Entry information : NhyAPx02
Entry ID 7740
Creation 2010-11-04 (Qiang Li)
Last sequence changes 2010-12-23 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2012-06-12 (Qiang Li)
Peroxidase information: NhyAPx02
Name NhyAPx02
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Charophyceae Characeae Nitella
Organism Nitella hyalina    [TaxId: 181804 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NhyAPx02
start..stop
S start..stop
NhyAPx05 867 0 1..461 1..462
CbraAPx01 549 0 1..460 1..433
RobtAPx04 515 0 122..459 5..335
SsAPx04_AU1 504 2e-178 97..460 59..418
Literature and cross-references NhyAPx02
Literature Timme,R.E., Bachvaroff,T.R. and Delwiche,C.F. Broad phylogenomic sampling and the sister lineage of land plants. PLoS ONE 7 (1), e29696 (2012).
EST ref. GenBank:   HO486536.1   HO562740.1   HO543483.1 [5' end]
Protein sequence: NhyAPx02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   461
PWM (Da):   %s   49473.5 Transmb domain:   %s   o443-460i
PI (pH):   %s   7.12
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTAIAAQGLT LRGEALGALS SSVGDGRECC PKTTSVVYGL GNADILKARA VTAVTPVTAI TAVAALSSRK LSSEFLPLLS VPQQQQQLKA TRRRTFKKVR ASQGDAATTT TTNATSTELS  LVEQLRGARE GIKEIIQSKH CNPILVRLGW HDSGTYNKEV EGWPKAAGAT GSIRFKPEID HGANAGLINA LELVKPIKEK YPAVSYADLF QLASATAIEV AGGPKIPMRY GRVDASSPED  CALDGNLPDA APPSPADHLR KVFYRMGLTD KDIVALSGAH TIGRARLGRS GFGKESTKYT EKGPGNPGGQ SWTPEWLVFD NSYFKEVKTK RDEDLLVLPT DAALFEDEGF KVYAEKYAAD 
QEAFFKDYAE SHAKLSELGS KFDPPEGITI DEATPAADAG VEKFVAAKYS TTAAELSPEM REKMRREYVS WGGTPNEPAA NNFLYAIIIV GVLALVTRLF T 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from ESTs (nhya_Contig3673 (in cDNA window) is very close to nhya_lrc2749_c(in DNA window) with a few mismatchs and close to nhya_lrc1663_c and nhya_lrc55453_c (not displayed) with short contaminations).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAAATCCCC AGCCAGCCCA CGGGTGACGG ACACTTGGCT AAAGTGCTGC TCTTTACATT CTCTAGGGCG TTGAGAGGGT GCCAGTTCAG GCCGGGCCAT TTTTCCGTCC GTGTTCTCTG  TCTCACCGTC ACCATGACTG CCATCGCCGC GCAAGGGCTC ACGCTACGCG GGGGGGCACT TGGGGCTCTT TCTTCTAGCG TTGGCGATGG CCGCGAGTGC TGTCCAAAGA CGACCAGCGT  GGTGTATGGC CTGGGAAATG CCGACATTCT GAAAGCGAGA GCTGTCACAG CTGTCACACC TGTCACAGCT GTCACAGCTG TTGCAGCTTT GCCAAGTCGA AAGCTTTCGT CGGAGTTCTT  GCCTCTTCTC AGTGCTCCGC AGCAGCAGCA GCAGCAGCTC AAAGCAACCG GGAGGAGAAC GTTTAAGAAA GCGAGAGCGA TTCAAGGAGA CGCTGCCACC ACCACCACCA CGAATGCAGC  GTCCACAGAG TTATCTCTTG TGGAGCAGCT AAGAGGAGCT AGAGAGGGAA TCAAAGAGAT TATTCAGAGC AAGCACTGCA ACCCAATTCT AGTGCGACTT GGGTGGCATG ACTCTGGGAC  TTACAATAAG GAGGTTGAAG GCTGGCCCAA AGCTGCGGGT