Entry information : CpapAPx06 (evm.model.supercontig_36.176)
Entry ID 8734
Creation 2011-06-28 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-31 (Achraf Jemmat)
Sequence status partial
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2015-12-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CpapAPx06 (evm.model.supercontig_36.176)
Name (synonym) CpapAPx06 (evm.model.supercontig_36.176)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx004]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Caricaceae Carica
Organism Carica papaya    [TaxId: 3649 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CpapAPx06
start..stop
S start..stop
VvAPx07 578 0 4..347 1..344
CclAPx01 566 0 4..347 1..349
MeAPx02 561 0 4..347 1..349
PtAPx10 560 0 4..347 1..347
Literature and cross-references CpapAPx06 (evm.model.supercontig_36.176)
DNA ref. Phytozome 12:   supercontig_36 (1283705..1280345)
EST ref. GenBank:   EX294710.1 [5' end]   EX267196.1 [3' end]
Protein sequence: CpapAPx06 (evm.model.supercontig_36.176)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347
PWM (Da):   %s   38011.56  
PI (pH):   %s   8.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MESIGVSFLS TVPSLVPPVS VRTLHSTRHP VVSGAIRCQK IEADVTGENG FHRRDILKYF GAAIGMELMS SGPFTGTAFA ADLIQRRQRS EFQSSVKETL FTLIKGNPDI VPSILTLALN  DAMTYDKATK SGGPNGSIRL SSELSRPENK GLSAALNLLM EAKKEIDSYS RGGPISFADL IQFAAQSAVK DTFLASAIRK CGGNEEKGRL LYTAYGSNGQ WGLFDKQFGR SDTQEPDPEG 
RVPQWEKASV QEMKDKFLAI GFGPRQLAVM SAFLGPDQTA TEALLATDPD VSKWVQKYQR SRETVSQTDY EVDLITTLTK LSSLGQKINY EAYTYPVQKV DLSKLKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Incorrect prediction from phytozome (Both 5' and 3' end are missing due to frame shift and N in the sequence).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGTCCA TTGGAGTTTC TTTTCTCTCA ACAGTCCCTT CTTTGGGTTC CCCCCGTGTC TGTCCGGACT CTACACTCTA CCAGACACCC AGTTGTGGCA GTAGTCTACT TGATTCGTCT  CTTTCAACTT CCTCTCTCCC TCTCTCTCTC TCTCnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnTTGGTAT GGTAAGAGCA TTTCTGTTGA TTTCTTTCTT ATTAATGTAC TATTAGTAAT TTCATCTGTC TGTGTCGGCA CTCTCATTTC ATTTAGTTGG ACTCATTATT  AGGGAATTCA AATGTATATG ATATTTAAAA AAGGGCAGAG CGCCTTGTTG CTTCCTTTTT CCTGATTATG AGCATGGGGG GATTACTTTC TTTTCCTCTA GTTATATCCT AGTGGTGTGG  TGTCCTGGAG TTGTTGCTTC TCTGTGGCCT CTGGGTTCAT TCCACTCCAT CGTACCGGAA AAATAAAAGA TTCCATGAAT GGACAACGGA TAATATTGGT AGATAGATGG AACTGAAGAA  TCGCTAAGAA TAGGACGTTG GAGATAGAAA TAGCCATTCA ACAATAGGAG TCAGATTGCT GTTAGGCCAC AAAGCTGGAA CCATATGCTA TTAGTACTTC TTTCTAGATG CAACTCTTTG  AGAAATGTTT GACTTCATGA ATTGGAATTA TGTGATCATA AGTTTCTGCC AGTTATGATC TTTGCTTAGG AATTAATGAG CTCGGGCCCA TTTACTGGGA