Entry information : LePrx72 (Solyc03g025380.2.1[2.3])
Entry ID 8351
Creation 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx72 (Solyc03g025380.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx72 (Solyc03g025380.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx027]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx72
start..stop
S start..stop
StPrx24 592 0 1..320 1..319
LePrx87 521 0 1..320 1..319
PatrPrx01 512 0 13..320 10..316
PtPrx53 509 0 13..320 10..316
Literature and cross-references LePrx72 (Solyc03g025380.2.1[2.3])
DNA ref. GenBank:   BABP01036042.1 (17208..14819)
Protein sequence: LePrx72 (Solyc03g025380.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   320 (294)
PWM (Da):   %s   34242.08 (31374.6) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.26 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-320
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVSLNRNLIL AFLCVLLCFV VSFSNAQLSA NFYGTSCPNL QTIVRNAMTQ AVNREARLGA SILRLFFHDC FVNGCDASIL LDDTSTFIGE KNANPNRNSA RGYEVIDTIK TQVEAACPNV  ISCADILALA AREGTVLLGG PSWAVPLGRR DARTASQSAA NTQIPAPSSS LATLISMFSA KGLSARDMTA LSGSHTIGQA RCTTFRNRIY NDTNIDPQFA ATRRATCPAS GGDANLAPLD 
IQTPNRFDND YYQNLVVRRG LLHSDQELFN GGSQDALVRS YSNNGASFRS DFAAAMVKMG NISPLTGTNG EIRTNCRAIN 

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Remarks Complete sequence from genomic (chromo 3, introns 1 and 2).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGTCTC TAAATAGGAA CCTCATTTTG GCATTTTTGT GTGTTTTATT GTGCTTTGTT GTTAGCTTTA GCAATGCCCA ATTATCAGCC AATTTTTATG GGACGTCGTG CCCTAATCTG  CAGACAATTG TAAGAAATGC AATGACACAA GCTGTGAATA GAGAGGCCAG ACTTGGTGCC TCTATTCTTC GATTGTTCTT CCATGATTGC TTCGTTAACG TAAGCTTATT TCTATCTTCA  TTTTCATTGT TATCGATCAC AAAATATATC TTATTTATTA TGTGGAAACG ATTTTGTATT GTATCTAAAA CTCCGCAAAG CGGAAATTTA GTATATATGT GACATTTAAG AGTACTATTT  TTATCTATTG ATATAAAAGT ACACTCTTTT AATAAAATAC AACATATATT GATGAGTGGG GCCTATATAA TGTAGTATTA ATGTATACTT CCTCATTTGA GGTGGTACTT TTGGTTTATT  TTGTTAATTT GGATTTAATA TAAATATTTT TTAACTTTAT CCAAACATTT TAAAATTACT TAAAAGCTAT TTTGGCTTTA AAATATTTAA AATAAGTCAA TCCAAACGGA TACTATGCTA  CAATAGTTTC TTAGTTCATT TCTAACAGAA TAATAATTTT CTCTTGAAAT AGATATGAAT CTATAGTTAC TTAGATGTTA TTGTTATGAC ACACACACAC ATATATATAT GATCACAAAT  TTCAGAGTnC TTAATTGTAC TATTTTGTAA GTCCAACAGT GATTGACTTT TTTTTTAAAA TTAGTGTCCC GTAGGCTAAA AAGAGGTAGA AAATTATTTA TAAAATAAAT TCAGGGAGTA  ATAGAATCTT AATATAGTAT AAGTCTGTTT TTAAAATTTC AAACATAGAT TGAGGGAATA CTTGTGCACT TTTCTTAAAA ATTTGAAAGG AATATAATTC AGAAAGCATT TGCTTTATTC  TACTGTGTAA TTTTCTATTA CTTTTAGGGG TGCGATGCAT CAATACTACT GGATGACACA TCAACTTTTA TAGGAGAAAA GAATGCAAAT CCAAACAGAA ATTCAGCAAG