Entry information : CsaAPx05 (Cucsa.311620.1)
Entry ID 8799
Creation 2011-06-29 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-01-04 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-01-04 (Qiang Li)
Peroxidase information: CsaAPx05 (Cucsa.311620.1)
Name (synonym) CsaAPx05 (Cucsa.311620.1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaAPx05
start..stop
S start..stop
PpeAPx05 545 0 1..348 1..349
CclAPx01 526 0 1..348 1..349
PtAPx10 524 0 1..348 1..347
VvAPx07 524 0 1..348 1..344
Literature and cross-references CsaAPx05 (Cucsa.311620.1)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold02995 (1462488..1157923)
Protein sequence: CsaAPx05 (Cucsa.311620.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   348
PWM (Da):   %s   37774.51  
PI (pH):   %s   7.25
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALSFLSSLP SFLPLLPPQT AFSSPTSSFP SLTVKLRCAH VKTDASNQDR ISRRDVLQGF GGTLALGLMV NSDLMVEPAY AADLIQRRQR SEFLSSIKST LYTAIKKNPD IVPSLLTLAL  NDAVTYDKAT KSGGPNGSIR FSSEISRPEN AKLSAAMSLI EEAKKEIDSY SKGGPISYAD LIQLAAQSGV KSTFLASAIR KCGGNEEKGS LLYSAYGSNG QWGLFERQFG RSDAEAPDPE 
GRVPIWEKAS VQEMKEKLSA IGFGPRQLAV LSAFLGPDQA ATEELLASDP DVFPWVQKYQ RSRETVSQTD YEVDLITTLT KISSLGQQIN YEAYSYPVKK VDLSKLKL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (Extra sequence at 5' end).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCTCT CTTTCCTCTC TTCTCTCCCT TCCTTTCTCC CTCTCCTTCC TCCTCAAACC GCCTTCTCCT CCCCCACTTC TTCATTTCCC TCCCTCACTG TAACTAACTC TTCCCTTTCT  TAATTTCATT CTGATCCCAC CTTCTAATTC CTCCCTCATC CTACATTCTC TCTTTTTCAT TTTCAGGTCA AACTTCGTTG TGCTCACGTC AAAACGGATG CTAGCAACCA GGATCGTATT  AGTAGAAGAG ATGTTCTTCA AGGTTTTGGC GGTACTCTTG CCCTGGTGAG AGCTATTTCT TTTTCTCTCT TCTCTCTCTC TTTACTAAGA GATATTTGTT TCGCCAGTGA ATTAATTCGA  CTAGTGCCTT ACAACTTAAT GTATGAAGAG AGTGAGCGAT CGAACTGTTA CTTTTAGAAA ATTATATATA TGAGCTTGAA TGAGTTTGAA TGATATGATG ATGAGTTTCT GCCAGTTGCG  ACCTCTTCCT TAGGGATTAA TGGTGAACTC TGACCTAATG GTAGAGCCGG CTTATGCTGC TGATTTAATA CAGCGTAGAC AGCGATCTGA ATTTTTGTGT AAGTTTATAT TAGTCTGCAT  TACTGTTTTT CAGTTGGTTG TTTGCTTGAT CTTAATCTTA CCATTCCCTA GTGCTTGAAA TGTCTAGTAA ATAATTCTAG TCTATGAGTT