Entry information : CroPrx04(prx4 / CRO_T017171 / cra_locus_5185_iso_2_len_1253_ver_3)
Entry ID 8399
Creation 2011-05-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx04(prx4 / CRO_T017171 / cra_locus_5185_iso_2_len_1253_ver_3)
Name CroPrx04(prx4 / CRO_T017171 / cra_locus_5185_iso_2_len_1253_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Stems
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx04
start..stop
S start..stop
NtPrx11-1A 527 0 1..320 1..321
NtPrx78-1A 526 0 12..320 11..319
GmPrx158 523 0 5..320 7..320
GmPrx328 522 0 5..320 7..320
Literature and cross-references CroPrx04(prx4 / CRO_T017171 / cra_locus_5185_iso_2_len_1253_ver_3)
Literature Kumar S, Jaggi M, Taneja J, et al. Cloning and characterization of two new Class III peroxidase genes from Catharanthus roseus . PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY. 2011
Protein sequence: CroPrx04(prx4 / CRO_T017171 / cra_locus_5185_iso_2_len_1253_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   320 (297)
PWM (Da):   %s   34268.17 (31751.8)  
PI (pH):   %s   9.09 (8.93) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-320
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALVRYNYSL GIFLLFLIGS SSAQLSTDYY SKSCPNVFNT VKSQVHSAIL KEARMGASLL RLFFHDCFVN GCDGSILLDD TSSFTGEKRA APNFNSARGF EVVDNIKSAV ENVCPGVVSC  ADILAIAARD SVQILGGPSW NVKLGRRDAT TASQAAANNS IPPPTSNLNA LVSRFNALGL STNDLVALSG SHTIGQARCT NFRARIYNET NNLDAALAQT RRSNCPRPSG SGDNNLAPLD 
LQTPRAFDNN YYKNLVNRRG LLHSDQQLFN GGSTDSIVRS YSGNPASFAS DFAAAMIKMG DISPLTGSNG QIRKNCRRIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and mRNA.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTAG TTCCTTATAA TTATTCTTTG GGGATATTTT TGTTGTTTCT AATTGGAAGC TCTTCAGCTC AGCTTTCCAC TGATTATTAC TCTAAATCTT GTCCAAATGT TTTCAATACG  GTGAAATCCC AAGTCCACTC TGCTATTTTG AAAGAAGCCC GAATGGGAGC CTCCCTCCTT CGCTTGTTCT TCCATGATTG CTTTGTCAAT GTAATTTACC TTACTCTACT TACTATTTGC  TTACTTACCC AAATTTTCCC TGTTTCATCA TTTTTATATT CTCTCAAAAT GGCCAAGTTA CAAACTTAAA TGCTACTTTT CCATGCAGCA TTTATAGATT TTTTTCGTGA AAAAAAAAAA  AAAGAGCTAG ACTTGTTCTA TACAATTAAT GATCCTGCTG ATGGTAAATT TTCAGCCGTG CTCGACACGG CAACAGTTGA GTAATTTTTT