Entry information : LePrx73 (Solyc04g076770.2.1[2.3])
Entry ID 8352
Creation 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx73 (Solyc04g076770.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx73 (Solyc04g076770.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx73
start..stop
S start..stop
LePrx07 556 0 3..331 2..331
NtPrx05-1A 532 0 1..331 6..329
NtPrx05-1B 514 0 4..331 9..333
MguPrx15 491 2e-176 4..331 9..342
Literature and cross-references LePrx73 (Solyc04g076770.2.1[2.3])
DNA ref. GenBank:   AEKE02013155.1 (15504..12699)
Protein sequence: LePrx73 (Solyc04g076770.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (312)
PWM (Da):   %s   36476.68 (34553.7)  
PI (pH):   %s   8.25 (8.31) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSLGLVML FLSCAISQAF LVSSSNYGGL FPDLYQFSCP QANDIIWSFL EEAIAKDPRM AASLLRLHFH DCFVQGCDAS VLLDNSSEFK SEKEAGPNKN SLRGFEVIDQ VKAKLEQVCP  CTVSCADILA LAARDSVVLS GGPYWEVPLG RRDSKRAYFN KANVNIPAPN SKIQTLISLF NRQGLDEKDL VALSGAHTIG VARCVSFRQR LYNQTGDHLP DAILEKNYYN DLKSICPTSG 
GNNNISPLDI ASPNRFDNSY FKLLLLGKGL LNSDEVLLTG KVKKTQQLVK IYAENEAIFF HQFSKSMVKM GNISPLTELK GEIRKNCRRV N 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 4, 3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CTCTTGGACT AGTAATGTTA TTTTTATCTT GTGCAATATC CCAAGCTTTT CTAGTTTCTA GTTCCAATTA TGGTGGTCTT TTTCCAGATT TATACCAATT TTCATGCCCT  CAAGCAAATG ACATTATATG GTCTTTTTTG GAAGAGGCAA TTGCTAAAGA TCCAAGAATG GCTGCTTCTT TGCTACGACT TCATTTTCAC GACTGCTTTG TTCAGGTATA AACTTGTATA  CACATTTTCA TATACTTTAT TCAACTCGTA TACCATGGAA GTTAGCACTG TGAGGACATT ATAGCTAAAT AGATGATTTC TCATCTCATC ATTAGTATTA AGCGTGTTAA TCTCAATACT  TTCATTAAAG TGTTCATAGA GACTGGTTTT TTCATTAACT TATACTATCA TAGGTGAGTA CGTTTTGGTA ACATTTCCTT AGGCTTATTT GAGATTGCTC TCATCTTTTA CATTAGCCTC  ATATCATGTT GTCACCACAT TCATTAACAT TAGCACATTT GCTCTTCATT ATACTAAACT CATTTTATGT GAATGTTCAT TTCATCATAT ACCAATGGAC TTGTCCATTT AGTGTGTTTC  ACACTCTTAC TTAACCTTTC TTAGGTTTCA TCATTTCATT GTTCATTTCA TCATTTTTTG TTCATTTCAT CATTTTATTG TTCATTTCAT CATACGCCAA TGCGCTTGGC CATTTAGTGT  GTTTCACACT TTTACTTAAC CCTTTTAGGA TTTCATCATT TCATCACATA CATCTTAGGT TCACTTAGTT TTATACGTAT GCCAGACTTA TGAGTCTATA CATACAAGCC ATGGGGCTTC  ATTCATAGTT TGTCTAAGTG ATTCATAGTT ATATTTTTGA TTTATTCATT TTCTCGATAT TAACAGTTTG TCTCACTCCC GCCCCCACCC CATGCAAACC ATTAATAAAA AAAAATGTAA  ATTTGAACGT TTTATTGATA AGTACGATTT TTCTAATTTG CTAATTATAA CTTATGACTT GATACATAAG TTTAATTTTA AAATATTATG TCTTAATTAA AAAGAGCATA CACTTAGTTT  ATGCTTTAGA GTATGAACGT GAGCCTTTTA TAAGGCATAA AATACATGAA AAATTATGTC ATAAATAAAG ATACTTTAGA CAACATATTT TTATAAAATG AGCGGTATGT TGTTAAAAAA  TTAAATACCA CCAATTTGAT GAAAAAGAAA TATTAAAGAC CACCTCGAAA AAGGGACAGT CCATGCAAAA AACTTAGATG TATAAGATGG TAATTTTGGA CCTTTTTCTA GGTGCTAAAT  TTGGCAACAA CTCCAATAAT TTCATTTTTC GTGTTAGGGT TGTGATGCAT CTGTATTATT GGATAATAGT