Entry information : CorAPx02
Entry ID 7720
Creation 2010-11-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2010-11-24 (Qiang Li)
Sequence status partial
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2012-06-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CorAPx02
Name CorAPx02
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Coleochaetophyceae Coleochaetaceae Coleochaete
Organism Coleochaete orbicularis    [TaxId: 3124 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CorAPx02
start..stop
S start..stop
CorAPx01 501 0 7..296 2..290
CscAPx04 500 0 27..296 15..284
CirAPx01 443 3e-159 29..297 1..269
CbrebAPx07 436 3e-155 24..297 1..274
Literature and cross-references CorAPx02
Literature Timme,R.E. and Delwiche,C.F. Uncovering the evolutionary origin of plant molecular processes: comparison of Coleochaete (Coleochaetales) and Spirogyra(Zygnematales) transcriptomes. BMC Plant Biol. 10 (1), 96 (2010).
EST ref. GenBank:   GW592709.1 [3' end]
Protein sequence: CorAPx02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   306
PWM (Da):   %s   32983.65  
PI (pH):   %s   6.52
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GFKLEAHPSH ALRGRVGRRG FAIAATSAEQ LKGAKEAISD LIKSTNSNPI LIRLGWHDAG TYDKNVSEWP KCGGANGSLF YDVVQRHAAN AGLNNAVKML ESIKATYPSV SWADLFQMAG  ATAIELAGGP QIHMKYGRVD VTSADDAVKE GNLPAAAPPT PAEHLRTVFY RMGLDDKDIV ALSGAHTLGR AYPNRSGFGK EETKYTKDGP GTKGGQSWTV EWLKFDNSYF KDVKAKRDAD 
LLVLPTDAAL FEDPGFKVYA EKYAEDQDAF FSDYAESHKK LSELGSKFDP AEGIYIDGPV LAGAKV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from 1 EST. Strain="UTEX 2651".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACTCTCGGA AGAGCCTACC CTAACCGCAG TGGTTTTGGC AAGGAGGAAA CAAAGTACAC GAAAGATGGA CCAGGTACCA AGGGTGGGCA ATCGTGGACA GTGGAGTGGC TCAAGTTTGA  CAACAGCTAC TTCAAGGATG TGAAGGCAAA GAGGGATGCA GATCTTCTTG TTCTCCCTAC AGATGCTGCC TTATTTGAGG ACCCTGGCTT CAAGGTGTAT GCTGAGAAGT ACGCGGAGGA  CCAAGATGCA TTCTTCAGCG ACTATGCGGA GTCCCACAAG AAGCTCAGTG AGCTGGGCTC CAAGTTTGAC CCTGCGGAGG GGATTTACAT TGATGGGCCC GTCTTGGCCG GTGCTAAGGT  GTAAATTTGG TCGAGACGCT GAGTTTTTTC GGTTGCATAT CAGAGGGGAA TGGGCTTTCC AGGAGACTGA AAGTGTTCAA GACTGCAGTA GAGTGAATTG GCCTTCACAG AAATGGCGAG  AGATCTCTCA TGAAAAGAGG CTGCTCTGCT TGCAGGCAGA GTCAAGAGTG CCATGTGATA ACCCCTTGCT ACCTATTGGG TATATGTGCT AACAGCTCCT GCATGACAGT AAAGGCCTGT  GAACTCTTTG AAAAGCTTGA GGGTGGATTG ATTTATGGAG AACCAGGTTT TGTGTGTAGA AAGTGTCATA ATCACTCTCA ATTGTACCCG GCGTACCATG CCTCATGTGA AGATTCTTCC  TGTGCAAACC TCTTCCATCT ATGTTTGTCA GATTTTGGGG TATGTGGAAT TTAAGGCCAG TCAAAAGAGA GTTGACCCCA AATAAAACTT ACCCTTGTTT CTAACCATAT ACAACCAAAT  GTTAGGACTG GCAATCAATT TGAAACAACT TGAGCGTAGG TGACGTGGGT TGTTAAGTGC ATGCGCTAAT GCCGTTCGGA GCAnAAnAAT GTTGTGATTG ACAACGGAGC TGGCATTCAA 
