Entry information : EglAPx[P]04
Entry ID 8442
Creation 2011-08-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-08-02 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Qiang Li
Last annotation changes 2012-05-22 (Qiang Li)
Peroxidase information: EglAPx[P]04
Name EglAPx[P]04
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglAPx[P]04
start..stop
S start..stop
EglAPx09 279 1e-96 1..156 107..262
EgrAPx09 279 2e-96 1..156 107..262
EguAPx09 278 4e-96 1..156 107..262
EgrAPx[P]04 273 7e-96 1..156 1..156
Literature and cross-references EglAPx[P]04
Protein sequence: EglAPx[P]04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   164
PWM (Da):   %s   15891.02  
PI (pH):   %s   4.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGPxIDFVPG RKDSRVSPNE GSLPDANEGP PHLRDIxYRM GLSDKDIVAL SGAHTLGRAH PERSGFDGxx xxxxxxxxNS YFVELLKGEA EGLLKLPTDK ALLEDPAFRP YVELYAQDED 
AFFxDYAISH KKLSELGFTP SSSGSKTVAN GAVLAQGAVG VAGA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from NGS. 5' and PS are missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAGGTCCCA YAATCGACTT TGTTCCCGGA AGAAAGGTAC TCTGTTTTAG CTRTATGTGA GCWAGATAAT TCYTACRAGT GCCTTATTCA TTAAGTTTTT TTCTATCTGC AGGATTCAAG  AGTTTCTCCA AACGAAGGAA GCCTTCCAGA TGCTAAYGAA GRKATTTTGT TGTGTCAACT TTCCCTTTGT TGTTTGACAn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnTCTT GGTTGTGGCC TGTTAGTTTT GAAATGTATG TCCATCTCAT CTGAATATCA RTTAGTAAGT  TTCCAGAGGA ATGATTTGAA TGAGATAAGA AGCGCAGTGG AAAAAGAGGT ATCGGAGCTA ACTGACATTC AAATGTTGTA CATCCYATCT AAATGTCAGT RAGTTTTCAG ATTAAGAACT  GCACAAGCAA AATGGGCACG GTGCCTATTT CGCATGAGTC AGCTGTTGTG AACTCACTAC AAAGAATGAC TTGAGAGAGA AGTGCTGGGA TTTGAACTCT TGATCYGTCA TATGAAACAG  TGCTAGAATA TCCAGCCTAA AAGTTTAAGC TGTGATGTGG ACAGAGACAA CATGTATATA AGAAAACTGA GCYATTAGGT GAGAGAGACT ATATGTGTAT GAGACTCATT ATGACCATGT  TTTCAGGGGA TGTTTGATTA TATTAAAAAC AATATTACTA CTCATGCTnn nnnnnnnnAA SCTTTCACAT GATATTTTAC ATCTGCAMCT CACTGTAGCT GAKYRWAAGG AGGCTCAAAK  GAAAGGAGGC CTTCAACCGC AGCTTGGTTA AGCTTATCRA TTTGTGATAT TCACGTTTAA CAATCCACTG CCTATCCATA MCTTACCATA GCTCTAAATC CATAGGAGAT MTTTCATGCG  TTATAATTCT CTTATTGGTG AAATACACRT ACATTTTGCT TAAAGGGTAT TCGAAATTTT TTCTAAACTY GTCATTGCTG GATGTAGGTC CTCCACATCT AAGGGACATC TTKTACAGGA  TGGGTCTCTC GGACAAGGAC ATAGTGGCCT TATCAGGGGC TCATACACTG GKAATTYCTA TTTCTGCTTG GRTTTACAYT CAMGACCAGC TGGGGATGCG CAACCACACT CGTTATTTTT  TTATTCTTGT GTCTAGGGAA GGGCACACCC GGAAAGATCT GGATTTGATG GTCnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn ATAATTCCTA TTTTGTGTAA GATTTCATCT TTTCACTGGA  TGCATTTTCT WAGTTTCGGT TGGWGCATTA TAGAGCCAGA TACTAATTGA TCATTTTTGA CACAGCGAGT TGTTGAAAGG GGAAGCAGAG GGACTGCTGA AACTGCCAAC TGACAAGGCA  TTGCTGGAAG ATCCTGCATT TCGCCCTTAT GTTGAGTTGT ATGCnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnCACA CCACTATTTC GTTTCCTTAT GCASACGGTC TATAACCCTT CGATGCTACT GTCCTTGGTT TTGCCGAGAA TGAAAAGAGA  TGGAAAGTGT TTTTCATGGA ATTTATGCTG TGTAGGCTTG TGATGCTTAA AAGTAAGCAT TCAGTCTGTT CCATCACTAT CTTCTATGTA GAGACYAGGA AATATTCATA ATGAGATYGC  ACATCAAATG TTGGGTAGAT ACRTACATGT GTTGGGATGG ATATRTTATG TGGTTCCCTG AAACCTCTAG GCTAGAGCAT CATTTTTGTG CTACTGGGAA CACCTGATTT GATATTTGAT  TTGGTTGTTG TTCCCGCAAC TCTCTCATGG TGGTTGGCAC GACCTTGAAA AGAGACAAAT GGACAATTTG ATACCGTGCT nTTCCTTCTC GTTTTCTTTT GCTATATGCT CTTCTTTCCC  TAATGTTGTC AAGCATGTGG CAGGATGAGG ATGCATTTTT CARAGATTAT GCAATCTCRC ATAAGAAGCT CTCTGAACTG GGGTTCACGC CAAGTTCTTC AGGCAGCAAG ACAGTAGCGA 
ATGGTGCCGT ATTGGCACAA GGTGCTGTTG GAGTGGCAGG GGCTGC 

Retrieve as FASTA