Entry information : LePrx59 (Solyc01g006310.2.1[2.3])
Entry ID 811
Creation 2010-01-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx59 (Solyc01g006310.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx59 (Solyc01g006310.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx59
start..stop
S start..stop
NtPrx30-1A 572 0 4..330 3..329
LePrx40 535 0 4..330 3..330
StPrx73 515 0 4..330 3..330
GrPrx41 464 6e-166 1..330 1..331
Literature and cross-references LePrx59 (Solyc01g006310.2.1[2.3])
Literature Cordonnier-Pratt, M.-M. et al., unpublished.
Protein sequence: LePrx59 (Solyc01g006310.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (304)
PWM (Da):   %s   36192.2 (32974.5) Transmb domain:   %s   i7-24o
PI (pH):   %s   7.29 (6.11) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKTKPRNFIL YFQIMTFLVL FVGVNCQLTP NFYSKTCPNL LRVVRREVQS AIKNEMRMAA SLLRLHFHDC FVNGCDASLL LDGNSSTSEK FAPGNLNSAR GYEVIDNIKT VLENTCTGIV  SCADILAIAV RDSVLLSGGP FWKVLLGRRD GLAANFSGSS NGLPTPFDPL NTIISKFQDV GLNLTDVVSL SGAHSIGLAR CTTFDNRLRN FNGTSSPDTT LDTTIVSELQ NLCPSTSDGN 
NTTPLDRNST NLFDNHFFKN LINGRGLLES DQILFSSDDA ITTTKTLVET YSNNSTFFFN DFVNSMIKMG NISPLIGSNG QIRTNCRVIN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 1, 3 introns) .
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGACTA AACCTCGTAA TTTTATTTTA TATTTTCAAA TTATGACTTT CTTGGTGTTA TTTGTTGGTG TGAATTGTCA ATTAACACCA AATTTTTACT CAAAAACATG TCCAAATCTT  CTTAGAGTTG TACGTAGAGA AGTTCAAAGT GCAATCAAGA ATGAAATGAG AATGGCTGCT TCTTTGCTTC GTCTTCACTT TCACGATTGC TTTGTCAATG TGAGTTTTTT TATTTACTAA  CGATATAATT TAACTTGTTA TAGTATAAGA TCGTTACCTT ATTTCAAAGT TATTATTAGG CCGAATACAT AATAAAGGGC TTAAAATTAA CACAAACTGT CAAAATCGCT ACTCGTTAAA  AATGTATCAT GTGAACGATA TATCATATGG ATATAACAAC ATTATTACTC CAAGACTCCC CTTTTAATAT ATTTATTTCA ATATTAAATT ATGTATATTA ATCGTATAAT TTTTTTAATA  AAACTATCAA TGCAATTTAA CCGGCTAAAT TGAGTTATCT ATACGTTATA TTGTATGTCA ATTTAGTTTC ACGGTTTGAT AAATTTATAC ATCGTCAGTA TACAAAACTC AAACTCTTCT  AACTATTTAT GAGTTAATTA ATTAACTTCT ATAATTAAAA TGTGATAATT AACACATTTT TAAAGATAAT TACAGACCTA AACATACTTC GACCAACTAG ATTATAAAAT ATGTAATCTC  TATACTAAAT ATTCACATAT AATATATACA ATATACATAC ATATACAGAA AATATATATG ATAAATAAAT TAAACAAACG GTATATATTT ATAACTTTTT CTTCTAATTT AGATTATAAA  ACATGTACAT AGTGTATCGA TCATATTTTT TATGTTAAAT AAATTTGTAT ATTAAATATA GCATACATGC ATATACACTA TATATACTGG TATTTTAATC GTATTAATAA ATTAACTGAA  TGAACGATAT ATATCTGTAA CTTTTTCTAC TGATTTATTT AATAAAAATG TAGGGTTGTG ATGCATCGTT GTTGTTGGAT GGAAATAGTA GTACAAGTGA AAAATTTGCT CCAGGAAATT  TGAACTCAGC AAGAGGATAT GAAGTGATAG ACAATATAAA AACTGTCCTT GAGAATACGT GTACTGGAAT TGTTTCTTGT GCAGACATTT TAGCTATAGC GGTAAGAGAT TCAGTGTTAT  TGGTAAGACT TTTTACGTTA TCACTGCAAT TTAACCTGTT ATATATTTTT TTAAAAAATA TATAATTTAT CTTTTTGATT TTCAAAGTTT GTGAATTTTT TAAAAGATAA CTTATTGTCT  TTTAGATAAA TTACTTATAT AGGTCAATTA TCATTTTTAC