TGTGAGCTGC T 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATTTAAGC TTGAGGCGCA TCCATCCCAT GCCCTTAGAG GGAGGGTGGG CAGAAGAGGG TTTGCCATTG CTGCAACATC TGCTGAGCAG TTGAAGGGAG CCAAGGAAGC CATTTCTGAT  CTCATCAAAA GCACGAACAG CAATCCCATC CTGATTCGCC TGGGGTGGCA TGATGCAGGC ACATACGATA AGAATGTGAG TGAGTGGCCC AAATGCGGGG GAGCTAATGG AAGCCTTTTC  TACGATGTTG TGCAAAGGCA TGCAGCAAAT GCAGGTTTGA ACAATGCAGT GAAGATGTTG GAGTCTATTA AGGCTACCTA TCCGTCAGTT AGTTGGGCCG ACCTCTTCCA GATGGCAGGT  GCAACTGCCA TCGAGCTTGC TGGAGGGCCA CAAATCCATA TGAAGTATGG CCGGGTTGAT GTTACAAGTG CTGACGACGC TGTGAAGGAA GGGAACCTCC CAGCTGCTGC CCCTCCAACG  CCAGCTGAAC ATCTCAGGAC CGTTTTCTAC AGAATGGGAC TCGATGACAA GGATATTGTT GCGCTTTCTG GGGCTCACAC TCTCGGAAGA GCCTACCCTA ACCGCAGTGG TTTTGGCAAG  GAGGAAACAA AGTACACGAA AGATGGACCA GGTACCAAGG GTGGGCAATC GTGGACAGTG GAGTGGCTCA AGTTTGACAA CAGCTACTTC AAGGATGTGA AGGCAAAGAG GGATGCAGAT  CTTCTTGTTC TCCCTACAGA TGCTGCCTTA TTTGAGGACC CTGGCTTCAA GGTGTATGCT GAGAAGTACG CGGAGGACCA AGATGCATTC TTCAGCGACT ATGCGGAGTC CCACAAGAAG 
CTCAGTGAGC TGGGCTCCAA GTTTGACCCT GCGGAGGGGA TTTACATTGA TGGGCCCGTC TTGGCCGGTG CTAAGGTGTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATGGCTTCC ATTACATTGC GCATGCAGGC CGGTCTCCGT GTGTCTTGCT CGGGATTCAG TTGTTCGTCG AGCAGGAAAC AATGCTTCAG GCTGTCAGCT CAGCCATCTA AAGTTGGTCC  CACAGTTGGT TATCGGCATA CAGCCTTGGC GTGCAATTTA TTGCCAGGAT TTAAGCTTGA GGCGCATCCA TCCCATGCCC TTAGAGGGAG GGTGGGCAGA AGAGGGTTTG CCATTGCTGC  AACATCTGCT GAGCAGTTGA AGGGAGCCAA GGAAGCCATT TCTGATCTCA TCAAAAGCAC GAACAGCAAT CCCATCCTGA TTCGCCTGGG GTGGCATGAT GCAGGCACAT ACGATAAGAA  TGTGAGTGAG TGGCCCAAAT GCGGGGGAGC TAATGGAAGC CTTTTCTACG ATGTTGTGCA AAGGCATGCA GCAAATGCAG GTTTGAACAA TGCAGTGAAG ATGTTGGAGT CTATTAAGGC  TACCTATCCG TCAGTTAGTT GGGCCGACCT CTTCCAGATG GCAGGTGCAA CTGCCATCGA GCTTGCTGGA GGGCCACAAA TCCATATGAA GTATGGCCGG GTTGATGTTA CAAGTGCTGA  CGACGCTGTG AAGGAAGGGA ACCTCCCAGC TGCTGCCCCT CCAACGCCAG CTGAACATCT CAGGACCGTT TTCTACAGAA TGGGACTCGA TGACAAGGAT ATTGTTGCGC TTTCTGGGGC  TCACACTCTC GGAAGAGCCT ACCCTAACCG CAGTGGTTTT GGCAAGGAGG AAACAAAGTA CACGAAAGAT GGACCAGGTA CCAAGGGTGG GCAATCGTGG ACAGTGGAGT GGCTCAAGTT  TGACAACAGC TACTTCAAGG ATGTGAAGGC AAAGAGGGAT GCAGATCTTC TTGTTCTCCC TACAGATGCT GCCTTATTTG AGGACCCTGG CTTCAAGGTG TATGCTGAGA AGTACGCGGA  GGACCAAGAT GCATTCTTCA GCGACTATGC GGAGTCCCAC AAGAAGCTCA GTGAGCTGGG CTCCAAGTTT GACCCTGCGG AGGGGATTTA CATTGATGGG CCCGTCTTGG CCGGTGCTAA  GGTGTAAATT TGGTCGAGAC GCTGAGTTTT TTCGGTTGCA TATCAGAGGG GAATGGGCTT TCCAGGAGAC TGAAAGTGTT CAAGACTGCA GTAGAGTGAA TTGGCCTTCA CAGAAATGGC  GAGAGATCTC TCATGAAAAG AGGCTGCTCT GCTTGCAGGC AGAGTCAAGA GTGCCATGTG ATAACCCCTT GCTACCTATT GGGTATATGT GCTAACAGCT CCTGCATGAC AGTAAAGGCC  TGTGAACTCT TTGAAAAGCT TGAGGGTGGA TTGATTTATG GAGAACCAGG TTTTGTGTGT AGAAAGTGTC ATAATCACTC TCAATTGTAC CCGGCGTACC ATGCCTCATG TGAAGATTCT 
TCCTGTGCAA ACCTCTTCCA TCTATGTTTG TCAGATTTTG GGGTATGTGG AATTTAAGGC CAGTCAAAAG AGAGTTGAAC CCCAAAT 

Retrieve as FASTA