Entry information : MePrx83 ( Manes.18G144800.1[6.1] / cassava4.1_025314m)
Entry ID 9138
Creation 2011-07-01 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-02-05 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-02-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: MePrx83 ( Manes.18G144800.1[6.1] / cassava4.1_025314m)
Name (synonym) MePrx83 ( Manes.18G144800.1[6.1] / cassava4.1_025314m)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Manihot
Organism Manihot esculenta (cassava)    [TaxId: 3983 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MePrx83
start..stop
S start..stop
PtPrx41 527 0 2..316 11..325
PbPrx09 520 0 3..316 9..325
CclPrx07 519 0 1..316 8..323
CsPrx15 519 0 1..316 8..323
Literature and cross-references MePrx83 ( Manes.18G144800.1[6.1] / cassava4.1_025314m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold11571 (44356..41625)
Protein sequence: MePrx83 ( Manes.18G144800.1[6.1] / cassava4.1_025314m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   316 (297)
PWM (Da):   %s   33768.99 (31858.0)  
PI (pH):   %s   8.96 (8.92) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-316
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMSCVVLGFV LMLGGKSSAQ LSTDFYSKSC PKLLSTVRSV VEDAVSKEKR MGASLLRLHF HDCFVNGCDG SILLEDTPSF RGEQTAGPNS NSVRGFNVIN DIKAKVEQVC PGIVSCADIV  AVAARDSTVI LGGPNWNVKL GRRDSKTASF SAANSGVLPP PSSTLSNLIN RFQAKGLSAR DMVALSGSHT IGQARCTVFR TRIYNETNID SSFARTRQEN CPFPTGSGDN NLAPLDVQTP 
TAFDNNYYKN LVNQKGLLHS DQVLFNGGSA DSLVITYSKN PKAFNSDFAA AMIKMGDIDP LTGSKGEIRK KCSKVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 18, 3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTT TTCAATCTCT GTCTTCTTCT TGCATGATGA GTTGTGTAGT ATTAGGTTTT GTTTTGATGT TGGGAGGGAA GTCATCAGCC CAACTGTCTA CTGATTTTTA CTCAAAAAGT  TGTCCGAAGC TTTTGAGCAC AGTGAGATCT GTTGTTGAAG ATGCAGTGTC TAAAGAGAAG CGAATGGGTG CTTCTCTTCT TCGTCTCCAC TTCCATGACT GTTTTGTCAA TGTAATCTCT  CTTTCACTTC TTCCTTTTTT GCTTCTTCTA CCTCTACGTT CTCCTATAAC TCTAAACACA TACGAATAAG TATTTATATT ATATATATAT ACTGAGAAAA ATATTAGGGT TTAGTAAGTT  TTGTTTTTGG TTTATATAAC CTAAAATTTT GGTTTTGATG AGTTGGGTTC GGTTTATTAT TTTGTTGTGT GTGATTTCTC TGAGTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTAAATA ATTTTTGTAT  TTTGATTTAA TTTATAGCTT TTTGAAAAAT AAAATTAAAC AAGTAAACAA TAAAGAGCAT ATTACTGTGG TTTGATGTCG GCTTGAATCG TAGAGCTTTC ACTAGATAAA ATATTATTTT  ATGCATAAGA ATATTGATTT GACTTCGCTT GTACACGTTA AATCAGTTTT AATTGATATA ACAAAATCAT TTTCAACTAA AGTATAATAA GATAATAGCA GTCGCTCACA ATCTCACGAA  TGATATTTTT CCTCAAGTCA TATCATTCAT TTCTGATTTA TTTATTTATA TTACTTGAAA GAAGTTAATC AAGCTTTTAT AGAAAACCCA TCAAGAGCCA GCAATAAACG GTATTTAAAA  ACAAAATTTA AACACAAATA TAAAAAAAAA TTATGGATTT CGAATATTTT GGAGTATTCT TTTATAATTA ATCGAATCAA AATAAATTAA AAAAATAAAA AATTAAATTA AAATTTTAAA  TTAATTCAAT TCAATTAATT TTTTCAATTC GAATAAATTA CCATTTATTT CTAGGTGTGT TTTTTTTTTA TTTTTTCTTG AATCAAATTT CTAGGTGTGT TTATATTCAT ATTAATTTTT  TTTTTCAATG TATCTAATAT TTAAAATTCA CTTAATTACT TAATTTGAAT TTGTGTGGAA