Entry information : NhyPrx03
Entry ID 7742
Creation 2010-11-04 (Qiang Li)
Last sequence changes 2010-12-23 (Qiang Li)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-14 (Qiang Li)
Peroxidase information: NhyPrx03
Name NhyPrx03
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx045]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Charophyceae Characeae Nitella
Organism Nitella hyalina    [TaxId: 181804 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NhyPrx03
start..stop
S start..stop
NhyPrx07 513 0 38..312 1..274
NhyPrx05 264 3e-88 15..277 1..270
CbraPrx14 249 9e-80 1..307 136..488
CbraPrx13 229 5e-74 11..304 18..313
Literature and cross-references NhyPrx03
Literature Timme,R.E., Bachvaroff,T.R. and Delwiche,C.F. Broad phylogenomic sampling and the sister lineage of land plants. PLoS ONE 7 (1), e29696 (2012).
EST ref. GenBank:   HO502432.1
Protein sequence: NhyPrx03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   312
PWM (Da):   %s   34621.69  
PI (pH):   %s   8.48
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
KRPExGELDR SLYxPEDEKC LLEAIKxSSF AVFRKDQRMA ATLLRLAFHD CLTPGGGCDA SILTTNELFH PLNDDLVRTQ TVIVWIREHA AKQCGVIPTM ADTIQRAGAA ACVFSGTEDP  VKFGLGLGRW DRGSKLNAGT IQPGLPSPFE QFHVAVNKLR RFNLTYEEVT VFTLGGHSVG RAGCPNFTDR LNNRTCTRPV DPTLSPKRAC HLVDICTTHP EAHEEFDFVT PFKLDNWYFK 
ILLRSKGLLH IDQQFALVPK TAKYVKEYAS MANEKFQNHF LKIYVKVGLV NVNSPTSAPP MQYYYHKDAK IV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from EST (HO502432.1). Short PS and 5'end is missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCGAATGGC CGCCACTCTC CTTAGGCTAG CATTTCACGA CTGCCTTACA CCAGGTGGTG GGTGTGACGC ATCGATCCTG ACAACCAATG AGTTGAATCA CCCCCTCAAT GATGATCTGG  TACCTACAAA GACGGTGATC GTGTCGATCC GCGAGCATGC AGCTAAGCAG TGTGGCGTGA TTCCTACCAT GGCCGACACA ATCCAAAGAG CAGGAGCTGC TGCGTGCGTT TTCTCCGGCA  CGGAAGATCC TGTCAAATTT GGATTTGGTG TAGGCCGCTG GGATCGGGTT CAAAACTCAC TCGGGGACGA TCCAACCGGA TTACCTAGCC CTTCTGAACA AATTCACGTG GTGGTCAATA  AGTTGAGGAG GTTCAATCTG ACCTACGAAG AAGTGACAGT GTTTACTCTT GGTGGCCATA GTGTGGGTCG AGCTGGATGC CCCAACTTCA CCGATAGGCT GAACAATAGG ACATGCACGC  GGCCCGTTGA CCCGACACTC TCGCCCAAAC GAGCTTGCCA TCTGGTGGAC ATATGTACTA CACATCCCGA AGCACGCGAA GAATTTGACC TCGTGACGCC GTTCAAGTTG GATAATTGGT  ACTTCAAGAT TCTTTTGCGG AGAAAAGGGT TGCTGCATAT CGACCAGCAG TTTGCCCTTG TGCCCAAGAC AGCGAAATAT GTGAAAGAGT ACGCATCCAT GCCAAACGAG