Entry information : CsaAPx06 (Cucsa.060660.1)
Entry ID 8800
Creation 2011-06-29 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-01-04 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-01-04 (Qiang Li)
Peroxidase information: CsaAPx06 (Cucsa.060660.1)
Name (synonym) CsaAPx06 (Cucsa.060660.1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Cucurbitaceae Cucumis
Organism Cucumis sativus    [TaxId: 3659 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsaAPx06
start..stop
S start..stop
CkAPx01-2 654 0 1..383 1..372
CkAPx01-1 654 0 1..382 1..371
GmAPx08 580 0 56..383 39..366
EguAPx08 581 0 14..382 27..396
Literature and cross-references CsaAPx06 (Cucsa.060660.1)
DNA ref. Phytozome 11:   scaffold00635 (161289..168315)
Protein sequence: CsaAPx06 (Cucsa.060660.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   383
PWM (Da):   %s   41460.97  
PI (pH):   %s   7.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAATVFGTAV AVAAASSSAS STTRFLSSAT RATLSFSSPS PTLLSRSSSS SSFSFLRSSP LISHLFLNQG RPSSCVSNRR FSASSTPKCL ASDPEQLKSA REDIKQLLKT TFCHPILVRL  GWHDAGTYNK DIEEWPQRGG ANGSLRFDVE LGHGANAGLI NALKLIEPIK NKYSNITYAD LFQLASATAI EEAGGPKIPM KYGRVDVVGS EQCPEEGRLP DAGPPSPASH LRDVFYRMGL  NDKEIVALSG AHTLGRARPE RSGWGKPETK YTKDGPGAPG GQSWTVQWLK FDNSYFKDIK EKIDEELLVL PTDAVLFEDP SFKVYAEKYL EDQESFFKDY AEAHAKLSNL GAKFDPPEGI 
VLDASPKPAG EKFDAAKYSY GKD 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (An extra seq at 5' end which has been removed).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTA CTGTTTTTGG AACCGCCGTC GCCGTCGCCG CCGCCTCCTC CTCCGCCTCT TCAACTACTC GTTTCCTCTC CTCCGCCACC AGAGCTACAC TATCTTTCTC TTCTCCTTCA  CCTACCCTCC TCTCTCGCTC CTCGTCTTCC TCCTCTTTCA GCTTCCTCAG ATCCTCTCCT CTCATTTCTC ACCTTTTTCT CAATCAGGTT CCTCTCGCTT TCTCTCCCTC TCTGTTCATG  TGTGTGTGTG CTTTGATTAA CGATGTTTAT GCTCGGTTTC TTCTCCTTTT CGCCGCTTTC AGGGAAGGCC AAGTTCTTGT GTATCAAACA GAAGATTCAG TGCGTCATCT ACTCCGAAAT  GCCTGGCATC GGACCCTGAG CAGTTGAAGA GTGCTAGAGA GGATATCAAG CAGCTCCTGA AGACCACATT CTGTCATCCT ATTTTGGTAT TTTTGTGGTT CATGATTAGG AGTGCTATTA  TCTATTAACT ATTATTTTCT CTCTTCATCT TGAATCGTGT GGAACTATTT GCTTGCGAGT TTCCCGTATA TTTGGTCCTT ATTTCACATG ATAGCGATTG AATGTTTTGC TTCTGATAAT  TGCCAGTTTA TGTTTGTACT AACTACCGCG CTTAAGTTGG AAATGGAAAT AATTAGCAAT GTTCGTGGTG GAGTATAATA TTTTGGAGAA TCTAGAGTCA TGTCCTCCAA AGTTCCACCG  ACATGTATTT CAAAGTTGCT TCCTTCCATC TAGGTACGCC TAGGTTGGCA TGATGCTGGA ACTTACAATA AAGATATTGA GGAATGGCCA CAGAGAGGTG GAGCTAATGG AAGTTTAAGA  TTTGATGTTG AGCTGGGGCA TGGTGCTAAT GCTGGTAATT