Entry information : MeAPx05 (cassava4.1_015741m)
Entry ID 9052
Creation 2011-07-01 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-01-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-01-04 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: MeAPx05 (cassava4.1_015741m)
Name (synonym) MeAPx05 (cassava4.1_015741m)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Manihot
Organism Manihot esculenta (cassava)    [TaxId: 3983 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MeAPx05
start..stop
S start..stop
PtAPx07 696 0 1..428 1..424
PtAPx08 689 0 16..428 1..409
LuAPx137 671 0 1..428 1..434
GmAPx07 656 0 8..428 6..432
Literature and cross-references MeAPx05 (cassava4.1_015741m)
DNA ref. Phytozome 11:   scaffold02904 (1516..302)
EST ref. GenBank:   JG988137.1 [5' end]
Protein sequence: MeAPx05 (cassava4.1_015741m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   429
PWM (Da):   %s   46406.7 Transmb domain:   %s   o408-427i
PI (pH):   %s   7.97
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARCPSHLTL TPSPTMASLA GAASSRLFPS TYRARISLSS PASSSSLSPL SLSSSSSYSF APLKCLLTSP LAPHFFLNQR ASSMSTVAAA SDLAQLKSAR EDIKELLKSK FCHPILVRLG  WHDAGTYNKN IEEWPKRGGA NGSLRFEIEL KHGANAGLVN ALNLLQPIKD KYSGVTYADL FQLASATAIE EAGGPKIPMK YGRVDVSAPE ECPEEGRLPS AGPPNPADHL QEIFYRMGLN  DQEIVALSGA HTLGRSRPDR SGWGKPETKY TKNGPGAPGG QSWTAEWLKF DNSYFRDIKE RKDEDLLVLP TDAVLFEDPS FKVYAEKYAD DQEAFFKDYA AAHAKLSNLG AKFDPPQGIL 
LDGVAGEKFV AANYSTGKRE LSEAMKQKIR AEYEAVGGSP DKPLKSNYFL NIMIVIAVLA LLTSLLGN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Incorrect prediction from phytozome (due to N in the sequence).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACGCT GCCCGTCACA CTTGACGCTT ACGCCATCGC CAACAATGGC TTCGCTCGCT GGCGCTGCCT CTTCTCGTCT CTTCCCCTCC ACTTATAGAG CTCGAATCTC CCTTTCCTCA  CCTGCATCTT CTTCCTCGCT CTCTCCTCTA TCTCTCTCCT CTTCTTCTTC TTATTCATTT GCTCCTCTCA AATGTCTTCT AACTTCTCCT CTCGCACCTC ATTTCTTCTT AAATCAGGTC  CCAGCCTCTG TCTGTTTATT TTTACATGTT ATGCTTGGTT TTAGTTGAGG TTGTTTATCC GGTGGTTTTT TGGTTTGTTG TGAAGTGTAG AGGGCATCGT CAATGAGCAC GGTGGCTGCA  GCGTCGGATC TTGCTCAGCT GAAGAGTGCG AGAGAGGATA TCAAAGAGCT TCTCAAGTCT AAGTTTTGCC ATCCTATTCT GGTATTTTCT TTTGTAACTA TGTGTATAGG TATGCTCTTA  AATTCTACGT TTTTCCTTCT TGTGTTTGTA GAATAGCTAA TGATTTGATC TGCTTGTTGA ATGTGCCTCT TATAATCTTG TTGATAATTA TGTTACTTTA TGTCAGTTAA AATTGCAATT  TTACTTGCGA TGATTGGAAA GTGAAGTTTT CCTTGTATTG ATAATGCAAA TGTAGGTGAA GTTATGTATA GTTGGCTCAT TTGTAGTTTG TTACCTCAGT CCGCTGATAT CAATACTATT  TTCTTTTTAC AATTATAGGT TCGACTGGGA TGGCATGATG CTGGTACATA TAACAAGAAC ATAGAGGAGT