Entry information : XtPOX02
Entry ID 7958
Creation 2011-02-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-02-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-02-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: XtPOX02
Name XtPOX02
Class Non mammalian vertebrate peroxidase    [Orthogroup: POX001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Amphibia Pipidae Xenopus
Organism Xenopus tropicalis    [TaxId: 8364 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Adipose tissue
Bone
Head
Liver
Lung
Spleen
Testis
Thymus
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value XtPOX02
start..stop
S start..stop
XlPOX02 1382 0 1..725 1..725
XlPOX01 1012 0 1..712 1..711
MmMPO 810 0 30..712 30..716
RnoMPO 809 0 30..712 30..716
Literature and cross-references XtPOX02
DNA ref. GenBank:   AAMC01042816.1 (1186..1) [5' end]   AAMC01042815.1 (33200..19129) [3' end]
EST ref. Galderia Genome:   CF525227.1 [Fragment] GenBank:   CX937840.1 [5' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   11704.Str [5' end]   68822.Str [3' end]
Protein sequence: XtPOX02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   725 (703)
PWM (Da):   %s   81930.13 (79584.8)  
PI (pH):   %s   9.07 (9.08) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-725
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPLYISFGF LLILGSVHVS LSSFYDGVEE LDNDIILNSV QEAKKLVDTA YKRTRDVLKA RLKQKNVRPS DVMAFFKQPV ATSRTHIRAA DYMGTTLELL SEKIQSVYRR PFNITDVLTA  NQLDTIYKVS GCAFLHLSRP CPNSRYRTFT GECNNRRFPN FGVSNRPYTR LLPAQYEDSR SLPRGWTENQ RINGFMLPLA RAVSNQILQF PEREQTLDNQ RSLMFMQWGQ WIDHDVDLAP  ETPARSSFLK GIDCDHSCAK ELPCFPLRIP PNDPRIQNRS DCIPLFRSSP ACVPGPVLEQ INVLTSYVDA SQVYGSTNDL ARMLRNNTAG QLGLMAVNTR FTDGGLPYLP FSTMKEDFCV  LTNETSGLPC FLAGDARVSE QPGLTAFHTI FVREHNRIAR ELRRINPNWT GEIIFQEARK IVGAVEQKIN YKDYLPLLLG SSMPRVLPRY TTYNDSVNPG ASNVFSLVFR MGHTMIQPFI  FRLVDGYRAS SSLPPVPLHL TFFNTWRVIL EGGVDPLLRG LIANKAKLNT QTQILVTQLT DHLFELFKRL GLDLGAINMQ RGRDHGLPGY NAFRRLCGLS QPRNESELAA VLRNNQLAQK  LISLYGTPDN IDIWMGAVAE PLITNGRVGE LLACLIGDQF RRTRDGDRFY YERASVFTPA QLRSIERASL ARIVCDNTRI TEVPRDVFKA NNYPANFVRC SSIPALDLSP WRRRRGGEEL 
EDPPM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 15+ 42 ESTs. complement(join(33278..33200 ,32143..32050,31323..31148,30303..30183,28607..28478,27494..27288,26785..26470,26283..26123,25229..24977,23251..23081,22379..22142,20442..20231,19149..19127))