AAATTTCAAA  ACAAGTTCCT CAATATTTAC ATGAAGGTGG GGCTTGTAAA CGTCAATAGC CCGACAAGCG CTCCGCCCAT GCAGTACTAC TACCATAAGG ATGCGAAAAT CGTTTAATTA AATCAAGTCC  AGGGGCAGTT GCTTGGTTCC TGTGGTCGTG CCCCTTAATG GAAAATAATT GGCTGCTTGG ATCCACCCTT TCTACATATT ACAAAATGGT CCTCGATTCC GGTGGGGAAT AATGTCTTCT  CAGGATCATT GTGAGGGTCA CTTAGGGAAA CTGAAGGTCA CCATAATTTT CTCAGCTCAG AACCTCCTGG GTTTCATTTC CCTGGGGTAT GAGATAGAGC TGGAACCAGG GCTAGGGTCG  CCGACTAACC GGCGGGCTTT GCTGGTGGAT TGTCCGTCCC GGTTACCCGG TGGCTTGAAG AGAGATGACA GGCGCCTGTC ATCTTTCTAA AAAAGAAATT CCGTAGGTGC TGGGGTTTAC  CCGGTCGCTC GGGTCCAGGG TTCGCCCGCC TCACTCGTGG AGAATATGCG CGAACGGGCA ACTTTAGAAC CATTTCTCCC AGTCTGGTTA TTCTTGGGCT CCAGAATTTT GTTGCAGACG  ATGAGAGCAG CAATGACAGC CGTTGAATGA TTTTTGTTGG TTCCTCAGAG AAATCACTGT TGAGCAAAGT TCTGGTCGGG ATTGTGGATG TATGTTCTGT TAATGCTCGC CAGATTTATA  GTGCGACCAC AATTAATCCA TTTTCAACCG TTTCCAAACG GTCACATTTT TAGTTTTGTT TTGATACGTG GCAATATGCC ACGGTCGGAC TGCAAAnAnn nnATGGTCTG GTCTGGTCTG  nTCTGGTCTG TTTTCTGGTn TGGTCTGGTC AGATCTGACA TATCTGCTGG GATCTTAGAC GACAAGAACC AGCTTGAACT GTTCTTTTAT CTGATCTTTT CTGGATCTGC TCTTGTGTTA 
TTTGGTCTGG TCT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGCGTCCTG AGAnGGGTGA GCTnGACCGA TCACTGTATn ATCCCGAGGA TGAAAAGTGC CTTCTAGAAG CCATCAAGnA GAGTTCGTTT GCTGTGTTTC GAAAGGACCA GCGAATGGCC  GCAACTCTCC TTAGGCTAGC ATTTCACGAC TGCCTTACAC CGGGTGGTGG GTGTGACGCA TCGATCCTGA CAACCAATGA GCTGTTTCAC CCGCTCAATG ATGATCTGGT ACGGACACAG  ACGGTGATCG TGTGGATCCG GGAGCATGCA GCTAAGCAGT GTGGCGTGAT TCCTACCATG GCCGACACAA TCCAAAGAGC AGGAGCTGCC GCGTGCGTTT TCTCCGGCAC GGAAGATCCG  GTCAAGTTTG GACTTGGACT GGGCCGCTGG GATCGGGGTT CTAAACTCAA CGCGGGGACG ATCCAACCGG GATTACCTAG CCCTTTTGAA CAATTCCACG TGGCGGTCAA TAAGTTGAGG  AGGTTCAATC TGACCTACGA AGAGGTGACA GTGTTTACTC TTGGTGGCCA TAGTGTGGGT CGAGCTGGAT GCCCCAACTT CACCGATAGG CTGAACAATA GGACATGCAC GCGGCCCGTA  GACCCGACAC TCTCGCCCAA ACGAGCTTGC CATCTGGTGG ACATATGTAC TACGCATCCG GAAGCACACG AAGAATTTGA CTTCGTGACG CCGTTCAAGT TGGATAATTG GTACTTCAAG  ATTCTTTTGC GGAGTAAGGG GTTGCTGCAT ATCGACCAGC AGTTTGCCCT TGTGCCCAAG ACAGCGAAAT ATGTGAAAGA GTACGCATCC ATGGCAAACG AGAAATTTCA AAACCACTTC 
