Entry information : EglAPx08
Entry ID 8441
Creation 2011-08-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-25 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EglAPx08
Name EglAPx08
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglAPx08
start..stop
S start..stop
EguAPx08 883 0 1..446 1..446
EgrAPx08 814 0 1..446 1..446
EcamAPx08 719 0 95..446 1..352
GmAPx07 660 0 17..446 10..432
Literature and cross-references EglAPx08
EST ref. GenBank:   ES593040.1 [5' end]
Protein sequence: EglAPx08
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   446
PWM (Da):   %s   47664.53 Transmb domain:   %s   o426-445i
PI (pH):   %s   8.27
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MQLLPLQPQS FSSSPPPSAS TATASMASLT GAAAASRLLP SASRAxxxLS LSSSAGRSPA SPLSSLRCLR GSSPLASRLF LSQRxPSMHL LAAQYSGAAS PKCAASDPEQ LKGAREEIKE  LLKTKFCHPL LVRLGWHDAG TYNKNIEEWP KRGGANGSLR FEIELKHAAN AGLVNALKLI EPIKEKYPSV TYADLFQLAG ATAIEEAGGP KIPMKYGRVD ISKPEECPEE GRLPDAGPPS  PADHLREVFY RMGLNDKEIV ALSGAHTLGR SRPERSGWGK PETKYTKDGP GAPGGQSWTV QWLKFDNSYF KDIKERKDED LLVLPTDGVL FEDPSFKVYS EKYAEDQEAF FKDYAEAHAK 
LSNLGAKFDP PEGIVIDGPA KAAPEKFVAA TYSSGKRELS DTMKQKIRAE YEGFGGSPDK PLQSNYFLNI IIVIAALALL SSLVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from NGS and EST. Short 5'end is missing due to NNNNN.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCCGCCGGC CGCTCCCCTG CTTCTCCTCT CTCCTCTCTC CSATGCCTCC GCGGATCGTC CCCGCYCGCT TCYYSCCTCT TCCTCAGCCA GGTACGCCCG TGCTTGCTTC CTTTCTTYCC  TCCAATCTCG CKTCTCSCCK CTTCCTCGGC CAGCTCGAGC TTAGGATYGG KCGTTCCTCT CTCAGTGGAG CATTCGCGTG TGGTGATCGT GCGTCGCTTT GCTTTGCTCT CGCTGTTTTG  CTCCGATTAG CTGCGTTTCG GTTCGGTCTC TCTCTGAGTG CGTCTGTCCG GATGTAGCTC TGCTTAAGTC GTTTACGTTG GATAAGCGCG TGTGGATCGK GTRCATTCCG GTCCTGTTCC  CTTATTGCTG TTTCGATTCC GTCGTCTCGT ACTGCKTCCC CAGTGGTTTT CGGCTTGACT CGTGATGAAA ATGCAGAGGA RGCCGTMCAT GCRCCTGTTG GCCGCGCAGT ACAGCGGAGC  CGCGTCTCCG AAATGYKSCG CGYCCGATCC GGAGCMGCTG AAGGGCGCCA GGGAAGAAAT TAAGGAGCTT CTCAAGACTA AGTTCTGTCA TCCTCTTCTG GTAACGTGCC TTCTTATCCT  TTGMAAAAAn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnTGGA AGATATATGC TTTGATCGCG TCACGAGATG ATGCTGAATG  AACGGAATTG CTCTTGCTAT TGTAATGTGT TTAGCCTACT GCACAAATTC ATCTATCCCC TGAAGAAAGC GTATCTATTT TTGGAATGAA CCCTTAGTTG AGAAAATACA CCTCTGAGAT  GCTATGGATA ATTGAAGCAC CTGAGATTTT GAAACTTYAC TACATTGTTC CCACCCGTTT AGCTAGCTGA