Entry information : PvPrx09 (Phvul.007G114200)
Entry ID 825
Creation 2005-09-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-19 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PvPrx09 (Phvul.007G114200)
Name (synonym) PvPrx09 (Phvul.007G114200)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx026]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Phaseolus
Organism Phaseolus vulgaris    [TaxId: 3885 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Nodules
Roots
Inducers Nodulation
Phosphate starvation
Rhizobium inoculation
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PvPrx09
start..stop
S start..stop
GmPrx14 585 0 14..326 1..314
GrPrx39 530 0 12..326 9..323
GhPrx39 530 0 12..326 9..323
MtPrx19 530 0 1..326 1..327
Literature and cross-references PvPrx09 (Phvul.007G114200)
Literature Ramirez,M., Graham,M.A., Blanco-Lopez,L., Silvente,S., Medrano-Soto ,A., Blair,M.W., Hernandez,G., Vance,C.P. and Lara,M. Sequencing and Analysis of Common Bean ESTs. Building a Foundation for Functional Genomics. Plant Physiol. 137 (4), 1211-1227 (2005).
DNA ref. Phytozome 12:   Chr07 (53105980..53104195)
EST ref. GenBank:   CV543977.1 [3' end]
Protein sequence: PvPrx09 (Phvul.007G114200)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   36168.9 Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   6.73
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLYKSCVRPS KVVMANFVTV LLLIEVFAYG FRFGADGLNM NYYLMSCPFI EPVVKNTVNR ALMEDPTLAA GLIRMHFHDC FIQGCDGSVL IDSTKDNTAE KDSPGNLSLR GFEVIDAIKE  QLEIQCPGVV SCADILAMAA RDAVFFAGGP VYDIPKGRKD GRRSKIEDTI NLPFPTFNAS ELIRSFAQRG FSAQEMVALS GAHTLGVASC GSFKNRLSQV DPTLDTEFGK TLGRTCSSGD 
NAKQPFDATS NDFDNVYFNA LLRRNGVLTS DQTLYTSPRT RNFVNAYAFN QAMFFFDFQQ AMVKMGLLDV KDYYNGEVRQ NCRKIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 3 ESTs (Cultivar="Negro Jamapa 81").
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTGACA AATGAGTTTG AACCCAATCA GTTCATCATA ATAACCTAGT GGTACATTTT CTAAATTTTA ATCTAATGGA ATTGAATTAT AAACATATAA ACTTGGAAGA ACATCTAGTA  GCTATTGTGT GAATGATTTG GAATCACAAA AACAGGATAA TATTTAAACA AAAAAAATAT ATGGTATAAA AATGTTTTGT ATGACAACTG AATGTTTGAG TTTGACTGTC AAATAAATAC  CTAGAGCTAA GTTTTCATAT TCAACTGGAT TGTTTAAAGG AATGTCTAAA AACTGTATGA TTATATGGGA GATAGAGATA