TAATACTCTC TAGCTAGACT CATTCATAAT  CAAACCAGTT AGGCTTATTC TTTATTATTT AAAATAATTA ATTTTTTATT TATTTTAAGT TATAAATTAT TTTTGACTTT TAGTTTAAAA TAAGTTGAAA ATTTTATTTT TCAAAGTATT  AATACTTTTT TAAATTACTT CTATTTATTG AAGCTATTAA CATTAAAAAT ATTAAAATAA TTTTTTTAAA AAGTACTTTT TTAAGCTGTT TAAAAAAAAA AGTAAAGTGA TGAAAAAACT  ACCCTTATTT TAATTCAATT TCACAACATT TGAATTATTT GTTAAAATAA AAAATATATA GATAACTTAA CTAGATATTT CGAGTTTAAA TTCTGAAAAT ATTAAATTGT GTGCATGACT  ACTTAAAAAT GCCTTCAATG TACGACGTAT TAATACGCTT AGAAGAATAT TGAATGGTCA TAGCATAATT CTTTTTCTAG TGATAAAATT AAAATTTTGC ATATTATATA TACTATGAAT  TTCAGGGCTG CGATGGATCC ATCCTGCTTG ATGACACATC TTCATTCACC GGGGAGAAAA GAGCCGCTCC TAATTTCAAC TCCGCTAGGG GATTTGAGGT GGTTGACAAC ATTAAATCCG  CCGTGGAAAA TGTTTGTCCG GGCGTTGTCT CTTGTGCCGA CATCCTCGCC ATTGCAGCTC GGGACTCTGT CCAAATTGTA AGTTCCTTCC ATGATGCTAA ATAATTAATA TTAACGTACC  ATATCAATCA AATTAATTCG AGTGAATTAT GTTTTTTTAA TTTCTTGTGT GGTAATTAGT TGGGTGGGCC TAGCTGGAAT GTGAAACTTG GAAGAAGAGA TGCAACAACT GCAAGCCAAG  CTGCTGCTAA CAATAGCATT CCTCCTCCTA CTTCTAACCT TAATGCCCTC GTCTCCAGAT TCAACGCTCT TGGTCTTTCA ACCAATGACC TCGTCGCTTT ATCCGGTATA TATTAAGTTA  ACATGCGACA TCTTAAACTC ACTCGATATG CCATGTGAAA ATAGTTAAAG TGAGGAATAG ACAATATTAA ACTACACACC TTGTCATCAT GTTCCGGATA TTTTTTAACA TTCTTAATAA  TAGTTTGGTT TGGAAAATTC TTACAGGTTC CCACACGATT GGACAAGCGA GATGCACGAA TTTCAGGGCA CGTATATACA ACGAAACAAA CAATTTGGAC GCAGCTTTAG CTCAAACAAG  AAGAAGCAAC TGTCCGAGGC CTAGTGGCTC AGGTGACAAC AATTTGGCAC CTCTTGATCT CCAAACACCA AGAGCTTTTG ACAATAATTA TTACAAGAAC CTTGTCAATC GAAGAGGTTT  GCTTCACTCT GATCAGCAGC TATTTAATGG CGGATCAACT GATTCCATAG TCAGATCATA CAGCGGAAAC CCTGCTTCTT TTGCTTCTGA TTTTGCTGCA GCCATGATTA AGATGGGTGA 
TATTAGTCCT CTCACTGGAT CTAATGGGCA GATAAGGAAG AACTGCAGGA GAATCAATTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTAG TTCGTTATAA TTATTCTTTG GGGATATTTT TGTTGTTTCT AATTGGAAGC TCTTCAGCTC AGCTTTCCAC TGATTATTAC TCTAAATCTT GTCCAAATGT TTTCAATACG  GTGAAATCCC AAGTCCACTC TGCTATTTTG AAAGAAGCCC GAATGGGAGC CTCCCTCCTT CGCTTGTTCT TCCATGATTG CTTTGTCAAT GGCTGCGATG GATCCATCCT GCTTGATGAC  ACATCTTCAT TCACCGGGGA GAAAAGAGCC GCTCCTAATT TCAACTCCGC TAGGGGATTT GAGGTGGTTG ACAACATTAA ATCCGCCGTG GAAAATGTTT GTCCGGGCGT