Entry information : PvPrx08 (Phvul.006G129200.1)
Entry ID 824
Creation 2008-09-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-19 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvPrx08 (Phvul.006G129200.1)
Name (synonym) PvPrx08 (Phvul.006G129200.1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx043]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Nodules
Roots
Inducers Nodulation
Phosphate starvation
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvPrx08
start..stop
S start..stop
GmPrx19 612 0 7..355 13..358
GmPrx260 562 0 21..355 15..349
GmPrx69 560 0 21..355 14..347
GmPrx24 553 0 8..355 3..350
Literature and cross-references PvPrx08 (Phvul.006G129200.1)
Literature Ramirez,M., Graham,M.A., Blanco-Lopez,L., Silvente,S., Medrano-Soto,A., Blair,M.W., Hernandez,G., Vance,C.P. and Lara,M. Sequencing and Analysis of Common Bean ESTs. Building a Foundation for Functional Genomics. Plant Physiol. 137 (4), 1211-1227 (2005).
DNA ref. Phytozome 12:   Chr06 (24388098..24384794)
Protein sequence: PvPrx08 (Phvul.006G129200.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   356 (326)
PWM (Da):   %s   38286.11 (35147.6)  
PI (pH):   %s   5.3 (4.91) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-355
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSFCVFSVK VALCCVVVLL AASPPFSHAQ LDNSFYRDTC PKVHSLVREV VRNVSKSDPR ILASLIRLHF HDCFVQGCDA SILLNDTATI VSEQTAAPNN NSIRGLDVVN QIKTAVENAC  PGIVSCADIL ALAAQISSVL AHGPDWKVPL GRRDSLNASF DLANQNLPGP NFSLDQLKSA FERQNLNTTD LVALSGAHTI GRAQCRFFDN RLYNFNGTGN PDPTLNTTLL QSLQAICPNG 
GPGTNLTNLD LTTPDELDSN YYSNLQLQNG LLRSDQELFS TSGADTIPIV NSFSSNQTLF YENFKASMIK MSIIQVLTGS QGEIRAQCNF VNGNSASLAT LPTKQSSEDG IVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGAAATAAA GTAAAAATAG CGTCTTTTTC CTTTTTCTTC TTTGTAGACG TACCAATCGA AATATGCTCC TTATTAAAAT AATATTAAAC ACAATTATAT ATTAATAATT TATGCACTCG  TAAGTATATA GAACACATAA ATTTATTCTC TCACCATAGT CTTGATTCAA CGTTGAATAA AATAGTAATA GGTATAACAT GTAAGTTTTA TTTAACCATA CTTGTAGATG ATCGTTAAGT  TTATTTAAAT TAAGAGTGAA ATATTTTTCT ATGAATATTG ATTATAGTTC TTGTAAATAA TTTATTTATT TATTTGGTTT CTATATTATT AGATAATAAT GATAATAAGG ATGTATTAAT  TTATTTATGT GATTAACTAT GTGTTATTTT TAACTTGTAT ATAAGATACT TGTGATTAAC TATGGTAAGT GATAAATTGA TATTACTTTT TTAATTTTAA TTTGAAGAGT GAATAGAATG  GGAGAGAAGT ATTATGTTGA GTACTCATGA AAAGCCTTAG TTTCAACTCA TATTTGTATT TCTAATCGTC CCTCTCAAAT TGTAATTTTT CTTATAAACA AAACGAAAAC ATAATTTATT  AGTGATTAAG TATAAATAAA ACTTAATAAA TATTTATTTT CACTGGAAGA TAATAAATAA TTAAAATAAG AGTATTATAA AAAAATAAAA AATAAAAAAT TTAATGTTTT ATGAAGTAAA  TTATTTCAAT AATTAATAAT