CTCAAGATTT ACGTGAAGGT GGGGCTTGTA AACGTCAATA GCCCGACAAG CGCTCCGCCC ATGCAGTACT ACTATCATAA GGATGCGAAA ATCGTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGGACAATC GGCCGCTCGC GACAGACCCC GGCTATGGTA GGCTGGTAGC TATATCAAGG AAGAACACTG CTTCCAACTT TCCTCCCACT TTTCGCTTCA AATTCTATCT ATAGATGATC  GTGGTCAGTG TCCACGTGGT GTGCATCCCT TGCCTCAAAG TTTGATCGTG CGACGTGTGC ACAAGGAAGT CGATCATTTG CGATCATATC GAATTGAGAG AACACGCGGC GATGGCTTCC  TTGTCATTGA TTACCTGGTT GAGAGGTTGC ATACTACTTT TCCTTGCTCT TGTTCTAAGC TTGTCGAATA ACAAGTCATG CGTCGAGGGC TCACCGTCGG ATGGACTTAC TGCAAAGCCC  GTTATCAAGC GTCGCCATCC CCCCTTATGG nAAGCGTCCT GAGAnGGGTG AGCTnGACCG ATCACTGTAT nATCCCGAGG ATGAAAAGTG CCTTCTAGAA GCCATCAAGn AGAGTTCGTT  TGCTGTGTTT CGAAAGGACC AGCGAATGGC CGCAACTCTC CTTAGGCTAG CATTTCACGA CTGCCTTACA CCGGGTGGTG GGTGTGACGC ATCGATCCTG ACAACCAATG AGCTGTTTCA  CCCGCTCAAT GATGATCTGG TACGGACACA GACGGTGATC GTGTGGATCC GGGAGCATGC AGCTAAGCAG TGTGGCGTGA TTCCTACCAT GGCCGACACA ATCCAAAGAG CAGGAGCTGC  CGCGTGCGTT TTCTCCGGCA CGGAAGATCC GGTCAAGTTT GGACTTGGAC TGGGCCGCTG GGATCGGGGT TCTAAACTCA ACGCGGGGAC GATCCAACCG GGATTACCTA GCCCTTTTGA  ACAATTCCAC GTGGCGGTCA ATAAGTTGAG GAGGTTCAAT CTGACCTACG AAGAGGTGAC AGTGTTTACT CTTGGTGGCC ATAGTGTGGG TCGAGCTGGA TGCCCCAACT TCACCGATAG  GCTGAACAAT AGGACATGCA CGCGGCCCGT AGACCCGACA CTCTCGCCCA AACGAGCTTG CCATCTGGTG GACATATGTA CTACGCATCC GGAAGCACAC GAAGAATTTG ACTTCGTGAC  GCCGTTCAAG TTGGATAATT GGTACTTCAA GATTCTTTTG CGGAGTAAGG GGTTGCTGCA TATCGACCAG CAGTTTGCCC TTGTGCCCAA GACAGCGAAA TATGTGAAAG AGTACGCATC  CATGGCAAAC GAGAAATTTC AAAACCACTT CCTCAAGATT TACGTGAAGG TGGGGCTTGT AAACGTCAAT AGCCCGACAA GCGCTCCGCC CATGCAGTAC TACTATCATA AGGATGCGAA  AATCGTTTAA TTAAATCAAG TCCAGGGGCA GTTGCTTGGT TCCTGTGGTC GTGCCCCTTA ATGGAAAATA ATTGGCTGCT TGGATCCACC CTTTCTACAT ATTACAAAAT GGTCCTCGAT  TCCGGTGGGG AATAATGTCT TCTCAGGATC ATTGTGAGGG TCACTTAGGG AAACTGAAGG TCACCATAAT TTTCTCAGCT CAGAACCTCC TGGGTTTCAT TTCCCTGGGG TATGAGATAG  AGCTGGAACC AGGGCTAGGG TCGCCGACTA ACCGGCGGGC TTTGCTGGTG GATTGTCCGT CCCGGTTACC CGGTGGCTTG AAGAGAGATG ACAGGCGCCT GTCATCTTTC TAAAAAAGAA  ATTCCGTAGG TGCTGGGGTT TACCCGGTCG CTCGGGTCCA GGGTTCGCCC GCCTCACTCG TGGAGAATAT GCGCGAACGG GCAACTTTAG AACCATTTCT CCCAGTCTGG TTATTCTTGG  GCTCCAGAAT TTTGTTGCAG ACGATGAGAG CAGCAATGAC AGCCGTTGAA TGATTTTTGT TGGTTCCTCA GAGAAATCAC TGTTGAGCAA AGTTCTGGTC GGGATTGTGG ATGTATGTTC  TGTTAATGCT CGCCAGATTT ATAGTGCGAC CACAATTAAT CCATTTTCAA CCGTTTCCAA ACGGTCACAT TTTTAGTTTT GTTTTGATAC GTGGCAATAT GCCACGGTCG GACTGCAAAn  AnnnnATGGT CTGGTCTGGT CTGnTCTGGT CTGTTTTCTG GTnTGGTCTG GTCAGATCTG ACATATCTGC TGGGATCTTA GACGACAAGA ACCAGCTTGA ACTGTTCTTT TATCTGATCT 
TTTCTGGATC TGCTCTTGTG TTATTTGGTC TGGTCT 

Retrieve as FASTA