Entry information : CatmAPx-R01
Entry ID 7707
Creation 2010-11-02 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-10-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CatmAPx-R01
Name CatmAPx-R01
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Chlorokybophyceae Chlorokybaceae Chlorokybus
Organism Chlorokybus atmophyticus     [TaxId: 3144 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CatmAPx-R01
start..stop
S start..stop
CatmAPx-R_UTEX2591 294 3e-99 220..365 144..289
CatmAPx-R_UTEX2591 154 7e-45 23..227 27..210
AhalAPx-R01 263 2e-86 125..364 95..327
MeAPx-R 263 2e-86 122..363 99..332
AlyAPx-R 262 6e-86 125..364 95..327
Literature and cross-references CatmAPx-R01
Protein sequence: CatmAPx-R01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   365 (348)
PWM (Da):   %s   38931.94 (37327.2)  
PI (pH):   %s   10.11 (10.11) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-365
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASAASAGWL LVSSVSSSWL SEDASFRAER GSGLRRRLQR HGAVTTAQAS QPKPKPKPQP QPEPQPQAVV TRRSLIQRSS GLLLFMPAAA PVLTTFVTRN GSNAARAVDA PSPRSGVPKS  PEANATLYAA LQSAIRETTS KGKAPGVLRL AFHDAGTYDP FAGAVLQGGP NGSIRFEDKR PENEGLQRPL RVIAKTMASL KKQLPNATVS WADVIAVAGA ESVAITGGPT FRVPIGRVDA  QASDADGRMP GENWTAAQLK SHFAAQGFST RELVALLGAH TIGFKGYGMP DVFDNTYYKT LLEKPWKNSK DAMAYMIGIP IDHAVAEDTE CLQWIQLYAA DQQQFFNDFA AAYTKMTSAG 
AVWSV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from RNA seq (scaffold-AZZW-2020021-Chlorokybus_atmophyticus) and genomic (Chlatm_Chrsp86S07999).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGG CGGCGTCAGC GGGGTGGCTG TTGGTTTCGT CGGTGTCGTC GAGCTGGTTA TCTGAGGATG CCAGCTTCCG GGCGGAGAGG GGTTCTGGGC TGAGGAGAAG ATTGCAGCGG  CATGGCGCAG TGACAACCGC GCAGGCTTCT CAGCCCAAGC CCAAGCCCAA GCCTCAGCCT CAGCCTGAGC CTCAGCCTCA AGCTGGTGAG TTAGGGTTTC ATGCTTGCTT GCTTGCATTC  TTGTTTTCTA ACTCGTACTA GCTAGTTGTG CTTTGCTAGG TGCAGAGGTA CACCTCTAGC AAGAAAGGCA GCTGATAACT GTTGTGATGT GCAAGCTTTG TTGGCATGAT CTTGACTAGA  TGCTTCTTGT CAATCGCCAA TGATCGCGGT AACATTGAGA GTCAGGATTA GGCATTGCTA TAAGCGTGCA AGCATGCGGT GTTTCTTGCT CAGCATACAA AGTTGCAGCG GTCGTGTTGC  AGACGGTATT AATGGTGGCG GATTGGCGCT GTACAGGAGG CAGTTTGCAT TATCTTCAGC AGCGGCAGGT ATCAGGCAGT AAACTATCTT