TAATTTTATG AAAAAGTTTA AATTTAATTA ATTAATTTGT AAACTAATTT TATTATATTT AAATTTTTTA AAAATTGGTA TGTGAAAAAA ATTATATATT  ACTGGCAATT ATTTATTTAA ATAAATTAAG TTTTAATTTT TAATATTACT TTTTACTTCA TAAAGTAATT ACTTTATAAT TAATCATCTT TCAATTTTTA TTCATATTCA TTTTTATTAT  ATTTTAACAA AAGATATTTT GATAATTTAT TATATTATCT AATTAATTTA GCTTTTTAAA TTTTATGATA TTAATTCAAT TAAATGTAAA TTTTCTATTA TTTCTCTCTC TTCTTCTCAC  TTTAAATAAC TTATTTCTTT TTTACTCTCT CTTTTAACTC AAACAAAACA ATAATCTAAT TACTTCAGGC TGAGTTTTTT TTTTCAGCTC TGAAAACAAT TCTCGGTGAA ATAAAACAAA  CATCCTTTTA GTGAATATCG AGACAAATAA TTTATGTTTA CAAAATAAAC AAAACTTGGA GGAAGTGCTA ATTTCCATTA ACGCACATAT TTAATATTTC TCTGGTTAAT TTCACACTAA  AACTTAATTA TATAAATATT AGCTCGATCA AAATTTTGGT AAAAAATAGA GTTCACTAGA TCAAATATTA TCGAGTTTAG TCATAGTAAA AAATATTATC GAAAAATAAA AATCTTAAAT  GGTGTATTGG AGATTGCTGT TATGGGTACC AGCATTAGTA TAATATTAGT AAAGTGTGTA ACTCAAAATA TTTTTTTTAT CTTTGATAAT TCTACCATAA TTTTAACATA ATTTAAAAAA  ATAACAAACA AAATATTTTA AAAAAAATTG ATATAATTAT AAAAATAAAA AATAAATTCT TCTGAATCAG TAATATAAAA ACATTTTTTA AAAATATAAG GTGAAAAATC TCTCTGCTCA  GTACTACTTT AACAAGACAA AAATAATAAA AAAGAGAAAG AGTCTCTGTC TCCATGTCTT ATTGAGTGTG TGTCTGTGAT AACTGCTGAG AACACACTTA AGCAAGCTGA GGCTTCATCG  TGAATATATG AATCGATTAT TATTAAATTT GAAACGCCAA ATTTGACTTT TCTGATTAAC CGGTAGCATG ATTGAAAAAT CTGAACCCAC CAGCAAACGA CCACGTTCCA TTTTTCTTTT 
TTCTTCATCT GTCTCCTTAA ATAGACCCTA AGCATTTGCT CACAAAAGCA TCACATTCAC AGTTCAAAAC ACAAGAAACA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCTCTT TCTGTGTTTT CTCAGTGAAA GTAGCACTTT GCTGTGTGGT GGTTTTGCTT GCAGCATCAC CACCCTTCTC ACATGCACAG CTTGATAACT CCTTTTACAG GGACACATGT  CCAAAGGTGC ATTCTCTTGT GCGTGAAGTT GTCAGAAATG TCTCCAAATC TGATCCTCGT ATTCTCGCCA GTCTCATAAG GCTCCATTTC CATGATTGCT TTGTTCAGGT AAGTCTGCAG  CATTCTCAAT TCTTGCTTGG TTTCTTCACC ATCCTTATAT AGAGATATCA TTATCATCTC TATTGAAAAA TCTTACTAAT CACTTTTAAT AGTCAAACAT AAACACTATT AGAGTGTAAT  GGTCTTAATC AAGTTTTATG CTGCTACATA ATTGAAATGA TGTGTGTTTA TATGAGTATC AGGGGTGTGA TGCATCAATT CTTTTGAACG ACACTGCTAC GATTGTGAGT GAACAAACTG  CAGCACCAAA TAACAACTCC ATAAGAGGTT TGGATGTTGT GAATCAGATC AAGACAGCAG TAGAAAATGC TTGCCCTGGC ATAGTTTCTT GTGCTGATAT TCTTGCTCTT GCAGCTCAGA  TATCTTCTGT TCTGGTAACT GTGCCTATTT TCCTGCATTC AACATACTAA CTAATATAGA TTTCATATTA ATTAATAATT TAATTAAAAT AATATATACA TAAACGATGC AAATCTCGCA  GTAAAATCAA GCAATCCCAT TTTTGGGGTT GATTTAGGAA GAGAAAAAAT AATTATAAGA AAAGAAAGAA ATTAGTGTTC AACTGTGATA TAGTGCTGCT ATATATATCT GGACAGTTAG  TTGTGTAGTT ATTGTCAAAA CTTTGATGAG TCCTCAATAA TGTGAGATAT ACACTGAAGC CTTGTGCCCA GGCCAAAAAC TAACCACACG ATTTGCAATA TTATGTCTTT TCATAGACAA  AAACATGATC TCTTATTTGA ATATTTTAAA