AGTGAATTCA AAAGTGAAAA GGAGGCTGGA CCAAACAAGA ATTCTCTGAG  AGGATTTGAA GTGATCGATC AAGTCAAAGC TAAATTAGAA CAAGTTTGTC CTTGCACTGT TTCTTGTGCT GATATTCTAG CCCTCGCTGC TCGTGATTCT GTCGTCTTGG TAAACATCTA  ACTTCAACAT TTCGTTCTCA TTTATGTTAC TTGGACTTTT TTATAATGTT GATTGAAGTG TGTCAGATTC TACGTATATT TTTAAAATAT CTTATATGGA TGCAACAATA ACAATAAATA  TTGATAGAAG TGTGTTAGAT TCTATAAAAT TCATGTATTT TTTTAAAAAA AATCTTATAG GGATACAACA ATAACAATTT TGGAGAGTCT GACCAACATA CTGTAACGAT TTTTAAGGTC  CCATTTGGAC ATGAGTTTTT TCTTCTCCTG AATTTTTTGA TGATGAGTTG TCCAAGTAAA AAATTCTTAC TTTTTCAAGT GAAATACATG TTCAAACATG ACTTCAACTT CAAATACTAT  TTTTTTTTCT AGGTTTTTAT TTCATATCAT GTCGGGTTAA TCTTACCTAT TGTAACTAAA TTTTACTCAT TATAACAATA AAATTACAAA AAGAAAAAGT AAAAATTTAC TATTACATTA  GAGTAACTAA ATTTTACTGT AATATATAGT AACAAAAAAG TACTAGTCAA TTCAAGATTT TTGCTAATAA GAATGTTATA TTTACACTTA ATATGTTGGA GTAGAGTGGT GGACCATATT  GGGAAGTGCC ACTAGGAAGA AGGGACTCAA AGAGAGCATA TTTCAACAAA GCAAATGTAA ATATTCCAGC ACCAAACTCA AAAATTCAAA CCCTCATAAG CCTCTTCAAT AGACAAGGCC  TTGATGAAAA AGACCTTGTT GCTCTTTCTG GTAAGCTTAA TTTTCAACCC GGGTTTTTGT GACACGAAAA AATGACTTTC TTCGTACTAA ACACACTCTC ATATGTTAAA CAGGAGCACA  CACCATTGGG GTGGCAAGAT GTGTGTCATT TAGACAAAGG CTATACAATC AAACAGGTGA TCATTTGCCA GATGCAATTC TAGAGAAAAA TTATTACAAT GATTTAAAAT CAATTTGTCC  AACAAGTGGT GGAAACAATA ATATTTCTCC TCTAGATATT GCATCACCAA ACAGATTTGA CAACTCATAT TTCAAGCTAT TGCTATTAGG CAAAGGTCTT TTGAACTCAG ATGAAGTACT  TCTTACTGGA AAGGTGAAAA AAACTCAGCA ATTGGTAAAG ATCTATGCTG AAAATGAGGC AATATTTTTC CATCAATTTT CTAAGTCTAT GGTCAAAATG GGGAATATTA GTCCCCTGAC 
CGAGTTGAAG GGTGAAATTA GAAAGAATTG TCGCAGAGTT AACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CTCTTGGACT AGTAATGTTA TTTTTATCTT GTGCAATATC CCAAGCTTTT CTAGTTTCTA GTTCCAATTA TGGTGGTCTT TTTCCAGATT TATACCAATT TTCATGCCCT  CAAGCAAATG ACATTATATG GTCTTTTTTG GAAGAGGCAA TTGCTAAAGA TCCAAGAATG GCTGCTTCTT TGCTACGACT TCATTTTCAC GACTGCTTTG TTCAGGGTTG TGATGCATCT  GTATTATTGG ATAATAGTAG TGAATTCAAA AGTGAAAAGG AGGCTGGACC AAACAAGAAT TCTCTGAGAG GATTTGAAGT GATCGATCAA GTCAAAGCTA AATTAGAACA AGTTTGTCCT  TGCACTGTTT CTTGTGCTGA TATTCTAGCC CTCGCTGCTC GTGATTCTGT CGTCTTGAGT GGTGGACCAT ATTGGGAAGT GCCACTAGGA AGAAGGGACT CAAAGAGAGC ATATTTCAAC  AAAGCAAATG TAAATATTCC AGCACCAAAC TCAAAAATTC AAACCCTCAT AAGCCTCTTC AATAGACAAG GCCTTGATGA AAAAGACCTT GTTGCTCTTT CTGGAGCACA CACCATTGGG  GTGGCAAGAT GTGTGTCATT TAGACAAAGG CTATACAATC AAACAGGTGA TCATTTGCCA GATGCAATTC TAGAGAAAAA TTATTACAAT GATTTAAAAT CAATTTGTCC AACAAGTGGT  GGAAACAATA ATATTTCTCC TCTAGATATT GCATCACCAA ACAGATTTGA CAACTCATAT TTCAAGCTAT TGCTATTAGG CAAAGGTCTT TTGAACTCAG ATGAAGTACT TCTTACTGGA  AAGGTGAAAA AAACTCAGCA ATTGGTAAAG ATCTATGCTG AAAATGAGGC AATATTTTTC CATCAATTTT CTAAGTCTAT GGTCAAAATG GGGAATATTA GTCCCCTGAC CGAGTTGAAG 
GGTGAAATTA GAAAGAATTG TCGCAGAGTT AACTAA 

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