CAACAGAGAA CTKTAAATCC TGAAGTGGCT AATCACCATG TTCCCACCCA  TCTATGCAAT TTACTAGGTC TGAYAGTCTC TGTATTACAT GTGTTTTGTA GGAAAAGGAA ATAGAATTTG CCGTTAATGA CATATGAGTA CTTTACAGGT TCGGTTGGGA TGGCATGATG  CCGGKACTTA TAATAAGAAC ATCGAAGAAT GGCCTAAAAG AGGTGGAGCT AACGGGAGTC TTCGGTTTGA AATTGAGCTT AAGCATGCAG CTAATGCTGG KAATAATTTA GCAGTGATAC  TACGGGTGGC ATGACTTGTT TCTTGAACTT CTCTCAAAAC TAGCTTTTAC AGGTCTTGTA AATGCACTAA AACTTATTGA GCCAATCAAA GAAAAATATC CCAGTGTGAC ATATGCAGAC  TTGTTTCAGC TGGCTGGCGC TMCTGCTATT GAGGTCAGTT TTTGCGCTCT TAATTGCTTA ACCTGAGATT TCTTGAAGCC ATACGTAACC TGAGATTCAC TYGTTCTTTG TGAAAATGTT  CTYCCTTTTA CTTTATTCTT CAGGAAGCTG GTGGGCCCAA GATTCCCATG AAGTATGGAA GAGTTGATAT CTCAAAACCT GAGGAGTGCC CTGAAGAAGG GAGGCTTCCT GGTGAGTGAA  ACATTGTTGT TCATTAAAGA GTAGACATCC ACTCGGCTTT GTTGTACTAG GGGATCACTA ATTTGGCTCT ATGAAGCACT GTAACTATCT CGCGCAAGTT GTTGTGATCT GYCGATTATT  CGACTGCTTT TTCTATGATA ATTCTGAGTG GGCACCCTAA YATGCAAAGG CTTTTTTTTT AGGTGAGATT TGTACTTAAG GTTGAAGGTG GTAATGTTAA AGAACTGTAA TTTGCTGATT  TGGGCAACAG ATGAAGTTCT AGATGACTTG ATTCATTTAG GCATTTACTA AAAAAATTCA AGCAACAAGA GATGTATTCA TCCTAGGTCT GTGTTTTGTT TCTGAATGGA TCACAnTCGT  ATGCATGGTA AGCTCTTGAA ACAAAGCATT GTTTGGAAAA AAAAARAATA TGCATTTAAA TGCGCTTTRT YACACATAAA TGAACTTGAA TATCCCGTYY TTTCTATGGT CAGAAGTCAT  TTTCTATCTC TCRTCTGGAG TTTTCACTTT TTTATTCTGT CTCCGGTGAT TGATTTCTTC TGTTTCTCGG ATCCTTTTGT CTCACTTATT AGTGTACTTT CTACTTCTGC CAGAAAAAAA  GTTTTTGTCG GTTCCTCTTG GAACAATCCA TTTCTTCTCT TTTTACTGAA CWGTTCTTTC TTTCAGATGC TGGCCCCCCT YCMCCAGMCG AYCATCTCCG GGAAGTTTTC TACAGGATGG  GACTAAATGA CAAGGTTTTT GTAATCGTTA CCTAATGGGA TGTTGTGTGC TATTTGTGTG TATCTCATGT GCTTGAGACT ATGAATTCTC TGTTCCGCAG GAAATAGTTG CTTTATCTGG  GGCACACMCT CTTGGAAGGT CAAGACCAGA ACGYAKKGGG KGGGGCAAGC CAGAAACAAA GTACACGGTA ACTAATTACT TTCTATTTAT TAATGTAATG CTCCGTACTT ATCATTTGAC  AAACTCAACT TGCCATAGGA ATTCTGAAAC AGCATGCATA GTGTCGAGAA TGTATTTTCC ATGGTTACCA TTGGTGAATT GAAAGTTATC CTCGATATAC AATTAGAGTT ATGAACTCTT  GATCATCTTT AAACRAATAA CAGGGAACAG GACTCTGATG GTCATAGTTG TGTCCATTAA ACGYGAAAAA CTACAGAAAT GTTTTGTTTG GATTTAGAAA CAATATTTCA TTGAGCTCCA  AGCACTTAAG GAGCTGTGCA GTAGGATGGC GTTCTATSAG TGATCAACCA TCAGAAATAG ATTGATATTC CCAAGGACGT TGTTGTAAAT TCTTTTATGT GCTTGTAATC TCCATTGTCT  CACACAGTTG CGACTCATGG TTCGGGTTAC AATATTTTGG CTTGATGGTC ACGATGATGC CCAGAAAAAG TAGCCATTTR CAGTGTGGCT TGTGACCACG TTAATGAWTC TCAWTAGCCA  TATTTGTTGC CATKGGATTT