Entry information : LePrx71 (Solyc05g050880.2.1[2.3])
Entry ID 8350
Creation 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx71 (Solyc05g050880.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx71 (Solyc05g050880.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx71
start..stop
S start..stop
VvPrx35 498 6e-180 7..317 17..326
EguPrx23 493 8e-178 19..317 21..319
VvPrx34 493 9e-178 17..317 25..325
EcamPrx23 493 9e-178 19..317 21..319
Literature and cross-references LePrx71 (Solyc05g050880.2.1[2.3])
DNA ref. GenBank:   AEKE02009093.1 (14966..16649)
Protein sequence: LePrx71 (Solyc05g050880.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (294)
PWM (Da):   %s   33600.79 (31153.5) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   8.4 (8.40) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-317
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANMSFLLLL VIVPFVLIGM SSAQLTSNFY NSSCPNVLSI IKTAVNSAIA KESRMGASLL RLHFHDCFVN GCDASVLLDD TSSFTGEKTA NPNSGSLRGF DVIDTIKTQI ESSCAGVVSC  ADILAVAARD SVVKLGGPSW TVLLGRRDST TASLSNANSD IPAPTLNLSS LISSFSNKGF NTREMVALSG SHTIGQARCT TFRDRLHNET DINASFATSI KSKCPQSGSD NNVSPLDTTS 
PTTFDNIYYK NLRIQKGLLH SDQQLSSGGS TDSIVNTYSS NSATFLADFA KAMVKMGNLS PLTGTNGQIR KNCRKTN 

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Remarks Complete sequence from genomic (chromo 5, 3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAACA TGTCTTTTTT ACTATTACTA GTTATAGTCC CTTTTGTTCT TATTGGAATG AGCTCAGCTC AATTGACTTC CAATTTCTAT AATTCTTCAT GTCCAAATGT TCTTTCCATA  ATCAAAACAG CTGTCAATTC TGCTATCGCT AAGGAGTCTC GCATGGGAGC CTCTTTGCTT CGTCTTCATT TTCACGATTG CTTCGTTAAT GTAAGTTGTC TTACTTAATC TTCATATATG  CAGAGGTGAA ATCAGAATTT TTCAATTTCA TAAGAGGTCT TGATAAATTG TTTAAACATA TGGATTAATT TTGCAACACA AACACAAAAT TTGAACTCAA GCTACTGAAT CTGTCGAATA  ACGCGTTCAT GCATCCAAGG GTGGAGCAAG AGTGTAGACA AGGACTTCTA CTAATCGAAC TTAATAACTT TGGCTCTAAC TTTGTGTACA AATTATTAAT TTAAAACTTA ATAATTTAAA  ATAACAATTT CAAATTTATA AGCTTCGAAT TCGGCTTATG CCTCTATAAG TGTCGTGCAA ACAAAATTTT CCACATGACA ACTTATTTTA CTTATTTGAA CGTGCATGCA GGGTTGTGAT  GCATCTGTGT TATTAGATGA TACATCAAGT TTTACTGGAG AGAAGACGGC TAATCCCAAT AGTGGATCCT TAAGGGGATT CGATGTGATT GATACTATCA AAACTCAAAT TGAATCGTCA  TGTGCTGGTG TCGTATCTTG TGCTGATATT TTAGCTGTTG CAGCTAGAGA CTCTGTTGTT AAAGTAAGCT AACAATTTAA ATCGTGTAAC ATGCCTTACA AATTACAATA AATTAAAATA  CCAACTAGTA ACACACATCC TATTTAGTTT ATATTTAACT AATAGTTAGG AAAAGGAAAA GAAAACATGT TGACCTTTAT AGAAAGCTGA GCATTAGTCA AAGTTTGAAT ATACAAATTA  AATAATTGGA TGTTGTGCTT ATAAAGTGTA TAAATTAGTT GTTGAAACTA ATTATATTAT ATTGTTTATG ATTTGTTAGC TTGGTGGACC TAGTTGGACT GTATTACTTG GAAGAAGAGA  CTCAACCACT GCAAGTTTGA GTAACGCAAA TAGTGACATT CCTGCACCAA CTTTGAACTT AAGCAGTCTT ATTTCTTCTT TCTCTAACAA AGGTTTCAAT ACCAGAGAAA TGGTCGCTCT  CTCAGGTTTA TTTTTATATT TAAATATAAT TAATTTTTAA TTAATTTACG AGACTCATAG AAAATATGTT AAAATTGAAA TATCTTTGGA TTTGACAGGG TCTCACACGA TAGGACAAGC  AAGGTGCACT ACTTTTCGCG ATCGTCTACA CAACGAAACT GATATAAATG CTTCATTTGC AACATCGATT AAATCGAAAT GTCCACAAAG TGGAAGTGAC AATAATGTCT CTCCATTAGA  CACTACAAGC CCAACTACAT TTGATAATAT TTACTATAAG AATCTGCGAA TTCAAAAGGG TCTTCTTCAT TCTGACCAAC AACTCTCTAG TGGAGGCTCA ACAGACTCTA TAGTTAACAC  TTATAGTTCA AATTCAGCCA CTTTCTTAGC TGATTTTGCA AAAGCTATGG TGAAAATGGG TAATCTTAGC CCACTTACTG GAACCAACGG CCAAATTCGT AAAAATTGCA GGAAGACCAA 
TTAA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAACA TGTCTTTTTT ACTATTACTA GTTATAGTCC CTTTTGTTCT TATTGGAATG AGCTCAGCTC AATTGACTTC CAATTTCTAT AATTCTTCAT GTCCAAATGT TCTTTCCATA  ATCAAAACAG CTGTCAATTC TGCTATCGCT AAGGAGTCTC GCATGGGAGC CTCTTTGCTT CGTCTTCATT TTCACGATTG CTTCGTTAAT GGTTGTGATG CATCTGTGTT ATTAGATGAT  ACATCAAGTT TTACTGGAGA GAAGACGGCT AATCCCAATA GTGGATCCTT AAGGGGATTC GATGTGATTG ATACTATCAA AACTCAAATT GAATCGTCAT GTGCTGGTGT CGTATCTTGT  GCTGATATTT TAGCTGTTGC AGCTAGAGAC TCTGTTGTTA AACTTGGTGG ACCTAGTTGG ACTGTATTAC TTGGAAGAAG AGACTCAACC ACTGCAAGTT TGAGTAACGC AAATAGTGAC  ATTCCTGCAC CAACTTTGAA CTTAAGCAGT CTTATTTCTT CTTTCTCTAA CAAAGGTTTC AATACCAGAG AAATGGTCGC TCTCTCAGGG TCTCACACGA TAGGACAAGC AAGGTGCACT  ACTTTTCGCG ATCGTCTACA CAACGAAACT GATATAAATG CTTCATTTGC AACATCGATT AAATCGAAAT GTCCACAAAG TGGAAGTGAC AATAATGTCT CTCCATTAGA CACTACAAGC  CCAACTACAT TTGATAATAT TTACTATAAG AATCTGCGAA TTCAAAAGGG TCTTCTTCAT TCTGACCAAC AACTCTCTAG TGGAGGCTCA ACAGACTCTA TAGTTAACAC TTATAGTTCA 
AATTCAGCCA CTTTCTTAGC TGATTTTGCA AAAGCTATGG TGAAAATGGG TAATCTTAGC CCACTTACTG GAACCAACGG CCAAATTCGT AAAAATTGCA GGAAGACCAA TTAA 

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