Entry information : EglAPx-R
Entry ID 8436
Creation 2011-08-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-08-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Qiang Li
Last annotation changes 2012-05-18 (Qiang Li)
Peroxidase information: EglAPx-R
Name EglAPx-R
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglAPx-R
start..stop
S start..stop
EguAPx-R 692 0 1..342 1..342
EgrAPx-R 691 0 1..342 1..342
EcamAPx-R 665 0 1..342 1..341
CsAPx-R 452 4e-161 16..342 10..335
Literature and cross-references EglAPx-R
Protein sequence: EglAPx-R
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   342
PWM (Da):   %s   36249.36  
PI (pH):   %s   7.54
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASPSPSTTH LSPLTCxxSS SSLSSHHSSR RTKFEFPANS QRSSPSPIAS RAGAIASPSS STPGAASSGD HAPVRGRSVA GLAATLPFLL QLRGYTEGIV ADAAELDNDE YTMIKEEVRK  VVSKVKAAGV LRLVFHDAGT FEMGENSGGM NGSIVYELER PENAGLKKPV KILEKAKGEV DAKRPVSWAD MIAVAGAEAV SVCGGPTIPV VLGRLDSMKP DPEGRLPEET LDALGLKQCF 
QRKGLSTQEL VALSGAHTLG SKGFGNPVVF DNSYYKVLLE KPWMSSAGMP SMIGLPSDRA LVEDNECLRW IEKYANDQNL FFKDFENAYV KLVNSGARWR SL 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnCACCC CTCTTCTCGC AGGCCAAAAT TCGAATCCCC CGCCAATTCC  CAACGGTCTT CTCCCTCCCC CATCGCCTCT Cnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnCCCCG TGCGCAGTCG ATGTTTCGCG  AATCCGGTCG ATCGCGATCT TTCGGAGCAC GCAGCTGGAG ACCGCGTCCC Gnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnCG GCCACATTGC CGTTTCTCCT TCAGCTGMGC  GGTTMCMCGG RGGGAAYCGY CGCCGACGCC GCCGAGTAAG CTCGACGCTC TTTGCTTGAC GAAAGTCCAT GTCTTTATTG GTTGGAACGA ATGAAACGGG AATTTCGAGG GAGATTGAGA  TGCTTTTGAG CTTTGGAGTT GAGCCTGCGG AGCGAAAGAA GGCTATGCGT TTTCGTCGGT GGTCGGWTTA TGGGTTTTGC AGCTGCTTCT TCCGGKGATC AGTTTGTGTG TATGTGTGCA  TGCTACGGAG TTGTCCCGCC GAAATGACGC TTTTTGCTTC CTTTRAAGGA CTTRCTTGCC GTTTAAAGTA GGAGGTCCAG GTGTGGTCCT TCGGATTATG AGATTTTAGT TTGTGTTTCC  KGSTKGYWCA TTCACTGACT TCCTGGRTTT TAGTATCTGT AAGCTGTAAC TGTGAATTGT CTTGTTTCTC AACATTGATG TTATGGACAC CGCATTCAGC TGGGGAAAAA CCATTTTGGG  TGATGGTTTG ATGGGTCGAA ATTGCGATTC GGAAGTACTA TTCGGATAGG GCTGTGAGTT TGATATTTTG TTTATCGTGA CCTTGGGGCT GCATCTGTAT TTGTGTTGAC TTGGGGCATT  TGGATATGTC CATGACTGTT GGTTTTTCAT GTTCGTATAT CAAAGATTAG ATAATGATGA ATACACGATG ATAAAGGAAG AGGTCAGAAA GGTAGTTTCC