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCTC TGTACATCAG TTTTGGGTTC CTACTGATTC TTGGATCGGT GCATGTCAGT TTATCTTCCT TCTACGATGG CGTGGAAGAG CTGGACAATG ATATAATTCT CAACTCGGTT  CAGGAGGCAA AAAAGCTGGT GGATACTGCT TATAAACGCA CCCGGGATGT CCTCAAGGCA CGCCTAAAAC AAAAAAATGT GCGTCCCTCT GATGTCATGG CGTTCTTTAA GCAACCGGTA  GCCACCAGCA GAACCCACAT CCGAGCTGCT GATTATATGG GCACCACACT TGAACTCCTT TCAGAGAAGA TTCAGAGTGT TTATAGGAGA CCATTCAACA TAACAGATGT ACTGACTGCC  AACCAGCTTG ACACAATATA TAAGGTTTCT GGATGTGCGT TCTTACATTT GTCAAGGCCT TGTCCCAATA GCCGATATCG CACCTTCACA GGGGAGTGTA ACAACAGGAG GTTTCCCAAC  TTTGGCGTCT CCAACAGGCC CTACACACGC CTGCTTCCAG CACAGTATGA GGACAGCAGA TCCCTTCCCC GCGGGTGGAC AGAGAATCAA AGGATCAATG GATTTATGTT GCCTCTAGCA  CGGGCTGTAT CCAACCAGAT TTTGCAATTT CCTGAAAGGG AACAGACCCT GGACAACCAA CGCTCCCTCA TGTTTATGCA GTGGGGTCAG TGGATTGATC ATGATGTTGA CTTGGCACCT  GAAACACCTG CAAGGTCAAG CTTCTTGAAG GGAATAGACT GTGACCACAG TTGTGCAAAG GAGCTGCCCT GCTTTCCTTT ACGGATTCCA CCAAATGATC CACGGATCCA AAATCGAAGT  GACTGTATCC CACTCTTCCG CTCTTCTCCA GCTTGTGTGC CAGGACCTGT GCTAGAACAA ATCAATGTTC TCACCTCTTA TGTTGATGCC AGCCAGGTGT ATGGAAGCAC CAATGACTTA  GCCAGAATGC TTCGTAACAA CACTGCCGGG CAGCTGGGCC TAATGGCTGT TAATACCAGG TTTACTGATG GCGGCCTTCC CTACCTGCCC TTTAGCACAA TGAAAGAAGA CTTCTGTGTT  TTGACAAATG AGACATCAGG TTTACCCTGC TTTTTGGCTG GGGACGCCCG TGTCAGTGAG CAGCCTGGCC TGACTGCATT CCATACCATT TTTGTGAGAG AACACAATCG CATAGCCAGA  GAGTTACGCA GAATAAACCC CAACTGGACA GGGGAGATCA TATTCCAGGA AGCGCGGAAA ATTGTTGGGG CAGTTGAGCA GAAAATAAAT TACAAGGATT ATTTACCGCT GCTACTTGGT  TCTTCAATGC CTCGAGTGCT TCCACGCTAC ACTACTTACA ATGACTCAGT GAACCCTGGA GCTTCCAATG TTTTCAGCCT GGTCTTTCGC ATGGGCCACA CAATGATCCA GCCCTTTATC  TTCAGGCTGG TAGATGGTTA CAGAGCCTCG TCGTCCCTTC CTCCAGTCCC TCTGCACCTT ACCTTCTTCA ATACATGGCG AGTCATTCTC GAAGGTGGTG TTGACCCTCT CCTTCGTGGG  CTTATCGCCA ATAAAGCAAA GCTGAATACA CAAACCCAGA TTTTGGTGAC TCAGTTAACG GATCATCTTT TTGAGCTGTT CAAGCGTCTC GGTCTTGATC TTGGCGCAAT CAACATGCAG  CGCGGGCGCG ATCATGGACT GCCAGGATAC AATGCATTTA GAAGATTATG TGGGCTTTCT CAGCCACGCA ATGAATCTGA ACTGGCTGCT GTGCTGAGAA ACAATCAACT GGCCCAGAAA  CTGATATCCC TTTATGGGAC ACCTGATAAT ATTGACATCT GGATGGGGGC TGTTGCTGAG CCATTGATTA CCAATGGCAG AGTGGGAGAA CTGCTGGCTT GTTTGATTGG GGACCAGTTC  CGTAGGACCC GTGATGGAGA CAGATTCTAT TATGAAAGGG CCTCTGTATT CACACCAGCT CAGCTGAGAT CAATAGAAAG AGCTTCCCTT GCACGTATTG TCTGTGACAA CACAAGGATC  ACGGAGGTCC CCCGAGATGT ATTCAAGGCT AACAACTATC CAGCCAATTT TGTGCGCTGC TCATCGATTC CAGCTCTGGA TTTGTCCCCA TGGAGGAGAA GGAGAGGCGG AGAAGAACTG 