GGCCAAAGAG AGGCGGAGCC AATGGAAGTC TCAGATTTGA AATTGAGTTG  AAACATGGAG CCAATGCAGG TCATTTCTTT TTACCATTAT GCATAAGTCG GTTTAGTTTA TAAGGCTTGT TTGTAATGAA CTAGCATTTC AGGCTTGGTG AACGCATTGA ACCTTCTTCA  GCCTATTAAA GACAAGTACT CTGGTGTGAC ATATGCAGAT TTATTCCAGT TGGCCAGTGC TACTGCTATA GAGGTCTTTA TTTTGCTTAA TATGGAACTG TTACGATGTT TCACTCAGAT  TTTCAAAATA ATGTATTGAT TTTACACTTG CAATTTTAGG AAGCTGGTGG CCCCAAAATC CCCATGAAGT ATGGAAGGGT GGATGTTTCA GCTCCTnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTGTATCTG TAGCTCCTTT TTCACTTATT GTAGGATAAA CATTTGCACT CATGCACCCA CTGCATTGCT TAGTAGATTT  CTCAAGAGTT TTTGAATTTC ATCATGAAAA TTGCATAGTT GAAACTTGAA ATAAACAAAT TTTAGTCTAT TGGATCTCAT GATCTTTTTC AGATTAGTAC GGTTTTGCTT TTTGCTAGTT  TCCTCTTGTT TATCAGAGGC TGCCTGTGGA TAACTCCTGT TTCAAACTTG TGACTGATTT TGAAATATTA TTATAATGCT CAGGTGCTGG GCCCCCTAAC CCTGCAGATC ATTTGCAAGA  AATTTTCTAC AGAATGGGCT TAAATGACCA GGTAACCTTA ATTGCACACA CACTTTACTA CTGACGCTAT TTTGATAAGC ATCTGCTGCT TATTGAACTC TTTTATTTTT AGGAAATAGT  TGCATTATCT GGTGCGCATA CGCTGGGAAG GTCCAGACCT GATCGCAGTG GTTGGGGAAA ACCAGAGACA AAGTATACGG TACTGAGCCA CAATCTGCTG ATCATTTTGA TAGTTATAAA  ATATAATCTT AGCTGATAGA CTTCTTCAAA ATTTGGACTT TGTTGAAGAA TGGATTTCGT CTGTCCATTA TGCATAACAA AATTGATGTA AAAAATCTTC AACCTAGGAT TGGAGTATTT  GCAAATGGTT AGTAATCAAT ATGCAACTTT TATGTTTTAT TTATCATATG ATATACAAAA TATTCTCTTA GCAGCTATTA GAGCTAATCA CTTCTTCTCT TCCTTTGTCT CTCAATGACG  GATGCGTACT AGCATGCTTT TGCACACTCT TCTTTTTGGC TCACTAGAAC CATAAAAATT GTCTTCTTTG TTTTATTGTA CGACTGATTG TTGGGTAAAG TGAGCAACAC TACCTCCAAA  AATTTAGAAA GCGTAACTTC TTAAGGATTT AGGTGGTCAA AACTTTACTA TTGGATTGAC TTCCATGCCT TGAGAAGTCC AAGAATTGGT GTATGTCAAA CTATTGGTGT ATGTTAAACT  ATCTGGCTTC TGCAATTCTT CTAATACATA ACTGGTTGTA ATTATCATAA GAAAAAAGTG AATTGCAAAT TTACATGCTA AAATTCTTTT ACCACTTCAA TTACCTGTTA CACATGCGCA  CACACTTGCT GCCCTTCTAT ACTCTAGATT CAAGTGTTTC TGTGTATGAT CTGTAGCATC TCTGTCTGTT GACATTTATG TGCATGGACA ATTATATGTC TATATTTCAG TTTGCTTTTG  CGATTCCTAT CAAGGCCCTT TTGTTTCTTG CTGTGGAATG TATCAAGTAT AGCATGAAAA ATGAATAACT AGTAATAAAT TTCAATGTTA GCAACAAGAG TAAGAGATTC ACATTTCATT  TCTTGCATGA CAGAAAAATG GACCGGGAGC TCCAGGAGGA CAATCCTGGA CAGCAGAATG GCTGAAGTTT GATAATTCCT ACTTCAGGGT TTGAATTCAG AGCTCACATT TTATATTGTA  AGAAGAAATT TATGAGAAGT GATGGTAAGA TTCTTGTGTC TTGAATTTAA TTTTTCCATA CAGGATATCA AAGAAAGAAA GGATGAAGAT CTACTTGTGT TGCCAACTGA TGCTGTTCTC  TTTGAAGATC CTTCTTTCAA GGTCAATTAA ATATGTGTGC AAGGAAGATG ACTGAGAGAT GTAGAACAAG GTTGTAGCTA ATCAATTGAA AATTTGCAGG TATATGCTGA GAAATATGCT  GATGATCAGG AAGCATTCTT CAAAGATTAC GCTGCAGCCC ATGCCAAGCT CAGCAACCTT GGTGCCAAAT TTGATCCTCC CCAGGTCTGT TATACATATC ATGACTTGTG