TATGAGGACT TGATTACATT ATTGATCAAC AAAAGAGCTT  ATTATATATG TGTAATGCAC CTCCCAAAGC ATATTGAGAT TGTTTACTAA TTTATGCAGG AGAAAGAAGT GAGTTATGTT TGGTTTAGTT GATTGGATGT TAGTTCAGTG AGCGGAGAAA  CAACAAGATG GATAACAATA TATAGTCTCA CAAAATTGGT GTTCGAACAC TTACCCAAAA CAATATGAAT TGTCACAATC GTTTCAGTTC AAATAGTAAA AATTCGGATG CAAACATTTA  TTCAAGAGAC TACATAGAAG GGAGCACTAA TATCAAAACC CTAGATTGTG GGGATACATA AACTATAAGT AAACTGTAAG GATGACAAAG ATTCAGAAAC CCGTAACATG GACAACTAGG  TATGAGGTAT GAGGTATGAG GTATGAGGTA TGAGGTATGA GGTATGAGGT ATGAGGTGTT ATGTAGAAAT TGGAGGACAA TGAATGTGCA AGATGTCTTT ATATCAAAGC TCACGAAGGA  AGTTATTTTT GGTTCAGTTA GTCTCCCTAA TGTATGACAG GAACATTGTA TGGGTCAATC TCATTGTATT AAAGTATCTA ATAGTTAGTT GAATGTTATT AAGGGTACGG GACTAAAACT  TATAAAGTTA TTATATTTTT TTTATACAGG TTGAAACACC CTTAATTTAT TTCATTTTTT ATGATAAAAA AATCTATTAT ATAACAAATC TACGCAACTA TATCAAATTA GTTTCACAAA  ATTTGTCTCG TTTTTTATTA TAATATTTTA CTTTTTAAAC GAACCCTATA ATCGAGAAAA TGCAGTGTAA CTATTTATTT AACATACCTA TGGAAGAAGT TCCCCATATA TACAAATTAA  GGAAATGGAA ATGGGCTTTC TATATATTAC TATAATTGCA TGTGATTGTC TCTTATCAAT GTAAACTTGT AACCATCCAA AATTAATTAC ACTATTTTAA TTAATCTATG ACCGAAATGG  TACCAAAACT TTAATGATCA TTTTGTGTCT GTCAATTTCT ATTCCACCAT TCCAAGATAA AGTTGACTTG CAATATACAT ATTCTCAGTG CTCCTAAAAA TTCAGATATA ACACATCTCA  ATTATTTTCT ACTCATTTTT AATCTAATGC TGATTTTTTA GTTTTAAAGT TTTTCAAAGG TTTTCGTCAT TTTACGGAAT GAGGTTAATT GTTGCACCAC ACGAGTGCGT GGCTCATGCA  CATTCGACCC TCACTAATGT GAAATTCTTA GCGTGTCAAC CTTCACATAA TACATGTAAT CAACATTCAC ACACAATAAA GTTTTATTAA ATCCACAACG TTTACATTGA CTTTAAGCTG  ATTAGGTAGG ATTTGAGAAA TTAAAAACAT GGTGCAGGTT TAAATAATAA AGTGCATACC ACTATCTTTT AACTTTTTCT ATTTTGTTTT AGATTATCCT TTTTTTCAAG TTTTGGCCAA  CATTTTTTTT CCAATCATTT TCATTATATA AGTATAACAT GTGTATACAC ACACAATACA CTAGTGCCGT ACCCCACTAT GCAGTTGCCA ACTATTCCCC ACTATATAAG GTTCTTAATT 
TTTGGGTCTT GTATATAGCA AATAAACCTC ACTCCTCTCC CTACAAACCC AGTATATATA AGTGTGTGTG TTTTGTGAAG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGTACA AATCATGTGT GAGGCCTTCA AAGGTGGTCA TGGCAAACTT TGTTACAGTG TTGTTGCTAA TTGAGGTGTT TGCATATGGC TTCAGATTCG GAGCAGATGG CTTGAACATG  AACTACTACT TGATGAGTTG TCCTTTCATT GAACCTGTTG TTAAGAACAC TGTCAACAGA GCTTTGATGG AAGATCCCAC TCTAGCAGCT GGTCTTATTA GAATGCACTT TCATGACTGC  TTCATTCAGG TTCCTTCTCT CTCTACTCAC ACATGGATGT AATACTATTC