CTGCATTTGC TGCTGATTTG  ATACAACGCC GTCAGCGTTC TGAATTTCAA TGTGAGTTTT ATAAGTTTAC TTTTCCATGC CTGAATTAAC AATTTCTTGC TGATTTGATG ATTCTATTTT TCTGTTTTTT TTTCTTTTTC  TTAACAGCAA GTGTTAAGGA AACACTTTTT ACGCTTATAA AGGTAAGTCT ATTTTATCTT CTCATGAGTC CAAGTACCAT AACGTGTAAA TGTGTATATA TGTATCTATT GTTTACCATC  CTTTCAGTGT ACACTGACCT TCGATCTTTT TCTGCATTAA TTCAAGGGAA ATCCTGATAT TGTTCCATCA ATACTAACTT TGGCATTGAA TGATGCCATG ACTTATGATA AGGTCAGATA  GAAAACTTTT CCTTGTAAAC ATCAATATGG ATGCTACAAT TTTTTTTTTT TTAACTTTGT TATGGAAACA GAAAGTTCAT TGATGAATTG CTGATAATTT TCTAGGCTAC AAAATCTGGG  GGCCCAAATG GATCAATACG GCTCAGGTAT TTGCCACATT AATCATCATC TCAAATGAGC TAGTGTGAAT TAGCTACAAT CTAGATACCG TTTTGTTTTT CAATTTTCTG GCTTGTAGGT  ACCAGTTACT GGTTACCTGA GATTCCAATA TGCTACATAT ATTTCCTAGA GAGAGTTAAG TAAGATCATA ACAAAATAAA TTCAAAGATA TTCAGATTCT TGTGAATCGT GAATTGAACA  CGTTCCTTAA ATAATCAACC TGGTTTTTGC AGGGAACAAG TTTGCTTCCG CAATCAATTT CAGGTTTTCA AAGCATGATT AATTTAGTCT TTTTGGAAAC AAAATTTAAA AATTTCTTTT  CCATCAATTT TCTTGCATGA AGCTCTGAGT TAAGCAGACC TGAGAATAAG GGGCTTTCTG CTGCTTTAAA TTTATTAATG GAAGCGAAGA AAGAGATCGA CTCATATTCT AGGGGTGGAC  CAATTTCCTT TGCAGATCTC ATTCAATTTG CAGGTAAAAT AACTAGCACA AGCAAAATTT GAATTATGCC ATGTTTGTTA TGGTCATCTA ACACAGAGGT GTGTGAGATA GAGGTCTAGC  AGGCCTGAAT AGGTTTTGTT CATTCTATGT AGCACAAAGT GCTGTTAAGG ACACGTTTCT TGCATCTGCA ATTCGCAAAT GTGGTGGGAA TGAAGAAAAG GGGAGATTAT TATACACTGC  ATATGGGTCA AATGGGCAGG TTCGTTTGTT AATGATTTGT GTCTTACAAT AATTGTCATT CTTTACATGT TGGATTCATG CAGCAAAAGT AGGAGTTTAT TTCTCAGTTT AGTGTACTTC  ATGGAACTCC TTCAGATTAG TTTGTGCCAA TCAATCACCA ATCCACCATA AGCAGATGTT GTTTTTCTTT TCCCACTGGG CGGTCCTAAG TTGGAGGTGT TCCCTAGCCG ACCATAAACT  ATTCTTAGCC ATTGCTAATT GCTATCTTGA AATGATCATG GTGACCTTAC AGGCCCCTTT GATCCGTACA ACCTTGTTTA CAATTTCTGA TGGTAGCTTT GCAGTTTCAT TGTGGTCCAA  GTAAAGGTTT TTGTACCCTC AAATGGGGCA GAATTATAGT TTGAGGGGCC TGAACATAAT AGCAGAAGTA ACAATGATCT TAATGAGGTG CTTCTAATGG AATATACATT GTCCATGTGC  TCAATTCATC TTGTAATATT TAGTTGACTG GGATGATGAT CAGGTTGTTC TTGCATATGA AGTTTGGCTT ATGGGTGCGT TCCTTATTTG TTCATACAGT GGGGCCTATT TGATAAACAA  TTTGGAAGGA GTGATACACA GGAACCAGAT CCAGAGGGAA GGGTTCCTCA GTGGGAGAAA GCAAGTGTAC AGGAAATGAA AGACAAGTTC TTGGCAATTG GATTTGGTCC ACGCCAGGTA  AATTTGTCAA ATATATATGC TTGTATTGAG ATCTTGTAAC CTCAAAAAAT CGAAACAAGC ATTCAAGATG GCTCATCATA TTCAAATGAG TAAAGTCAGC AGTGTAAAGG ACTTCCTGAG  CAATTGTTAC GCATATGCTG CTTAAAGATA TTTGAGACAG AACACTATTC TATAATTGTA TTGGTTTTTA CTTTAAAACA GCACAGCCAA GTTATTAGAA CGAGCTTAAG TTTTTATACT  TAGGCAAGTA CAGGTTATGC ACAGTCCATT CGCTGCTACT GCAAGAAATA ACAAGCGACA AATTTACTAA CTGCCTAAGT TTATTTGCTG AAGTTGCTCG CTCATATTTA TCCTCCAAAT  CTCCTTTGAA TTGGTCTCTT ATCCTGGTCA TTTTTCTTTA AGGGATCTAT TCTATGCTCT CATGTCCGCA TCAGGTAACT GATTTCTCAT GAAAGGCACT AATCAAATTC ACATGTTCTA 