CTTATACAAA TAACCGTGCA TTACACAGGT TTTGACAGTT TTGTTCATTC TAATTGACGG GTCTTTTGCA GGTCTTATTA  ATGCCTTGAA ACTCATTGAG CCTATCAAAA ATAAGTATTC TAACATCACA TATGCAGACC TATTTCAGTT GGCCAGTGCT ACAGCTATCG AGGTCATAGA ATTACCCATC TCTGAAACTA  AGATTAACTC CCTGAAAATA AAAAAAGGAT TGAATGTTCT AATGATTTGA TTTAATGCCG ATACAGGAGG CTGGGGGGCC CAAAATCCCC ATGAAATATG GACGAGTGGA TGTTGTTGGG  TCGGAGCAAT GCCCTGAAGA AGGGAGGCTT CCTGGTTAGT AGACTATATG CATGGCCTAC AAGGGGCAAT CTGATTTTTT TTTCTTTAAA TATGAATTAA ATAATTTGTA AATTAGTATT  TAGTAATTGA CTTCCTTATG GGTACCCTAC AGAAATTGCA GATGGAGGAA ATATTGCAAT GCTTAAATTT AATTGTAGGA TTCATTGAAA ATTACATTCT CAAGCTCTAT TATTTCATTC  TGTCGCAACG TATCAAAATA GGATCAACTA CGTTATAATG CCATGTACTG AATCATTGAA ATATTGTGGT GTGAAGTAAC ATATTATGTT GATAATTAAT AAGTGAAATC TGTAGATGTG  GCTTCCCGAG TTGCTTATTT TGTTTTACCT GCATCATATT CTTGATCCCT TTTTGTTACC TTACTTCTAG GCACTATTAT TATTATTATT TTTGTAAATC ATGAATTAGA CTAAATTGAT  TTGAAGCCTG GAGGATGGTT GTCTAGAATT TAGTATAAGT ATTGGAGTAG TTGAGAGTCC CATATTGGAA AAAACAAGGG GACTCATACT CCATATAAGA TAGATGGGCT ACTCCTTTCA  TTGCTAATTG GTTTTGAGTT GGAACCCTAT ACTATCAAAT TTAAGATGGT ATCAGAGCCC AGTAAACCCA AACGGGTATT CAGTTCAAGA TAGGTGAACC CAAAGAGGCA CCATCTTGAG  GGGACATATT GGAGAAGTTG AGAGTCCCAC ATTGGATAAA CCAAGGGGAC TCATACTTCA TATAAGATAG ATGAGCTACT CCTCTCATTG CCAATTGGTT TTGAGATGGA ACCCCACAAT  ATCAAATTTA ACAATAAGAA GTGAGCCCAA TTAGATATTT AGAAGGATGA GATGCTCAAT TGTGATACAA GTGAAAGGAA GAGGAAGTGT AAGGCATATC TCTTGCCTTT TAGCAATTTT  CTTGTAATGC TCAAAAATTT GAAAAGTGCA GGAGTATTTC CTCATGCTGC TGAAGATTTA ATTTGTCATT TTAGGATAAA TTACAAAACC ATTTTTTTTT TTTTGTTTCT TTAAATAGTC  TTTTGGACAG TATCTGATAC TTATCGCAAG ATGCTGCATC TACCAACGTA CTCGCTTCAC TGTTTTCCAA ATATTGTTAA GAACTTGTCT TTGTTCAGAT GCTGGTCCTC CATCACCTGC  TTCACATCTA CGAGATGTTT TTTACCGAAT GGGGTTGAAT GACAAGGTAT TGTGAATCAG TTTGCTATTT GAGTCAATAC TTTCTGGATG CTTTCTTTGC TTGATACAAG GTTTTTGGAT  CTTTAGGAAA TTGTTGCATT ATCCGGGGCA CACACATTAG GCAGAGCTAG GCCAGAACGC AGTGGTTGGG GCAAGCCAGA GACCAAATAT ACGGTATGTT ACCATTAGCA TGATAAGAAT  GGAAGATCAT TTATGTGACT CAACAAGTTA TTCGTCTATT TGATTGTTGT TTTGTGGAAT GAACATTTTG CTTATTGTGT GTGGGTGCAT GTGTGTATAA TATGCTTATT AAGAAACATA  TTTTTTTTCA TTTGATGTGA AACCGTAGAT TTACAGTGGA GGAAAATATG AAAAATAGGT AAGATATAAC AAACTCTTAA TGGGATTACC ATATTTGTGG CAGTGAGGTG ATGGAAAGAA  AAATATCACT TTATGATATT AAAGAGTTGA AGAAACCGAA CTCAACCGAC TTTCATTGAC TAGTCCAGAA GATTATGACT TAGTTGGGAC CTAATTTGTG TGATAAAGTG ACATATTATT  CAACTTATCT TTTATTTAAA TTTATTCTAA TATTGATTAA GCTGCCTTTG GTCTTGCTAT CTCAGACATT CTTGGATCTT CACCCGCAGG ATCATAGGAA CTACTATAAC AATCAAGGCC  