CATCTTCATT TTGGCACATT ATTTATTGAA TCTATCAAAC TTTCTCTTTT TCTTTGTGTT TGTCTCCTTA  CCTCTCTCTC CCCAAAAAAC CCTGAGGTGT AAGACCATTA AAACCCTAGC AATATACAGT TAAATAATAT AGCCTCCAAT GTTTGTCTTC TACAATCCTA CTCTAGTAAG AGTATTTAAT  TGTCACTAAC TTTAACGTAA GTAATTAAAT ATCAGTTTAG TTAACTATAA GTTCTAAATA ATTCAAACTA GTATGCTACA CAATTTCTGA AGATACAGTG CAAATATAAT CAATCTATTT  TTACACTGTA TTTTTATTTC TTAGAAAATG GCCAAAACGT GAAAGTGGTT ACTCAACTAT TTGTTGTCGG TAAATTGTTC ACCACTATGG AAGATGTCGT GTGGTGCATG TGTCTCAAGA  AAGGACAAAG TGGCTTTGCA TTCACATAAT ATAGTAATCC ACAGTAATAA AATATTTGTT TTTGGGTACT ATAGGGATGT GATGGCTCAG TTTTGATTGA CTCCACTAAG GATAATACAG  CAGAAAAGGA TTCTCCAGGA AATTTGAGCC TGAGAGGGTT CGAAGTGATA GATGCTATCA AAGAACAGCT TGAAATTCAA TGCCCTGGTG TGGTTTCATG TGCTGATATT CTGGCCATGG  CTGCTAGAGA TGCAGTTTTC TTTGTAAGAT ATTCAAGTCA AAAAATACAT TACTCATTAA TCATTTCTTT TCAAATATAG TTATTTATGT TGTTGGTGTA GATATTGACA TGATTATGGA  ATGATGACAG GCAGGAGGAC CAGTATATGA CATACCTAAA GGAAGAAAGG ATGGAAGAAG ATCCAAAATT GAGGATACTA TCAATTTGCC ATTCCCTACT TTCAATGCCT CTGAGCTCAT  TAGGTCGTTT GCTCAACGTG GTTTTTCTGC ACAAGAGATG GTGGCTCTCT CTGGTACCCA CTCGCCTAAA CATACTACTC TCTTGAATCA TGTTAACGAT ATTTCAAACA AAAAAACATT  ATGTCCCATT AACTTTCACT TTCACCAATG AAAGAAATGT TTCTTTGAAA ACGACCGATT TATAATATAA TTTCAAAAAA TTGAGATCCA TTTCAGAAAA AAGGTTATTT ATCTTTCTCT  TTGAAACATC AAACATGCAA GAAAATTACA GAAACCCATG TAACAAGCAC TTCACTACTT CACTAGAAAG TAGAAAAGTA TGATTAAGAT GTTGGGTACT TGGATTGCAT GCATACGCAG  GGGCTCATAC ACTAGGAGTG GCAAGTTGTG GTTCTTTCAA GAACCGGTTG AGCCAAGTGG ATCCAACTCT GGATACAGAA TTTGGCAAGA CACTTGGGAG AACATGCAGT TCTGGTGACA  ACGCAAAGCA ACCATTCGAT GCGACGAGTA ACGATTTTGA CAACGTTTAC TTCAACGCTT TGCTGAGGAG AAACGGGGTT CTTACATCAG ACCAAACACT GTACACTAGC CCCAGAACCA  GGAACTTTGT GAACGCTTAT GCATTCAACC AAGCCATGTT CTTTTTTGAT TTCCAACAAG CAATGGTGAA GATGGGTCTG CTTGATGTGA AAGACTATTA CAATGGTGAA GTACGACAAA 
ATTGTCGCAA AATTAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGTACA AATCATGTGT GAGGCCTTCA AAGGTGGTCA TGGCAAACTT TGTTACAGTG TTGTTGCTAA TTGAGGTGTT TGCATATGGC TTCAGATTCG GAGCAGATGG CTTGAACATG  AACTACTACT TGATGAGTTG TCCTTTCATT GAACCTGTTG TTAAGAACAC TGTCAACAGA GCTTTGATGG AAGATCCCAC TCTAGCAGCT GGTCTTATTA GAATGCACTT TCATGACTGC  TTCATTCAGG GATGTGATGG CTCAGTTTTG ATTGACTCCA CTAAGGATAA TACAGCAGAA AAGGATTCTC CAGGAAATTT GAGCCTGAGA GGGTTCGAAG