AAGGTGAAGG CTGCTGGKGT  GCTTCGTTTG GTATTTCATG ATGCTGGAAC CTTTGAAATG GGTGAAAACT CAGGTATTTT ACATGGACAG CAAGTTAAAG TTTTACAAAT AATGATACTC GACATCAGTA ACTGTGCTCC  ATATCTCTGG CTACAATTTT TGAATGCCTA CTAATCGATC CAAATTGTTT TATCCTCTTT TCCCCATAAT TGAACTTTTG AGCTGAAGCT AAGATGATGC ATATATTGAT TTTATCTGAA  TTAGGGGGAT ATAGCTCTCA TTTGCCAAAA AAGTTAGATA ATCCCTGTAA ATGGGCATAA CTTTTTTTTG TCATGGTGGT TTACTAAATG AACAAGGGCA AGTAATTCTA TGACTGTTAA  AGCAACTACA GACTCTAATG GACCTTTATA AATGAATGAT CAATCATAGA GAGCAGTATC ATTCATACTA CCTGTATTTG TGAACTAATG GTCATGTCCG ATTCTTTTAA TGCATGCACA  TACTTCTTTT GAGTTGAAAA TTTTCTGCGT CATGCTTTTT TGTCTGAGTA TGGATTTCAA TCCTCATATT GTAATTCTAA TATGTTTTTG TGTCAATATC CAGGTGGTAT GAATGGTTCC  ATAGTTTATG AACTTGAAAG GCCCGAAAAT GCTGGGCTAA AAAAGCCTGT GAAGGTATGT TTTCTTTTAT TACATCCTCA AGCTTAGCAT CCATTCTGGA GATGCAACAT TTCATTTCAA  CTGGTGTACT CCCTCATGCA TTTCTGGACT GCTAGAAGTT CCTGTGTCTT ATGTCTAGAA CAGTCAACTC CGGTTCATCT TCAGGCTAAC TCGTCAGTCA TTGTGTTGTT GTTTAGATAC  TAGAGAAAGC AAAGGGKGAG GKGGATGCAA AGAGACCAGG TGATTTTTTT GAGTGTTATA TTCTATATGC TGATGGTATG ATTGTGGTGA TATAGATGGA ACTTTCCTCT CTCAGTATCC  TGGGCARACA TGATAGCTGT GGCTGGRGCT GAAGCAGTTT CTGTTTGTGG AGGTCCAACT ATTCCAGTTG TTCTGGGCAG ACTTGACTCA ATGTAAGAAG CTATTTCCAA TTCAATTACT  ACTGTTCTGA AGATGCGTTG ATGGCAGACA AAACATTATT TCACTCATTT AGTATTGTCA GCATTGCAAG ATTCTTTGCA TGTCTCCATC TTTGTGCATA GTCCCAAGCT AATATTGGTT  TGGTTTCATT TCTTTATTGA AGGAAGCCTG ATCCTGAAGG AAGACTTCCC GAAGAAACTC TTGATGCTTT GGGTTTAAAG CAGTGTTTTC AGAGGAAGGG CTTATCGTGA GTTGCTATCC  CATGTACATG TTGAATGATG CTTGCAAATT AAATGAAGTA TTGTTTATTG ACTATTGCAT ATTGTTATGC ATCTTACTGC TGATGGTTAA ACTGTTTAAT AGATATTTCA CCAGTCAACA  TAGAATTGGT TGTTTAGTCA ACTGTGATAC ATTATGTTTT GCAATTTCAG GATGATAGAT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnAGCAAG ACAACTATGC TTCCTTCTGT GSMAATAAGC ATTCCTTCTT TGTTTTTCCC CTCCATTCCA AAAAAATTAT GCCCCCTCTA TGAGTTATTA TTCTGACAGT  ATTAGCTGCA TGATTACAAA AATGAAGCTT TCAAAACAGA CTAAGAACAT GTTTGATTGT TCCTGCTATG GACTCTKTTT GATTTTTTTT TGCTATAGAA ATCTGTCCTT TCAGTTTCTT  ACACTATTCT GTAGTTTCTT CTCTCAGCAA AAGGAACATA TTGATGTTGT CCTCATCCTC TCAGGACACA AGAACTTKTT GCATTATCTG GAGCSCATAC CCTCGGCAGT AAAKGTTTTG  GGAATCCGGT TGTTTTTGAC AATTCATACT ACAAGGTTCT TCTAGAGAAA CCCTGGATGT CTTCAGGTAG CGAAAAAACA TTGATGGTTC TCATGTTCTT CCGTTAGACT