TTTCTGAAAA GGCACCAACA GTCCATGCGA  AAGGACATGG GAAACAGTCA GACACTCAGC TGGCTGGAGT TCAGTTCGTC ATGCATACCG TTGCTGCAGC AACACACATT ATAGATTTAT TGTAGCAACT CGCGATCACT TTGGATCGCA  CTCTAGCGTT CTTCACTACA CACATTTTGT AGAAGCGCAT CCTCTCAGTC ATCACACGGG AAAGTTGGAC GGGCTCAAAC AATTGAAACA GTCGAGTTCT ACGCATGCAA CTCTCGTGAT  TGCCTTGTAA GTGTCCTCAT CAAGTTTGCG TACTGTTGCT GACCCAAGTT GTGAGCAGTG TTCTGGTAAT TTATACAACT CTGCCACAAG CCATCATTCG CTCGCTGTTG TTGATTTCCT  GGTAATTAGG AACTAAGTGT CTCATGCAAC AATATCTTGT CCTAAAAGCT GCTCTTGCTT TACAGTTGTG ACGAGGAGGA GTTTGATACA ACGCAGCAGC GGCTTGCTGC TATTCATGCC  GGCCGCTGCC CCTGTTCTGA CTACGTTCGT CACACGCAAC GGCAGCAATG CTGCTCGCGC TGTTGATGCG CCGTCTCCAC GGTCAGGCGT GCCGAAGTCG CCTGAAGCAA AGTAAGTCAG  CTGACGAGCT ACAAGCTAGT GTGTTGTGGG TGGAGAAGGC ATATACGAAT ACAAAGACAT GCACAAGTAC ATATATGTGT GCCTTTGTGT ATACGTGAGT CCGTCCGTAT ATGTGTGCGC  ATGGGTACAT GCACCCACGC AAGCGTCACT GTGTGCATGT GCACCATACC ATGCGTGCAC CAGCACGTAC ATCTGTGCGC TTGCGCAAGT GTACAAGCAT GTGCACATGC GCGCAACGTA  CTGTGCATGC ATCCATTTGT GCGCGTATGC GTGTACACTT GTGCACACGC ACAGTACCTA TGTTGTAAGC GCTCAATCTG TTGTGCGTGC TTGTCAACAA TAGTGTACAT GCACATAGTG  TTTGTGCATG CATGCTTGCA TATTGTGCTG CTTGGCAACA TGCAAGATCA AATAACAATA TATCAAAGGC ATCTACAATG TGCAGCACTG ACCAACTGTT GTCATCAACA GCGCAACGCT  CTATGCCGCG TTGCAATCGG CGATCCGCGA GACCACAAGC AAGGGCAAGG CGCCGGGCGT GCTGCGGCTG GCTTTCCACG ATGCCGGCAC GTATGATCCA TTTGCGGGTG CGGTGTTGCA  GGGCGGACCC AACGGCAGCA TAAGGTAGTC AGGATACACA AGCATACGTA TGCCTGATGT ATATATATAT TGCCGCACAT ATATGCAAGC GTGTGCAGGT GCGCATGTGC GAGTGCTACT  GCGTGTGTGC ATGTGTGCAT CAAATGGAAA TGCTGTGCAG GTTTGAGGAC AAGCGGCCAG AAAACGAGGG CTTGCAACGG CCTTTGAGGG TGAGGAACAC ATGTTCAATT CATCCAGGCT  TGCAATGCAA TTTGGATATG TGTCTGAGCT CAGGTTCTGA TCGCAATTGT CAGTACTATG TGCACTACTG TTGTATGTTG CATGTGCGTG AAAAGCAACA CGACTGCATG GCATCAAAGC  CAACAAGACA AACACGTGCA CCTGTGTCAA CGAGCCTTGT ACTTAGCATG TTGTGTACAG TGTGTGGTGC CTCCACTTTG TAAGCAGAAG TGTTGTGACT GGCGGTCTTT AAATGGCAGC  CCCTGCTCTT GTAGACACAC TTCACCCAAA CAGTTGTCAC ACTCGAAGCA CTAGTAGAAA TAAGATTAGT ATGTAAACAG ATTGACGCGT GTGCACTGGA TGTGTACACG TCTCATCAAC  TTTTTGTTCG TACCCATGCG CGCACTTGCC GGCATATGCA TATGTTGACC CCTGCCTTCC ATTTATGTGC AACGTGCAGG TGATAGCGAA GACAATGGCG TCGCTGAAGA AGCAGCTGCC  GAATGCGACT GTGTCGTGGG