AGGATATGAA  GTGATAGACA CCATTAAAAC TCAAGTTGAA GCTGCTTGTC CTAACGTTAT CTCTTGTGCG GATATTCTTG CTCTTGCTGC TCGAGAAGGC ACCGTACTGG TTAGTAATCC TTTTATCAAT  ACTGACCTCA CAATTTTCAT GCTTCCTTAT TTAGAAACAT TTAACTTTTA CGATGCTTTT ATTTTTTTCA CTTTGAAAAT AATATATATA TATATAAAAA AAAAAGTTTC ACAATAAAAC  ATGATGGCTA AATACATAAA TAAATCCTAA ACTTGTTTGG TTTTTTTCCT AAGGTACCTT AACTATGTCA TTTTCCTATT GAATCGTTGA ACCGCCGATA GTTTGTTCAT TTTAAACAAA  CACTGTTGGC TGATGTGAAA TCAAATTTTT GAAGGTACAT ATATTGTTCG AGAACTCATT AGTCCAATTA ACAATGAAAA TGTTCGAGAG TAATGATGTT TTATTTCAAG TCATTTGAAT  ATATTAGAAT ACAAGTGAAA CTAACACAGT TTGTCGTCAT TCTTTAGTAA AAAAAAATTA CAATACGAAC ACAATCGAAG ACATTTATAA TAGAATAGTC GATCAAAATC AACTAACGAT  GTTTAAAAGA AACAAATTAT GGGTGATTCA ATGATTTAAT AGAAAAATGA CGTAGTTGAG ATACCTAAGG ACAAAAATCT AACAAATTTA AGAATTTGTT TATGAATTCG ACCAAGCATG  ATTAATGTTA CATTTCCTGA ATTAATTTGT TTATGTAGCT TGGAGGGCCA TCATGGGCAG TGCCATTGGG CCGAAGAGAC GCAAGGACCG CGAGCCAAAG CGCCGCCAAC ACCCAAATCC  CCGCACCATC TTCCAGTCTT GCAACTTTAA TTTCCATGTT CTCCGCCAAA GGCCTAAGTG CGCGTGACAT GACGGCACTA TCCGGCAGCC ACACGATCGG CCAGGCTCGG TGCACCACTT  TCAGAAACCG GATCTACAAC GACACCAACA TCGACCCGCA GTTCGCCGCC ACGCGCAGGG CTACCTGCCC TGCTTCCGGC GGCGACGCCA ATTTGGCCCC GTTGGATATC CAGACTCCGA  ACCGGTTCGA TAATGATTAT TATCAGAACC TAGTGGTTCG GCGTGGGTTG CTTCACTCGG ATCAGGAATT GTTTAACGGT GGATCTCAGG ATGCGTTGGT GAGGAGTTAT AGTAACAATG 
GTGCGAGTTT TAGAAGTGAT TTTGCTGCAG CTATGGTGAA GATGGGGAAT ATTAGTCCAC TTACTGGAAC TAATGGAGAG ATTAGAACAA ACTGCAGGGC TATTAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGTCTC TAAATAGGAA CCTCATTTTG GCATTTTTGT GTGTTTTATT GTGCTTTGTT GTTAGCTTTA GCAATGCCCA ATTATCAGCC AATTTTTATG GGACGTCGTG CCCTAATCTG  CAGACAATTG TAAGAAATGC AATGACACAA GCTGTGAATA GAGAGGCCAG ACTTGGTGCC TCTATTCTTC GATTGTTCTT CCATGATTGC TTCGTTAACG GGTGCGATGC ATCAATACTA  CTGGATGACA CATCAACTTT TATAGGAGAA AAGAATGCAA ATCCAAACAG AAATTCAGCA AGAGGATATG AAGTGATAGA CACCATTAAA ACTCAAGTTG AAGCTGCTTG TCCTAACGTT  ATCTCTTGTG CGGATATTCT TGCTCTTGCT GCTCGAGAAG GCACCGTACT GCTTGGAGGG CCATCATGGG CAGTGCCATT GGGCCGAAGA GACGCAAGGA CCGCGAGCCA AAGCGCCGCC  AACACCCAAA TCCCCGCACC ATCTTCCAGT CTTGCAACTT TAATTTCCAT GTTCTCCGCC AAAGGCCTAA GTGCGCGTGA CATGACGGCA CTATCCGGCA GCCACACGAT CGGCCAGGCT  CGGTGCACCA CTTTCAGAAA CCGGATCTAC AACGACACCA ACATCGACCC GCAGTTCGCC GCCACGCGCA GGGCTACCTG CCCTGCTTCC GGCGGCGACG CCAATTTGGC CCCGTTGGAT  ATCCAGACTC CGAACCGGTT CGATAATGAT TATTATCAGA ACCTAGTGGT TCGGCGTGGG TTGCTTCACT CGGATCAGGA ATTGTTTAAC GGTGGATCTC AGGATGCGTT GGTGAGGAGT  TATAGTAACA ATGGTGCGAG TTTTAGAAGT GATTTTGCTG CAGCTATGGT GAAGATGGGG AATATTAGTC CACTTACTGG AACTAATGGA GAGATTAGAA CAAACTGCAG GGCTATTAAC 
TAA 

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