AGTAGACCAC CCAATAGATT CTATTTTGTA TGTATCAGCC ATTCTCTCAA AATGCTTACC TAATGGGAGA GAGCTTGATA TATTCATATG CACCAACCAG CAACAAGATT GGATCATTTC  TGACAAAACT TAATTGACGG ACCGTGAGTG AATGAAAATA CTCCTATTAC TTCCCCATGT TCCATTTGAT ATCCCACATC ATTTTCCTCT CCTTGGAGAA ATCCCCCTCT ATTACACACC  AGGCTTGAGG ACCGCATTCT ACGAATCTCA AGTCTTTGTA TCAACTCGTA TAGGATAGAC TAAACAGTCC CATCTATGGC GTAGATTGTC CAGAACCGAC TCTGCAATTA GCCTTGATTT  ATCTTAGAAA TGCATGCTGG CCAAGCTTTA TTTATTGTTC ATGATAGTCT TAAATGATCA TGATAGTCTT AAATGGAATT TTTAATGCTG CCGCTAATTT CACTATGAAG TCTACCTTTC  TTAAATTAAC CAAAAGATCC CCCACCATCG CTTTACCTTT GGTTCGTTAC ATTTGGAAGA CTAAAATCCT AGAAAAGGTT ATGGTTGCTT GCCTATAGAA GTCTAAACAC TCATGAGAAA  CTTCAAAGAA AATTACAGTA CACTGCACTC AATCCTTCGA TGTGCTGCCT TTGTTTCAAA GACAAGGAGA TCTTGAACCA CTTATTTTTG CGTTGCATCT TTACTAGGAA AGCTTGGAAT  ATGTGCTTCA GAATCTTTAA TCTTGAGTTT TGTCTTCCTA GTAAGGTTGA TAGTTGGATG CTTGAAGGGC TCAATAGCAG AGGTTTTAGT CCATAAAAAT AAGAGTATGT TGTTGAGTCA  TAAAAGGATG AAATGCCTCG ATACAGGAGA GGAAGTTGAA GATGAAGTCG CTGCTTGAGT TCTTGAAGTA TACTCATCCT CAGAAAGAGT TGCTTCAGTT TCAGCCTTCC TCTTGTTCGG  AGGGTATGCA TTCCTTATGC TATAGCAAGA ATGTTTTCAG TCTGATTGAA ACAAGCATAG CTACCTTTAT CTCTGTGGAA AGGTTAGGCC TCATAGCTCT CCGAAAGATT TCCCGAGATA  ACTACTCCGA AGGGTAACAT TCTGTGGGTC CGTGGGATAT GTGTGATCCG TTCCATTTTG TGGTGTATTT AGAAAAAGAG GAATAGCAGA ATTTTTTAAG ACAACTTTAA TTCTTTTGAT  TCTTTTTGGA CTGTGTTTCA ACACACAACT TCTCATTGAA GTATGAACTA CACCAAACAC TTTTATAATT ACAGCCTTTC TTTGATTTTC AACAATTGGA AGGCCCTTAT TCTTTAGTTT  TTTTCGGAGA GGGCGGACCC TCTTGTCCCT TGGCTTTAGG CTGTTCTCTT TTGTTCTTTG ATTATATCTG TTTCTTATAA AAAAAGGAAT TGAGACATGA TATGCTGTAT TTAGTTTTGG  AGCTTCTAGA AATGGTTAGT GTCACGGTGC ATGAACCAGA TTTGATATTC ATTCTATACT AGTTTTCATA CGATGAAGAA GATGGATTAC TAGTTGATAT GCTGAACTTA ATCTTCTTTA  GCTTGTTTGC GGGTCTTTTG TACTTCAATG TACTTTTGTC TTTCCAACCA TATCTTATTT TTAATCATGG TCATTGCTTT GAATTTGCAA CCGCATTTGA GTTGCTATTC TCATGAGATT  CCTTTTGTTT TGATTTTTCC TTACTGACAG AAAGATGGAC CCGGTGCACC TGGTGGACAA TCCTGGACTG TACAATGGTT GAAGTTTGAC AACTCGTATT TTAAGGTTTT TATCATATTG  GCTTCATTTT ATATCTTGAG AAAATGAACT AGTTTTTGCT TACTATGTTT GGTCCATATT ATATTTAGGA TATCAAAGAA AAGATAGATG AAGAATTACT GGTGTTGCCA ACTGATGCTG  TTCTCTTTGA AGATCCATCA TTCAAGGTAA AACATAGCAT AAATTCCCCC ACCCCATCGT TGCTCCTTCA GGAGACTTTA TCATGGTGAC CAAAAAACAT CTTCAATGAA TTTGGTCATA  AGACAATCGA GAGGCTCAGT TTGGTTTCCA TTTACTTATA TTGTGTTGCA GGTTTATGCT GAAAAGTATC TTGAAGATCA AGAATCATTC TTCAAAGACT ATGCTGAAGC CCATGCCAAA  CTCAGCAACC TTGGTGCTAA ATTTGACCCT CCAGAGGTTT GTTGCCTTGG ATGATATATT ATTTTCTTTT TATTCTTGCT TAGGCGTTTT