TTTTGCCGGA  CGTAGTTACG TTGGCCTACT GGTTCTAGTT TGTTGTAGGT AAAGCATTAT TTGGCATGAA ATTAGTCCTG CCATCAGCTT TCTAACCCAG GAAAAGATTC TCTATCTGAT ACTATGGAGT  CATAATTGTG GTATTGTTTC AATAGTTAGC TCTGATCCAG TGGAAATTTA TTTAGTCTGT ACTGGGAAAA GGTTATTCTC ACTTTTTCTG TTGCAAAAGC GACCTGAGTT TTTCTCATCG  GTAATAGTTC TCACTTAAGC TTTGCTCTTA ATTATCCCTT GCTTAATTTC CTTTTTCTCA ATGCAGCTGG TATGCCAAGT ATGATTGGAC TTCCTTCTGA TCGTGCACTT GTTGAGGACA  ATGAATGCTT AAGGTTACTG ATTTGATATC CCTACTATTT CCTTTTTACT AGGAAGATGG GAACAGTTTT GCCATATCTT TCTGGCCATA GACTATTATG KTKAKAKATA TATATATWKC  TGTCACTGGC ACTTGTCAAC TTTCAGGGAT GCACCATTAT TGCCACTTTT GATTTTCTTT TTCTCATGAT TCTGGATAAA AGTTGGCTTT TGTCTTAATG ATCCAGTTAA ATCCACATTC  CATAAATATG GGAGGTGCTA TATTATCATG GCCTGTTTAT GCTTCTGAGA AAGCAATGTA GAATGKAAAT GTGCCGACAC AACAAACATA AGTAGCCAGT CTGAAGTAAT TAGTATCACC  TGATTTACTA TGGATATTTT GCATGAGAAT GTTCTGTTTA ATGTGATATT TGTTTCTTTT ATTTGCTCGA TCATGATACC TATATATTTT ATATATACAG ATGGATTGAG AAATATGCAA 
ATGATCAGAA TTTGTTCTTC AAAGATTTTG AGAATGCTTA TGTCAAGTTA GTGAATTCTG GTGCAAGGWG GAGGAGCTTG T 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAC CGTCGCCGTC GACGACCCAC CTCTCCCCAC TCACCTGCTG nnnCTCCTCC TCCTCCCTTT CCTCCCATCA CTCTTCTCGC AGGACGAAAT TCGAATTCCC CGCCAATTCC  CAACGGTCTT CTCCCTCCCC CATCGCCTCT CGCGCCGGAG CCATCGCCTC TCCCTCAAGC TCGACCCCCG GCGCCGCTTC TTCCGGTGAC CACGCCCCCG TGCGCGGTCG ATCCGTGGCG  GGCCTGGCGG CCACATTGCC GTTTCTCCTT CAGCTGCGCG GTTACACGGA GGGAATCGTC GCCGACGCCG CCGAATTAGA TAATGATGAA TACACGATGA TAAAGGAAGA GGTCAGAAAG  GTAGTTTCCA AGGTGAAGGC TGCTGGTGTG CTTCGTTTGG TATTTCATGA TGCTGGAACC TTTGAAATGG GTGAAAACTC AGGTGGTATG AATGGTTCCA TAGTTTATGA ACTTGAAAGG  CCCGAAAATG CTGGGCTAAA AAAGCCTGTG AAGATACTAG AGAAAGCAAA GGGTGAGGTG GATGCAAAGA GACCAGTATC CTGGGCAGAC ATGATAGCTG TGGCTGGAGC TGAAGCAGTT  TCTGTTTGTG GAGGTCCAAC TATTCCAGTT GTTCTGGGCA GACTTGACTC AATGAAGCCT GATCCTGAAG GAAGACTTCC CGAAGAAACT CTTGATGCTT TGGGTTTAAA GCAGTGTTTT  CAGAGGAAGG GCTTATCGAC ACAAGAACTT GTTGCATTAT CTGGAGCCCA TACCCTCGGC AGTAAAGGTT TTGGGAATCC GGTTGTTTTT GACAATTCAT ACTACAAGGT TCTTCTAGAG  AAACCCTGGA TGTCTTCAGC TGGTATGCCA AGTATGATTG GACTTCCTTC TGATCGTGCA CTTGTTGAGG ACAATGAATG CTTAAGATGG ATTGAGAAAT ATGCAAATGA TCAGAATTTG 
TTCTTCAAAG ATTTTGAGAA TGCTTATGTC AAGTTAGTGA ATTCTGGTGC AAGGTGGAGG AGCTTGTGA 

Retrieve as FASTA