Entry information : CroPrx05(CRO_T027228/ prx3 / cra_locus_11519_iso_4_len_1258_ver_3)
Entry ID 8398
Creation 2011-05-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-05-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx05(CRO_T027228/ prx3 / cra_locus_11519_iso_4_len_1258_ver_3)
Name CroPrx05(CRO_T027228/ prx3 / cra_locus_11519_iso_4_len_1258_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Flowers
Stems
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx05
start..stop
S start..stop
CclPrx07 491 7e-177 13..326 9..323
CsPrx15 491 7e-177 13..326 9..323
MePrx83 481 6e-173 18..326 5..316
VvPrx55 479 5e-172 7..326 2..321
Literature and cross-references CroPrx05(CRO_T027228/ prx3 / cra_locus_11519_iso_4_len_1258_ver_3)
Literature Kumar S, Jaggi M, Taneja J, et al. Cloning and characterization of two new Class III peroxidase genes from Catharanthus roseus . PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY. 2011
mRNA ref. GenBank:   EF661875.2
Protein sequence: CroPrx05(CRO_T027228/ prx3 / cra_locus_11519_iso_4_len_1258_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (296)
PWM (Da):   %s   34781.47 (31705.0) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.93 (9.06) Peptide Signal:   %s   cut: 35 range:35-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSSSSSSN FGIVIMVIVL SIIMMRSCSG QLSSEFYSKT CPQVYNTVRK GVESAVSKEK RMGASLLRLH FHDCFVQGCD GSILLDDTSS LRGEKTAGPN VGSVRGFEVV DNIKSDVEKV  CPGVVSCADI LAIAARDSVV ALGGPSWNVK VGRRDSKTAS LSGANSRIPP PTSTLRNLIS SFQAVGLSAK DMVVLSGSHT IGQARCTIFR ARIYNESNIE TSFARTRQGN CPLPTGNGDN 
SLAPLDLQSP NGFDINYYKN LINKKGLLHS DQELYNGGST NSLVETYGKD TKAFYSDFAA AMIKMGDISP LTGSNGEVRK NCRRVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic 1 mRNA. cra_locus_11519_iso_4_len_1258_ver_3 (PS is missiing). Incorrect prediction from MPGR (fusion of 3 ORFs).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CTTCTTCTTC TTCCTCTAAT TTTGGCATTG TTATAATGGT TATTGTGTTG TCAATAATAA TGATGAGAAG TTGTTCTGGG CAGCTTTCAA GTGAATTTTA TTCTAAGACA  TGTCCCCAAG TTTATAATAC AGTGAGAAAA GGGGTTGAAT CAGCTGTTTC CAAGGAAAAA CGCATGGGTG CTTCCCTCCT TCGCCTCCAT TTTCACGATT GCTTTGTTCA AGTAATGCTT  AATTTTTGTT CAAGTTTTTT TTTTTTTTTG GGTGCATTTT TAATCTTTGC TTCTTCACAT ATCAGTTTAG CTAGTTTAAG CCTGTATCTC CTGATACTCC AGTTTCACAT AATAATAATA  ATAATAATAA TAATAATAAA TAATAATAAT AAAATGAGTG TTGTATATAT ATAATTAATG AATAGTATAT GGTCTAAGCA TTTTTTCAAT AATTTTAAAA TATATTTTGA TATAACAAAT  CCATTATATA TATTATATGT AATAGGGAGT AAATGAGTAA AGTCGTTCGT GAACCGTTAC GATTAAAACT TGATTCGAGT TTATTGTTAA TCAAACTCGA GTTAAACAAT CGAATCGAAT  TCAAGTTTTC ATAAAACTGA TTTTGACGGC TCGTCAATGC ATATATATAA TTTTTTATTT TTAATAATAT ATATACTTTT