GAAGACCCTC CCATGTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCTC TGTACATCAG TTTTGGGTTC CTACTGATTC TTGGATCGGT GCATGTCAGT TTATCTTCCT TCTACGATGG CGTGGAAGAG CTGGACAATG ATATAATTCT CAACTCGGTT  CAGGAGGCAA AAAAGCTGGT GGATACTGCT TATAAACGCA CCCGGGATGT CCTCAAGGCA CGCCTAAAAC AAAAAAATGT GCGTCCCTCT GATGTCATGG CGTTCTTTAA GCAACCGGTA  GCCACCAGCA GAACCCACAT CCGAGCTGCT GATTATATGG GCACCACACT TGAACTCCTT TCAGAGAAGA TTCAGAGTGT TTATAGGAGA CCATTCAACA TAACAGATGT ACTGACTGCC  AACCAGCTTG ACACAATATA TAAGGTTTCT GGATGTGCGT TCTTACATTT GTCAAGGCCT TGTCCCAATA GCCGATATCG CACCTTCACA GGGGAGTGTA ACAACAGGAG GTTTCCCAAC  TTTGGCGTCT CCAACAGGCC CTACACACGC CTGCTTCCAG CACAGTATGA GGACAGCAGA TCCCTTCCCC GCGGGTGGAC AGAGAATCAA AGGATCAATG GATTTATGTT GCCTCTAGCA  CGGGCTGTAT CCAACCAGAT TTTGCAATTT CCTGAAAGGG AACAGACCCT GGACAACCAA CGCTCCCTCA TGTTTATGCA GTGGGGTCAG TGGATTGATC ATGATGTTGA CTTGGCACCT  GAAACACCTG CAAGGTCAAG CTTCTTGAAG GGAATAGACT GTGACCACAG TTGTGCAAAG GAGCTGCCCT GCTTTCCTTT ACGGATTCCA CCAAATGATC CACGGATCCA AAATCGAAGT  GACTGTATCC CACTCTTCCG CTCTTCTCCA GCTTGTGTGC CAGGACCTGT GCTAGAACAA ATCAATGTTC TCACCTCTTA TGTTGATGCC AGCCAGGTGT ATGGAAGCAC CAATGACTTA  GCCAGAATGC TTCGTAACAA CACTGCCGGG CAGCTGGGCC TAATGGCTGT TAATACCAGG TTTACTGATG GCGGCCTTCC CTACCTGCCC TTTAGCACAA TGAAAGAAGA CTTCTGTGTT  TTGACAAATG AGACATCAGG TTTACCCTGC TTTTTGGCTG GGGACGCCCG TGTCAGTGAG CAGCCTGGCC TGACTGCATT CCATACCATT TTTGTGAGAG AACACAATCG CATAGCCAGA  GAGTTACGCA GAATAAACCC CAACTGGACA GGGGAGATCA TATTCCAGGA AGCGCGGAAA ATTGTTGGGG CAGTTGAGCA GAAAATAAAT TACAAGGATT ATTTACCGCT GCTACTTGGT  TCTTCAATGC CTCGAGTGCT TCCACGCTAC ACTACTTACA ATGACTCAGT GAACCCTGGA GCTTCCAATG TTTTCAGCCT GGTCTTTCGC ATGGGCCACA CAATGATCCA GCCCTTTATC  TTCAGGCTGG TAGATGGTTA CAGAGCCTCG TCGTCCCTTC CTCCAGTCCC TCTGCACCTT ACCTTCTTCA ATACATGGCG AGTCATTCTC GAAGGTGGTG TTGACCCTCT CCTTCGTGGG  CTTATCGCCA ATAAAGCAAA GCTGAATACA CAAACCCAGA TTTTGGTGAC TCAGTTAACG GATCATCTTT TTGAGCTGTT CAAGCGTCTC GGTCTTGATC TTGGCGCAAT CAACATGCAG  CGCGGGCGCG ATCATGGACT GCCAGGATAC AATGCATTTA GAAGATTATG TGGGCTTTCT CAGCCACGCA ATGAATCTGA ACTGGCTGCT GTGCTGAGAA ACAATCAACT GGCCCAGAAA  CTGATATCCC TTTATGGGAC ACCTGATAAT ATTGACATCT GGATGGGGGC TGTTGCTGAG CCATTGATTA CCAATGGCAG AGTGGGAGAA CTGCTGGCTT GTTTGATTGG GGACCAGTTC  CGTAGGACCC GTGATGGAGA CAGATTCTAT TATGAAAGGG CCTCTGTATT CACACCAGCT CAGCTGAGAT CAATAGAAAG AGCTTCCCTT GCACGTATTG TCTGTGACAA CACAAGGATC  ACGGAGGTCC CCCGAGATGT ATTCAAGGCT AACAACTATC CAGCCAATTT TGTGCGCTGC TCATCGATTC CAGCTCTGGA TTTGTCCCCA TGGAGGAGAA GGAGAGGCGG AGAAGAACTG  GAAGACCCTC CCATGTAGGC AGCAGAAGGC AATTTATGGG CTGGGTGCCA TTCTCTTTTT TTATCGCCTC TGTGTACTTT CCGCATATCT TGTAGGTTTG TCATAnACAT CAAAGCATAT 
AAGCATTGTT CTGCAATATT AATATCAAAC TA 

Retrieve as FASTA