TGTCTCTTGT  GCCGACATCC TCGCCATTGC AGCTCGGGAC TCTGTCCAAA TTTTGGGTGG GCCTAGCTGG AATGTGAAAC TTGGAAGAAG AGATGCAACA ACTGCAAGCC AAGCTGCTGC TAACAATAGC  ATTCCTCCTC CTACTTCTAA CCTTAATGCC CTCGTCTCCA GATTCAACGC TCTTGGTCTT TCAACCAATG ACCTCGTCGC TTTATCCGGT TCCCACACGA TTGGACAAGC GAGATGCACG  AATTTCAGGG CACGTATATA CAACGAAACA AACAATTTGG ACGCAGCTTT AGCTCAAACA AGAAGAAGCA ACTGTCCGAG GCCTAGTGGC TCAGGTGACA ACAATTTGGC ACCTCTTGAT  CTCCAAACAC CAAGAGCTTT TGACAATAAT TATTACAAGA ACCTTGTCAA TCGAAGAGGT TTGCTTCACT CTGATCAGCA GCTATTTAAT GGCGGATCAA CTGATTCCAT AGTCAGATCA  TACAGCGGAA ACCCTGCTTC TTTTGCTTCT GATTTTGCTG CAGCCATGAT TAAGATGGGT GATATTAGTC CTCTCACTGG ATCTAATGGG CAGATAAGGA AGAACTGCAG GAGAATCAAT 
TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCCTCATGTA TGATGTTAAA TTGCAAGCGG CCGGGGGGCA AAACAGAAGC ATTTTTTTCT TCTTTGGCTT AATTAATCAA TAGGGCAAAA TGGCTTTAGT TCGTTATAAT TATTCTTTGG  GGATATTTTT GTTGTTTCTA ATTGGAAGCT CTTCAGCTCA GCTTTCCACT GATTATTACT CTAAATCTTG TCCAAATGTT TTCAATACGG TGAAATCCCA AGTCCACTCT GCTATTTTGA  AAGAAGCCCG AATGGGAGCC TCCCTCCTTC GCTTGTTCTT CCATGATTGC TTTGTCAATG GCTGCGATGG ATCCATCCTG CTTGATGACA CATCTTCATT CACCGGGGAG AAAAGAGCCG  CTCCTAATTT CAACTCCGCT AGGGGATTTG AGGTGGTTGA CAACATTAAA TCCGCCGTGG AAAATGTTTG TCCGGGCGTT GTCTCTTGTG CCGACATCCT CGCCATTGCA GCTCGGGACT  CTGTCCAAAT TTTGGGTGGG CCTAGCTGGA ATGTGAAACT TGGAAGAAGA GATGCAACAA CTGCAAGCCA AGCTGCTGCT AACAATAGCA TTCCTCCTCC TACTTCTAAC CTTAATGCCC  TCGTCTCCAG ATTCAACGCT CTTGGTCTTT CAACCAATGA CCTCGTCGCT TTATCCGGTT CCCACACGAT TGGACAAGCG AGATGCACGA ATTTCAGGGC ACGTATATAC AACGAAACAA  ACAATTTGGA CGCAGCTTTA GCTCAAACAA GAAGAAGCAA CTGTCCGAGG CCTAGTGGCT CAGGTGACAA CAATTTGGCA CCTCTTGATC TCCAAACACC AAGAGCTTTT GACAATAATT  ATTACAAGAA CCTTGTCAAT CGAAGAGGTT TGCTTCACTC TGATCAGCAG CTATTTAATG GCGGATCAAC TGATTCCATA GTCAGATCAT ACAGCGGAAA CCCTGCTTCT TTTGCTTCTG  ATTTTGCTGC AGCCATGATT AAGATGGGTG ATATTAGTCC TCTCACTGGA TCTAATGGGC AGATAAGGAA GAACTGCAGG AGAATCAATT AATTTATTAA AATCCTTTTC TTTTAAGATT  ATCTTTATGT TATTTTCTTG TTTTCTAATG TCTTAAGAGT GTTTAATTTA TATCCCAATG TCAAAGTTCA TGTGGTGCAT TTTTCATTTT TTCTTTTTTT CTATTTTCTG GTTTTGGAAG 
AAGTTCCATC ATCACTTGTG CTATTTCGTT CAAAAAAATA CTCCCAATTG TCC 

Retrieve as FASTA