TTATAAAAAA AAATATGTAT AAATAAAAAA CACATTCGAA  ATCGGCTTGA CTTCTCCTTA ATGCATTTTA AATAAGAAAT AGTAGTTATT TTTTTAATTA ATAAAAATGC ATAAATGTTA CTAACTCATA AGCGCATGCA CAGTTAAACT TGCGTCTGAG  AATGGTAAAT TCTCATTATA TATACAGGGA CAGAACCATA GGGCTCGGAT GGGCTCAAGT CCTCCAAAAA ATTTTAAAAA CTTTAGAATT TTTAAGTATT TTACTTTTAA ATCTTTCAGT  TTTTTTTAAT ACAATCTCAA AACTTGTTAT TTTATTTATA AATTTGGCAT TGTTTGAATA GTTTTGTACT TGGAATGCAT CTATAAAATA AAGAAATTCT AACAAAATTT TTATTGTTAT  TCAGTCTCCA AACATTTTTG TCTTGGTTGC ATCCTCATAT ATAATATATA ATATATATAT ATATATACAG ACCATGCAGG ATTGAAAAGT CAGAAGATTT GGCATAGAAA TATACAGTCA  AAGAAGAAGA TATAGGAGGA CTCAGCCTAT GATTTGGGGT CCTAAAATAA AAACCAACTT ACTACAAGAA ATCCATGCTT AAATTAATTA AACCAGAACG TTAATATTAA CTAATGATTG  AAGAAATAAT CATTTGCTTG TCTCAGTCCA AGAGAAAACA GAGAATATAT TATTATTAGT ATTCAATGAT GAGCAATACG GTATAAAAAT TGTCTTGATC ACATTTCATC AAGACTAATT  TGTGCTCAAT AATAATTAAT ATTTCTAATT ATACATTGTC TGAATTATAT ATACATGTAG GGTTGCGATG GATCCATACT ATTGGACGAT ACATCTTCTT TGAGAGGGGA AAAAACTGCC  GGTCCTAACG TCGGTTCTGT TCGAGGATTC GAAGTGGTCG ACAATATCAA ATCCGATGTA GAGAAAGTAT GTCCAGGTGT GGTCTCCTGT GCTGATATTC TTGCCATTGC TGCCCGTGAT  TCAGTGGTCG CTGTAAGTCT CTCTTTCTTC TTCTTGATTA AACCAACCAT ATACTGGTAG TATTTGCGAA AATATTCAAT GATCGATGAA TAAATATATG TATATAGTTG GGAGGGCCAA  GTTGGAACGT TAAAGTAGGA AGAAGAGACT CGAAAACAGC CAGTTTATCA GGTGCCAATA GCCGGATTCC GCCACCAACT TCTACCCTCC GGAACCTCAT CAGCAGCTTC CAAGCTGTGG  GTCTTTCGGC TAAAGATATG GTCGTCTTAT CAGGTAATTA GTTCTTCCTT ATATTCAACA ATCAAGAAAA CATACACAAG CTAGAATTAA TTAATTTTTG CAAAATTCTT CTAAAATGCC  TTTATATTAT TTACTCAAGT TGTATGTAGT GAACTCTTAA ACTAAAACAT GCACTAAAAG ATAGCCCGCC ACCACAAAAT ACAGCGGTGC CACTCTAAAT AGCTTATGTG CGGCTAAAAG  GAAAAATTTG GAGGGGAAAT TTTTTTATAC AAGATTTTAA TTTAAGGGAA AAAACTAAAA AAAATAAGTT TATTAATAAA ATGAATGCCA TTTAAGTGGA TAGTATACGG GTATTTTAAG  AGAATTGACA TTTTACCTCT ACAAATCATC TCATGAATGG CACATAAGCT GTTTAGGGTA GCTTGTGGTG GCGGACCACT TTTTTTCTCA TGATTTTAGT TTGGGGTAAA AAAATAAAAT  GGGTTCAAGA GAAGAATACA ACTTAGTAAA TAATATAGGG ACATTTTTAG AGAATTTTCC TTTATTTTCG AAAGGGTTAG ACGGATGAAT TCAAAGAAAA TATATTTGAA AACATAAAAA  CTAAAATTCC TAAAAGAAAT AGTTCTATTA CATATCAATA TCCATATAAC AAAACTTTGT ACTTTTTGAA TTATATTAAG TCACGACAAT ATCTCTCTAT TTGTATTAAA GAAGAAATAA  TATATTAATA AAATGAATAA CGGAACTTAA TATAATCCAA AAAAATTCAT ATTCTAATCC ATAACTATTT CCAATCTTAT GAACAATATA TATGCAGGAT CACACACAAT TGGTCAAGCA  AGGTGCACAA TATTCAGGGC TAGAATATAC AACGAAAGCA ACATAGAGAC ATCTTTTGCA AGAACCAGAC AAGGAAATTG TCCATTACCA ACAGGAAACG GTGACAATAG TTTGGCTCCT  TTGGATCTTC AAAGTCCTAA TGGTTTCGAC ATTAACTACT ACAAGAATCT AATAAACAAA AAAGGCCTTC TTCACTCTGA TCAAGAACTC TATAATGGTG GCTCTACAAA TTCTCTTGTT  GAAACTTATG GCAAGGACAC AAAGGCATTC TACTCTGATT TTGCTGCCGC CATGATCAAG ATGGGAGATA TTAGTCCTTT GACTGGTTCA AATGGAGAGG TTAGGAAAAA TTGTAGGAGG 
GTTAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CTTCTTCTTC TTCCTCTAAT TTTGGCATTG TTATAATGGT TATTGTGTTG TCAATAATAA TGATGAGAAG TTGTTCTGGG CAGCTTTCAA GTGAATTTTA TTCTAAGACA  TGTCCCCAAG TTTATAATAC AGTGAGAAAA GGGGTTGAAT CAGCTGTTTC CAAGGAAAAA CGCATGGGTG CTTCCCTCCT TCGCCTCCAT TTTCACGATT GCTTTGTTCA AGGTTGCGAT  GGATCCATAC TATTGGACGA TACATCTTCT TTGAGAGGGG AAAAAACTGC CGGTCCTAAC GTCGGTTCTG TTCGAGGATT CGAAGTGGTC GACAATATCA AATCCGATGT AGAGAAAGTA  TGTCCAGGTG TGGTCTCCTG TGCTGATATT CTTGCCATTG CTGCCCGTGA TTCAGTGGTC GCTTTGGGAG GGCCAAGTTG GAACGTTAAA GTAGGAAGAA GAGACTCGAA AACAGCCAGT  TTATCAGGTG CCAATAGCCG GATTCCGCCA CCAACTTCTA CCCTCCGGAA CCTCATCAGC AGCTTCCAAG CTGTGGGTCT TTCGGCTAAA GATATGGTCG TCTTATCAGG ATCACACACA  ATTGGTCAAG CAAGGTGCAC AATATTCAGG GCTAGAATAT ACAACGAAAG CAACATAGAG ACATCTTTTG CAAGAACCAG ACAAGGAAAT TGTCCATTAC CAACAGGAAA CGGTGACAAT  AGTTTGGCTC CTTTGGATCT TCAAAGTCCT AATGGTTTCG ACATTAACTA CTACAAGAAT CTAATAAACA AAAAAGGCCT TCTTCACTCT GATCAAGAAC TCTATAATGG TGGCTCTACA  AATTCTCTTG TTGAAACTTA TGGCAAGGAC ACAAAGGCAT TCTACTCTGA TTTTGCTGCC GCCATGATCA AGATGGGAGA TATTAGTCCT TTGACTGGTT CAAATGGAGA GGTTAGGAAA 
AATTGTAGGA GGGTTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAGCTAATAA AGTCTCTCGA TCAAAGGCAA AAATGGCTTC TTCTTCTTCT TCTTCCTCTA ATTTTGGCAT TGTTATAATG GTTATTGTGT TGTCAATAAT AATGATGAGA AGTTGTTCTG  GGCAGCTTTC AAGTGAATTT TATTCTAAGA CATGTCCCCA AGTTTATAAT ACAGTGAGAA AAGGGGTTGA ATCAGCTGTT TCCAAGGAAA AACGCATGGG TGCTTCCCTC CTTCGCCTCC  ATTTTCACGA TTGCTTTGTT CAAGGTTGCG ATGGATCCAT ACTATTGGAC GATACATCTT CTTTGAGAGG GGAAAAAACT GCCGGTCCTA ACGTCGGTTC TGTTCGAGGA TTCGAAGTGG  TCGACAATAT CAAATCCGAT GTAGAGAAAG TATGTCCAGG TGTGGTCTCC TGTGCTGATA TTCTTGCCAT TGCTGCCCGT GATTCAGTGG TCGCTTTGGG AGGGCCAAGT TGGAACGTTA  AAGTAGGAAG AAGAGACTCG AAAACAGCCA GTTTATCAGG TGCCAATAGC CGGATTCCGC CACCAACTTC TACCCTCCGG AACCTCATCA GCAGCTTCCA AGCTGTGGGT CTTTCGGCTA  AAGATATGGT CGTCTTATCA GGATCACACA CAATTGGTCA AGCAAGGTGC ACAATATTCA GGGCTAGAAT ATACAACGAA AGCAACATAG AGACATCTTT TGCAAGAACC AGACAAGGAA  ATTGTCCATT ACCAACAGGA AACGGTGACA ATAGTTTGGC TCCTTTGGAT CTTCAAAGTC CTAATGGTTT CGACATTAAC TACTACAAGA ATCTAATAAA CAAAAAAGGC CTTCTTCACT  CTGATCAAGA ACTCTATAAT GGTGGCTCTA CAAATTCTCT TGTTGAAACT TATGGCAAGG ACACAAAGGC ATTCTACTCT GATTTTGCTG CCGCCATGAT CAAGATGGGA GATATTAGTC  CTTTGACTGG TTCAAATGGA GAGGTTAGGA AAAATTGTAG GAGGGTTAAT TGATTTTGAC AGAATATTAT GTTGTCTCGT GTTTGGAATT TTAAGGATAG TTTTTTGATT AATTTTTGGT  TTTGATTTTG TTTGTTATTG TTGTTTGGTT TGTTTTTTTC AAATGATTTT AATTATGTCC TGCTTCTCCT GTGTAAGATT GAGGGCAGAT TAAGTGTAAT TACTTTATTG GAAACACCAA 
GTTTCAATAA AGTTGCTCTG A 

Retrieve as FASTA