CGGATGTGAT TGCCGTCGCG GGCGCCGAGT CCGTTGCCAT CACGGGCGGG CCGACCTTCC GCGTACCTAT TGGCAGAGTT GACGCACAGT AAGTTGATTC  TCTCTTGCTA ATGGGGGTTG CTTGTTTGTG TGTTTGGTGA TCCTCCGGGA GTTTGCTGGC TGGATACCTT GCATATGCAG AACAACGCTG ATGGGTGCAG AAGTCTTGTT TGAGGTAGTA  TGAGGCCACC CAGTGTTTGC ACTACCCAAG CTGGGTGTGT TAGAGATAGC ATACATTGCT GCTGACATAG CGCCCGTACC AAAATCTCCC ATGCATACCA TGCGTGCCAT ATGCAGTGCT  TGTAATTCGT TGCAAGACAC ATTATTATTG CAGCGCGCAA ATAGAGTTGG TATTGTACAC ACATGCTATA TGTCACATAT CACACCTTGC AGGGCGTCAG ATGCGGATGG TCGCATGCCA  GGCGAGAATT GGACGGCAGC ACAGCTGAAG TCTCATTTCG CAGCACAGGG TTTCAGGTAC ACGAACTGCG TGCATGCCTA CATGAGTGTG TGTTAAGGGT TCTCTTGGTG TGATTTGTGA  GCTCACAGCT TCGTGTGCGG ATTGTCTCTT GACATGTCAA GGCACTTCAC CAGCTGCATT GTCTGAAGTG GGATGTGTTC GTCACATGTG CTAATTGTCA GGAGTGCGGA TGCTGCAAGT  GGCTCGTCGT TGTTCACTTT ATTACGCTCA TATCGCTAGT ATCACATCTG CTGCCAATGC ATCAAGTAAC TTGATTGTGA GTCATGATTA TTGCCTAGTC ATGTGACAGG TCTAGTCATG  TAACAGTCAT GTGCAAGTAG TCGTGGAGCA CTTACATTAT GTTGCTGCGT GGGTCTGCAG CACGCGCGAG TTGGTGGCGT TGTTGGGTGC ACACACCATT GGGTTCAAGG GTTACGGGAT  GCCGGATGTG TTTGACAACA CATACTACAA GACGCTGTTG GAGAAGCCTT GGAAAAACAG TAAAGGTGAG TCCAATCAGT CTGAGGGTGG GCTGTCCTAC ACATGTGGCA CTTGTGAGGG  TGTGTGCGTG TGTTCATGTA TTTGTGAGTG CACGGTGAGC AAAGCCAAGA CTGAATAGCT GTTACCGGTT GCAGATGCAA TGGCATACAT GATTGGTATA CCTATTGACC ATGCGGTTGC  CGAGGACACG GAGTGCTTAC AGTAAGTGCG CTTCACGTGC ATGGTTGTGG TCAGTTCAGC TTATTGGACA CCTGATTGAC TGATCATGGC GCAATGTGCA GATGGATTCA GCTCTATGCG 
GCCGATCAGC AGCAGTTTTT CAATGATTTC GCTGCTGCGT ACACAAAGAT GACGTCTGCA GGAGCCGTGT GGTCGGTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGG CGGCGTCAGC GGGGTGGCTG TTGGTTTCGT CGGTGTCGTC GAGCTGGTTA TCTGAGGATG CCAGCTTCCG GGCGGAGAGG GGTTCTGGGC TGAGGAGAAG ATTGCAGCGG  CATGGCGCAG TGACAACCGC GCAGGCTTCT CAGCCCAAGC CCAAGCCCAA GCCTCAGCCT CAGCCTGAGC CTCAGCCTCA AGCTGTTGTG ACGAGGAGGA GTTTGATACA ACGCAGCAGC  GGCTTGCTGC TATTCATGCC GGCCGCTGCC CCTGTTCTGA CTACGTTCGT CACACGCAAC GGCAGCAATG CTGCTCGCGC TGTTGATGCG CCGTCTCCAC GGTCAGGCGT GCCGAAGTCG  CCTGAAGCAA ACGCAACGCT CTATGCCGCG TTGCAATCGG CGATCCGCGA GACCACAAGC AAGGGCAAGG CGCCGGGCGT GCTGCGGCTG GCTTTCCACG ATGCCGGCAC GTATGATCCA  TTTGCGGGTG CGGTGTTGCA GGGCGGACCC AACGGCAGCA TAAGGTTTGA GGACAAGCGG CCAGAAAACG AGGGCTTGCA