TTCTTTTTTC CTTGTTGACC AGCTAGCTGT CATGTCCGCA TTCTTGGGTC CTGATCAGAC TTGGCAACCG ATCCAGATGT CTCTAAATGG GTTCAAAAAT ATCAGCGAAG CCGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGTCCA TTGGAGTTTC TTTTCTCTCA ACAGTCCCTT CTTTGGTTCC CCCCGTTTCT GTCCGGACTC TACACTCTAC CAGACACCCA GTTGTGGAAT TAATGAGCTC GGGCCCATTT  ACTGGGACTG CATTTGCTGC TGATTTGATA CAACGCCGTC AGCGTTCTGA ATTTCAATCA AGTGTTAAGG AAACACTTTT TACGCTTATA AAGGGAAATC CTGATATTGT TCCATCAATA  CTAACTTTGG CATTGAATGA TGCCATGACT TATGATAAGG CTACAAAATC TGGGGGCCCA AATGGATCAA TACGGCTCAG CTCTGAGTTA AGCAGACCTG AGAATAAGGG GCTTTCTGCT  GCTTTAAATT TATTAATGGA AGCGAAGAAA GAGATCGACT CATATTCTAG GGGTGGACCA ATTTCCTTTG CAGATCTCAT TCAATTTGCA GCACAAAGTG CTGTTAAGGA CACGTTTCTT  GCATCTGCAA TTCGCAAATG TGGTGGGAAT GAAGAAAAGG GGAGATTATT ATACACTGCA TATGGGTCAA ATGGGCAGTG GGGCCTATTT GATAAACAAT TTGGAAGGAG TGATACACAG  GAACCAGATC CAGAGGGAAG GGTTCCTCAG TGGGAGAAAG CAAGTGTACA GGAAATGAAA GACAAGTTCT TGGCAATTGG ATTTGGTCCA CGCCAGCTAG CTGTCATGTC CGCATTCTTG  GGTCCTGATC AGACTGCAAC CGAGGCCCTA CTGGCAACCG ATCCAGATGT CTCTAAATGG GTTCAAAAAT ATCAGCGAAG CCGTGAAACA GTGTCCCAGA CAGATTACGA GGTTGATCTA 
ATTACTACTC TCACAAAATT AAGTTCCCTG GGACAAAAGA TCAATTACGA GGCATACACA TATCCAGTCC AAAAAGTGGA TCTAAGCAAG CTAAAATTGT AG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGCCGGAAA TTCCCGGGTA TTCGGCATTA CGGCCGGGGG CTAGACAGAA ACAGATTACA ATGGAGTCCA TTGGAGTTTC TTTTCTCTCA ACAGTCCCTT CTTTGGTTCC CCCCGTTTCT  GTCCGGACTC TACACTCTAC CAGACACCCA GTTGTGGAAT TAATGAGCTC GGGCCCATTT ACTGGGACTG CATTTGCTGC TGATTTGATA CAACGCCGTC AGCGTTCTGA ATTTCAATCA  AGTGTTAAGG AAACACTTTT TACGCTTATA AAGGGAAATC CTGATATTGT TCCATCAATA CTAACTTTGG CATTGAATGA TGCCATGACT TATGATAAGG CTACAAAATC TGGGGGCCCA  AATGGATCAA TACGGCTCAG CTCTGAGTTA AGCAGACCTG AGAATAAGGG GCTTTCTGCT GCTTTAAATT TATTAATGGA AGCGAAGAAA GAGATCGACT CATATTCTAG GGGTGGACCA  ATTTCCTTTG CAGATCTCAT TCAATTTGCA GCACAAAGTG CTGTTAAGGA CACGTTTCTT GCATCTGCAA TTCGCAAATG TGGTGGGAAT GAAGAAAAGG GGAGATTATT ATACACTGCA  TATGGGTCAA ATGGGCAGTG GGGCCTATTT GATAAACAAT TTGGAAGGAG TGATACACAG GAACCAGATC CAGAGGGAAG GGTTCCTCAG TGGGAGAAAG CAAGTGTACA GGAAATGAAA  GACAAGTTCT TGGCAATTGG ATTTGGTCCA CGCCAGCTAG CTGTCATGTC CGCATTCTTG GGTCCTGATC AGACTGCAAC CGAGGCCCTA CTGGCAACCG ATCCAGATGT CTCTAAATGG  GTTCAAAAAT ATCAGCGAAG CCGTGAAACA GTGTCCCAGA CAGATTACGA GGTTGATCTA ATTACTACTC TCACAAAATT AAGTTCCCTG GGACAAAAGA TCAATTACGA GGCATACACA  TATCCAGTCC AAAAAGTGGA TCTAAGCAAG CTAAAATTGT AGAGAAGCTG TATCTAATCG ACCAGAGCTG CCACTTTGTG AATGTGGCAA CAGTTTTGTC TTATGGGAGC TTCCATTTTC 
TTCAGGATGG TCCAGCATAT GCTTTATATC TCAGTTGACA TCTTGAGATC ATCAAAGCGG AGCACTCAGA TATTAATCTT GTTTAAAGCA A 

Retrieve as FASTA