CTGCTCATTC TTAAATTTTA AATATATTTT ATAAGAATTT AAATCATTAT TACCCACATT  ATTTTTTAAA ACTTTTCAAA GTAAAAAAAA TAAAAATAAA AATAAAAATT AGCAAAAAAG GCATTGGCAT TTGTATATAC TTAAGCGTCC AATGTCACAC AAAATTACCA TAATGTGCAT  TACAATATTA TATTCTTCAT AGAAATTAAT CAATACATAA ATTTTTAACA AATAAATTAC AAAATAAAAA TTTTCAATCG GAATTCAAAT CTGGTAATTC TTGAGAGAAT TTCAGTGTTA  CTAACTTAAA AGTTATTTAT ATATTAATTT AATTGATTTT ATTGATATAG TAAATTAAAT AATTATAACA GGGATGTGAT GGGTCTATTC TCCTGGAAGA CACACCTTCA TTCAGAGGGG  AGCAGACTGC AGGTCCAAAT AGCAATTCAG TGAGAGGATT CAATGTTATA AATGATATTA AGGCTAAAGT GGAGCAAGTT TGCCCAGGCA TCGTCTCCTG TGCTGATATT GTCGCTGTTG  CTGCTCGCGA TTCTACTGTT ATTGTAAGTA ATTTATTTCT TTTTCTCATT ATTTTTTTTT TTTTAATTGT GAAGAGCGTA AGATTCTACC ACTAGAGTCG CTCAATTTAA AACTTTAAAT  TTGAAAGTAA AAGTCCTAAA AATAGTTTTA TATTTTCAAT ATATATGTTT TTGTATTGAC TGAATTTAAA GTGGAAATAA ACTAATTCCA ACTTTAAATT TTTTAATTTA AAAGACTCAT  ATAGCATGTT AAATAATTAT TTAATTTAAA AATTTAAGAT TTGAAGCGAA GTCCTCAAGA ATATAGAGAC ATGTAATTCC ATCATATTTA TAGGGGTTAA TTAATAATTT ATTGCAGCTT  GGAGGACCAA ATTGGAATGT GAAACTTGGA AGAAGGGACT CAAAGACAGC CAGCTTTTCT GCTGCTAATA GTGGTGTTCT TCCTCCTCCT TCTTCTACCC TTAGCAACCT CATCAATCGC  TTTCAAGCTA AAGGCCTCTC TGCCAGGGAC ATGGTTGCTT TGTCTGGTAT GTTATTATTT GTTAAAATGT ATCCATCAGT AATATGGTTA ATTATCCATG TCATTGGAAG ATTGAAACCT  TCAGTCAACT GAGATCTCAC AACTTTATTT TGAATATATG AGGACTAATT AATTAATTTT TTAAAATAGA GGGACCGAAT AGTTAATTTT ACTAAAACGT ATGATTGTGT TTAAAAGGAT  CCCACACAAT TGGGCAAGCA AGATGTACAG TTTTTAGGAC TCGCATATAC AATGAGACCA ACATTGACAG TTCATTTGCA AGAACAAGAC AAGAGAACTG CCCATTTCCC ACAGGCTCAG  GAGACAACAA CTTAGCACCT TTGGATGTCC AAACTCCTAC AGCCTTTGAC AACAATTACT ATAAAAACCT CGTCAACCAA AAGGGTCTCC TCCACTCAGA TCAAGTTCTG TTTAACGGTG  GATCTGCTGA TTCTTTGGTT ATAACATACA GCAAAAACCC AAAAGCCTTC AATTCAGACT TTGCTGCTGC AATGATTAAG ATGGGTGACA TTGATCCTCT CACTGGTTCT AAGGGTGAAA 
TTAGGAAGAA ATGCAGCAAG GTCAACTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGAGTT GTGTAGTATT AGGTTTTGTT TTGATGTTGG GAGGGAAGTC ATCAGCCCAA CTGTCTACTG ATTTTTACTC AAAAAGTTGT CCGAAGCTTT TGAGCACAGT GAGATCTGTT  GTTGAAGATG CAGTGTCTAA AGAGAAGCGA ATGGGTGCTT CTCTTCTTCG TCTCCACTTC CATGACTGTT TTGTCAATGG ATGTGATGGG TCTATTCTCC TGGAAGACAC ACCTTCATTC  AGAGGGGAGC AGACTGCAGG TCCAAATAGC AATTCAGTGA GAGGATTCAA TGTTATAAAT GATATTAAGG CTAAAGTGGA GCAAGTTTGC CCAGGCATCG TCTCCTGTGC TGATATTGTC  GCTGTTGCTG CTCGCGATTC TACTGTTATT CTTGGAGGAC CAAATTGGAA TGTGAAACTT GGAAGAAGGG ACTCAAAGAC AGCCAGCTTT TCTGCTGCTA ATAGTGGTGT TCTTCCTCCT  CCTTCTTCTA CCCTTAGCAA CCTCATCAAT CGCTTTCAAG CTAAAGGCCT CTCTGCCAGG GACATGGTTG CTTTGTCTGG ATCCCACACA ATTGGGCAAG CAAGATGTAC AGTTTTTAGG  ACTCGCATAT ACAATGAGAC CAACATTGAC AGTTCATTTG CAAGAACAAG ACAAGAGAAC TGCCCATTTC CCACAGGCTC AGGAGACAAC AACTTAGCAC CTTTGGATGT CCAAACTCCT  ACAGCCTTTG ACAACAATTA CTATAAAAAC CTCGTCAACC AAAAGGGTCT CCTCCACTCA GATCAAGTTC TGTTTAACGG TGGATCTGCT GATTCTTTGG TTATAACATA CAGCAAAAAC 
CCAAAAGCCT TCAATTCAGA CTTTGCTGCT GCAATGATTA AGATGGGTGA CATTGATCCT CTCACTGGTT CTAAGGGTGA AATTAGGAAG AAATGCAGCA AGGTCAAC 

Retrieve as FASTA