GACTCATGGC AAAGCATTAT ATACCCAGTG TTAAGAAATT GTTCATGGCA AAGAAAAAAA AAATTGCTTA TTAAGATTAA AAAAATATAT  TATATAATCT AACTGTTTAT AAGAAAAGTA ACAAACCGGT TTTTTAGTTT TTATTTTTTG TAAGGAATTT ATATAACTAT TGTTACTTTT AACTGAAGGA AATAAACGAA TCCAGATTTT  AAATATCTCA TTATATTTAA TATTAATCGA GCAAGTTCGA TGTTTTTTAA GGAAATTAAG GAAAATAAAA ACATTAAAAA TTAAGATAAA TATAATTAAA TATGAAAATA TAAAATAAAA  CATAAACAAT TTATCTCAAA ATAAGCATTC AAATTTATTA TATATACTAT AAATATGGTC TCATCTTAAA TTTTTGTTGG GAGGGGAGAA TCCAACGAAA TAATGGTCAT AAGAGGCTGT  TTATTCCTGC ACCTAATCTT CTTCTGCCAC CTCCATACAT AAGATGAAAA TACATTTTTG TCCTTCTTGT CTCACCTCTA TAGTAGTTTC TGGATTATGT AATTCGGAAA TTCATTTGAA  AAAAGACTTC TGGATTACAT AATCCAGAAG TTAAATAAGA CTTCCGAATT ATGTAATCCA AAGAATAATC ATGCATCTGA AAAATGGCTT TCGGATTATG TAATCCGGTA ACTAATTACA  AATTTGAAAA ATGACTTTCA GATTACGTAA TCCGGAATAT TATAAAGGGG TATATTTGGA AATTTGAAAA CTTATGGAGG TGAGAGAAGA AGGTATGGAG GTGCAGGAAG AAATAGTCGT  CATAAGATTA TGATACTTCT TTATTTAGGC TTGGCTAATT AACTACCTTT GACCCTTCAG CCCAAGTCGG TAGATATAAA GCCCACAGTT TTAGATATGT TCAAGGCTTT GCTATTCTCA  TTATGCTTGT GCTAAGTTCA CCCCAGTTTT AGAAAAATAT ATTGATAGGA GTATATCTTA AAGGAAACAG TATTGAGATA CGTAACGGGA AAAAAATAGT GGGTGAACTT AGAAAAGCAG  GGTGAAAATA TCAGAGTCCT ATGTTTATAG TATACACAAA ATATATCTCC TTAAGTTTTT AGTTAAAAAA AATATAAATT TAGAGATAAT TTTGTTCTTT TGATAAAATT TTACTGAATT  ACTTTTAAAT ATTTTAAAAA AAATCTTTTA ATATATTTTT AGGAATTAAG TCAATATTAA ACGAATAAAA ATTTATTTAC ACGATTTTTT TTCTGAAATC ACTTTCCTTT TTTGTCAATT  TGATTATTTC ATCTTCTTTT TTAGTTTGTG GATGTTTTGG AAAATTTCTT TTATCTTATC TTGTTTGTTT TATTACTTGT TAGGCTCATG GTCCTGATTG GAAAGTTCCT CTAGGAAGAA  GAGACAGTTT AAATGCAAGT TTTGATCTTG CTAATCAAAA TCTTCCTGGT CCTAATTTCT CCCTTGATCA ACTCAAATCT GCATTTGAAA GGCAAAACCT TAACACAACT GATCTAGTTG  CACTTTCAGG TATAATTTTT ACATTATAAA AAATACATTT AATAGAGTTA GAGATGTGTA TTACATACGT ATGATTCATT TTTCAGGTGC TCATACAATT GGCAGAGCTC AATGTAGATT  TTTTGATAAT CGATTATACA ATTTCAATGG CACTGGAAAC CCTGATCCAA CTCTTAACAC AACCCTTTTA CAATCACTAC AAGCAATATG CCCCAATGGT GGACCTGGAA CCAATCTCAC  CAATTTAGAC CTAACCACTC CTGATGAACT TGACTCCAAC TACTACTCCA ATCTTCAACT TCAAAATGGC TTGCTTCGAA GTGATCAAGA GTTATTTTCC ACAAGTGGTG CAGATACTAT  TCCAATTGTC AACAGTTTCA GTAGTAATCA GACTCTTTTC TACGAAAATT TTAAGGCATC AATGATAAAA ATGAGCATCA TACAAGTGCT CACAGGATCA CAGGGAGAGA TTCGAGCACA 