GCCACAGGAA GCATAAGGTT CAAGCCGGAG ATTGACCATG GTGCAAATGC AGGGCTCATA AATGCACTCA AGCTCGTCGA  GCCAATCAAG GAAAAGTATC CAGCTGTCAG CTATGCTGAC CTGTTTCAGC TTGCAAGTGC AACTGCAATT GAGGTTGCTG GTGGGCCCAA GATTCCCATG AGGTATGGCC GTGTCGATGC  CAGCTCTCCT GAGGACTGCG CTCCCGATGG AAATCTCCCA GATGCTGCAC CCCCATCTCC AGCAGACCAC CTTCGCAAAG TCTTCTATCG CATGGGTTTG ACAGATAAGG ATATTGTTGC  ACTTTCCGGT GCCCACACAA TAGGACGTGC TCGCCCGGAC CGGAGTGGCT TCGGAAAGGA GTCAACGAAA TACACAGAAA AAGGGCCTGG CAATCCTGGT GGGCAATCTT GGACCCCAGA  GTGGCTGGTA TTTGACAACA GCTATTTCAA GGAGGTTAAG GCAAAGCGGG ATGAGGACCT ACTCGTCTTG CCGACAGATG CTGCTTTGTT TGAAGATGAA GGCTTCAAGG TATATGCGGA  AAAGTATGCC GCAGATCAAG AAGCGTTTTT CAAGGATTAC GCAGAATCAC ATGCGAAGCT GAGTGAGCTT GGTTCCAAGT TTGACCCGGC AGAGGGCATC ACGATCGATG AGGTCACGCC  TGCAGCAGAT GCGGGCGTTG AGAAATTTGT TGCGGCAAAG TATTCCACCA CTGCAGCAGA AGAGACACCA AAGAAGGTTT AAATTATTTT TTGAGAAAGT TTTTTATTTA CCTTAATCAG  CTGCAAGATT TTGAGGATGG ATTATCCCCT GAGATGAGAG AGAAGATGCG GAGAGAGTAC GTCTCATGGG GTGGAACGCC AAACGAGCCA GCTGCAAATA ATTTTCTTTA TGCTATCATC  ATCGTCGGGG TCCTTGCTCT TGTCACCAGG CTCTTCACTT AATTGTTTAG ATTTTGTAAA TGGCGAAACC TCTCAAACTG CAAATCTCCA CAAAAGAACG AGACAACTTT CTAACTGGTG  AAGTGTCATC ATACTCATCA CTGTGAAGCG GAGTACGGTT TGATTTTTGT GAATTAATTT CAATTAAATT ATAAAAAAAG CCTCTGTATA CAAAAAGGCG TCGCAAGTTG CAGCCAGCGC  CATAGCAATG GTTTCCCTCA GGCTTCAGAA GCGGCTTGCC GCGAGCGTGC TGAAGTGTGG AAGGAAGAAG ATATGGCTGG ACCCTAACGA AGTCAACGAG ATCTCCATGG CCAATTCAAG  GCAAAACATC AGGAAGCTAG TAAAGGATGG TTTTGTTATC CGGAAGCCGC AGAAGATCCA CTCACGAGAT CGTGCACGAC GGGCCCTAGA AGCGAAGAGG AAGGGTCGGC ACACAGGATA  CGGTAAGCGT CATGGTACCC GGGAAGCTAG ACTTCCGACA AAGGTATTGT GGATGCGGAG AATGAGGGTA CTACGCAGAC TTCTTCGAAA GTATCGCGAT GCAAAGAAGA TTGATAAACA 
TATGTATCAC GACATGTATA TGAAGGTGAA GGGTAACGTT TTTAAAAACA AACGTGTACT GATGGAGAGT ATCCATAAGT CGAAGGCGGA GAAGGCCCGT GAGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTGCCA TCGCCGCGCA AGGGCTCACG CTACGCGGAG AGGCACTTGG GGCTCTTTCT TCTAGCGTTG GCGATGGCCG TGAGTGCTGT CCAAAGACGA CCAGCGTGGT ATATGGCCTG  GGAAATGCTG ACATTCTGAA GGCGAGAGCT GTCACAGCTG TCACACCTGT CACAGCTATC ACAGCTGTTG CAGCTTTGTC AAGTCGGAAG CTTTCGTCGG AGTTCTTGCC TCTTCTCAGT  GTTCCGCAGC AGCAGCAGCA GCTCAAAGCA ACAAGGAGGA GAACGTTTAA AAAAGTGAGA GCGAGTCAAG GAGACGCTGC CACGACCACC ACCACGAATG CAACCTCCAC AGAGTTATCT  CTTGTGGAGC AGCTAAGAGG AGCTAGAGAG GGAATCAAAG AGATTATTCA GAGCAAGCAC TGCAACCCAA TTCTAGTGCG CCTTGGGTGG CATGATTCTG GGACTTACAA TAAGGAGGTT  GAAGGTTGGC CCAAAGCTGC GGGTGCCACA GGAAGCATAA GGTTCAAGCC GGAGATTGAC CATGGTGCAA ATGCAGGGCT CATCAATGCA CTCGAGCTCG TCAAGCCAAT CAAAGAAAAA  TATCCAGCTG TCAGCTATGC TGACCTGTTT CAGCTTGCAA GTGCAACTGC AATTGAGGTT