Entry information : EgrPrx[P]06
Entry ID 8168
Creation 2011-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-22 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EgrPrx[P]06
Name EgrPrx[P]06
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx046]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus grandis    [TaxId: 71139 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EgrPrx[P]06
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]11 585 0 1..332 1..327
EglPrx[P]06 546 0 1..332 1..307
EguPrx12 434 4e-154 1..332 1..334
EgrPrx12 433 8e-154 1..332 1..334
Literature and cross-references EgrPrx[P]06
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_1 (437833..433071)
Protein sequence: EgrPrx[P]06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (309)
PWM (Da):   %s   35386.62 (33246.5)  
PI (pH):   %s   5.14 (4.97) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:21-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTPSRLWQLL LAALAVVSSC *VQHNANAAA TMEPPQKLQW LYYQNSCPDA EKYVRDQVEF YSKQDRSLAL KLIRLLYSDC FVTGCNASIL LDGPIQNAAL LGLPMEMIDK VKEVLEQHCP  GDLSCxDIIN LAAKDAVVLV GGTSYPIPTG RRDENSSSAK LVDLLPLQAV PWKAEPSYFK SKGLNVLVLT TLCGxxxxxx xTSCxSFIPD RLYDFNKTGE PDPSMDPTFL SQWSEQCPPN 
STNIAYLNPD LGSSYSFGNS FYSRVRHHQA VLGINQQIAS NFDSSLIAWE YDVRFGDFQK MFGMSTIRMG NIKLLPEDQG *IRKNC*VVD GK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic ( several stops in frame). No prediction from phytozome. No EST. Containing motif 'YSDC'.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACACCAT CAAGATTGTG GCAGTTGTTG CTAGCGGCGC TCGCGGTGGT GAGCTCATGC TAGGTGCAGC ACAATGCCAA CGCGGCAGCG ACAATGGAAC CGCCGCAGAA GCTGCAGTGG  CTTTACTACC AGAACTCATG CCCTGACGCT GAGAAGTACG TGAGGGACCA GGTCGAGTTC TACTCGAAGC AGGACAGGAG CCTTGCTCTC AAGCTCATCC GACTGCTCTA CTCCGACTGC  TTCGTCACCT TATGTGTCGT CTGTTTTTTT TCCCCTCTCT TGGACGATAT TGAAATCTGT ATCACTTCAA TATCAAGTTT CCATCACCTT TCTATGCACG TCATATCCTA ACGGTTTAAA  CCTGTCGAAC TGGGCTTTCT AACGCTTGCT CAAAAAAAGA AAAGAAAAAG AACTGGGCTT TCTAACGTAC CACTCTTTTG CGTATAAAAC TCGGGTGCAA TGCGTCAATT CTATTGGACG  GGCCTATTCA GAATGCAGCG CTTCTAGGGC TTCCTATGGA GATGATTGAC AAGGTCAAGG AAGTCCTGGA ACAGCATTGT CCCGGGGACC TCTCTTGCAC nGACATAATC AACCTCGCTG  CTAAAGATGC TGTTGTCTTG GTATGCAACA TGGTTCGCAG TTTTTCCCTT TTGGGCTTGA AAAAAGATCG TTTAGGCTGC TCCACTAATA ATTGACATTG TGCGTTTGGT TCAGCATTTT  CAAGGGGCTT TCAGCCCTGA AAGCCTCTTG GGGAAATGCT AGACCGTTTG GTTCAATTTT TTTGCTAGCT TTCAACTTTC AACTTACCTT CAAAATGTTA AAGGCCCAAA GCTAGTAGAG  ACTAGCTTTT GGGCTTTTAG CATTAAGCGG AATGTTAAAA TTATTTTTTA TCTTCCAAAA CTACTCTCAC TAATTTTTCA