TGATAGATGC TATCAAAGAA  CAGCTTGAAA TTCAATGCCC TGGTGTGGTT TCATGTGCTG ATATTCTGGC CATGGCTGCT AGAGATGCAG TTTTCTTTGC AGGAGGACCA GTATATGACA TACCTAAAGG AAGAAAGGAT  GGAAGAAGAT CCAAAATTGA GGATACTATC AATTTGCCAT TCCCTACTTT CAATGCCTCT GAGCTCATTA GGTCGTTTGC TCAACGTGGT TTTTCTGCAC AAGAGATGGT GGCTCTCTCT  GGGGCTCATA CACTAGGAGT GGCAAGTTGT GGTTCTTTCA AGAACCGGTT GAGCCAAGTG GATCCAACTC TGGATACAGA ATTTGGCAAG ACACTTGGGA GAACATGCAG TTCTGGTGAC  AACGCAAAGC AACCATTCGA TGCGACGAGT AACGATTTTG ACAACGTTTA CTTCAACGCT TTGCTGAGGA GAAACGGGGT TCTTACATCA GACCAAACAC TGTACACTAG CCCCAGAACC  AGGAACTTTG TGAACGCTTA TGCATTCAAC CAAGCCATGT TCTTTTTTGA TTTCCAACAA GCAATGGTGA AGATGGGTCT GCTTGATGTG AAAGACTATT ACAATGGTGA AGTACGACAA 
AATTGTCGCA AAATTAACTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGTACCCCAC TATGCAGTTG CCAACTATTC CCCACTATAT AAGGTTCTTA ATTTTTGGGT CTTGTATATA GCAAATAAAC CTCACTCCTC TCCCTACAAA CCCAGTATAT ATAAGTGTGT  GTGTTTTGTG AAGATGTTGT ACAAATCATG TGTGAGGCCT TCAAAGGTGG TCATGGCAAA CTTTGTTACA GTGTTGTTGC TAATTGAGGT GTTTGCATAT GGCTTCAGAT TCGGAGCAGA  TGGCTTGAAC ATGAACTACT ACTTGATGAG TTGTCCTTTC ATTGAACCTG TTGTTAAGAA CACTGTCAAC AGAGCTTTGA TGGAAGATCC CACTCTAGCA GCTGGTCTTA TTAGAATGCA  CTTTCATGAC TGCTTCATTC AGGGATGTGA TGGCTCAGTT TTGATTGACT CCACTAAGGA TAATACAGCA GAAAAGGATT CTCCAGGAAA TTTGAGCCTG AGAGGGTTCG AAGTGATAGA  TGCTATCAAA GAACAGCTTG AAATTCAATG CCCTGGTGTG GTTTCATGTG CTGATATTCT GGCCATGGCT GCTAGAGATG CAGTTTTCTT TGCAGGAGGA CCAGTATATG ACATACCTAA  AGGAAGAAAG GATGGAAGAA GATCCAAAAT TGAGGATACT ATCAATTTGC CATTCCCTAC TTTCAATGCC TCTGAGCTCA TTAGGTCGTT TGCTCAACGT GGTTTTTCTG CACAAGAGAT  GGTGGCTCTC TCTGGGGCTC ATACACTAGG AGTGGCAAGT TGTGGTTCTT TCAAGAACCG GTTGAGCCAA GTGGATCCAA CTCTGGATAC AGAATTTGGC AAGACACTTG GGAGAACATG  CAGTTCTGGT GACAACGCAA AGCAACCATT CGATGCGACG AGTAACGATT TTGACAACGT TTACTTCAAC GCTTTGCTGA GGAGAAACGG GGTTCTTACA TCAGACCAAA CACTGTACAC  TAGCCCCAGA ACCAGGAACT TTGTGAACGC TTATGCATTC AACCAAGCCA TGTTCTTTTT TGATTTCCAA CAAGCAATGG TGAAGATGGG TCTGCTTGAT GTGAAAGACT ATTACAATGG  TGAAGTACGA CAAAATTGTC GCAAAATTAA CTGAATAATC AATTGTGGGT TTGTGATTGT TTTAGCTTTA AGCCAAACCT CAATCCTTGC TACTACTTAA AACTACATGA TATGCATATT 
ATATGCTTAA CTAGCTAGCT CTATTTGGTA TCCTTGGGTG TATTGTATTC ATATTTATAG ATGTAATCCT TAATCATCAA TATATTTCCT ATATATCTCG CATGGAATAG TTACT 

Retrieve as FASTA