TGATTCAAGC GGTTACATGT TTACAAACGC  ATATTTTACT TATTTTGGTT TTACATTATT GATTGCAGCA AGTATCAAGA GCACCCTTTA TACAGCTATT AAGGTATAAG TCCCATAATT CATTACTAGA TTTAAGCTGA TAGACTAAGG  TGGAATTTAC ATTTTTTTTA GTACATTCTC AACAAATCCT GTAATGTTAA GGCTTGGATA CTTGAATTGA GATTCAACAT GTGAAACAAG GAAGAACAAC ATTTTACGGA TTTGAGCTAT  TAGACCTATG CTAGCATCAG TAGGCCCAGA AGCTTAAATG GGATAGTGTA CATTTAATCC TATTCTCAAC AAATTTTGGT TTTAATTGCT ATGGTTGAAG GATCAATGTT CTTATAATCA  TACACGGTTC TCAGAGTAGA TACTTATCTC TTTTGTTTTC GTTTGTTTAT CTCAGAAAAA TCCAGACATT GTTCCCTCCC TTTTAACATT GGCACTAAAT GATGCTGTGA CTTACGATAA  GGTCAGACAA AAATACTTCC TCTCCTAAAA TTACACAACT GGGTTTGATT TTACTGCATT GACAAACTAA AAGATTTGAA GGAAGATGCT AATACAATTT GATCAAGTTT GTAGGCTACT  AAATCTGGAG GGCCAAATGG ATCCATCCGC TTTAGGTACT ACATTTTAGA TGTTATGTCC TTGCTGGGAA ATAAATTATT AACATTCACA TTATTTTCAA AAAAGACTTT GCATGTCTGG  TGCATCATTG ATGATTCGAG TATGGTATCC TATAAATAGA TTGAAATCAT TATCCTTCCA CGTTTTCCAG TTCAAAATTA TTTTCAGGCA TCATGTCATG CATCACGTAG TTTGGTTTTA  TTTAACTACC TTGGCACTTT CTTCATTATA AAATCTATTA ACTTCTTTTT CTATGCTTTT TGCCATGAAG TTCAGAGATT TCCAGACCTG AAAACGCCAA GTTGTCTGCT GCTATGAGTT  TAATAGAGGA AGCAAAAAAG GAGATAGATT CTTATTCAAA GGGTGGACCT ATTTCCTACG CAGATCTTAT TCAACTCGCA GGTTTAATGT CTTAACAATT TCCGTCTCTG AACTTCTTCC  ATGCATTGGT CAATTGCATT CTGATACCCT TTTTTCTTCT TCTTTTTTTA GTTTTTATTT TTAAATTAAA ATGTTGCAGG TAATTAGCTA AGTTGTGACC TTCCTAGCCC CTCAAATTTA  TAGAAAATTT CAGATTTATT TAGGGATGAG TTGGAGTAGA GGTAATTAGC TTGTGGCTTT TCTGAATAAA CAATAACAAT GAGATCAAGT TCATTTTCTC CATGCAGCAC AAAGTGGCGT  TAAATCCACC TTTCTAGCAT CTGCCATCAG AAAATGTGGT GGGAATGAGG AAAAGGGGAG TTTGTTATAT AGTGCATATG GCTCCAACGG GCAGGTCAGT TATGCTGCAT GGACATCTGA  ATGTTTATTA CAAATATACT CATCCAGTAC ATGTATGAGC CTGTGCAAGT GTGTCTGTGG ATCACCCACT GACAATCTTA CGCAGGCTCA TTCTAACATC CATCCACCAA GTGAGGATCT  TTTGGCAGTT CAAGTAGAGG GTTGACGTGA TTCCCTATTA ATGACGTCTT CTTTTTGCAA TTACACAGTG AATGTAGTGA TACTGCCTCA CTGAGCTGAC AATCCTCTAT GTGGTCCAGT  TCTCTAAGTT CACATTTTTT CTTAAATCTT CTTTAATCAA CTCAACCAAA TTTCTTGGTG AATGAGCAAA TTGTTCAGTG TGATATTTGG TTGAGCTGAT TTAAGGATAT TTTTTCTATC  TCCTTCTAAT GGATTGGCCA TATCTTTGCC TTCGTCCAAA TTGATAGAAA AGATGTTTTG TTCTGAAAAT