TGAATGACTA AACTTCCTTT TATCGAATAC  TTTTTGCCTT GGTGAATTTT CTTCTAATGA ACGCCCTTTG ATGTCATCCA ACTTAGATTT ATTGCACCAT TAAATACCCT GTGTTTTCAA GCATTACATT ATAAGACTAT TAGGTGGTCT  TGGACTCTTG GTTGGTTATA AACTAGTTTG GACACGGACA CTGATTATCC ATTGAAAAAA CTATACATGG GGAAAGTTAC TTTTTTGCCT CTAGGTTGAG TCTAGTTTTC ATTAGGTTTC  AAAATATTAC ACATTTAGTT GTGAAGATTT GAGTTTGAAT TCAATTTAGT TTCTAGGTTT TAAAATTTTA CAATTTTATC CTTTAATTTA AGATTTGTTT CAATTTGGTC CCTAATTTCA  TGTTTACACT TCTAACTTTT ATTTTATTGA ATACGTTTAG TCTTTTGCGT TAATGTTTGT TAATTAATTT ATAATAACTT TGAAGTGAAA ATTTTAATTT TGTTTTAATA ATGAAACTTT  AACTGATTAT AATTTTTAAA TTAATTAATA AAAATTAACA CTAGAGACTA AAAGTAAGTA TTTAGTAGAA AATCAAGATT AAAAGTGTAA TTCTGGAACG TGGGGACTAA ATTGGAATCA  AACCCAAACT TGAAGGGTAA AACCTTAATA TTTTGAAACT TAGAGATTAA ATTGAAAATT TGAAATCAAA ACTTAAAAGT GACTAAATGT ATAACATTTT GGATCCTAAG GATCAAATAA  AACTAAACCT GAAACCTAGA GACCAAAATG TATTTTTTTC CAAAAATATA TCTACTTAAG GCTCATTGAA AACTGCATTT TGTTGATCAC AGGGTATTGT GCTTGATGCA TCTCCCAAAC  CTGCAGGAGA GAAGTTTGAT GCCGCCAAAT ATTCGTACGG AAAGGTTGTA TGAATTACAG ACTTTCATAT TTTCATTTCA TTTCCTTGCA CAATTGAAGT CTTCAGAAAA TCTCACGTCT 
TCGTAAAATG TTTATCTTCT CTACTTGTCT ACTGCAGGAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGCTA CTGTTTTTGG AACCGCCGTC GCCGTCGCCG CCGCCTCCTC CTCCGCCTCT TCAACTACTC GTTTCCTCTC CTCCGCCACC AGAGCTACAC TATCTTTCTC TTCTCCTTCA  CCTACCCTCC TCTCTCGCTC CTCGTCTTCC TCCTCTTTCA GCTTCCTCAG ATCCTCTCCT CTCATTTCTC ACCTTTTTCT CAATCAGGGA AGGCCAAGTT CTTGTGTATC AAACAGAAGA  TTCAGTGCGT CATCTACTCC GAAATGCCTG GCATCGGACC CTGAGCAGTT GAAGAGTGCT AGAGAGGATA TCAAGCAGCT CCTGAAGACC ACATTCTGTC ATCCTATTTT GGTACGCCTA  GGTTGGCATG ATGCTGGAAC TTACAATAAA GATATTGAGG AATGGCCACA GAGAGGTGGA GCTAATGGAA GTTTAAGATT TGATGTTGAG CTGGGGCATG GTGCTAATGC TGGTCTTATT  AATGCCTTGA AACTCATTGA GCCTATCAAA AATAAGTATT CTAACATCAC ATATGCAGAC CTATTTCAGT TGGCCAGTGC TACAGCTATC GAGGAGGCTG GGGGGCCCAA AATCCCCATG  AAATATGGAC GAGTGGATGT TGTTGGGTCG GAGCAATGCC CTGAAGAAGG GAGGCTTCCT GATGCTGGTC CTCCATCACC TGCTTCACAT CTACGAGATG TTTTTTACCG AATGGGGTTG  AATGACAAGG AAATTGTTGC ATTATCCGGG GCACACACAT TAGGCAGAGC TAGGCCAGAA CGCAGTGGTT GGGGCAAGCC AGAGACCAAA TATACGAAAG ATGGACCCGG TGCACCTGGT  GGACAATCCT GGACTGTACA ATGGTTGAAG TTTGACAACT CGTATTTTAA GGATATCAAA GAAAAGATAG ATGAAGAATT ACTGGTGTTG CCAACTGATG CTGTTCTCTT TGAAGATCCA  TCATTCAAGG TTTATGCTGA AAAGTATCTT GAAGATCAAG AATCATTCTT CAAAGACTAT GCTGAAGCCC ATGCCAAACT CAGCAACCTT GGTGCTAAAT TTGACCCTCC AGAGGGTATT 
GTGCTTGATG CATCTCCCAA ACCTGCAGGA GAGAAGTTTG ATGCCGCCAA ATATTCGTAC GGAAAGGATT AA 

Retrieve as FASTA