GCTGGTGGGC CCAAGATTCC CATGAGGTAT GGCCGTGTCG ATGCCAGCTC TCCTGAGGAC  TGCGCTCTCG ATGGAAATCT CCCAGATGCT GCACCCCCAT CTCCAGCAGA CCACCTTCGC AAAGTCTTCT ATCGCATGGG TTTGACAGAT AAGGATATTG TTGCACTTTC CGGTGCCCAC  ACAATAGGAC GTGCTCGCCT GGGCCGGAGT GGATTCGGAA AGGAGTCAAC GAAATACACA GAAAAAGGCC CTGGCAATCC TGGTGGGCAA TCTTGGACCC CAGAGTGGCT GGTATTTGAC  AACAGCTATT TCAAGGAGGT TAAGACAAAG CGGGATGAGG ACCTACTCGT CTTGCCGACA GATGCCGCTT TGTTTGAAGA TGAAGGCTTC AAGGTGTATG CGGAAAAGTA TGCCGCAGAT  CAAGAAGCGT TTTTCAAGGA TTACGCAGAA TCACATGCGA AGCTGAGTGA GCTCGGTTCC AAGTTTGACC CGCCAGAGGG CATCACAATC GATGAGGCCA CGCCTGCAGC AGATGCGGGC  GTTGAGAAAT TTGTTGCGGC AAAGTATTCG ACCACTGCAG CAGAATTATC CCCTGAGATG AGAGAGAAGA TGAGGAGAGA GTACGTCTCA TGGGGTGGAA CGCCAAACGA GCCAGCTGCA 
AATAATTTTC TTTATGCTAT CATCATTGTC GGGGTCCTTG CTCTTGTCAC CAGGCTCTTC ACTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCCTTGTTC TTCTGTCTCA ACGTCACCAT GACTGCCATC GCCGCGCAAG GGCTCACGCT ACGCGGAGAG GCACTTGGGG CTCTTTCTTC TAGCGTTGGC GATGGCCGTG AGTGCTGTCC  AAAGACGACC AGCGTGGTAT ATGGCCTGGG AAATGCTGAC ATTCTGAAGG CGAGAGCTGT CACAGCTGTC ACACCTGTCA CAGCTATCAC AGCTGTTGCA GCTTTGTCAA GTCGGAAGCT  TTCGTCGGAG TTCTTGCCTC TTCTCAGTGT TCCGCAGCAG CAGCAGCAGC TCAAAGCAAC AAGGAGGAGA ACGTTTAAAA AAGTGAGAGC GAGTCAAGGA GACGCTGCCA CGACCACCAC  CACGAATGCA ACCTCCACAG AGTTATCTCT TGTGGAGCAG CTAAGAGGAG CTAGAGAGGG AATCAAAGAG ATTATTCAGA GCAAGCACTG CAACCCAATT CTAGTGCGCC TTGGGTGGCA  TGATTCTGGG ACTTACAATA AGGAGGTTGA AGGTTGGCCC AAAGCTGCGG GTGCCACAGG AAGCATAAGG TTCAAGCCGG AGATTGACCA TGGTGCAAAT GCAGGGCTCA TCAATGCACT  CGAGCTCGTC AAGCCAATCA AAGAAAAATA TCCAGCTGTC AGCTATGCTG ACCTGTTTCA GCTTGCAAGT GCAACTGCAA TTGAGGTTGC TGGTGGGCCC AAGATTCCCA TGAGGTATGG  CCGTGTCGAT GCCAGCTCTC CTGAGGACTG CGCTCTCGAT GGAAATCTCC CAGATGCTGC ACCCCCATCT CCAGCAGACC ACCTTCGCAA AGTCTTCTAT CGCATGGGTT TGACAGATAA  GGATATTGTT GCACTTTCCG GTGCCCACAC AATAGGACGT GCTCGCCTGG GCCGGAGTGG ATTCGGAAAG GAGTCAACGA AATACACAGA AAAAGGCCCT GGCAATCCTG GTGGGCAATC  TTGGACCCCA GAGTGGCTGG TATTTGACAA CAGCTATTTC AAGGAGGTTA AGACAAAGCG GGATGAGGAC CTACTCGTCT TGCCGACAGA TGCCGCTTTG TTTGAAGATG AAGGCTTCAA  GGTGTATGCG GAAAAGTATG CCGCAGATCA AGAAGCGTTT TTCAAGGATT ACGCAGAATC ACATGCGAAG CTGAGTGAGC TCGGTTCCAA GTTTGACCCG CCAGAGGGCA TCACAATCGA  TGAGGCCACG CCTGCAGCAG ATGCGGGCGT TGAGAAATTT GTTGCGGCAA AGTATTCGAC CACTGCAGCA GAATTATCCC CTGAGATGAG AGAGAAGATG AGGAGAGAGT ACGTCTCATG  GGGTGGAACG CCAAACGAGC CAGCTGCAAA TAATTTTCTT TATGCTATCA TCATTGTCGG GGTCCTTGCT CTTGTCACCA GGCTCTTCAC TTAATTGTTT AGATTTTGTA AATGGCAAAA 
CCTCTCAAAC TGCAAATCTC CACAAAAGAA CGAGACAACT TTCTAACTGG TGAAGTGTCA TCATACTCAT CACTGTGAAG CGGAGTACGG TTTGATnTTT 

Retrieve as FASTA