CAATTAATAT TTACAAGATT TACATGGACT TATGTACCAA GTAATAATAA TCTAATTGTG TAAATATTCA TTTTTTTAAA  GATAAATTCA TATGATATTT GATATTCTCT TTTAAGACTA ACTAATCTTT GATTATATTC TATATATATG GTGCCTAATA TATCGACAAA GTTCTCATTA ATTCAGATTC ATGCTTCCTA  AGCCTCGTTC ATTTAAGTAA CGCTCCTTAT CAAACAAAAT TTCTCTTTTT CTTTTTTTCA GCATTATGAA CTTGAGATTT CTAATTAAGA GTGACGAAAT CCTATTTCAA ATAAATTAAT  TTATTAATTA ATTTTTTTCA GAGTGGAGGG CCATTTTGGA AGGTGTTATT AGGGAGAAGA GATGGATTAG CTGCTAATTT TTCTGGATCA AGTAATGGAC TTCCAACACC ATTTGATCCA  CTTAATACAA TTATTTCTAA ATTCCAGGAT GTTGGATTAA ACTTAACAGA TGTTGTGAGC CTATCAGGTA ATATTTAAAT ATTTTTTTAC AAAAAAAAAT TATATACACT TATATATATA  GTAAAAATAT TTTTCTTATA TTAGCAATGT AAATTTAAAT ATAATAAATG ATCAACTATA ATCAATAAAT TTACCTACCA ATGATTAAAT ATAAAAAAAA ACACTAGTAC CTTAATTGTG  TTATATCTTT AACTTTTTTG TTAAATATAG ATGTGTAATT TAACGATGAT TAGGTGCACC TCCTAGTGAG GTCAGAAATT TGAATTTTAT ATCTATTTTA TTTTATTTTT CTTTCTAAAA  ATGAGCAATA CATCTTTAAA TAGTTATTGA TAGCAATTTT GGTGTTTAAA TTAATAAAAC ATTTCAATTT TAAACCTATA ATTTTAAAAA CTTAATGATA TTCAATGATA AGAATCTGAA  TGTCAAATCG ATTAGATCCT CCTTAATATT CATCATAGTG CATCGGCAAT ATCATCCCGA AATTCTGAAT ATGCTTTTAC TTTGTACTAA CCCTTTTTAA ATGTTTAATT GAATATTATT  GTAGGTGCAC ATTCAATTGG ATTAGCAAGG TGTACAACAT TTGACAATAG ATTAAGAAAC TTCAATGGGA CAAGTTCACC AGACACAACA TTAGACACAA CCATAGTAAG TGAACTTCAA  AATTTGTGTC CTTCAACAAG TGATGGAAAC AACACAACCC CACTTGATAG GAATTCTACA AATTTATTTG ACAATCATTT TTTCAAGAAT TTGATTAATG GAAGAGGACT TCTTGAATCA  GACCAAATCT TGTTCTCTAG TGATGATGCT ATAACAACAA CAAAAACCCT AGTTGAGACA TATAGCAATA ACTCTACGTT TTTCTTTAAT GACTTTGTTA ATTCAATGAT TAAGATGGGA 
AACATTAGTC CTTTGATCGG ATCGAACGGT CAAATCAGGA CGAACTGTAG GGTTATTAAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGACTA AACCTCGTAA TTTTATTTTA TATTTTCAAA TTATGACTTT CTTGGTGTTA TTTGTTGGTG TGAATTGTCA ATTAACACCA AATTTTTACT CAAAAACATG TCCAAATCTT  CTTAGAGTTG TACGTAGAGA AGTTCAAAGT GCAATCAAGA ATGAAATGAG AATGGCTGCT TCTTTGCTTC GTCTTCACTT TCACGATTGC TTTGTCAATG GTTGTGATGC ATCGTTGTTG  TTGGATGGAA ATAGTAGTAC AAGTGAAAAA TTTGCTCCAG GAAATTTGAA CTCAGCAAGA GGATATGAAG TGATAGACAA TATAAAAACT GTCCTTGAGA ATACGTGTAC TGGAATTGTT  TCTTGTGCAG ACATTTTAGC TATAGCGGTA AGAGATTCAG TGTTATTGAG TGGAGGGCCA TTTTGGAAGG TGTTATTAGG GAGAAGAGAT GGATTAGCTG CTAATTTTTC TGGATCAAGT  AATGGACTTC CAACACCATT TGATCCACTT AATACAATTA TTTCTAAATT CCAGGATGTT GGATTAAACT TAACAGATGT TGTGAGCCTA TCAGGTGCAC ATTCAATTGG ATTAGCAAGG  TGTACAACAT TTGACAATAG ATTAAGAAAC TTCAATGGGA CAAGTTCACC AGACACAACA TTAGACACAA CCATAGTAAG TGAACTTCAA AATTTGTGTC CTTCAACAAG TGATGGAAAC  AACACAACCC CACTTGATAG GAATTCTACA AATTTATTTG ACAATCATTT TTTCAAGAAT TTGATTAATG GAAGAGGACT TCTTGAATCA GACCAAATCT TGTTCTCTAG TGATGATGCT  ATAACAACAA CAAAAACCCT AGTTGAGACA TATAGCAATA ACTCTACGTT TTTCTTTAAT GACTTTGTTA ATTCAATGAT TAAGATGGGA AACATTAGTC CTTTGATCGG ATCGAACGGT 
CAAATCAGGA CGAACTGTAG GGTTATTAAT TAA 

Retrieve as FASTA