TATTTTCGAT TTTGTCCCTA TTTATGTCTT ATTTTTTTTA  TTGAAAAATG AGGCAGCCCT TCGCCGGACC GACGAAGGGC TACGGCCGCC GGCGAGCCAG ATCTAGCATC TACAGCCATG GCTGAGGTCG CTTGAGGTCG GACAACCTTC AACGAGGGTT  GTGCGACCCA ACTGAGGGCC GCGAGACTCA AGCGGCGGTT GCCTAGGTCA CACGACCCTC GCCGAGGGTC GCTCAACCTC GAGCGACCTC TAGCGGCCCT CGGCTAGGTC GCACAACCCT  CGCTGAGGGT CGCCCGAGGT CGGGCGACCT TCGGCGGCCC TCAACTAGGT CGCGCGACCC TTGCCGAAGG TCGCCTAGGG TCGGGCGACC TTAGCTGACG GCCGGCGGCG GCCATAGCCC  TTCGCTGGTT TGACGAAGGG TTTAGTTTAA TTTTCAAAAA TAAAAATAAA AGTATATATA ATTATATACC CATCAAAGCT CATTGGGAAA GTTTTCTTTA CCAAACTCAC ATTCAACTCA  AAGACCATTT GCAAAAAAAA TTTACCAAAC ACAATTGCAT TTCTCCAAGT AAATTTGGGC TTTCAGCATT TGCATTGAAC TCAAAACCTA TTGCAAATGC TGAACCAAAC GCGGTCACTG  TCAACTTGAG TTTTAGAGCG TTTGATATGG AGAAAAATTA GAATTACTAA TGCAATAATG ATGTTGTAAC AAGTGGGAGG GACGTCGTAC CCCATTCCAA CGGGGAGGAG GGATGAGAAT  TCATCCTCCG CGAAGTTGGT GGACCTCCCA TTTATGCCAT GTTTGGTAAC GGGTTAAATA GTAAAAAAAT TTATTCTTTT GTTCTGGGGA GTAGTTTTGG AACAGAATCA TATTTAGTAA  AATTTTTGTT CCCAGAAACA AATTTTTATT TTTTTGTTCA CGGAAGTAGA TTTGGAATAT AATCAAGAAT GAAAAAGAAA AAGTTGATTC TTCTTTCCAA GAACAATTCT AGAATTAAGT  TCATATTTTC CTTTTTATTT TCTTTTTCTT TGTTCTTCTT CCATTTTCTT CTTCTTCATC TATTGCCACC GCCGCCATTG CCGTCCGCCA CCCACTGTTG CTGGTTGCCG ACAACTGGTT  CGGCGAGGCG GGTGAGGCTC GCCCAACCCC GGCGAGGGTT AGCCAGCCTC GACTAGGCTC AACCGAGTTC ACCCAGCCGT CAACGGGGCT CGACCTCGCC AAGCCATCGC GAGGTCAGCC  TCACCTAGGG TGGTGGGCTT CACAATGCTA AGATGGGTTT CGAAAGGCGA TGGCAGGGAA GCTAACGCCC ATTAGGGTAC CTAGGGTGGT GCTCTAGTCA TGGAAGAAAG AACCTGTGGG  CTTCCCCTGC CATTCGCATG AAGCAAAAGA ATAGCATAAC CGCAGCACGA TGACAATGGC TGCTCTnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnGGC CTTGCTAGAA CTGGGGGCGA GGCCGCTCCA CCCAGCCATG GCTCGACCGA  CGAGGGCTGG CGATGCTTTG GTGAGGTCGT TGGCCCTCAT CTGGCCCAGT TGTTAGTCAT CGTAAGGCTG GCAACTGGCC ATTTAAAGAA GAAGAATAGG AAAGAAAAAA AAGAAGGAAA  AAGTAAAAAA GTAATAACAT TATTTAAAAA TTAAAAGAAA ATGATTTGGA GTAGGAATTT TGAGTACAGT ACCAAACGCA ATTTTATTTC GGGAATTGAA ATTTTGGACA GTTACCAAAC  AACTTAAAAT ACTTAAAAAT TGTTCTTGGA AACAGAATAA AAGAGAATCA ATTCTGATAA GAAATTGTTT CTGAGAACAG AAGCGTTACC AAACGCACCC TTAGAGTGGG TCTTAGACCT  ATATATGACC CATTTAAATT ATAAATTGGT CATATATGGA TCACTTATTT TTTGAAGAAA CTAGTTAAAT GGATTTAAAA ATTAAAGACT TAAGATAAAT TGGTTTTAAT TTTTAAATGG  GTCTTAAACG GGTTGGACTT AGAACCCATT TTCAACCAAA ACCTCACAAT CTCCATCTTC CCTCTTTAAC TTTATGAAAT TATTTTTAAA CAAAGATCAA AATTATAATT ATTTTTTATA  TTTTAATTTT CTTTTTTCTT TCCTTCTTCC TCTTTCTTTA GCTGATGGCC AGCATGGCAA TTGGCCAAGT GAGGCTTGAG CTCATTGGCC TCAGGCGTGG CTCAAGCCTC GCCAGATCCA  GCAATGGGCG AGCTCGAGCC TCGTCGATCT AGCGAGCCTT GAGCGAGCTA