ACGGCCTTTG AGGGTGATAG CGAAGACAAT GGCGTCGCTG  AAGAAGCAGC TGCCGAATGC GACTGTGTCG TGGGCGGATG TGATTGCCGT CGCGGGCGCC GAGTCCGTTG CCATCACGGG CGGGCCGACC TTCCGCGTAC CTATTGGCAG AGTTGACGCA  CAGGCGTCAG ATGCGGATGG TCGCATGCCA GGCGAGAATT GGACGGCAGC ACAGCTGAAG TCTCATTTCG CAGCACAGGG TTTCAGCACG CGCGAGTTGG TGGCGTTGTT GGGTGCACAC  ACCATTGGGT TCAAGGGTTA CGGGATGCCG GATGTGTTTG ACAACACATA CTACAAGACG CTGTTGGAGA AGCCTTGGAA AAACAGTAAA GATGCAATGG CATACATGAT TGGTATACCT  ATTGACCATG CGGTTGCCGA GGACACGGAG TGCTTACAAT GGATTCAGCT CTATGCGGCC GATCAGCAGC AGTTTTTCAA TGATTTCGCT GCTGCGTACA CAAAGATGAC GTCTGCAGGA 
GCCGTGTGGT CGGTTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAACCAACAG CCACCCCGCT GACGCATCAG CTTCGTTCGT CGCGCATGCG CGGCGATGGC GTCGGCGGCG TCAGCGGGGT GGCTGTTGGT TTCGTCGGTG TCGTCGAGCT GGTTATCTGA  GGATGCCAGC TTCCGGGCGG AGAGGGGTTC TGGGCTGAGG AGAAGATTGC AGCGGCATGG CGCAGTGACA ACCGCGCAGG CTTCTCAGCC CAAGCCCAAG CCCAAGCCTC AGCCTCAGCC  TGAGCCTCAG CCTCAAGCTG TTGTGACGAG GAGGAGTTTG ATACAACGCA GCAGCGGCTT GCTGCTATTC ATGCCGGCCG CTGCCCCTGT TCTGACTACG TTCGTCACAC GCAACGGCAG  CAATGCTGCT CGCGCTGTTG ATGCGCCGTC TCCACGGTCA GGCGTGCCGA AGTCGCCTGA AGCAAACGCA ACGCTCTATG CCGCGTTGCA ATCGGCGATC CGCGAGACCA CAAGCAAGGG  CAAGGCGCCG GGCGTGCTGC GGCTGGCTTT CCACGATGCC GGCACGTATG ATCCATTTGC GGGTGCGGTG TTGCAGGGCG GACCCAACGG CAGCATAAGG TTTGAGGACA AGCGGCCAGA  AAACGAGGGC TTGCAACGGC CTTTGAGGGT GATAGCGAAG ACAATGGCGT CGCTGAAGAA GCAGCTGCCG AATGCGACTG TGTCGTGGGC GGATGTGATT GCCGTCGCGG GCGCCGAGTC  CGTTGCCATC ACGGGCGGGC CGACCTTCCG CGTACCTATT GGCAGAGTTG ACGCACAGGC GTCAGATGCG GATGGTCGCA TGCCAGGCGA GAATTGGACG GCAGCACAGC TGAAGTCTCA  TTTCGCAGCA CAGGGTTTCA GCACGCGCGA GTTGGTGGCG TTGTTGGGTG CACACACCAT TGGGTTCAAG GGTTACGGGA TGCCGGATGT GTTTGACAAC ACATACTACA AGACGCTGTT  GGAGAAGCCT TGGAAAAACA GTAAAGATGC AATGGCATAC ATGATTGGTA TACCTATTGA CCATGCGGTT GCCGAGGACA CGGAGTGCTT ACAATGGATT CAGCTCTATG CGGCCGATCA  GCAGCAGTTT TTCAATGATT TCGCTGCTGC GTACACAAAG ATGACGTCTG CAGGAGCCGT GTGGTCGGTT TGATCCATTT GTCACTTAGA ACTGAAGTAC TTGCTGAGTG TAACATTATG  CTGCCTTTAC TGCAGTACAC ATTGTGCTGC ATACCTGATT TTGTTAAACT CGTACACACT AGCGTGCTGT TGTGTAATGT GCTTAATTTG CGTACAACAG TTGTCCTGAT AACCTGTTTT 
AGCTATTGCC ATCATGACAA TAGCAATAGG GTTGTAATTA TCATAGGCAT TT 

Retrieve as FASTA