GCGCCTCAGA GTCTCTTTTG TTAAGGATGA CAGTTGACTA TTAATTTCCA TAGAGGCGGK CCATATCAAC TGWTATTTGC AGATCTTTTC TTCTAGGAGT  ACAACAAGCA AGCATTTTAG GGGTTAGTTG GTCAGCTTAA AGAGTTTGTT TACATCATTA CCCTCTGTGT AGTATCAAAT CCTCTATAAA ACTCAAGAAC TCGGCATCTT TCTAAAAAGT  ATCCATCCAC GTCTTTTAGG TCTTATTTAC CTCTTTTACA TGTGTCCAYT GTAATGTCAC ATCTTCTTAC TTTATCATCT GTAGGCCATT GCCTTTTGTG TCCAAACTAC TTTAGAAAGG  TTTTTCATCT TATTCCCACT TTAAGCCACC CCCTCAGCTA TAATCTGTTC TAACTTGATC TTGTGTTAGT GTCCAAATAT CCTTAGGCAT TATTATCTTA GCTATATTAG TTTYGTACGT  GTGCCTTTCT TACCGACAGT AGAAATGGTT GTGGACATTG AAGCTTGGGA AAAGTTTCTC CCCAGTGGAC AAATTAATGG CTGCTTGAAT TGAACTTATA TGACTATTTT CAACAMWATA  GTTTAGTTGA AATGATTAAG AATAGTATAA ATGGCCTTCA TGAATCATAA TGGCCTCCAT CATGTCACAG AAAGATGGAC CAGGAGCACC AGGTGGACAG TCGTGGACCG TGCAATGGTT  GAAGTTTGAT AACTCATACT TCAAGGTYTG CGAGTTGAAT CCATACGTGC TTTTTCCATG GGAAGGTGGT GATTCAGAAT CAAGTGGGAT GCTAACTTCA TGTTTCATGC AGGATATAAA  AGAACGGAAG GAYGAAGMCC TGCTGGTATT GCCAACTGAT GGTGTTCTTT TTGAAGATCC TTCATTCAAG GTAATAAGAG TTTTTCTGAA AGCTCCAAAA TAAAAGAAGW MKCTAAATTT  GAGTTATCTT TCTAAAGAAT GTTGGCGAAT TGCAGGTCTA TTCTGAGAAA TACGCTGAAG ATCAGGAAGC ATTCTTTAAG GATTATGCTG AAGCACATGC AAAACTCAGC AACCTTGGTG  CAAAATTTGA TCCTCCAGAG GTTTGTCAGT GCTCTCTTAT GGTCATTACT TTGCTAATTG TAGTGACGCT GGACCGTGTT CAAATCATTT CCAATGCCTT CTTAATTTTA AGTTTTTAAG  GAGCCAATGG CCAAAGWTCT ATAAGAACTG TCCGAATATT TGAAATTCTT CCAYGATRTT CATGTTGGCT ATTCRACCAT CTGTTGTGAT GGCWTTGGCC TCTGGATCAA GTGAAATTTG  YAGGATTGAT GGGGCCTCCC MTTTGGAGAC GCATCRATTG TAGTTTTATT GCnnTTTATT GCACGGCATK AATAACCATC AAGTTCATCT TAKCAGCATT GATGTTTKGC TTGTTATGGA  AAATTTGTGC GTAGATAACA AGCGCTTCTA CTTATTTACA AGTTTTTCTT GGGTCTAGAT TTACAAGTTT TTCTTCAGTC TAGATTTACT AGTTTGCAAT TTAACTTATA CAGAACGTGG  GTTAGAGTTG TGGTGAAAAC TAAAGCTTAC GTTGAGTAAT CTTTCAGGGT ATTGTGATAG ATGGTCCTGC TAAAGCTGCA CCGGAGAAGT TTGTGGCTGS CACCTWCTCA TCTGGAAAGG  TTATACTAAG AAATAACTTA CATCTTGATC TTCCATTGTT ACAGAGAGTT CCTTTTCATT ATGCGATCTT TAACGGAGAG ACTATTTCTT TGCAAATTGT TCATGTTCCT TGTTTCTTAT  GGTTTGCTGC AGGATTAGAA AACAATGTCC CGTTTTCTGT GCCGTGTCTT TTWTAAATAA AAGATGGAAG ATATTTTCAA TCTTGTGAAA CCACTTCTTA AAACTTGGGG AGTCTTAGCG  AAAGGAGGAA TAAAATTCAA TGCGTGTTGC GTATTTGAAT TGCAGAGAGA GCTGTCAGAT ACTATGAAGC AGAAGATCCG AGCTGAGTAT GAAGGATTCG GTGGCAGCCC AGATAAGCCC 
CTGCAATCCA ACTATTTTCT GAACATAATC ATTGTCATTG CTGCTTTGGC ACTCTTGTCA TCTCTAGTAG TAAATTGA 

Retrieve as FASTA