GATGAGCTCA AGGCTTGCCT GTGGCTGGTA GCCAGCTGTC GTCATGGTCG ACGACCGGCC ATAGAAGAAG  AAAAACAAAA AACAAAAAAC AAAAGGAAAA TTAAAAATTA TATTCTTAAA AAATATAAAA ATTGTCCATT AAATTTATAT TGGATAAAAT TATTTTAGCA ATACCATTTA AAAAAATGAT  AAGAAATAAT TTTTCTTAAG TTTAGTTAAA TGGGTCAGAT ATGGGTTAGG TCGGGTATGG GTAAAAAACT TTGCACTACA ATAAATCGGT CATAAACGGG TTAAATAGAT CGAATTGGGT  CGGACCATTT ATGACCCGAT CCACCAATTT AACGGATCTA CTTCCATTGC AGGCCGTCCC GTGGAAAGCG GAGCCCAGTT ACTTCAAATC AAAGGGTTTG AATGTGCTAG TCCTCACTAC  TCTATGTGGT GTCATTTGAC CCTCACAAAT TTGACCGGGA CCTCATTATA TCACCTTAGA TCTTAACCAA TCCAGGCAAA TCGTTTAGTT TAGTGGATCG CAACGTCTTT TTTTGCTTTT  AAGTTTTGTA AGTCGCTGCC TAATTGTCAC GATACAAAGA ATTTTATCAG ATATAGTATT GTCGAGGATA TAATCTGAGC CCCAATACTC ACTATGATCT CCTCCCAGTG CACAAAATGG  CAATGCTCAC GTATTATGTC AATCTCAGAA TCATAGCCAA AATCCTAACT TGCCGAAACA ATTTAAATTT TCCCnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnACCAGT TGCnnnAGCT TCATCCCGGA CAGGTTGTAC GATTTCAACA AAACTGGCGA GCCAGACCCA  AGCATGGACC CAACCTTCTT GTCACAATGG AGCGAGCAAT GCCCTCCGAA CTCAACGAAT ATAGCGTACC TCAACCCTGA CTTAGGCTCG AGCTACAGCT TCGGCAATTC CTTCTACTCA  AGGGTACGGC ACCACCAGGC GGTCCTCGGC ATCAACCAGC AGATCGCTAG CAACTTCGAC AGCTCCCTGA TCGCTTGGGA GTATGATGTC AGATTCGGGG ACTTCCAGAA GATGTTCGGC 
ATGTCAACAA TCCGGATGGG GAACATCAAG CTCCTACCGG AGGATCAGGG GTAGATTCGC AAGAATTGCT GAGTCGTGGA CGGGAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACACCAT CAAGATTGTG GCAGTTGTTG CTAGCGGCGC TCGCGGTGGT GAGCTCATGC TAGGTGCAGC ACAATGCCAA CGCGGCAGCG ACAATGGAAC CGCCGCAGAA GCTGCAGTGG  CTTTACTACC AGAACTCATG CCCTGACGCT GAGAAGTACG TGAGGGACCA GGTCGAGTTC TACTCGAAGC AGGACAGGAG CCTTGCTCTC AAGCTCATCC GACTGCTCTA CTCCGACTGC  TTCGTCACCT TATGTGTCAT AAAACTCGGG TGCAATGCGT CAATTCTATT GGACGGGCCT ATTCAGAATG CAGCGCTTCT AGGGCTTCCT ATGGAGATGA TTGACAAGGT CAAGGAAGTC  CTGGAACAGC ATTGTCCCGG GGACCTCTCT TGCACnGACA TAATCAACCT CGCTGCTAAA GATGCTGTTG TCTTGGTAGG AGGGACGTCG TACCCCATTC CAACGGGGAG GAGGGATGAG  AATTCATCCT CCGCGAAGTT GGTGGACCTC CTTCCATTGC AGGCCGTCCC GTGGAAAGCG GAGCCCAGTT ACTTCAAATC AAAGGGTTTG AATGTGCTAG TCCTCACTAC TCTATGTGGT  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nACCAGTTGC nnnAGCTTCA TCCCGGACAG GTTGTACGAT TTCAACAAAA CTGGCGAGCC AGACCCAAGC ATGGACCCAA CCTTCTTGTC ACAATGGAGC  GAGCAATGCC CTCCGAACTC AACGAATATA GCGTACCTCA ACCCTGACTT AGGCTCGAGC TACAGCTTCG GCAATTCCTT CTACTCAAGG GTACGGCACC ACCAGGCGGT CCTCGGCATC  AACCAGCAGA TCGCTAGCAA CTTCGACAGC TCCCTGATCG CTTGGGAGTA TGATGTCAGA TTCGGGGACT TCCAGAAGAT GTTCGGCATG TCAACAATCC GGATGGGGAA CATCAAGCTC 
CTACCGGAGG ATCAGGGGTA GATTCGCAAG AATTGCTGAG TCGTGGACGG GAAA 

Retrieve as FASTA