TTTTGATGCT  AGATTTTTTT TTTGGAACTC TATAGTTCAG ACTGACTTTA TCTTCTGATG ATTAATGCCA TTGCCTTGGA AATTTTTGGA GGGTCCTGGA GAACCGCAAC TATAAAAAAC ACCAATTCTT  GTACTTAAAA AATTGTGAGA TTATTATGGC TGATTCGAAT AATTCTCAGG CTGTGTAGCC TTTGATTGAT GACATAGTAC CTGTCAGTGT ATACCTTGCT ATTCTTTCTA TGTTGGTTTT  GGCCTAACAG GTCCTTACTA CATATAGCTT AGGTTTGTAC ACATGCCCAA ACCTATTATA TTTTGGCTTT CCTTTTATTT CACTTATTGG AAACTCCATT AGCATATTGA GTTGTCAAAG  ATTGTAGATT GGGGAAAAGT GGGTTACTTG AATTAACAAT TTTTGTATCT GAATTTGATA ATCAGGGTAT TTTGTTAGAT GGAGTTGCAG GAGAGAAATT TGTGGCAGCG AACTACTCAA  CTGGAAAGGT TGTTAGCTAT AAGCTGTTTC ATTTTTTTTC TCATTAATTA TCAGAATTCC TTACTTTTCT TGGTTGCATG AAAATGTTTA TTGATGAAAT TACATTTTAA CAAAAATTGT  TCATTTTTCC ACTTTTCATG ATTTGCTGCA GGATTAATAA ACAAGCATCT TGTTTTCTAG TGCCCTATCT TTAATAATAT AGGATGAAGC TATATGCAAA ACCTATTTAT TAACATCTAA  ACCTTGGAAT TCTAACTGAA GGAGAAAGGG AAAAAAATTC AATAAGTATT GCCTGTTTGA ATTGCAGAGA GAACTGTCAG AGGCTATGAA GCAGAAGATC CGGGCAGAGT ATGAAGCGGT 
TGGTGGAAGC CCAGATAAGC CTTTAAAGTC TAACTATTTT CTAAATATCA TGATAGTGAT TGCTGTTTTG GCATTATTGA CATCCCTTCT TGGAAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACGCT GCCCGTCACA CTTGACGCTT ACGCCATCGC CAACAATGGC TTCGCTCGCT GGCGCTGCCT CTTCTCGTCT CTTCCCCTCC ACTTATAGAG CTCGAATCTC CCTTTCCTCA  CCTGCATCTT CTTCCTCGCT CTCTCCTCTA TCTCTCTCCT CTTCTTCTTC TTATTCATTT GCTCCTCTCA AATGTCTTCT AACTTCTCCT CTCGCACCTC ATTTCTTCTT AAATCAGAGG  GCATCGTCAA TGAGCACGGT GGCTGCAGCG TCGGATCTTG CTCAGCTGAA GAGTGCGAGA GAGGATATCA AAGAGCTTCT CAAGTCTAAG TTTTGCCATC CTATTCTGGT TCGACTGGGA  TGGCATGATG CTGGTACATA TAACAAGAAC ATAGAGGAGT GGCCAAAGAG AGGCGGAGCC AATGGAAGTC TCAGATTTGA AATTGAGTTG AAACATGGAG CCAATGCAGG CTTGGTGAAC  GCATTGAACC TTCTTCAGCC TATTAAAGAC AAGTACTCTG GTGTGACATA TGCAGATTTA TTCCAGTTGG CCAGTGCTAC TGCTATAGAG GAAGCTGGTG GCCCCAAAAT CCCCATGAAG  TATGGAAGGG TGGATGTTTC AGCTCCTGAA GAGTGTCCTG AGGAGGGGAG GCTTCCTAGT GCTGGGCCCC CTAACCCTGC AGATCATTTG CAAGAAATTT TCTACAGAAT GGGCTTAAAT  GACCAGGAAA TAGTTGCATT ATCTGGTGCG CATACGCTGG GAAGGTCCAG ACCTGATCGC AGTGGTTGGG GAAAACCAGA GACAAAGTAT ACGAAAAATG GACCGGGAGC TCCAGGAGGA  CAATCCTGGA CAGCAGAATG GCTGAAGTTT GATAATTCCT ACTTCAGGGA TATCAAAGAA AGAAAGGATG AAGATCTACT TGTGTTGCCA ACTGATGCTG TTCTCTTTGA AGATCCTTCT  TTCAAGGTAT ATGCTGAGAA ATATGCTGAT GATCAGGAAG CATTCTTCAA AGATTACGCT GCAGCCCATG CCAAGCTCAG CAACCTTGGT GCCAAATTTG ATCCTCCCCA GGGTATTTTG  TTAGATGGAG TTGCAGGAGA GAAATTTGTG GCAGCGAACT ACTCAACTGG AAAGAGAGAA CTGTCAGAGG CTATGAAGCA GAAGATCCGG GCAGAGTATG AAGCGGTTGG TGGAAGCCCA 
GATAAGCCTT TAAAGTCTAA CTATTTTCTA AATATCATGA TAGTGATTGC TGTTTTGGCA TTATTGACAT CCCTTCTTGG AAATTAA 

Retrieve as FASTA