACAAGTTA TCTGTGTGTA AATGAGAGGG ACTGGAGTAG  GCGTGAGCGT CCCCGAGATG ACAGGGAGCA GAGGTGAGGA AGTTCTTGGG GTCAACAGTT CAGAGCAACA GAGAGGTGAG GAGGCGTGTC CAAGCAGGTT AAAACAGGTG GAGGAAGGTT  TCAGGTCTGA TGTGTGACCA AGGTGACCAA GCTCAGTGGC CTTGTGGAAG AGTGTCCGCC CTGTGACTGG AAGGTCGGGT GTTCAAATCT AGGCAGAGTC ATACCAAGAC TAAAAATGGG  ACCCAATGCT TCCCTGCTTG ACACTCAGCA TTAAGGGGTT GGATTGGGGG TTTAAGCCAC CAAATGGTTC CTGAGCGCGG CTGTGTCTGC AGCTCCCCCC TCCCCCAGGG GATGGGCAAA  TGCAGAGAAC AAATTTCACA CACCTAAATG TGTGACAGAT AATGGTACTT TAAAATGAAA GGAAAGGTGA AGAAAAGCAG CTATGTTGTT GGCTTAGAGA CAGGAGGCAG CGGAGATGAA  GATGCTGAGC TTCTCTTTGA CCAGAATGGA TCATTGAGTC CATTAGAGGA ACACATCATA GATGTTCCGG AGATCCATGC AGGGAAGCAG ATGGAGGAAC AGTGATGATG ATGGTGAACG  GATGCTATGG TTGAAAAGGA AAGAGAGGAA GACCATCCTC TTTCACTGCA TAGGGAGTGG AGGAGGACAG GGTTTGGGTG GAGGTGGATA ATTCCCTCTA GTAACCACTA AAAAGAGCAG  CCAAAAGGTA TAAAAAGCAG AAGTGGTAGT TTCCAAATAG GACTTTGGGC TGAACCAAAC GCACTAATGC TACCGTCACA AATACAAATG TCACGATGGG GAGGCATCGG GAGAATATTG  AAGATTTCAT GCCTCCACCA GATTTTTGGA AAATCATAGA CGTAGTCATA AACGTAGACG GCTGCAGTCA GTCAGGCGGG GATGACGCCA TCACGAACTT GGGCGACAGC TGCGGGTGGT  TGCTCTGATT GGACGTGTGT AAACGTCTCC GTACGGCGAC TGTCCAGATC AAGTACCACC AGTGGCCTGG TAGCCAAGGG GTATAAAAAA AGCAGGCGAT TCAGCACCAT TGGTCAATCG  CAACTCAGAT TTTGAGCACA CATTCGAGTC AATTTACAAA TTGACACATT TTTTGACAAG ATACCTCCCA AGAAACCCAG GAAGGGCAAC GTCCCAGCAC CCAAAAAAAC AAAGGTTCAA  GCGGTCCAAC CACACCAGGA GTCTTCATCA GATGAGGAGC ATCAATGCCG TCTCCCCACT TGGACCAACG GGGGATGGGA TCACCAAGTT GGCATCCCGT CATCCCCCGG CCCATGTAAA 
CAGCCCTCAT TGAGTGCCCG CACTGCTACC C 

Retrieve as FASTA