ATGTAACTTT GTGAATGGAA ACTCAGCTAG TTTGGCTACT CTACCCACCA AACAATCTTC AGAAGATGGT ATCGTGAGCT CAATGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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ATGACCTCTT TCTGTGTTTT CTCAGTGAAA GTAGCACTTT GCTGTGTGGT GGTTTTGCTT GCAGCATCAC CACCCTTCTC ACATGCACAG CTTGATAACT CCTTTTACAG GGACACATGT  CCAAAGGTGC ATTCTCTTGT GCGTGAAGTT GTCAGAAATG TCTCCAAATC TGATCCTCGT ATTCTCGCCA GTCTCATAAG GCTCCATTTC CATGATTGCT TTGTTCAGGG GTGTGATGCA  TCAATTCTTT TGAACGACAC TGCTACGATT GTGAGTGAAC AAACTGCAGC ACCAAATAAC AACTCCATAA GAGGTTTGGA TGTTGTGAAT CAGATCAAGA CAGCAGTAGA AAATGCTTGC  CCTGGCATAG TTTCTTGTGC TGATATTCTT GCTCTTGCAG CTCAGATATC TTCTGTTCTG GCTCATGGTC CTGATTGGAA AGTTCCTCTA GGAAGAAGAG ACAGTTTAAA TGCAAGTTTT  GATCTTGCTA ATCAAAATCT TCCTGGTCCT AATTTCTCCC TTGATCAACT CAAATCTGCA TTTGAAAGGC AAAACCTTAA CACAACTGAT CTAGTTGCAC TTTCAGGTGC TCATACAATT  GGCAGAGCTC AATGTAGATT TTTTGATAAT CGATTATACA ATTTCAATGG CACTGGAAAC CCTGATCCAA CTCTTAACAC AACCCTTTTA CAATCACTAC AAGCAATATG CCCCAATGGT  GGACCTGGAA CCAATCTCAC CAATTTAGAC CTAACCACTC CTGATGAACT TGACTCCAAC TACTACTCCA ATCTTCAACT TCAAAATGGC TTGCTTCGAA GTGATCAAGA GTTATTTTCC  ACAAGTGGTG CAGATACTAT TCCAATTGTC AACAGTTTCA GTAGTAATCA GACTCTTTTC TACGAAAATT TTAAGGCATC AATGATAAAA ATGAGCATCA TACAAGTGCT CACAGGATCA 
CAGGGAGAGA TTCGAGCACA ATGTAACTTT GTGAATGGAA ACTCAGCTAG TTTGGCTACT CTACCCACCA AACAATCTTC AGAAGATGGT ATCGTGAGCT CAATGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTGTCTCCT TAAATAGACC CTAAGCATTT GCTCACAAAA GCATCACATT CACAGTTCAA AACACAAGAA ACAATGACCT CTTTCTGTGT TTTCTCAGTG AAAGTAGCAC TTTGCTGTGT  GGTGGTTTTG CTTGCAGCAT CACCACCCTT CTCACATGCA CAGCTTGATA ACTCCTTTTA CAGGGACACA TGTCCAAAGG TGCATTCTCT TGTGCGTGAA GTTGTCAGAA ATGTCTCCAA  ATCTGATCCT CGTATTCTCG CCAGTCTCAT AAGGCTCCAT TTCCATGATT GCTTTGTTCA GGGGTGTGAT GCATCAATTC TTTTGAACGA CACTGCTACG ATTGTGAGTG AACAAACTGC  AGCACCAAAT AACAACTCCA TAAGAGGTTT GGATGTTGTG AATCAGATCA AGACAGCAGT AGAAAATGCT TGCCCTGGCA TAGTTTCTTG TGCTGATATT CTTGCTCTTG CAGCTCAGAT  ATCTTCTGTT CTGGCTCATG GTCCTGATTG GAAAGTTCCT CTAGGAAGAA GAGACAGTTT AAATGCAAGT TTTGATCTTG CTAATCAAAA TCTTCCTGGT CCTAATTTCT CCCTTGATCA  ACTCAAATCT GCATTTGAAA GGCAAAACCT TAACACAACT GATCTAGTTG CACTTTCAGG TGCTCATACA ATTGGCAGAG CTCAATGTAG ATTTTTTGAT AATCGATTAT ACAATTTCAA  TGGCACTGGA AACCCTGATC CAACTCTTAA CACAACCCTT TTACAATCAC TACAAGCAAT ATGCCCCAAT GGTGGACCTG GAACCAATCT CACCAATTTA GACCTAACCA CTCCTGATGA  ACTTGACTCC AACTACTACT CCAATCTTCA ACTTCAAAAT GGCTTGCTTC GAAGTGATCA AGAGTTATTT TCCACAAGTG GTGCAGATAC TATTCCAATT GTCAACAGTT TCAGTAGTAA  TCAGACTCTT TTCTACGAAA ATTTTAAGGC ATCAATGATA AAAATGAGCA TCATACAAGT GCTCACAGGA TCACAGGGAG AGATTCGAGC ACAATGTAAC TTTGTGAATG GAAACTCAGC  TAGTTTGGCT ACTCTACCCA CCAAACAATC TTCAGAAGAT GGTATCGTGA GCTCAATGTA AAATAAATTA ATGAAAAGTA TTTTACTAAA TGCATGTGAC ATCAATGATC ACTAATAAAA 
ACTTTTACAA GAACATGCAT GTATATGTTA ATGGTGGATC GTAATAACCT TTATATTTTG TATTGGCTAT GGATAGCTCC AACCT 

Retrieve as FASTA