TGTAGTCTAC ACATAGCAGC TACGAATTTT GTGTTAAAAA AGAACATGAT  CATCCTGCAA ATTTTTACTA TTGGGGGCAT AACGCAAACA ACAGTGTCTC CTTGTGCCTA CAGTGGGGGT TGTTTGAAAG ACAATTTGGA AGATCAGATG CCGAAGCGCC TGATCCTGAG  GGAAGGGTCC CCATCTGGGA GAAAGCTAGC GTTCAGGAAA TGAAAGAAAA GTTATCGGCC ATTGGATTTG GTCCCCGCCA GGTATGCTCC TTAATTTAAA GTTCCAATTG AAATATTTGG  CTTTGCTGTC TTACAAGTAT AGTAAACATG TCCAATATTC CCTGCGGATT ATATATGTCA AAAAACTTAA ATTGATCTCT GCAGCGAAGT ATAGTAATAA CAATAATATG CTAAAAATTT  GTTTGGACTT CCGGCAGCTG GCAGTTCTGT CCGCATTTCT GGGTCCTGAT CAGGCAGCAA CTGAGGAATT ACTAGCCTCA GATCCTGATG TTTTTCCATG GGTTCAAAAG TATCAACGAA  GCCGTGAAAC GGTTTCTCAA ACTGATTATG AGGTGAGTAC GTGACTATTA ACTGCTTTTG TTTTCAGTCT AATCACATTC TTTACATATA TGAACCCAAT ATAATACACA TCTCCATTTG  ACCTCGTATT CTCACACTTA GCTTTATGAT CTATTCCTTC AGGTTGATCT AATAACCACT CTTACAAAAA TAAGTAGCTT GGGACAGCAG ATAAATTACG AGGCTTATAG CTATCCAGTT 
AAGAAAGTTG ATTTGAGCAA ACTCAAGTTA TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCTCT CTTTCCTCTC TTCTCTCCCT TCCTTTCTCC CTCTCCTTCC TCCTCAAACC GCCTTCTCCT CCCCCACTTC TTCATTTCCC TCCCTCACTG TCAAACTTCG TTGTGCTCAC  GTCAAAACGG ATGCTAGCAA CCAGGATCGT ATTAGTAGAA GAGATGTTCT TCAAGGTTTT GGCGGTACTC TTGCCCTGGG ATTAATGGTG AACTCTGACC TAATGGTAGA GCCGGCTTAT  GCTGCTGATT TAATACAGCG TAGACAGCGA TCTGAATTTT TGTCAAGTAT CAAGAGCACC CTTTATACAG CTATTAAGAA AAATCCAGAC ATTGTTCCCT CCCTTTTAAC ATTGGCACTA  AATGATGCTG TGACTTACGA TAAGGCTACT AAATCTGGAG GGCCAAATGG ATCCATCCGC TTTAGTTCAG AGATTTCCAG ACCTGAAAAC GCCAAGTTGT CTGCTGCTAT GAGTTTAATA  GAGGAAGCAA AAAAGGAGAT AGATTCTTAT TCAAAGGGTG GACCTATTTC CTACGCAGAT CTTATTCAAC TCGCAGCACA AAGTGGCGTT AAATCCACCT TTCTAGCATC TGCCATCAGA  AAATGTGGTG GGAATGAGGA AAAGGGGAGT TTGTTATATA GTGCATATGG CTCCAACGGG CAGTGGGGGT TGTTTGAAAG ACAATTTGGA AGATCAGATG CCGAAGCGCC TGATCCTGAG  GGAAGGGTCC CCATCTGGGA GAAAGCTAGC GTTCAGGAAA TGAAAGAAAA GTTATCGGCC ATTGGATTTG GTCCCCGCCA GCTGGCAGTT CTGTCCGCAT TTCTGGGTCC TGATCAGGCA  GCAACTGAGG AATTACTAGC CTCAGATCCT GATGTTTTTC CATGGGTTCA AAAGTATCAA CGAAGCCGTG AAACGGTTTC TCAAACTGAT TATGAGGTTG ATCTAATAAC CACTCTTACA 
AAAATAAGTA GCTTGGGACA GCAGATAAAT TACGAGGCTT ATAGCTATCC AGTTAAGAAA GTTGATTTGA GCAAACTCAA GTTATAG 

Retrieve as FASTA